MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Ruminococcus albus 7 plasmid pRUMAL02

Total Repeats: 185

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014825	GCTGG	2	10	934	943	0 %	20 %	60 %	20 %	319788692
2	NC_014825	CGCTG	2	10	1366	1375	0 %	20 %	40 %	40 %	319788692
3	NC_014825	GTCAG	2	10	1906	1915	20 %	20 %	40 %	20 %	319788693
4	NC_014825	CAGTA	2	10	6338	6347	40 %	20 %	20 %	20 %	319788697
5	NC_014825	TGTTT	2	10	9504	9513	0 %	80 %	20 %	0 %	319788700
6	NC_014825	GTCGG	2	10	10162	10171	0 %	20 %	60 %	20 %	319788701
7	NC_014825	ACTAT	2	10	14724	14733	40 %	40 %	0 %	20 %	319788704
8	NC_014825	TTTTC	2	10	19801	19810	0 %	80 %	0 %	20 %	319788710
9	NC_014825	ACAGC	2	10	20760	20769	40 %	0 %	20 %	40 %	319788711
10	NC_014825	CAGCC	2	10	22037	22046	20 %	0 %	20 %	60 %	319788712
11	NC_014825	TATCA	2	10	22516	22525	40 %	40 %	0 %	20 %	319788712
12	NC_014825	GTTCA	2	10	23137	23146	20 %	40 %	20 %	20 %	319788712
13	NC_014825	TGATA	2	10	28020	28029	40 %	40 %	20 %	0 %	319788718
14	NC_014825	CGAGC	2	10	29369	29378	20 %	0 %	40 %	40 %	319788719
15	NC_014825	CTGAT	2	10	35990	35999	20 %	40 %	20 %	20 %	319788726
16	NC_014825	TGTTC	2	10	36041	36050	0 %	60 %	20 %	20 %	319788726
17	NC_014825	TTCAT	2	10	37612	37621	20 %	60 %	0 %	20 %	319788726
18	NC_014825	TTCTT	2	10	39662	39671	0 %	80 %	0 %	20 %	319788729
19	NC_014825	TGCCT	2	10	40348	40357	0 %	40 %	20 %	40 %	319788729
20	NC_014825	TCTGC	2	10	41234	41243	0 %	40 %	20 %	40 %	319788729
21	NC_014825	CCTGC	2	10	41632	41641	0 %	20 %	20 %	60 %	319788729
22	NC_014825	TACAA	2	10	42798	42807	60 %	20 %	0 %	20 %	319788731
23	NC_014825	TCATC	2	10	42919	42928	20 %	40 %	0 %	40 %	319788731
24	NC_014825	AGTTC	2	10	45306	45315	20 %	40 %	20 %	20 %	319788731
25	NC_014825	ATATC	2	10	46087	46096	40 %	40 %	0 %	20 %	319788731
26	NC_014825	GTCCT	2	10	47429	47438	0 %	40 %	20 %	40 %	319788732
27	NC_014825	ATACC	2	10	59778	59787	40 %	20 %	0 %	40 %	319788740
28	NC_014825	CAGCT	2	10	61137	61146	20 %	20 %	20 %	40 %	319788742
29	NC_014825	AATGA	2	10	65491	65500	60 %	20 %	20 %	0 %	319788746
30	NC_014825	CTGTG	2	10	67323	67332	0 %	40 %	40 %	20 %	319788746
31	NC_014825	ACATC	2	10	70772	70781	40 %	20 %	0 %	40 %	319788749
32	NC_014825	TGCCT	2	10	71152	71161	0 %	40 %	20 %	40 %	319788750
33	NC_014825	CAGCT	2	10	71437	71446	20 %	20 %	20 %	40 %	319788750
34	NC_014825	TACAT	2	10	71471	71480	40 %	40 %	0 %	20 %	319788750
35	NC_014825	AGCTT	2	10	71570	71579	20 %	40 %	20 %	20 %	319788750
36	NC_014825	CAGCC	2	10	72709	72718	20 %	0 %	20 %	60 %	319788751
