MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Riemerella anatipestifer ATCC 11845 = DSM 15868 chromosome

Total Repeats: 42218

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014738	AAG	2	6	22872	22877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313205535
502	NC_014738	TTA	2	6	22976	22981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313205535
503	NC_014738	GCA	2	6	23026	23031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313205535
504	NC_014738	CTAT	2	8	23033	23040	25 %	50 %	0 %	25 %	313205535
505	NC_014738	ATC	2	6	23065	23070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313205535
506	NC_014738	ATG	2	6	23158	23163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313205535
507	NC_014738	CGG	2	6	23204	23209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313205535
508	NC_014738	AAG	2	6	23249	23254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313205535
509	NC_014738	ATA	2	6	23282	23287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313205535
510	NC_014738	TAT	2	6	23358	23363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313205535
511	NC_014738	TAA	2	6	23370	23375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313205535
512	NC_014738	AGAA	2	8	23379	23386	75 %	0 %	25 %	0 %	313205535
513	NC_014738	ATT	2	6	23415	23420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313205535
514	NC_014738	TAA	2	6	23421	23426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313205535
515	NC_014738	ATG	2	6	23534	23539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313205535
516	NC_014738	ATGG	2	8	23571	23578	25 %	25 %	50 %	0 %	313205535
517	NC_014738	GA	3	6	23637	23642	50 %	0 %	50 %	0 %	313205535
518	NC_014738	ATTTC	2	10	23691	23700	20 %	60 %	0 %	20 %	313205535
519	NC_014738	TCTAAC	2	12	23743	23754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313205535
520	NC_014738	TAC	2	6	23763	23768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313205535
521	NC_014738	CAT	3	9	23783	23791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313205535
522	NC_014738	GAAC	2	8	23804	23811	50 %	0 %	25 %	25 %	313205535
523	NC_014738	GAAAA	2	10	23827	23836	80 %	0 %	20 %	0 %	313205535
524	NC_014738	ATT	2	6	23861	23866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313205535
525	NC_014738	A	6	6	23869	23874	100 %	0 %	0 %	0 %	313205535
526	NC_014738	GTG	2	6	23990	23995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313205535
527	NC_014738	TTA	2	6	24016	24021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313205535
528	NC_014738	TACTA	2	10	24028	24037	40 %	40 %	0 %	20 %	313205535
529	NC_014738	TACT	2	8	24064	24071	25 %	50 %	0 %	25 %	313205535
530	NC_014738	TTC	2	6	24096	24101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313205535
531	NC_014738	TAA	2	6	24114	24119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313205535
532	NC_014738	GAG	2	6	24215	24220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313205535
533	NC_014738	G	6	6	24224	24229	0 %	0 %	100 %	0 %	313205535
534	NC_014738	TA	3	6	24275	24280	50 %	50 %	0 %	0 %	313205535
535	NC_014738	AGAT	2	8	24417	24424	50 %	25 %	25 %	0 %	313205535
536	NC_014738	AGG	2	6	24489	24494	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313205535
537	NC_014738	AGC	2	6	24648	24653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313205535
538	NC_014738	GGT	2	6	24685	24690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313205535
539	NC_014738	GGT	2	6	24706	24711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313205535
540	NC_014738	TTCT	2	8	24747	24754	0 %	75 %	0 %	25 %	313205535
541	NC_014738	CAG	2	6	24763	24768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313205535
542	NC_014738	ATG	2	6	24773	24778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313205535
543	NC_014738	TAGA	2	8	24809	24816	50 %	25 %	25 %	0 %	313205535
544	NC_014738	AATGCT	2	12	24967	24978	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	313205535
545	NC_014738	ATT	2	6	25079	25084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313205535
546	NC_014738	AGA	2	6	25089	25094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313205535
547	NC_014738	ATA	2	6	25115	25120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313205535
548	NC_014738	GT	3	6	25271	25276	0 %	50 %	50 %	0 %	313205535
549	NC_014738	TTAA	2	8	25302	25309	50 %	50 %	0 %	0 %	313205535
550	NC_014738	AAT	2	6	25334	25339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313205536
551	NC_014738	GCT	2	6	25368	25373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313205536
552	NC_014738	TC	3	6	25387	25392	0 %	50 %	0 %	50 %	313205536
553	NC_014738	TAG	2	6	25427	25432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313205536
554	NC_014738	AAG	2	6	25522	25527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313205536
555	NC_014738	GTG	2	6	25528	25533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313205536
556	NC_014738	ACT	2	6	25576	25581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313205536
557	NC_014738	CTAC	2	8	25608	25615	25 %	25 %	0 %	50 %	313205536
558	NC_014738	GA	3	6	25637	25642	50 %	0 %	50 %	0 %	313205536
559	NC_014738	TAT	2	6	25707	25712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313205536
560	NC_014738	TTA	2	6	25747	25752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313205536
