MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Rhodomicrobium vannielii ATCC 17100 chromosome

Total Repeats: 57288

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014664	CGA	2	6	73	78	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112795
2	NC_014664	GCC	2	6	100	105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112795
3	NC_014664	TTG	2	6	281	286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312112795
4	NC_014664	GTT	2	6	302	307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312112795
5	NC_014664	CCT	2	6	310	315	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312112795
6	NC_014664	GGA	2	6	468	473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312112795
7	NC_014664	GCC	2	6	607	612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112795
8	NC_014664	GGC	2	6	1035	1040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112796
9	NC_014664	GCC	2	6	1050	1055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112796
10	NC_014664	GTG	2	6	1130	1135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312112796
11	NC_014664	ATT	2	6	1182	1187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312112796
12	NC_014664	GCT	2	6	1195	1200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112796
13	NC_014664	CTG	2	6	1204	1209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112796
14	NC_014664	GAA	2	6	1279	1284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312112796
15	NC_014664	ACC	2	6	1334	1339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312112796
16	NC_014664	TCC	2	6	1343	1348	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312112796
17	NC_014664	TCA	2	6	1365	1370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312112796
18	NC_014664	CGC	2	6	1419	1424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112796
19	NC_014664	TCG	3	9	1452	1460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112796
20	NC_014664	CGC	2	6	1483	1488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112796
21	NC_014664	CCG	2	6	1644	1649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112796
22	NC_014664	CCT	2	6	1729	1734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312112796
23	NC_014664	CAT	2	6	1735	1740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312112796
24	NC_014664	CGA	2	6	1741	1746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112796
25	NC_014664	CAG	2	6	1775	1780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112796
26	NC_014664	CGG	2	6	1813	1818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112796
27	NC_014664	GGT	2	6	1825	1830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312112796
28	NC_014664	CGG	2	6	1836	1841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112796
29	NC_014664	TGC	2	6	1854	1859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112796
30	NC_014664	CGG	2	6	1897	1902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112796
31	NC_014664	TCG	2	6	1905	1910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112796
32	NC_014664	CGA	2	6	2182	2187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112796
33	NC_014664	TCG	2	6	2199	2204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112796
34	NC_014664	CTG	2	6	2234	2239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112796
35	NC_014664	GCC	2	6	2244	2249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112796
36	NC_014664	CGT	2	6	2333	2338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112796
37	NC_014664	TGC	2	6	2364	2369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112796
38	NC_014664	TGT	2	6	2569	2574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312112797
39	NC_014664	TCG	2	6	2619	2624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112797
40	NC_014664	GCG	2	6	2626	2631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112797
41	NC_014664	GAG	2	6	2843	2848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312112797
42	NC_014664	CCG	2	6	2901	2906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112797
43	NC_014664	GCG	2	6	2961	2966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112797
44	NC_014664	CAA	2	6	3327	3332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312112797
45	NC_014664	AAG	2	6	3338	3343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312112797
46	NC_014664	CTC	2	6	3400	3405	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312112797
47	NC_014664	TCG	2	6	3450	3455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112797
48	NC_014664	GAG	2	6	3491	3496	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312112797
49	NC_014664	CTC	2	6	3610	3615	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312112797
50	NC_014664	GCT	2	6	4312	4317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112798
51	NC_014664	GGC	2	6	4379	4384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112798
52	NC_014664	GCG	2	6	4478	4483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112798
53	NC_014664	GCC	2	6	4599	4604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112798
54	NC_014664	GCC	2	6	4652	4657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112798
55	NC_014664	CAA	2	6	4687	4692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312112798
56	NC_014664	CGC	2	6	4713	4718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112798
57	NC_014664	GCC	2	6	4754	4759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112798
58	NC_014664	GCG	2	6	4793	4798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112798
59	NC_014664	GCG	2	6	4856	4861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112798
60	NC_014664	GGA	2	6	4882	4887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312112798
61	NC_014664	GGC	2	6	4891	4896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112798
62	NC_014664	CGA	2	6	4921	4926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112798
63	NC_014664	GCT	2	6	5083	5088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112798
64	NC_014664	TCA	2	6	5118	5123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312112798
65	NC_014664	CGC	2	6	5170	5175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112798
66	NC_014664	GCC	2	6	5190	5195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112798
67	NC_014664	GTT	2	6	5306	5311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312112798
