MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodomicrobium vannielii ATCC 17100 chromosome

Total Repeats: 83208

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014664	TCA	2	6	46847	46852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312112833
1002	NC_014664	CG	3	6	46862	46867	0 %	0 %	50 %	50 %	312112833
1003	NC_014664	GCG	2	6	46876	46881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112833
1004	NC_014664	GTG	2	6	46960	46965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312112833
1005	NC_014664	GCG	2	6	47005	47010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112833
1006	NC_014664	CGG	2	6	47088	47093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112833
1007	NC_014664	GATC	2	8	47153	47160	25 %	25 %	25 %	25 %	312112833
1008	NC_014664	CGGG	2	8	47210	47217	0 %	0 %	75 %	25 %	312112834
1009	NC_014664	CG	3	6	47219	47224	0 %	0 %	50 %	50 %	312112834
1010	NC_014664	GGCG	2	8	47256	47263	0 %	0 %	75 %	25 %	312112834
1011	NC_014664	GTC	3	9	47272	47280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112834
1012	NC_014664	GCG	2	6	47344	47349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112834
1013	NC_014664	GCG	3	9	47353	47361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112834
1014	NC_014664	GCTC	2	8	47366	47373	0 %	25 %	25 %	50 %	312112834
1015	NC_014664	CGG	2	6	47381	47386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112834
1016	NC_014664	CCT	2	6	47388	47393	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312112834
1017	NC_014664	CAA	2	6	47397	47402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312112834
1018	NC_014664	CG	3	6	47414	47419	0 %	0 %	50 %	50 %	312112834
1019	NC_014664	CGCT	2	8	47422	47429	0 %	25 %	25 %	50 %	312112834
1020	NC_014664	CGA	2	6	47442	47447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112834
1021	NC_014664	ATG	2	6	47491	47496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312112834
1022	NC_014664	CG	3	6	47500	47505	0 %	0 %	50 %	50 %	312112834
1023	NC_014664	GC	3	6	47522	47527	0 %	0 %	50 %	50 %	312112834
1024	NC_014664	CGT	2	6	47550	47555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112834
1025	NC_014664	TGC	2	6	47598	47603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112834
1026	NC_014664	TCG	2	6	47618	47623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112834
1027	NC_014664	CGCTCG	2	12	47711	47722	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	312112834
1028	NC_014664	CGA	2	6	47748	47753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112834
1029	NC_014664	GC	3	6	47756	47761	0 %	0 %	50 %	50 %	312112834
1030	NC_014664	CGA	2	6	47781	47786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112834
1031	NC_014664	GCTGT	2	10	47797	47806	0 %	40 %	40 %	20 %	312112834
1032	NC_014664	TCA	2	6	47831	47836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312112834
1033	NC_014664	CGC	2	6	47956	47961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112835
1034	NC_014664	TGC	2	6	47994	47999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112835
1035	NC_014664	CG	5	10	48046	48055	0 %	0 %	50 %	50 %	312112835
1036	NC_014664	TCA	2	6	48072	48077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312112835
1037	NC_014664	CTCG	2	8	48097	48104	0 %	25 %	25 %	50 %	312112835
1038	NC_014664	GTC	2	6	48106	48111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112835
1039	NC_014664	GCC	2	6	48124	48129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112835
1040	NC_014664	GTC	2	6	48131	48136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112835
1041	NC_014664	GAT	2	6	48160	48165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312112835
1042	NC_014664	GCC	3	9	48208	48216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112835
1043	NC_014664	CGC	2	6	48219	48224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112835
1044	NC_014664	CGA	2	6	48234	48239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112835
1045	NC_014664	CCG	2	6	48315	48320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112835
1046	NC_014664	A	6	6	48360	48365	100 %	0 %	0 %	0 %	312112835
1047	NC_014664	TCG	2	6	48397	48402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112836
1048	NC_014664	CGGCC	2	10	48426	48435	0 %	0 %	40 %	60 %	312112836
1049	NC_014664	GAA	2	6	48453	48458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312112836
1050	NC_014664	CG	3	6	48513	48518	0 %	0 %	50 %	50 %	312112836
1051	NC_014664	CGG	2	6	48612	48617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112836
1052	NC_014664	CGA	2	6	48683	48688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112836
1053	NC_014664	TGC	2	6	48697	48702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112836
1054	NC_014664	CCG	2	6	48705	48710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112836
