MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodomicrobium vannielii ATCC 17100 chromosome

Total Repeats: 83208

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_014664	TCG	2	6	137479	137484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112909
3003	NC_014664	TCG	2	6	137564	137569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112909
3004	NC_014664	GC	4	8	137587	137594	0 %	0 %	50 %	50 %	312112909
3005	NC_014664	AGGG	2	8	137663	137670	25 %	0 %	75 %	0 %	312112909
3006	NC_014664	CAG	2	6	137687	137692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112909
3007	NC_014664	AGCGC	2	10	137776	137785	20 %	0 %	40 %	40 %	312112909
3008	NC_014664	GCA	2	6	137814	137819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112909
3009	NC_014664	GAA	2	6	137826	137831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312112909
3010	NC_014664	CGG	2	6	137837	137842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112909
3011	NC_014664	AAG	2	6	137865	137870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312112909
3012	NC_014664	GAC	2	6	137883	137888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112909
3013	NC_014664	AGGC	2	8	137985	137992	25 %	0 %	50 %	25 %	312112909
3014	NC_014664	CCA	2	6	137996	138001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312112909
3015	NC_014664	AGG	2	6	138019	138024	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312112909
3016	NC_014664	CTT	2	6	138080	138085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312112910
3017	NC_014664	GAT	2	6	138203	138208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312112910
3018	NC_014664	GAG	2	6	138219	138224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312112910
3019	NC_014664	AGC	3	9	138315	138323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112910
3020	NC_014664	GCG	2	6	138324	138329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112910
3021	NC_014664	CGG	2	6	138412	138417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112910
3022	NC_014664	GGC	2	6	138445	138450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112910
3023	NC_014664	CGA	2	6	138457	138462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112910
3024	NC_014664	CCTT	2	8	138480	138487	0 %	50 %	0 %	50 %	312112910
3025	NC_014664	TCG	2	6	138496	138501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112910
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3027	NC_014664	CGG	2	6	138610	138615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112910
3028	NC_014664	CGG	2	6	138628	138633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112910
3029	NC_014664	GCT	2	6	138649	138654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112910
3030	NC_014664	GCG	2	6	138672	138677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112910
3031	NC_014664	CGG	2	6	138718	138723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112910
3032	NC_014664	TTC	2	6	138741	138746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312112910
3033	NC_014664	CGG	2	6	138754	138759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112910
3034	NC_014664	GTTTC	2	10	138775	138784	0 %	60 %	20 %	20 %	312112910
3035	NC_014664	GA	3	6	138819	138824	50 %	0 %	50 %	0 %	312112910
3036	NC_014664	GCG	2	6	138828	138833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112910
3037	NC_014664	CGG	2	6	139313	139318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112911
3038	NC_014664	GC	3	6	139366	139371	0 %	0 %	50 %	50 %	312112911
3039	NC_014664	AGG	2	6	139396	139401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312112911
3040	NC_014664	CGA	2	6	139403	139408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112911
3041	NC_014664	CAT	2	6	139418	139423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312112911
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3043	NC_014664	CGC	2	6	139475	139480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112911
3044	NC_014664	GC	4	8	139479	139486	0 %	0 %	50 %	50 %	312112911
3045	NC_014664	TCA	2	6	139528	139533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312112911
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3047	NC_014664	GCATC	2	10	139586	139595	20 %	20 %	20 %	40 %	312112911
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3050	NC_014664	CGA	2	6	139628	139633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112911
3051	NC_014664	CCGA	2	8	139749	139756	25 %	0 %	25 %	50 %	312112911
3052	NC_014664	GCG	2	6	139763	139768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112911
3053	NC_014664	CTC	2	6	139803	139808	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312112911
3054	NC_014664	GCT	2	6	139856	139861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112911
3055	NC_014664	TGC	2	6	139873	139878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112911
3056	NC_014664	CGA	2	6	139925	139930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112911
3057	NC_014664	TCT	2	6	139964	139969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312112911
3058	NC_014664	TTC	2	6	140034	140039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312112911
3059	NC_014664	GGC	2	6	140058	140063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112911
3060	NC_014664	CTCA	2	8	140196	140203	25 %	25 %	0 %	50 %	312112911
3061	NC_014664	AACGAC	2	12	140241	140252	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	312112911
3062	NC_014664	CGC	2	6	140277	140282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112911
3063	NC_014664	GC	3	6	140281	140286	0 %	0 %	50 %	50 %	312112911
3064	NC_014664	GCC	2	6	140351	140356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112911
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3066	NC_014664	GAG	2	6	140418	140423	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312112911
