MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Riemerella anatipestifer ATCC 11845 = DSM 15868 chromosome

Total Repeats: 42218

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_014738	AAT	2	6	253503	253508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313205731
5002	NC_014738	TGA	2	6	253621	253626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313205731
5003	NC_014738	ACA	2	6	253675	253680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313205731
5004	NC_014738	ACC	2	6	253735	253740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313205731
5005	NC_014738	TTA	2	6	253750	253755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313205731
5006	NC_014738	TAA	2	6	253761	253766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313205731
5007	NC_014738	AGA	2	6	253782	253787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313205731
5008	NC_014738	ACT	3	9	253912	253920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313205731
5009	NC_014738	GTT	2	6	253996	254001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313205731
5010	NC_014738	ATATTG	2	12	254220	254231	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	313205731
5011	NC_014738	ACT	2	6	254308	254313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313205731
5012	NC_014738	TCT	2	6	254374	254379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313205731
5013	NC_014738	TAA	2	6	254384	254389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313205731
5014	NC_014738	CT	3	6	254399	254404	0 %	50 %	0 %	50 %	313205731
5015	NC_014738	T	6	6	254451	254456	0 %	100 %	0 %	0 %	313205731
5016	NC_014738	AT	3	6	254507	254512	50 %	50 %	0 %	0 %	313205731
5017	NC_014738	TAT	2	6	254558	254563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313205731
5018	NC_014738	CATT	2	8	254584	254591	25 %	50 %	0 %	25 %	313205731
5019	NC_014738	CTT	2	6	254603	254608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313205731
5020	NC_014738	GTC	2	6	254735	254740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313205731
5021	NC_014738	T	6	6	254772	254777	0 %	100 %	0 %	0 %	313205731
5022	NC_014738	T	6	6	254837	254842	0 %	100 %	0 %	0 %	313205731
5023	NC_014738	A	6	6	254866	254871	100 %	0 %	0 %	0 %	313205731
5024	NC_014738	CCA	3	9	254872	254880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313205731
5025	NC_014738	CCTG	2	8	254890	254897	0 %	25 %	25 %	50 %	313205731
5026	NC_014738	AGC	2	6	254934	254939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	313205731
5027	NC_014738	ACC	2	6	255007	255012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313205731
5028	NC_014738	CTT	2	6	255035	255040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313205731
5029	NC_014738	TAC	2	6	255096	255101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313205731
5030	NC_014738	AT	3	6	255118	255123	50 %	50 %	0 %	0 %	313205731
5031	NC_014738	T	7	7	255288	255294	0 %	100 %	0 %	0 %	313205732
5032	NC_014738	T	6	6	255324	255329	0 %	100 %	0 %	0 %	313205732
5033	NC_014738	TCT	2	6	255361	255366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313205732
5034	NC_014738	CTT	2	6	255449	255454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313205732
5035	NC_014738	T	6	6	255453	255458	0 %	100 %	0 %	0 %	313205732
5036	NC_014738	TCA	2	6	255542	255547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313205732
5037	NC_014738	TGT	2	6	255556	255561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313205732
5038	NC_014738	ATA	2	6	255603	255608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313205732
5039	NC_014738	T	7	7	255681	255687	0 %	100 %	0 %	0 %	313205732
5040	NC_014738	TAT	2	6	255708	255713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313205732
5041	NC_014738	T	6	6	255713	255718	0 %	100 %	0 %	0 %	313205732
5042	NC_014738	T	6	6	255745	255750	0 %	100 %	0 %	0 %	313205732
5043	NC_014738	AAG	2	6	255932	255937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313205732
5044	NC_014738	TAA	2	6	255939	255944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313205732
5045	NC_014738	ATT	2	6	255958	255963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313205732
5046	NC_014738	AAT	2	6	256045	256050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313205733
5047	NC_014738	TTTC	2	8	256060	256067	0 %	75 %	0 %	25 %	313205733
5048	NC_014738	AAAC	2	8	256201	256208	75 %	0 %	0 %	25 %	313205733
5049	NC_014738	GAT	2	6	256241	256246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313205733
5050	NC_014738	TTTAC	2	10	256300	256309	20 %	60 %	0 %	20 %	313205733
5051	NC_014738	TCA	2	6	256456	256461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313205733
5052	NC_014738	TCA	2	6	256492	256497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313205733
5053	NC_014738	CCA	2	6	256517	256522	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313205733
5054	NC_014738	TTTC	2	8	256675	256682	0 %	75 %	0 %	25 %	313205734
5055	NC_014738	TTC	2	6	256691	256696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313205734
5056	NC_014738	TTTTTA	2	12	256767	256778	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	313205734
5057	NC_014738	TCA	2	6	256938	256943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313205734
5058	NC_014738	T	8	8	257006	257013	0 %	100 %	0 %	0 %	313205734
5059	NC_014738	AGG	2	6	257024	257029	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	313205734
5060	NC_014738	AATC	2	8	257042	257049	50 %	25 %	0 %	25 %	313205734
