MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris DX-1 chromosome

Total Repeats: 126380

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_014834	CTG	2	6	207248	207253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931579
5002	NC_014834	GAA	2	6	207320	207325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931579
5003	NC_014834	CGC	2	6	207349	207354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931579
5004	NC_014834	GAA	2	6	207365	207370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931579
5005	NC_014834	CGT	2	6	207382	207387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931579
5006	NC_014834	CGA	2	6	207388	207393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931579
5007	NC_014834	CGAC	2	8	207396	207403	25 %	0 %	25 %	50 %	316931579
5008	NC_014834	GCT	2	6	207463	207468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931579
5009	NC_014834	GTG	2	6	207491	207496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931579
5010	NC_014834	CGG	2	6	207508	207513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931579
5011	NC_014834	AAG	2	6	207563	207568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931579
5012	NC_014834	CGC	2	6	207595	207600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931579
5013	NC_014834	GC	3	6	207613	207618	0 %	0 %	50 %	50 %	316931579
5014	NC_014834	TGG	3	9	207651	207659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931579
5015	NC_014834	CGA	2	6	207664	207669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931579
5016	NC_014834	ATCA	2	8	207698	207705	50 %	25 %	0 %	25 %	316931579
5017	NC_014834	GGC	2	6	207712	207717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931579
5018	NC_014834	ATC	2	6	207728	207733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931579
5019	NC_014834	CAA	2	6	207742	207747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	316931579
5020	NC_014834	CTG	2	6	207791	207796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931579
5021	NC_014834	GCG	2	6	207825	207830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931579
5022	NC_014834	TGT	2	6	207832	207837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	316931579
5023	NC_014834	GCT	2	6	207880	207885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931579
5024	NC_014834	GAT	2	6	207889	207894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931579
5025	NC_014834	CCG	2	6	207942	207947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931579
5026	NC_014834	CCGCGG	2	12	207976	207987	0 %	0 %	50 %	50 %	316931579
5027	NC_014834	CAT	2	6	208036	208041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931579
5028	NC_014834	CG	3	6	208070	208075	0 %	0 %	50 %	50 %	316931579
5029	NC_014834	GCCC	2	8	208149	208156	0 %	0 %	25 %	75 %	316931579
5030	NC_014834	GGT	2	6	208177	208182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931579
5031	NC_014834	CG	3	6	208220	208225	0 %	0 %	50 %	50 %	316931579
5032	NC_014834	GA	3	6	208236	208241	50 %	0 %	50 %	0 %	316931579
5033	NC_014834	CCA	2	6	208251	208256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931579
5034	NC_014834	GCTC	2	8	208272	208279	0 %	25 %	25 %	50 %	316931579
5035	NC_014834	GAT	2	6	208285	208290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	316931579
5036	NC_014834	CGA	2	6	208396	208401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931579
5037	NC_014834	CGC	2	6	208405	208410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931579
5038	NC_014834	CGG	2	6	208432	208437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931579
5039	NC_014834	CAA	2	6	208507	208512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	316931579
5040	NC_014834	GCC	2	6	208526	208531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931579
5041	NC_014834	CTA	2	6	208555	208560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931579
5042	NC_014834	CAT	2	6	208564	208569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931579
5043	NC_014834	TGG	2	6	208578	208583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931579
5044	NC_014834	AAG	2	6	208592	208597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931579
5045	NC_014834	GCG	2	6	208728	208733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931579
5046	NC_014834	CGT	2	6	208759	208764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931579
5047	NC_014834	GAAG	2	8	208813	208820	50 %	0 %	50 %	0 %	316931579
5048	NC_014834	TCG	2	6	208821	208826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931579
5049	NC_014834	CAT	2	6	208882	208887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931579
5050	NC_014834	AGA	2	6	209159	209164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	316931580
5051	NC_014834	CGG	2	6	209175	209180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931580
5052	NC_014834	CGCT	2	8	209188	209195	0 %	25 %	25 %	50 %	316931580
5053	NC_014834	G	6	6	209244	209249	0 %	0 %	100 %	0 %	316931580
