MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodomicrobium vannielii ATCC 17100 chromosome

Total Repeats: 83208

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_014664	CCG	2	6	159907	159912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112926
3502	NC_014664	GCG	2	6	159927	159932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112926
3503	NC_014664	CGG	2	6	159965	159970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112926
3504	NC_014664	GCG	2	6	160016	160021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112926
3505	NC_014664	AGCCG	2	10	160022	160031	20 %	0 %	40 %	40 %	312112926
3506	NC_014664	GAAGCG	2	12	160080	160091	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	312112926
3507	NC_014664	CGC	2	6	160098	160103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112926
3508	NC_014664	CGC	2	6	160106	160111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112926
3509	NC_014664	TCG	2	6	160161	160166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112927
3510	NC_014664	CGC	2	6	160177	160182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112927
3511	NC_014664	GC	3	6	160239	160244	0 %	0 %	50 %	50 %	312112927
3512	NC_014664	GCG	3	9	160262	160270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112927
3513	NC_014664	GCGCG	2	10	160377	160386	0 %	0 %	60 %	40 %	312112927
3514	NC_014664	GGGCGG	2	12	160401	160412	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	312112927
3515	NC_014664	CGC	2	6	160425	160430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112927
3516	NC_014664	TGC	2	6	160461	160466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112927
3517	NC_014664	CCG	2	6	160475	160480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112927
3518	NC_014664	TAT	2	6	160496	160501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312112927
3519	NC_014664	GCGG	2	8	160511	160518	0 %	0 %	75 %	25 %	312112927
3520	NC_014664	GC	3	6	160561	160566	0 %	0 %	50 %	50 %	312112927
3521	NC_014664	CG	3	6	160589	160594	0 %	0 %	50 %	50 %	312112927
3522	NC_014664	CGGG	2	8	160598	160605	0 %	0 %	75 %	25 %	312112927
3523	NC_014664	CAT	2	6	160693	160698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312112927
3524	NC_014664	ATT	2	6	160716	160721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312112927
3525	NC_014664	GCT	2	6	160744	160749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112927
3526	NC_014664	CGG	2	6	160750	160755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112927
3527	NC_014664	CG	3	6	160820	160825	0 %	0 %	50 %	50 %	312112927
3528	NC_014664	GC	3	6	160863	160868	0 %	0 %	50 %	50 %	312112927
3529	NC_014664	CCA	2	6	160877	160882	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312112927
3530	NC_014664	TCC	2	6	160896	160901	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312112927
3531	NC_014664	GAC	2	6	160918	160923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112927
3532	NC_014664	GGC	2	6	160925	160930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112927
3533	NC_014664	CGG	2	6	160968	160973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112927
3534	NC_014664	GGC	2	6	160977	160982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112927
3535	NC_014664	GGTC	2	8	161014	161021	0 %	25 %	50 %	25 %	312112927
3536	NC_014664	AGC	2	6	161035	161040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112927
3537	NC_014664	CGC	2	6	161065	161070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112927
3538	NC_014664	GC	3	6	161103	161108	0 %	0 %	50 %	50 %	312112927
3539	NC_014664	CCG	2	6	161112	161117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112927
3540	NC_014664	CGG	2	6	161143	161148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112927
3541	NC_014664	CGG	2	6	161154	161159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112927
3542	NC_014664	GCG	2	6	161166	161171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112927
3543	NC_014664	ATC	2	6	161236	161241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312112928
3544	NC_014664	CG	3	6	161276	161281	0 %	0 %	50 %	50 %	312112928
3545	NC_014664	AGA	2	6	161282	161287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312112928
3546	NC_014664	TGC	2	6	161288	161293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112928
3547	NC_014664	AGC	2	6	161344	161349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112928
3548	NC_014664	AGCG	2	8	161425	161432	25 %	0 %	50 %	25 %	312112928
3549	NC_014664	AGC	2	6	161458	161463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112928
3550	NC_014664	CG	3	6	161529	161534	0 %	0 %	50 %	50 %	312112928
3551	NC_014664	AT	3	6	161542	161547	50 %	50 %	0 %	0 %	312112928
3552	NC_014664	AGA	2	6	161573	161578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312112928
3553	NC_014664	GA	3	6	161584	161589	50 %	0 %	50 %	0 %	312112928
3554	NC_014664	GCA	2	6	161657	161662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112928
3555	NC_014664	TTC	3	9	161676	161684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312112928
3556	NC_014664	TTC	2	6	161694	161699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312112928
3557	NC_014664	GCC	2	6	161783	161788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112928
3558	NC_014664	CGC	2	6	161809	161814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112928
3559	NC_014664	GTG	2	6	161815	161820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312112928
3560	NC_014664	GCC	2	6	161826	161831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112928
3561	NC_014664	GAT	2	6	161856	161861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312112928
3562	NC_014664	CGC	2	6	161876	161881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112928
3563	NC_014664	GGC	2	6	161943	161948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112928
3564	NC_014664	ACC	2	6	161965	161970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312112928
3565	NC_014664	CCG	2	6	161974	161979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112928
3566	NC_014664	GCCA	2	8	161990	161997	25 %	0 %	25 %	50 %	312112928