5061	NC_014738	TTG	2	6	257222	257227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313205734
5062	NC_014738	TCACC	2	10	257230	257239	20 %	20 %	0 %	60 %	313205734
5063	NC_014738	CAT	2	6	257276	257281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313205734
5064	NC_014738	CTT	2	6	257293	257298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313205734
5065	NC_014738	ATT	2	6	257301	257306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313205734
5066	NC_014738	CTG	2	6	257344	257349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313205734
5067	NC_014738	TA	3	6	257355	257360	50 %	50 %	0 %	0 %	313205734
5068	NC_014738	T	6	6	257366	257371	0 %	100 %	0 %	0 %	313205734
5069	NC_014738	AAC	2	6	257423	257428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	313205735
5070	NC_014738	TAA	2	6	257435	257440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313205735
5071	NC_014738	TTTTCT	2	12	257462	257473	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	313205735
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5073	NC_014738	ATA	2	6	257542	257547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313205735
5074	NC_014738	TGC	2	6	257550	257555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	313205735
5075	NC_014738	AATAAG	2	12	257597	257608	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	313205735
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5079	NC_014738	TCT	2	6	257761	257766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313205736
5080	NC_014738	CTT	2	6	257775	257780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313205736
5081	NC_014738	AAT	2	6	257823	257828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313205736
5082	NC_014738	TCA	2	6	257869	257874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313205736
5083	NC_014738	TTG	2	6	257904	257909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313205736
5084	NC_014738	GTT	2	6	258049	258054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313205736
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5087	NC_014738	AAT	2	6	258102	258107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313205736
5088	NC_014738	ATT	2	6	258120	258125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313205736
5089	NC_014738	GCG	2	6	258148	258153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	313205736
5090	NC_014738	TAC	2	6	258155	258160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313205736
5091	NC_014738	CGC	2	6	258161	258166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313205736
5092	NC_014738	CA	3	6	258168	258173	50 %	0 %	0 %	50 %	313205736
5093	NC_014738	GGT	2	6	258182	258187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313205736
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5095	NC_014738	TATAA	2	10	258300	258309	60 %	40 %	0 %	0 %	313205736
5096	NC_014738	GGT	2	6	258312	258317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313205736
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5101	NC_014738	TCT	2	6	258628	258633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313205736
5102	NC_014738	CT	3	6	258632	258637	0 %	50 %	0 %	50 %	313205736
5103	NC_014738	AGAT	2	8	258640	258647	50 %	25 %	25 %	0 %	313205736
5104	NC_014738	T	6	6	258712	258717	0 %	100 %	0 %	0 %	313205736
5105	NC_014738	CTT	2	6	258845	258850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313205736
5106	NC_014738	TCTATT	2	12	258878	258889	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	313205737
5107	NC_014738	TAA	2	6	258914	258919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	313205737
5108	NC_014738	TTA	2	6	258931	258936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	313205737
5109	NC_014738	CCG	2	6	259027	259032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	313205737
5110	NC_014738	A	6	6	259036	259041	100 %	0 %	0 %	0 %	313205737
5111	NC_014738	T	6	6	259316	259321	0 %	100 %	0 %	0 %	313205737
5112	NC_014738	GGT	2	6	259323	259328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	313205737
5113	NC_014738	AGCGA	2	10	259366	259375	40 %	0 %	40 %	20 %	313205737
5114	NC_014738	TTTTA	2	10	259500	259509	20 %	80 %	0 %	0 %	313205737
5115	NC_014738	T	6	6	259523	259528	0 %	100 %	0 %	0 %	313205737
5116	NC_014738	TTC	2	6	259536	259541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	313205738
5117	NC_014738	A	6	6	259600	259605	100 %	0 %	0 %	0 %	313205738
5118	NC_014738	T	6	6	259621	259626	0 %	100 %	0 %	0 %	313205738
5119	NC_014738	T	6	6	259629	259634	0 %	100 %	0 %	0 %	313205738
5120	NC_014738	GTT	2	6	259749	259754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	313205738
5121	NC_014738	CAC	2	6	259799	259804	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	313205738
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5123	NC_014738	ATC	2	6	259941	259946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313205738
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5243	NC_014738	A	7	7	266014	266020	100 %	0 %	0 %	0 %	313205743
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5496	NC_014738	AT	3	6	278477	278482	50 %	50 %	0 %	0 %	313205755
5497	NC_014738	ATG	2	6	278503	278508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	313205755
5498	NC_014738	AATG	2	8	278512	278519	50 %	25 %	25 %	0 %	313205755
5499	NC_014738	TCA	2	6	278729	278734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	313205755
5500	NC_014738	AAG	2	6	278970	278975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	313205755

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