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3069	NC_014664	GCG	2	6	140477	140482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112911
3070	NC_014664	GAG	2	6	140547	140552	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312112911
3071	NC_014664	GC	3	6	140577	140582	0 %	0 %	50 %	50 %	312112911
3072	NC_014664	TGC	2	6	140629	140634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112911
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3080	NC_014664	GC	3	6	140868	140873	0 %	0 %	50 %	50 %	312112911
3081	NC_014664	GTG	2	6	140886	140891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312112911
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3089	NC_014664	TTC	2	6	141042	141047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312112911
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3091	NC_014664	GGC	2	6	141138	141143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112911
3092	NC_014664	GCG	3	9	141154	141162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112911
3093	NC_014664	GC	3	6	141273	141278	0 %	0 %	50 %	50 %	312112911
3094	NC_014664	TCGC	2	8	141291	141298	0 %	25 %	25 %	50 %	312112911
3095	NC_014664	CGC	3	9	141296	141304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112911
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3097	NC_014664	AGC	2	6	141370	141375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112911
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3099	NC_014664	CTT	3	9	141437	141445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312112911
3100	NC_014664	GC	3	6	141533	141538	0 %	0 %	50 %	50 %	312112911
3101	NC_014664	CG	3	6	141570	141575	0 %	0 %	50 %	50 %	312112911
3102	NC_014664	CGGCA	2	10	141599	141608	20 %	0 %	40 %	40 %	312112911
3103	NC_014664	GAAG	2	8	141623	141630	50 %	0 %	50 %	0 %	312112911
3104	NC_014664	GCG	2	6	141656	141661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112911
3105	NC_014664	GCG	2	6	141665	141670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112911
3106	NC_014664	TTC	2	6	141681	141686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312112911
3107	NC_014664	GCT	2	6	141692	141697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112911
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3109	NC_014664	CG	3	6	141740	141745	0 %	0 %	50 %	50 %	312112911
3110	NC_014664	GACA	2	8	141768	141775	50 %	0 %	25 %	25 %	312112911
3111	NC_014664	ACG	2	6	141782	141787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112911
3112	NC_014664	GC	3	6	141796	141801	0 %	0 %	50 %	50 %	312112911
3113	NC_014664	TGGAA	2	10	141808	141817	40 %	20 %	40 %	0 %	312112911
3114	NC_014664	CAT	2	6	141839	141844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312112911
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3119	NC_014664	GCG	2	6	141899	141904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112911
3120	NC_014664	GGC	2	6	141958	141963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112911
3121	NC_014664	GAC	2	6	142295	142300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112912
3122	NC_014664	CGG	2	6	142325	142330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112912
3123	NC_014664	ACG	2	6	142332	142337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112912
3124	NC_014664	ACGA	2	8	142353	142360	50 %	0 %	25 %	25 %	312112912
3125	NC_014664	ATC	2	6	142407	142412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312112912
3126	NC_014664	TCA	2	6	142426	142431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312112912
3127	NC_014664	CCG	2	6	142574	142579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112913
3128	NC_014664	CGT	2	6	142633	142638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112913
3129	NC_014664	CGC	2	6	142665	142670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112913
3130	NC_014664	GC	3	6	142669	142674	0 %	0 %	50 %	50 %	312112913
3131	NC_014664	TCG	2	6	142681	142686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112913
3132	NC_014664	TCGCC	2	10	142700	142709	0 %	20 %	20 %	60 %	312112913
3133	NC_014664	TGC	2	6	142762	142767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112913
3134	NC_014664	GAG	2	6	142806	142811	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312112913
3135	NC_014664	TCG	2	6	142820	142825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112913
3136	NC_014664	CGT	2	6	142925	142930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112913
3137	NC_014664	GAT	2	6	142965	142970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312112913
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3139	NC_014664	CGG	2	6	143022	143027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112913
3140	NC_014664	CG	3	6	143072	143077	0 %	0 %	50 %	50 %	312112913
3141	NC_014664	TCC	2	6	143095	143100	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312112913
3142	NC_014664	GGT	2	6	143112	143117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312112913
3143	NC_014664	CG	4	8	143486	143493	0 %	0 %	50 %	50 %	312112914
3144	NC_014664	AGC	2	6	143509	143514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112914
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3146	NC_014664	CGG	2	6	143564	143569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112914
3147	NC_014664	ATCG	2	8	143595	143602	25 %	25 %	25 %	25 %	312112914
3148	NC_014664	GAA	2	6	143609	143614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312112914
3149	NC_014664	ATC	2	6	143637	143642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312112914
3150	NC_014664	GAT	2	6	143774	143779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312112914
3151	NC_014664	GGT	2	6	143834	143839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312112914
3152	NC_014664	TCA	2	6	143902	143907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312112914
3153	NC_014664	CG	3	6	143932	143937	0 %	0 %	50 %	50 %	312112914
3154	NC_014664	CTC	2	6	143955	143960	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312112914
