MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Ruminococcus albus 7 plasmid pRUMAL04

Total Repeats: 54

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014827	ATA	2	6	29	34	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317133711
2	NC_014827	CTT	2	6	128	133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317133711
3	NC_014827	AGA	2	6	178	183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317133711
4	NC_014827	GTT	2	6	260	265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	317133711
5	NC_014827	GAT	2	6	408	413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317133712
6	NC_014827	TAA	2	6	639	644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317133712
7	NC_014827	ATT	2	6	706	711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	317133713
8	NC_014827	GCC	2	6	755	760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317133713
9	NC_014827	CAA	2	6	787	792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	317133713
10	NC_014827	TTC	2	6	965	970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317133713
11	NC_014827	ATA	2	6	1156	1161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317133714
12	NC_014827	CTT	2	6	1169	1174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317133714
13	NC_014827	TTC	2	6	1188	1193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317133714
14	NC_014827	TAT	2	6	1250	1255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	317133714
15	NC_014827	TTA	2	6	1258	1263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	317133714
16	NC_014827	TCA	2	6	1324	1329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317133714
17	NC_014827	GCT	2	6	4188	4193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317133715
18	NC_014827	CGC	2	6	4348	4353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317133715
19	NC_014827	GCA	2	6	4448	4453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317133715
20	NC_014827	ACA	2	6	4543	4548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	317133715
21	NC_014827	TGA	2	6	4632	4637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317133715
22	NC_014827	GCA	2	6	4781	4786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317133715
23	NC_014827	CGG	2	6	4827	4832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317133715
24	NC_014827	GTT	3	9	4966	4974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	317133715
25	NC_014827	CAA	2	6	4980	4985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	317133715
26	NC_014827	AAG	3	9	5017	5025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317133715
27	NC_014827	GTG	2	6	5052	5057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317133715
28	NC_014827	GAT	2	6	5224	5229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317133715
29	NC_014827	ATT	2	6	5261	5266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	317133715
30	NC_014827	TAA	2	6	5319	5324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317133715
31	NC_014827	AGC	2	6	5432	5437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317133715
32	NC_014827	GCA	2	6	5454	5459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317133715
33	NC_014827	TGG	2	6	5530	5535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317133715
34	NC_014827	GAA	2	6	5790	5795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317133716
35	NC_014827	AGA	2	6	5797	5802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317133716
36	NC_014827	ATG	2	6	5911	5916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317133716
37	NC_014827	ATA	2	6	5950	5955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	317133716
38	NC_014827	TTA	2	6	5961	5966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	317133716
39	NC_014827	CAG	2	6	5985	5990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317133716
40	NC_014827	AGC	2	6	6043	6048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317133716
41	NC_014827	TGG	2	6	6066	6071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317133716
42	NC_014827	GAA	2	6	6121	6126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317133717
43	NC_014827	CTG	2	6	6195	6200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317133717
44	NC_014827	TGG	2	6	6204	6209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317133717
45	NC_014827	AGG	2	6	6307	6312	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317133717
46	NC_014827	GAA	2	6	6341	6346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317133718
47	NC_014827	TCT	2	6	6418	6423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317133718
48	NC_014827	ACA	2	6	6536	6541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	317133718
49	NC_014827	GCT	2	6	6567	6572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317133718
50	NC_014827	ATG	2	6	6573	6578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317133718
51	NC_014827	AGC	2	6	6626	6631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317133718
52	NC_014827	TAC	2	6	6632	6637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317133718
53	NC_014827	TCT	2	6	6651	6656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317133718
54	NC_014827	TAC	2	6	6677	6682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317133718

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.