37	NC_014825	TACTT	2	10	75258	75267	20 %	60 %	0 %	20 %	319788755
38	NC_014825	TATCT	2	10	78057	78066	20 %	60 %	0 %	20 %	319788759
39	NC_014825	TACCG	2	10	81191	81200	20 %	20 %	20 %	40 %	319788762
40	NC_014825	CAAGT	2	10	82625	82634	40 %	20 %	20 %	20 %	319788763
41	NC_014825	TTACC	2	10	82747	82756	20 %	40 %	0 %	40 %	319788763
42	NC_014825	ATATC	2	10	85777	85786	40 %	40 %	0 %	20 %	319788764
43	NC_014825	CTTTT	2	10	86057	86066	0 %	80 %	0 %	20 %	319788765
44	NC_014825	GCTGT	2	10	86277	86286	0 %	40 %	40 %	20 %	319788765
45	NC_014825	TATCA	2	10	88033	88042	40 %	40 %	0 %	20 %	319788766
46	NC_014825	CTGCA	2	10	95427	95436	20 %	20 %	20 %	40 %	319788774
47	NC_014825	TCCTG	2	10	97930	97939	0 %	40 %	20 %	40 %	319788776
48	NC_014825	CTCAC	2	10	101964	101973	20 %	20 %	0 %	60 %	319788779
49	NC_014825	CGTCT	2	10	103387	103396	0 %	40 %	20 %	40 %	319788781
50	NC_014825	AAGAC	2	10	109544	109553	60 %	0 %	20 %	20 %	319788787
51	NC_014825	AAAGC	2	10	111787	111796	60 %	0 %	20 %	20 %	319788790
52	NC_014825	GGAAA	2	10	114210	114219	60 %	0 %	40 %	0 %	319788793
53	NC_014825	AAATC	2	10	115990	115999	60 %	20 %	0 %	20 %	319788794
54	NC_014825	TGCCT	2	10	116284	116293	0 %	40 %	20 %	40 %	319788794
55	NC_014825	GGGAA	2	10	118298	118307	40 %	0 %	60 %	0 %	319788796
56	NC_014825	GTCAT	2	10	122668	122677	20 %	40 %	20 %	20 %	319788799
57	NC_014825	CAGAG	2	10	123363	123372	40 %	0 %	40 %	20 %	319788800
58	NC_014825	GGCAA	2	10	125651	125660	40 %	0 %	40 %	20 %	319788804
59	NC_014825	CAAGC	2	10	125717	125726	40 %	0 %	20 %	40 %	319788804
60	NC_014825	TCGGT	2	10	126239	126248	0 %	40 %	40 %	20 %	319788805
61	NC_014825	ATCAA	2	10	126626	126635	60 %	20 %	0 %	20 %	319788805
62	NC_014825	TTGCT	2	10	130128	130137	0 %	60 %	20 %	20 %	319788809
63	NC_014825	AGCCC	2	10	130639	130648	20 %	0 %	20 %	60 %	319788809
64	NC_014825	AAGTG	2	10	130791	130800	40 %	20 %	40 %	0 %	319788809
65	NC_014825	TATGA	2	10	130910	130919	40 %	40 %	20 %	0 %	319788809
66	NC_014825	AGGAT	2	10	132146	132155	40 %	20 %	40 %	0 %	319788811
67	NC_014825	GTGCG	2	10	132282	132291	0 %	20 %	60 %	20 %	319788811
68	NC_014825	TGTTC	2	10	133609	133618	0 %	60 %	20 %	20 %	319788815
69	NC_014825	GGCGC	2	10	136754	136763	0 %	0 %	60 %	40 %	319788820
70	NC_014825	ACAGC	2	10	140115	140124	40 %	0 %	20 %	40 %	319788822
71	NC_014825	GGTCA	2	10	142816	142825	20 %	20 %	40 %	20 %	319788825
72	NC_014825	TTCTT	2	10	143166	143175	0 %	80 %	0 %	20 %	319788825
73	NC_014825	TACGT	2	10	153765	153774	20 %	40 %	20 %	20 %	319788829
74	NC_014825	ATTAC	2	10	155564	155573	40 %	40 %	0 %	20 %	319788829