3155	NC_014664	CAT	2	6	144002	144007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312112914
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3158	NC_014664	GCC	2	6	144166	144171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112914
3159	NC_014664	CGT	2	6	144179	144184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112914
3160	NC_014664	CGG	2	6	144194	144199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112914
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3163	NC_014664	TCG	2	6	144270	144275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112914
3164	NC_014664	GCT	2	6	144320	144325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112914
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3182	NC_014664	TCG	2	6	145108	145113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112914
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3193	NC_014664	TCG	2	6	145689	145694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112915
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3202	NC_014664	GAT	2	6	145934	145939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312112915
3203	NC_014664	CCG	2	6	145957	145962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112915
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3220	NC_014664	GAT	2	6	146744	146749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312112915
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3227	NC_014664	TGAA	2	8	147198	147205	50 %	25 %	25 %	0 %	312112915
3228	NC_014664	TGT	2	6	147217	147222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312112915
3229	NC_014664	CGA	2	6	147226	147231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112915
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3231	NC_014664	CGCC	2	8	147310	147317	0 %	0 %	25 %	75 %	312112915
3232	NC_014664	TCT	2	6	147346	147351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312112915
3233	NC_014664	GCGA	2	8	147390	147397	25 %	0 %	50 %	25 %	312112915
3234	NC_014664	CGT	2	6	147401	147406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112915
3235	NC_014664	GC	3	6	147421	147426	0 %	0 %	50 %	50 %	312112915
3236	NC_014664	CG	4	8	147433	147440	0 %	0 %	50 %	50 %	312112915
3237	NC_014664	GGTC	2	8	147515	147522	0 %	25 %	50 %	25 %	312112915
3238	NC_014664	CG	4	8	147523	147530	0 %	0 %	50 %	50 %	312112915
3239	NC_014664	GTC	2	6	147551	147556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112915
3240	NC_014664	TGC	2	6	147573	147578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112915
3241	NC_014664	CGC	2	6	147598	147603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112915
3242	NC_014664	CGC	2	6	147622	147627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112915
3243	NC_014664	T	6	6	147643	147648	0 %	100 %	0 %	0 %	312112915
3244	NC_014664	GC	3	6	148046	148051	0 %	0 %	50 %	50 %	312112916
3245	NC_014664	GGC	2	6	148062	148067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112916
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3274	NC_014664	CGG	3	9	149066	149074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112917
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3281	NC_014664	GGCG	2	8	149304	149311	0 %	0 %	75 %	25 %	312112917
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3360	NC_014664	GAG	2	6	152474	152479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312112920
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3362	NC_014664	TCA	2	6	152548	152553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312112920
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3364	NC_014664	GTC	2	6	152624	152629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112920
3365	NC_014664	GAT	2	6	152653	152658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312112920
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3373	NC_014664	TCA	2	6	153093	153098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312112920
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3471	NC_014664	CGA	2	6	157642	157647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112924
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3474	NC_014664	AAT	2	6	157849	157854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312112924
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3480	NC_014664	ATA	2	6	158097	158102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312112924
3481	NC_014664	CT	3	6	158328	158333	0 %	50 %	0 %	50 %	312112925
3482	NC_014664	GAGC	2	8	158378	158385	25 %	0 %	50 %	25 %	312112925
3483	NC_014664	TTC	2	6	158446	158451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312112925
3484	NC_014664	TGCG	2	8	158468	158475	0 %	25 %	50 %	25 %	312112925
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3486	NC_014664	GAT	2	6	158521	158526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312112925
3487	NC_014664	TTC	2	6	158546	158551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312112925
3488	NC_014664	CTTC	2	8	158574	158581	0 %	50 %	0 %	50 %	312112925
3489	NC_014664	CGA	2	6	158599	158604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112925
3490	NC_014664	TCA	2	6	158735	158740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312112925
3491	NC_014664	AGA	2	6	159401	159406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312112926
3492	NC_014664	CCAA	2	8	159431	159438	50 %	0 %	0 %	50 %	312112926
3493	NC_014664	GCG	2	6	159451	159456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112926
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3495	NC_014664	TCG	2	6	159631	159636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112926
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3499	NC_014664	TTC	2	6	159826	159831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312112926
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