68	NC_014664	ATG	2	6	5337	5342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312112798
69	NC_014664	AGC	2	6	5420	5425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112799
70	NC_014664	GAC	2	6	5532	5537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112799
71	NC_014664	CCA	2	6	5549	5554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312112799
72	NC_014664	GGT	2	6	5567	5572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312112799
73	NC_014664	CGA	2	6	5585	5590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112799
74	NC_014664	CCG	3	9	5707	5715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112799
75	NC_014664	TCA	2	6	5719	5724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312112799
76	NC_014664	GGT	2	6	5804	5809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312112799
77	NC_014664	TCG	2	6	5908	5913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112799
78	NC_014664	TGG	2	6	5977	5982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312112799
79	NC_014664	GCG	2	6	6067	6072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112799
80	NC_014664	GGC	2	6	6105	6110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112799
81	NC_014664	TGG	2	6	6216	6221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312112799
82	NC_014664	ACG	2	6	6223	6228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112799
83	NC_014664	AAC	2	6	6258	6263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312112799
84	NC_014664	CGC	2	6	6335	6340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112799
85	NC_014664	CGA	2	6	6383	6388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112799
86	NC_014664	CCG	2	6	6487	6492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112799
87	NC_014664	CAT	2	6	6500	6505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312112799
88	NC_014664	GAG	2	6	6531	6536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312112799
89	NC_014664	GCG	4	12	6579	6590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112799
90	NC_014664	GGC	2	6	6596	6601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112799
91	NC_014664	CGC	2	6	6624	6629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112799
92	NC_014664	TCG	2	6	6712	6717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112799
93	NC_014664	TGC	2	6	6775	6780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112799
94	NC_014664	TCA	2	6	6856	6861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312112799
95	NC_014664	CGA	2	6	6887	6892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112799
96	NC_014664	CAT	2	6	6923	6928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312112799
97	NC_014664	TTC	2	6	6984	6989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312112799
98	NC_014664	GCC	2	6	7040	7045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112799
99	NC_014664	CGG	2	6	7121	7126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112799
100	NC_014664	GCC	2	6	7269	7274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112799
101	NC_014664	CCT	2	6	7283	7288	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312112799
102	NC_014664	GAC	2	6	7308	7313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112799
103	NC_014664	GAG	3	9	7314	7322	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312112799
104	NC_014664	GGC	2	6	7327	7332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112799
105	NC_014664	GGT	2	6	7343	7348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312112799
106	NC_014664	GAG	2	6	7371	7376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312112799
107	NC_014664	ACC	2	6	7513	7518	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312112799
108	NC_014664	AGC	2	6	7678	7683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112799
109	NC_014664	GAC	2	6	7691	7696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112799
110	NC_014664	TGG	2	6	7786	7791	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312112799
111	NC_014664	CAG	2	6	7812	7817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112799
112	NC_014664	TCT	2	6	8202	8207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312112800
113	NC_014664	GCC	2	6	8221	8226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112800
114	NC_014664	GCC	2	6	8263	8268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112800
115	NC_014664	GCC	2	6	8301	8306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112800
116	NC_014664	GCG	2	6	8410	8415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112800
117	NC_014664	CAG	2	6	8930	8935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112801
118	NC_014664	CGC	2	6	8951	8956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112801
119	NC_014664	TTC	2	6	8961	8966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312112801
120	NC_014664	CCG	2	6	8989	8994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112801
121	NC_014664	CAG	2	6	9029	9034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112801
122	NC_014664	CGC	2	6	9055	9060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112801
123	NC_014664	ATC	2	6	9093	9098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312112801
124	NC_014664	CCG	2	6	9147	9152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112801
125	NC_014664	TCA	2	6	9169	9174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312112801
126	NC_014664	TGA	2	6	9319	9324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312112801
127	NC_014664	ATC	2	6	9375	9380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312112801
128	NC_014664	AGC	2	6	9393	9398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112801
129	NC_014664	TTC	2	6	9399	9404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312112801
130	NC_014664	CCA	2	6	9424	9429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312112801
131	NC_014664	TCG	2	6	9504	9509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112801
132	NC_014664	CTT	2	6	9520	9525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312112801
133	NC_014664	CGG	2	6	9663	9668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112802
134	NC_014664	GCT	2	6	9789	9794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112802