75	NC_014825	CAGAT	2	10	157752	157761	40 %	20 %	20 %	20 %	319788830
76	NC_014825	GTGAG	2	10	157805	157814	20 %	20 %	60 %	0 %	319788830
77	NC_014825	ACTGC	2	10	158655	158664	20 %	20 %	20 %	40 %	319788831
78	NC_014825	ATATC	2	10	161574	161583	40 %	40 %	0 %	20 %	319788835
79	NC_014825	TATCT	2	10	162085	162094	20 %	60 %	0 %	20 %	319788835
80	NC_014825	TTCCC	2	10	168377	168386	0 %	40 %	0 %	60 %	319788838
81	NC_014825	CAAGA	2	10	173062	173071	60 %	0 %	20 %	20 %	319788843
82	NC_014825	TTTCA	2	10	173564	173573	20 %	60 %	0 %	20 %	319788843
83	NC_014825	ATGAG	2	10	174805	174814	40 %	20 %	40 %	0 %	319788844
84	NC_014825	AAACA	2	10	176277	176286	80 %	0 %	0 %	20 %	319788846
85	NC_014825	TCTTT	2	10	179129	179138	0 %	80 %	0 %	20 %	319788847
86	NC_014825	CATAT	2	10	179226	179235	40 %	40 %	0 %	20 %	319788847
87	NC_014825	TATCA	2	10	181535	181544	40 %	40 %	0 %	20 %	319788850
88	NC_014825	ATTTC	2	10	183843	183852	20 %	60 %	0 %	20 %	319788852
89	NC_014825	AAACA	2	10	184036	184045	80 %	0 %	0 %	20 %	319788852
90	NC_014825	TATTC	2	10	184214	184223	20 %	60 %	0 %	20 %	319788852
91	NC_014825	ATTCC	2	10	184441	184450	20 %	40 %	0 %	40 %	319788852
92	NC_014825	ATATC	2	10	185083	185092	40 %	40 %	0 %	20 %	319788853
93	NC_014825	TAATA	2	10	185231	185240	60 %	40 %	0 %	0 %	319788853
94	NC_014825	ATATT	2	10	185284	185293	40 %	60 %	0 %	0 %	319788853
95	NC_014825	CCACA	2	10	187228	187237	40 %	0 %	0 %	60 %	319788855
96	NC_014825	CCTTA	2	10	189211	189220	20 %	40 %	0 %	40 %	319788857
97	NC_014825	GAACA	2	10	190776	190785	60 %	0 %	20 %	20 %	319788858
98	NC_014825	CGTTG	2	10	192808	192817	0 %	40 %	40 %	20 %	319788861
99	NC_014825	CTTGT	2	10	194312	194321	0 %	60 %	20 %	20 %	319788863
100	NC_014825	CCGAA	2	10	194322	194331	40 %	0 %	20 %	40 %	319788863
101	NC_014825	TTTCA	2	10	195238	195247	20 %	60 %	0 %	20 %	319788863
102	NC_014825	TCGTT	2	10	198460	198469	0 %	60 %	20 %	20 %	319788866
103	NC_014825	AATGT	2	10	200216	200225	40 %	40 %	20 %	0 %	319788867
104	NC_014825	CCGAT	2	10	202402	202411	20 %	20 %	20 %	40 %	319788867
105	NC_014825	TATCC	2	10	204376	204385	20 %	40 %	0 %	40 %	319788869
106	NC_014825	TTCAG	2	10	204398	204407	20 %	40 %	20 %	20 %	319788869
107	NC_014825	CATCA	2	10	204943	204952	40 %	20 %	0 %	40 %	319788869
108	NC_014825	TCCTG	2	10	209183	209192	0 %	40 %	20 %	40 %	319788873
109	NC_014825	TCGGG	2	10	210436	210445	0 %	20 %	60 %	20 %	319788873
110	NC_014825	CTTTT	2	10	210550	210559	0 %	80 %	0 %	20 %	319788873
111	NC_014825	ACGAT	2	10	211460	211469	40 %	20 %	20 %	20 %	319788873
112	NC_014825	GGTCG	2	10	211854	211863	0 %	20 %	60 %	20 %	319788873