561	NC_014738	GAA	2	6	25806	25811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313205536
562	NC_014738	T	6	6	25838	25843	0 %	100 %	0 %	0 %	313205536
563	NC_014738	ATTT	2	8	25873	25880	25 %	75 %	0 %	0 %	313205536
564	NC_014738	CCT	2	6	25926	25931	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	313205536
565	NC_014738	GAAAG	2	10	25941	25950	60 %	0 %	40 %	0 %	313205536
566	NC_014738	ATT	2	6	25994	25999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313205536
567	NC_014738	GCT	2	6	26040	26045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313205536
568	NC_014738	TGC	2	6	26053	26058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313205536
569	NC_014738	A	6	6	26098	26103	100 %	0 %	0 %	0 %	313205536
570	NC_014738	AGC	2	6	26114	26119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313205536
571	NC_014738	T	7	7	26179	26185	0 %	100 %	0 %	0 %	313205536
572	NC_014738	ATA	2	6	26203	26208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313205536
573	NC_014738	GTA	2	6	26214	26219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313205536
574	NC_014738	ACA	2	6	26265	26270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313205536
575	NC_014738	TGC	2	6	26282	26287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313205536
576	NC_014738	AGG	2	6	26291	26296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313205536
577	NC_014738	GGT	2	6	26328	26333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313205536
578	NC_014738	GGA	2	6	26337	26342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313205536
579	NC_014738	CTA	2	6	26350	26355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313205536
580	NC_014738	TAG	2	6	26362	26367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313205536
581	NC_014738	CAT	2	6	26452	26457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313205536
582	NC_014738	ATAG	2	8	26493	26500	50 %	25 %	25 %	0 %	313205536
583	NC_014738	TACAGA	2	12	26537	26548	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	313205536
584	NC_014738	CTTAT	2	10	26575	26584	20 %	60 %	0 %	20 %	313205536
585	NC_014738	GAG	2	6	26605	26610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313205536
586	NC_014738	CTTA	2	8	26634	26641	25 %	50 %	0 %	25 %	313205536
587	NC_014738	TAAA	2	8	26644	26651	75 %	25 %	0 %	0 %	313205536
588	NC_014738	AG	3	6	26736	26741	50 %	0 %	50 %	0 %	313205536
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591	NC_014738	GGT	2	6	26835	26840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313205536
592	NC_014738	ATA	2	6	26889	26894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313205536
593	NC_014738	GAA	2	6	27014	27019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313205537
594	NC_014738	CTTT	2	8	27048	27055	0 %	75 %	0 %	25 %	313205537
595	NC_014738	TAT	2	6	27135	27140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313205537
596	NC_014738	AG	3	6	27239	27244	50 %	0 %	50 %	0 %	313205537
597	NC_014738	AGAT	2	8	27271	27278	50 %	25 %	25 %	0 %	313205537
598	NC_014738	A	6	6	27280	27285	100 %	0 %	0 %	0 %	313205537
599	NC_014738	A	7	7	27325	27331	100 %	0 %	0 %	0 %	313205537
600	NC_014738	AGAATA	2	12	27385	27396	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	313205537
601	NC_014738	GTT	2	6	27399	27404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313205537
602	NC_014738	CAA	2	6	27453	27458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313205537
603	NC_014738	AGA	2	6	27485	27490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313205537
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607	NC_014738	ATT	2	6	27852	27857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313205537
608	NC_014738	CTT	2	6	27934	27939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313205537
609	NC_014738	CTA	2	6	27949	27954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313205537
610	NC_014738	AT	3	6	27956	27961	50 %	50 %	0 %	0 %	313205537
611	NC_014738	TGG	2	6	27969	27974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313205537
612	NC_014738	GCT	2	6	28074	28079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313205537
613	NC_014738	A	6	6	28094	28099	100 %	0 %	0 %	0 %	313205537
614	NC_014738	TA	3	6	28101	28106	50 %	50 %	0 %	0 %	313205537
615	NC_014738	TTGG	2	8	28159	28166	0 %	50 %	50 %	0 %	313205537
616	NC_014738	A	6	6	28260	28265	100 %	0 %	0 %	0 %	313205537
617	NC_014738	ATG	2	6	28278	28283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313205537
618	NC_014738	AGC	2	6	28301	28306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313205537
619	NC_014738	AACT	2	8	28307	28314	50 %	25 %	0 %	25 %	313205537
620	NC_014738	AATA	2	8	28350	28357	75 %	25 %	0 %	0 %	313205537
621	NC_014738	CTG	2	6	28366	28371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313205537
622	NC_014738	ATT	2	6	28395	28400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313205537
623	NC_014738	CAT	2	6	28413	28418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313205537
624	NC_014738	GAT	2	6	28430	28435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313205537
625	NC_014738	AGC	2	6	28544	28549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313205537
626	NC_014738	GCT	2	6	28554	28559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313205537
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