3567	NC_014664	GTT	2	6	162035	162040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312112928
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3569	NC_014664	AGA	2	6	162181	162186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312112929
3570	NC_014664	TCG	2	6	162220	162225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112929
3571	NC_014664	CGC	3	9	162302	162310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112929
3572	NC_014664	CCG	2	6	162410	162415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112929
3573	NC_014664	GCT	2	6	162530	162535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112929
3574	NC_014664	CTCG	2	8	162551	162558	0 %	25 %	25 %	50 %	312112929
3575	NC_014664	TCTT	2	8	162576	162583	0 %	75 %	0 %	25 %	312112929
3576	NC_014664	CGA	2	6	162617	162622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112929
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3578	NC_014664	CGG	2	6	162679	162684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112929
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3580	NC_014664	CG	3	6	162703	162708	0 %	0 %	50 %	50 %	312112929
3581	NC_014664	GAT	2	6	162710	162715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312112929
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3585	NC_014664	CCG	2	6	162817	162822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112929
3586	NC_014664	GGC	2	6	162861	162866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112929
3587	NC_014664	GTCG	2	8	162875	162882	0 %	25 %	50 %	25 %	312112929
3588	NC_014664	GC	3	6	162979	162984	0 %	0 %	50 %	50 %	312112929
3589	NC_014664	GC	3	6	163032	163037	0 %	0 %	50 %	50 %	312112929
3590	NC_014664	TCG	2	6	163063	163068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112929
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3592	NC_014664	TGG	2	6	163153	163158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312112929
3593	NC_014664	GCCTCG	2	12	163168	163179	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	312112929
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3597	NC_014664	TGC	2	6	163303	163308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112929
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3601	NC_014664	CGC	2	6	163494	163499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112930
3602	NC_014664	CG	3	6	163504	163509	0 %	0 %	50 %	50 %	312112930
3603	NC_014664	CCT	2	6	163538	163543	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312112930
3604	NC_014664	TCA	2	6	163544	163549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312112930
3605	NC_014664	CCG	2	6	163595	163600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112930
3606	NC_014664	GAC	2	6	163629	163634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112930
3607	NC_014664	GCG	2	6	163645	163650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112930
3608	NC_014664	GC	3	6	163724	163729	0 %	0 %	50 %	50 %	312112930
3609	NC_014664	CG	3	6	163742	163747	0 %	0 %	50 %	50 %	312112930
3610	NC_014664	CCA	2	6	163748	163753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312112930
3611	NC_014664	GCC	3	9	163779	163787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112930
3612	NC_014664	AAG	2	6	163800	163805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312112930
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3614	NC_014664	GAG	2	6	163863	163868	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312112930
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3616	NC_014664	GC	3	6	163973	163978	0 %	0 %	50 %	50 %	312112930
3617	NC_014664	GCG	2	6	164056	164061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112930
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3619	NC_014664	CG	3	6	164137	164142	0 %	0 %	50 %	50 %	312112930
3620	NC_014664	ACG	2	6	164152	164157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112930
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3622	NC_014664	GCA	2	6	164285	164290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112930
3623	NC_014664	GCG	2	6	164301	164306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112930
3624	NC_014664	CGA	2	6	164311	164316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112930
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3866	NC_014664	GAA	2	6	175239	175244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312112935
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3984	NC_014664	AGGC	2	8	181169	181176	25 %	0 %	50 %	25 %	312112939
3985	NC_014664	CGA	2	6	181216	181221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112939
3986	NC_014664	GCG	2	6	181347	181352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112939
3987	NC_014664	GCA	2	6	181353	181358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112939
3988	NC_014664	GAA	2	6	181378	181383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312112939
3989	NC_014664	GCG	2	6	181468	181473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112939
3990	NC_014664	GGC	3	9	181531	181539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112939
3991	NC_014664	CAT	2	6	181544	181549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312112939
3992	NC_014664	GCA	2	6	181579	181584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112939
3993	NC_014664	CGC	2	6	181597	181602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112939
3994	NC_014664	CG	3	6	181647	181652	0 %	0 %	50 %	50 %	312112939
3995	NC_014664	GC	3	6	181681	181686	0 %	0 %	50 %	50 %	312112939
3996	NC_014664	TG	3	6	181712	181717	0 %	50 %	50 %	0 %	312112939
3997	NC_014664	GAA	2	6	181724	181729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312112939
3998	NC_014664	CTG	2	6	181946	181951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112940
3999	NC_014664	GCG	2	6	181972	181977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112940
4000	NC_014664	CTT	2	6	181979	181984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312112940

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