MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Riemerella anatipestifer ATCC 11845 = DSM 15868 chromosome

Total Repeats: 42218

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014738	ACA	2	6	11	16	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313205512
2	NC_014738	ATT	2	6	34	39	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313205512
3	NC_014738	TGT	2	6	128	133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313205512
4	NC_014738	TAA	2	6	162	167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313205512
5	NC_014738	ATT	2	6	231	236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313205512
6	NC_014738	CAG	2	6	239	244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313205512
7	NC_014738	A	6	6	252	257	100 %	0 %	0 %	0 %	313205512
8	NC_014738	A	6	6	298	303	100 %	0 %	0 %	0 %	313205512
9	NC_014738	ACA	3	9	324	332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313205512
10	NC_014738	GTA	2	6	427	432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313205512
11	NC_014738	A	6	6	441	446	100 %	0 %	0 %	0 %	313205512
12	NC_014738	CATT	2	8	478	485	25 %	50 %	0 %	25 %	313205512
13	NC_014738	TAA	2	6	510	515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313205512
14	NC_014738	CTG	2	6	527	532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313205512
15	NC_014738	CTT	2	6	563	568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313205512
16	NC_014738	TGG	2	6	588	593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313205512
17	NC_014738	ATT	2	6	671	676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313205512
18	NC_014738	ATC	2	6	678	683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313205512
19	NC_014738	CAG	2	6	697	702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313205512
20	NC_014738	AGA	2	6	747	752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313205512
21	NC_014738	GAT	2	6	793	798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313205512
22	NC_014738	TTC	2	6	838	843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313205512
23	NC_014738	CAG	2	6	905	910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313205512
24	NC_014738	GAG	2	6	925	930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313205512
25	NC_014738	AGT	2	6	933	938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313205512
26	NC_014738	CGG	2	6	962	967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313205512
27	NC_014738	AGA	2	6	994	999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313205512
28	NC_014738	ATTG	2	8	1095	1102	25 %	50 %	25 %	0 %	313205512
29	NC_014738	CTA	2	6	1130	1135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313205512
30	NC_014738	CAAT	2	8	1175	1182	50 %	25 %	0 %	25 %	313205512
31	NC_014738	TTA	2	6	1208	1213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313205512
32	NC_014738	AGG	2	6	1229	1234	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313205512
33	NC_014738	AG	4	8	1259	1266	50 %	0 %	50 %	0 %	313205512
34	NC_014738	ATT	2	6	1269	1274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313205512
35	NC_014738	AG	3	6	1289	1294	50 %	0 %	50 %	0 %	313205512
36	NC_014738	GAG	2	6	1369	1374	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313205512
37	NC_014738	AAT	2	6	1490	1495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313205512
38	NC_014738	TTTG	2	8	1604	1611	0 %	75 %	25 %	0 %	313205513
39	NC_014738	AT	3	6	1616	1621	50 %	50 %	0 %	0 %	313205513
40	NC_014738	AGA	2	6	1665	1670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313205513
41	NC_014738	CAG	2	6	1685	1690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313205513
42	NC_014738	GAAG	2	8	1794	1801	50 %	0 %	50 %	0 %	313205513
43	NC_014738	GAG	2	6	1876	1881	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313205513
44	NC_014738	AAT	2	6	1912	1917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313205513
45	NC_014738	TTA	2	6	1935	1940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313205513
46	NC_014738	TGG	2	6	1941	1946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313205513
47	NC_014738	AGA	2	6	2063	2068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313205514
48	NC_014738	TAT	2	6	2093	2098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313205514
49	NC_014738	ATT	2	6	2122	2127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313205514
50	NC_014738	T	7	7	2126	2132	0 %	100 %	0 %	0 %	313205514
51	NC_014738	A	6	6	2143	2148	100 %	0 %	0 %	0 %	313205514
52	NC_014738	T	7	7	2169	2175	0 %	100 %	0 %	0 %	313205514
53	NC_014738	A	8	8	2182	2189	100 %	0 %	0 %	0 %	313205514
54	NC_014738	TGA	2	6	2260	2265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313205514
55	NC_014738	TAT	2	6	2393	2398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313205514
56	NC_014738	A	7	7	2477	2483	100 %	0 %	0 %	0 %	313205514
57	NC_014738	AGC	2	6	2500	2505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313205514
58	NC_014738	GAA	2	6	2640	2645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313205514
59	NC_014738	TTA	2	6	2647	2652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313205514
60	NC_014738	GAA	2	6	2675	2680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313205514
61	NC_014738	TGTT	2	8	2713	2720	0 %	75 %	25 %	0 %	313205514
62	NC_014738	CTA	2	6	2728	2733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313205514
63	NC_014738	A	6	6	2737	2742	100 %	0 %	0 %	0 %	313205514
64	NC_014738	AG	3	6	2796	2801	50 %	0 %	50 %	0 %	313205515
65	NC_014738	TAGTCC	2	12	2888	2899	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	313205515
66	NC_014738	AAT	2	6	2936	2941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313205515
67	NC_014738	GTT	2	6	2965	2970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313205515
68	NC_014738	TGT	2	6	3036	3041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313205515
69	NC_014738	T	6	6	3121	3126	0 %	100 %	0 %	0 %	313205515