113	NC_014825	GAAAT	2	10	214039	214048	60 %	20 %	20 %	0 %	319788873
114	NC_014825	TTTCT	2	10	214992	215001	0 %	80 %	0 %	20 %	319788873
115	NC_014825	CGACA	2	10	216414	216423	40 %	0 %	20 %	40 %	319788873
116	NC_014825	TCCTG	2	10	222355	222364	0 %	40 %	20 %	40 %	319788877
117	NC_014825	TCAAC	2	10	222371	222380	40 %	20 %	0 %	40 %	319788877
118	NC_014825	TTGTC	2	10	225149	225158	0 %	60 %	20 %	20 %	319788877
119	NC_014825	TAATA	2	10	226713	226722	60 %	40 %	0 %	0 %	319788879
120	NC_014825	TTCCG	2	10	228114	228123	0 %	40 %	20 %	40 %	319788880
121	NC_014825	ACCGA	2	10	228250	228259	40 %	0 %	20 %	40 %	319788880
122	NC_014825	TGAAC	2	10	234163	234172	40 %	20 %	20 %	20 %	319788886
123	NC_014825	AGATC	2	10	235685	235694	40 %	20 %	20 %	20 %	319788887
124	NC_014825	CTTTG	2	10	236789	236798	0 %	60 %	20 %	20 %	319788888
125	NC_014825	TTATG	2	10	239570	239579	20 %	60 %	20 %	0 %	319788891
126	NC_014825	CGGTA	2	10	239858	239867	20 %	20 %	40 %	20 %	319788891
127	NC_014825	CAGCG	2	10	242102	242111	20 %	0 %	40 %	40 %	319788894
128	NC_014825	TCATT	2	10	250926	250935	20 %	60 %	0 %	20 %	319788902
129	NC_014825	CTTGC	2	10	251114	251123	0 %	40 %	20 %	40 %	319788902
130	NC_014825	CCGAC	2	10	257636	257645	20 %	0 %	20 %	60 %	319788905
131	NC_014825	AACAT	2	10	257949	257958	60 %	20 %	0 %	20 %	319788905
132	NC_014825	ATTAT	2	10	260765	260774	40 %	60 %	0 %	0 %	319788907
133	NC_014825	TGAAT	2	10	263182	263191	40 %	40 %	20 %	0 %	319788908
134	NC_014825	GCACA	2	10	264975	264984	40 %	0 %	20 %	40 %	319788909
135	NC_014825	ATGCG	2	10	265305	265314	20 %	20 %	40 %	20 %	319788910
136	NC_014825	CCTGT	2	10	265751	265760	0 %	40 %	20 %	40 %	319788910
137	NC_014825	CCGCA	2	10	265911	265920	20 %	0 %	20 %	60 %	319788910
138	NC_014825	CCGTA	2	10	266497	266506	20 %	20 %	20 %	40 %	319788911
139	NC_014825	AGATT	2	10	272079	272088	40 %	40 %	20 %	0 %	319788916
140	NC_014825	TGCCT	2	10	274549	274558	0 %	40 %	20 %	40 %	319788917
141	NC_014825	GAGCA	2	10	276325	276334	40 %	0 %	40 %	20 %	319788920
142	NC_014825	CCGTT	2	10	276567	276576	0 %	40 %	20 %	40 %	319788920
143	NC_014825	AAAGA	2	10	276928	276937	80 %	0 %	20 %	0 %	319788920
144	NC_014825	AGATA	2	10	278484	278493	60 %	20 %	20 %	0 %	319788922
145	NC_014825	GATAT	2	10	278995	279004	40 %	40 %	20 %	0 %	319788922
146	NC_014825	GCTGT	2	10	281369	281378	0 %	40 %	40 %	20 %	319788925
147	NC_014825	TTTTC	2	10	282530	282539	0 %	80 %	0 %	20 %	319788925
148	NC_014825	AGCAC	2	10	283052	283061	40 %	0 %	20 %	40 %	319788925
149	NC_014825	TGCAC	2	10	284278	284287	20 %	20 %	20 %	40 %	319788925