5054	NC_014834	CGA	2	6	209324	209329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931580
5055	NC_014834	CGG	2	6	209346	209351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931580
5056	NC_014834	CGA	2	6	209355	209360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931580
5057	NC_014834	GCG	2	6	209405	209410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931580
5058	NC_014834	CGA	2	6	209463	209468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931580
5059	NC_014834	GCCGAG	2	12	209476	209487	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	316931580
5060	NC_014834	GCT	2	6	209499	209504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931580
5061	NC_014834	ACC	2	6	209565	209570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931581
5062	NC_014834	TTGC	2	8	209580	209587	0 %	50 %	25 %	25 %	316931581
5063	NC_014834	ACG	2	6	209593	209598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931581
5064	NC_014834	GCA	2	6	209600	209605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931581
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5067	NC_014834	ACA	2	6	209653	209658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	316931581
5068	NC_014834	CGG	2	6	209672	209677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931581
5069	NC_014834	CGG	3	9	209681	209689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931581
5070	NC_014834	AGC	2	6	209692	209697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931581
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5072	NC_014834	GTG	2	6	209730	209735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931581
5073	NC_014834	GGT	2	6	209777	209782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931581
5074	NC_014834	CGGG	2	8	209842	209849	0 %	0 %	75 %	25 %	316931581
5075	NC_014834	CCA	2	6	209872	209877	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931581
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5078	NC_014834	CTG	2	6	210018	210023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931581
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5080	NC_014834	GGT	2	6	210119	210124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931581
5081	NC_014834	GCCC	2	8	210135	210142	0 %	0 %	25 %	75 %	316931581
5082	NC_014834	CG	3	6	210231	210236	0 %	0 %	50 %	50 %	316931581
5083	NC_014834	GCT	2	6	210257	210262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931581
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5086	NC_014834	CGA	2	6	210314	210319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931581
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5088	NC_014834	GCT	2	6	210398	210403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931581
5089	NC_014834	GAC	2	6	210423	210428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931581
5090	NC_014834	TTG	2	6	210489	210494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	316931581
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5097	NC_014834	GGGC	2	8	211301	211308	0 %	0 %	75 %	25 %	316931583
5098	NC_014834	CG	3	6	211337	211342	0 %	0 %	50 %	50 %	316931583
5099	NC_014834	CGT	2	6	211358	211363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931583
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5101	NC_014834	CGT	2	6	211397	211402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931583
5102	NC_014834	CGC	2	6	211403	211408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931583
5103	NC_014834	CG	3	6	211417	211422	0 %	0 %	50 %	50 %	316931583
5104	NC_014834	CGGC	2	8	211474	211481	0 %	0 %	50 %	50 %	316931583
5105	NC_014834	CGG	2	6	211490	211495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931583
5106	NC_014834	CCGA	2	8	211518	211525	25 %	0 %	25 %	50 %	316931583
5107	NC_014834	CGC	2	6	211664	211669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931583
5108	NC_014834	CGG	2	6	211672	211677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931583
5109	NC_014834	TCA	2	6	211735	211740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931583
5110	NC_014834	ACG	2	6	211741	211746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931583
5111	NC_014834	CGA	2	6	211769	211774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931583
5112	NC_014834	TGG	3	9	211798	211806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	316931583
5113	NC_014834	CCG	2	6	211813	211818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931583
5114	NC_014834	ATC	2	6	211923	211928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	316931583
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5119	NC_014834	GC	3	6	212027	212032	0 %	0 %	50 %	50 %	316931583
5120	NC_014834	CTT	2	6	212105	212110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316931583
5121	NC_014834	TGC	2	6	212269	212274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931583
5122	NC_014834	GTC	2	6	212325	212330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931583