70	NC_014738	ATT	2	6	3189	3194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313205516
71	NC_014738	ATC	2	6	3218	3223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313205516
72	NC_014738	TAA	2	6	3385	3390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313205516
73	NC_014738	GA	3	6	3447	3452	50 %	0 %	50 %	0 %	313205516
74	NC_014738	TA	3	6	3511	3516	50 %	50 %	0 %	0 %	313205516
75	NC_014738	T	7	7	3528	3534	0 %	100 %	0 %	0 %	313205516
76	NC_014738	TCA	2	6	3539	3544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313205516
77	NC_014738	AGT	2	6	3549	3554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313205516
78	NC_014738	TTA	2	6	3623	3628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313205517
79	NC_014738	TTCTG	2	10	3692	3701	0 %	60 %	20 %	20 %	313205517
80	NC_014738	GTC	2	6	3716	3721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313205517
81	NC_014738	TCT	2	6	3747	3752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313205517
82	NC_014738	TGT	2	6	3781	3786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313205517
83	NC_014738	TAC	2	6	3797	3802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313205517
84	NC_014738	T	6	6	3826	3831	0 %	100 %	0 %	0 %	313205517
85	NC_014738	CTT	2	6	3847	3852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313205517
86	NC_014738	AGA	2	6	3932	3937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313205517
87	NC_014738	AAT	2	6	3944	3949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313205517
88	NC_014738	T	6	6	4008	4013	0 %	100 %	0 %	0 %	313205517
89	NC_014738	AAT	2	6	4051	4056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313205517
90	NC_014738	ATTT	2	8	4225	4232	25 %	75 %	0 %	0 %	313205518
91	NC_014738	T	6	6	4275	4280	0 %	100 %	0 %	0 %	313205518
92	NC_014738	GAA	2	6	4290	4295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313205518
93	NC_014738	CAT	2	6	4415	4420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313205518
94	NC_014738	AGAA	2	8	4458	4465	75 %	0 %	25 %	0 %	313205518
95	NC_014738	ATT	2	6	4467	4472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313205518
96	NC_014738	GCT	2	6	4655	4660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313205518
97	NC_014738	AGA	2	6	4666	4671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313205518
98	NC_014738	CCT	2	6	4717	4722	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313205518
99	NC_014738	TAGAA	2	10	4752	4761	60 %	20 %	20 %	0 %	313205518
100	NC_014738	T	6	6	4775	4780	0 %	100 %	0 %	0 %	313205518
101	NC_014738	CTT	2	6	4811	4816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313205518
102	NC_014738	TG	3	6	4879	4884	0 %	50 %	50 %	0 %	313205518
103	NC_014738	GGA	2	6	4912	4917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313205518
104	NC_014738	TCA	2	6	4994	4999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313205518
105	NC_014738	ATT	2	6	5001	5006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313205518
106	NC_014738	ATTC	2	8	5124	5131	25 %	50 %	0 %	25 %	313205518
107	NC_014738	ATC	2	6	5178	5183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313205518
108	NC_014738	AT	3	6	5426	5431	50 %	50 %	0 %	0 %	313205518
109	NC_014738	AAG	2	6	5487	5492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313205518
110	NC_014738	TAA	2	6	5510	5515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313205518
111	NC_014738	GTC	2	6	5541	5546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313205518
112	NC_014738	TTC	2	6	5585	5590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313205518
113	NC_014738	ATT	2	6	5607	5612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313205518
114	NC_014738	TCA	2	6	5650	5655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313205518
115	NC_014738	ATA	2	6	5658	5663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313205518
116	NC_014738	TGT	2	6	5729	5734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313205518
117	NC_014738	ATTT	2	8	5828	5835	25 %	75 %	0 %	0 %	313205518
118	NC_014738	CTAGG	2	10	5852	5861	20 %	20 %	40 %	20 %	313205518
119	NC_014738	GAA	2	6	5923	5928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313205518
120	NC_014738	TGA	2	6	5981	5986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313205518
121	NC_014738	CTT	2	6	6122	6127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313205518
122	NC_014738	AG	3	6	6144	6149	50 %	0 %	50 %	0 %	313205518
123	NC_014738	GTC	2	6	6225	6230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313205518
124	NC_014738	T	8	8	6269	6276	0 %	100 %	0 %	0 %	313205518
125	NC_014738	TATAA	2	10	6363	6372	60 %	40 %	0 %	0 %	313205518
126	NC_014738	GATTAA	2	12	6395	6406	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	313205518
127	NC_014738	CTTC	2	8	6428	6435	0 %	50 %	0 %	50 %	313205518
128	NC_014738	TCT	2	6	6571	6576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313205518
129	NC_014738	ATCA	2	8	6609	6616	50 %	25 %	0 %	25 %	313205518
130	NC_014738	TAT	2	6	6647	6652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313205518
131	NC_014738	T	6	6	6699	6704	0 %	100 %	0 %	0 %	313205518
132	NC_014738	AT	3	6	6712	6717	50 %	50 %	0 %	0 %	313205518
133	NC_014738	AG	3	6	6783	6788	50 %	0 %	50 %	0 %	313205518
134	NC_014738	TTAC	2	8	6793	6800	25 %	50 %	0 %	25 %	313205518
135	NC_014738	A	6	6	6816	6821	100 %	0 %	0 %	0 %	313205518
136	NC_014738	TCTAAA	2	12	6850	6861	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	313205518
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398	NC_014738	GTC	2	6	17985	17990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313205530
399	NC_014738	TTA	2	6	18028	18033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313205530
400	NC_014738	ATTT	2	8	18074	18081	25 %	75 %	0 %	0 %	313205530
401	NC_014738	A	6	6	18113	18118	100 %	0 %	0 %	0 %	313205530
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