150	NC_014825	TTGAT	2	10	285886	285895	20 %	60 %	20 %	0 %	319788925
151	NC_014825	ACCGT	2	10	287621	287630	20 %	20 %	20 %	40 %	319788925
152	NC_014825	TTGCC	2	10	287679	287688	0 %	40 %	20 %	40 %	319788925
153	NC_014825	TTCCG	2	10	288175	288184	0 %	40 %	20 %	40 %	319788925
154	NC_014825	ATCAC	2	10	288233	288242	40 %	20 %	0 %	40 %	319788925
155	NC_014825	ATTTT	2	10	290387	290396	20 %	80 %	0 %	0 %	319788925
156	NC_014825	TCCGT	2	10	294740	294749	0 %	40 %	20 %	40 %	319788929
157	NC_014825	TTTTC	2	10	295636	295645	0 %	80 %	0 %	20 %	319788929
158	NC_014825	TTCAA	2	10	297221	297230	40 %	40 %	0 %	20 %	319788931
159	NC_014825	GTGCT	2	10	297493	297502	0 %	40 %	40 %	20 %	319788931
160	NC_014825	CGTTC	2	10	298105	298114	0 %	40 %	20 %	40 %	319788932
161	NC_014825	TCTGC	2	10	299109	299118	0 %	40 %	20 %	40 %	319788933
162	NC_014825	CCACA	2	10	304128	304137	40 %	0 %	0 %	60 %	319788936
163	NC_014825	TGCTG	2	10	304203	304212	0 %	40 %	40 %	20 %	319788936
164	NC_014825	AGGGC	2	10	304555	304564	20 %	0 %	60 %	20 %	319788936
165	NC_014825	CATCG	2	10	308786	308795	20 %	20 %	20 %	40 %	319788939
166	NC_014825	GAAGT	2	10	309228	309237	40 %	20 %	40 %	0 %	319788940
167	NC_014825	CATTC	2	10	311526	311535	20 %	40 %	0 %	40 %	319788942
168	NC_014825	CACAG	2	10	318889	318898	40 %	0 %	20 %	40 %	319788949
169	NC_014825	TGCCT	2	10	319002	319011	0 %	40 %	20 %	40 %	319788949
170	NC_014825	GAAAA	2	10	320942	320951	80 %	0 %	20 %	0 %	319788951
171	NC_014825	GAAAA	2	10	322598	322607	80 %	0 %	20 %	0 %	319788951
172	NC_014825	CGACC	2	10	322678	322687	20 %	0 %	20 %	60 %	319788951
173	NC_014825	TATGA	2	10	327637	327646	40 %	40 %	20 %	0 %	319788955
174	NC_014825	CAGGG	2	10	332043	332052	20 %	0 %	60 %	20 %	319788960
175	NC_014825	AGTAT	2	10	334205	334214	40 %	40 %	20 %	0 %	319788963
176	NC_014825	AGAAA	2	10	335433	335442	80 %	0 %	20 %	0 %	319788965
177	NC_014825	GATCT	2	10	339202	339211	20 %	40 %	20 %	20 %	319788968
178	NC_014825	GCTTC	2	10	339868	339877	0 %	40 %	20 %	40 %	319788969
179	NC_014825	GATAA	2	10	343653	343662	60 %	20 %	20 %	0 %	319788972
180	NC_014825	TGCCT	2	10	344286	344295	0 %	40 %	20 %	40 %	319788973
181	NC_014825	TAAAG	2	10	347147	347156	60 %	20 %	20 %	0 %	319788976
182	NC_014825	ATCTG	2	10	348065	348074	20 %	40 %	20 %	20 %	319788977
183	NC_014825	TTGTC	2	10	349111	349120	0 %	60 %	20 %	20 %	319788978
184	NC_014825	GCTTT	2	10	349869	349878	0 %	60 %	20 %	20 %	319788979
185	NC_014825	TCCTG	2	10	351218	351227	0 %	40 %	20 %	40 %	319788981

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.