5123	NC_014834	CTG	2	6	212400	212405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931583
5124	NC_014834	C	7	7	212417	212423	0 %	0 %	0 %	100 %	316931583
5125	NC_014834	TCGG	2	8	212427	212434	0 %	25 %	50 %	25 %	316931583
5126	NC_014834	GCC	2	6	212443	212448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931583
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5130	NC_014834	ATCC	2	8	212502	212509	25 %	25 %	0 %	50 %	316931583
5131	NC_014834	TGC	2	6	212512	212517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931583
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5134	NC_014834	GCG	2	6	212602	212607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931583
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5142	NC_014834	CGG	2	6	212984	212989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931583
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5152	NC_014834	CAAGGT	2	12	213281	213292	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	316931583
5153	NC_014834	GCT	2	6	213296	213301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931583
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5241	NC_014834	GCCG	2	8	217233	217240	0 %	0 %	50 %	50 %	316931586
5242	NC_014834	GGCG	2	8	217260	217267	0 %	0 %	75 %	25 %	316931586
5243	NC_014834	CCA	2	6	217272	217277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931586
5244	NC_014834	CGC	2	6	217288	217293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931586
5245	NC_014834	CTT	2	6	217299	217304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	316931586
5246	NC_014834	CGGCG	2	10	217305	217314	0 %	0 %	60 %	40 %	316931586
5247	NC_014834	CG	3	6	217313	217318	0 %	0 %	50 %	50 %	316931586
5248	NC_014834	GAG	2	6	217339	217344	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	316931586
5249	NC_014834	GCCGG	2	10	217351	217360	0 %	0 %	60 %	40 %	316931586
5250	NC_014834	ACC	2	6	217367	217372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	316931586
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5254	NC_014834	TGC	2	6	217886	217891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931587
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5264	NC_014834	GGC	2	6	218041	218046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931587
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5271	NC_014834	CGG	2	6	218298	218303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931587
5272	NC_014834	CTGG	2	8	218355	218362	0 %	25 %	50 %	25 %	316931587
5273	NC_014834	CGA	2	6	218364	218369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931587
5274	NC_014834	GCGA	2	8	218381	218388	25 %	0 %	50 %	25 %	316931587
5275	NC_014834	CGATC	2	10	218463	218472	20 %	20 %	20 %	40 %	316931587
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5279	NC_014834	GCT	2	6	218619	218624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931587
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5286	NC_014834	GC	3	6	218805	218810	0 %	0 %	50 %	50 %	316931587
5287	NC_014834	GGGCGC	2	12	218814	218825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931587
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5362	NC_014834	CTG	3	9	222191	222199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931589
5363	NC_014834	CGG	2	6	222208	222213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931589
5364	NC_014834	CCGG	2	8	222215	222222	0 %	0 %	50 %	50 %	316931589
5365	NC_014834	CG	3	6	222235	222240	0 %	0 %	50 %	50 %	316931589
5366	NC_014834	CTCG	2	8	222241	222248	0 %	25 %	25 %	50 %	316931589
5367	NC_014834	GACCA	2	10	222251	222260	40 %	0 %	20 %	40 %	316931589
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5431	NC_014834	CGG	3	9	225132	225140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931592
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5470	NC_014834	TCG	2	6	227146	227151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	316931594
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5476	NC_014834	AGAGG	2	10	227374	227383	40 %	0 %	60 %	0 %	316931594
5477	NC_014834	ACG	2	6	227504	227509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931594
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5480	NC_014834	GGC	2	6	227668	227673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	316931594
5481	NC_014834	CAA	2	6	227703	227708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	316931594
5482	NC_014834	CTCC	2	8	227763	227770	0 %	25 %	0 %	75 %	316931594
5483	NC_014834	CG	3	6	227794	227799	0 %	0 %	50 %	50 %	316931594
5484	NC_014834	AGG	2	6	227813	227818	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	316931594
5485	NC_014834	ACG	2	6	227822	227827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	316931594
5486	NC_014834	CGGC	2	8	227868	227875	0 %	0 %	50 %	50 %	316931594
5487	NC_014834	GCC	2	6	227931	227936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	316931594
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