135	NC_014664	GGC	2	6	9795	9800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112802
136	NC_014664	ATA	2	6	9847	9852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312112802
137	NC_014664	GAA	2	6	9961	9966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312112802
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140	NC_014664	CTT	2	6	10132	10137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312112802
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248	NC_014664	ATC	2	6	17361	17366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312112808
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250	NC_014664	CTT	2	6	17432	17437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312112808
251	NC_014664	GGC	2	6	17617	17622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112808
252	NC_014664	ATG	2	6	17652	17657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312112808
253	NC_014664	CGT	2	6	17669	17674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112808
254	NC_014664	CGC	2	6	17702	17707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112808
255	NC_014664	CAT	2	6	17857	17862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312112809
256	NC_014664	CTG	2	6	17911	17916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112809
257	NC_014664	AGC	2	6	17928	17933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112809
258	NC_014664	CGT	2	6	17968	17973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112809
259	NC_014664	GCC	2	6	17991	17996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112809
260	NC_014664	CGC	2	6	18020	18025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112809
261	NC_014664	GGC	2	6	18127	18132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112809
262	NC_014664	GCC	2	6	18216	18221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112809
263	NC_014664	CGC	2	6	18277	18282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112809
264	NC_014664	AAG	2	6	18287	18292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312112809
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266	NC_014664	ACG	2	6	18332	18337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112809
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269	NC_014664	TCG	2	6	18483	18488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112809
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271	NC_014664	TCG	2	6	18630	18635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112809
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275	NC_014664	CGC	2	6	19180	19185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112810
276	NC_014664	CGA	2	6	19186	19191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112810
277	NC_014664	CGC	2	6	19222	19227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112810
278	NC_014664	CGC	2	6	19240	19245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112810
279	NC_014664	GCG	2	6	19394	19399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112810
280	NC_014664	CGC	2	6	19510	19515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112810
281	NC_014664	TGC	2	6	19518	19523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112810
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283	NC_014664	GCG	2	6	19757	19762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112810
284	NC_014664	GCG	2	6	19772	19777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112810
285	NC_014664	GGC	2	6	19829	19834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112810
286	NC_014664	CGG	2	6	19876	19881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112810
287	NC_014664	GGC	2	6	20032	20037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112810
288	NC_014664	TGC	2	6	20219	20224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112811
289	NC_014664	GCT	2	6	20262	20267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112811
290	NC_014664	GCC	2	6	20333	20338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112811
291	NC_014664	CTC	2	6	20347	20352	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312112811
292	NC_014664	GCG	2	6	20411	20416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112811
293	NC_014664	CGA	2	6	20466	20471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112811
294	NC_014664	GCC	2	6	20933	20938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112811
295	NC_014664	TCG	2	6	20939	20944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112811
296	NC_014664	TGG	2	6	20945	20950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312112811
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302	NC_014664	CGA	2	6	21424	21429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112812
303	NC_014664	ACT	2	6	21457	21462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312112812
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311	NC_014664	CGC	2	6	22055	22060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112812
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360	NC_014664	GAT	2	6	25627	25632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312112815
361	NC_014664	CGA	2	6	25657	25662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112815
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370	NC_014664	GGC	2	6	26333	26338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112816
371	NC_014664	AGT	2	6	26341	26346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312112816
372	NC_014664	TGA	2	6	26392	26397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312112816
373	NC_014664	TGA	2	6	26428	26433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312112816
374	NC_014664	CTG	2	6	26489	26494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112816
375	NC_014664	GCA	2	6	26509	26514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112816
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377	NC_014664	GCC	2	6	26664	26669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112816
378	NC_014664	TCG	2	6	26670	26675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112816
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500	NC_014664	CGG	2	6	36489	36494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112824

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