1055	NC_014664	GCA	2	6	48769	48774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112836
1056	NC_014664	CGG	2	6	48800	48805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112836
1057	NC_014664	AAT	2	6	48819	48824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	312112836
1058	NC_014664	TTC	2	6	48834	48839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312112836
1059	NC_014664	GAG	2	6	49095	49100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312112837
1060	NC_014664	CCG	2	6	49110	49115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112837
1061	NC_014664	CGA	2	6	49168	49173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112837
1062	NC_014664	ACC	2	6	49203	49208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312112837
1063	NC_014664	TTC	3	9	49314	49322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312112837
1064	NC_014664	TCT	2	6	49324	49329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312112837
1065	NC_014664	G	6	6	49330	49335	0 %	0 %	100 %	0 %	312112837
1066	NC_014664	TGTGCC	2	12	49352	49363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112837
1067	NC_014664	GC	3	6	49379	49384	0 %	0 %	50 %	50 %	312112837
1068	NC_014664	TCA	2	6	49399	49404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312112837
1069	NC_014664	GGC	2	6	49463	49468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112837
1070	NC_014664	CCGG	2	8	49487	49494	0 %	0 %	50 %	50 %	312112837
1071	NC_014664	CGC	2	6	49565	49570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112837
1072	NC_014664	CGG	2	6	49790	49795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112837
1073	NC_014664	CCG	2	6	49798	49803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112837
1074	NC_014664	CGA	2	6	49811	49816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112837
1075	NC_014664	T	6	6	49872	49877	0 %	100 %	0 %	0 %	312112837
1076	NC_014664	GTC	2	6	49937	49942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112837
1077	NC_014664	CGG	2	6	49960	49965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112837
1078	NC_014664	AT	3	6	49984	49989	50 %	50 %	0 %	0 %	312112837
1079	NC_014664	CCG	2	6	49991	49996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112837
1080	NC_014664	ACG	2	6	50122	50127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112837
1081	NC_014664	GTC	2	6	50133	50138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112837
1082	NC_014664	TCA	2	6	50185	50190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312112837
1083	NC_014664	CCG	2	6	50236	50241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112837
1084	NC_014664	CGA	2	6	50288	50293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112837
1085	NC_014664	TCT	2	6	50305	50310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312112837
1086	NC_014664	GAC	2	6	50325	50330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112837
1087	NC_014664	CGG	2	6	50342	50347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112837
1088	NC_014664	ATCGA	2	10	50370	50379	40 %	20 %	20 %	20 %	312112837
1089	NC_014664	GGT	2	6	50414	50419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312112837
1090	NC_014664	ACG	2	6	50473	50478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112837
1091	NC_014664	GACC	2	8	50485	50492	25 %	0 %	25 %	50 %	312112837
1092	NC_014664	CCG	2	6	50555	50560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112837
1093	NC_014664	GC	3	6	50621	50626	0 %	0 %	50 %	50 %	312112837
1094	NC_014664	GGA	2	6	50627	50632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312112837
1095	NC_014664	GGC	2	6	50661	50666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112838
1096	NC_014664	GC	3	6	50695	50700	0 %	0 %	50 %	50 %	312112838
1097	NC_014664	CGA	2	6	50717	50722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112838
1098	NC_014664	GGC	2	6	50726	50731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112838
1099	NC_014664	CGCGC	2	10	50742	50751	0 %	0 %	40 %	60 %	312112838
1100	NC_014664	CGC	2	6	50771	50776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112838
1101	NC_014664	GGCG	2	8	50813	50820	0 %	0 %	75 %	25 %	312112838
1102	NC_014664	CG	3	6	50825	50830	0 %	0 %	50 %	50 %	312112838
1103	NC_014664	GCG	2	6	50847	50852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112838
1104	NC_014664	GGC	2	6	50880	50885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112838
1105	NC_014664	GCGGCA	2	12	50905	50916	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	312112838
1106	NC_014664	GC	3	6	50939	50944	0 %	0 %	50 %	50 %	312112838
1107	NC_014664	GGCG	2	8	50975	50982	0 %	0 %	75 %	25 %	312112838
1108	NC_014664	GTCGA	2	10	50985	50994	20 %	20 %	40 %	20 %	312112838
1109	NC_014664	CG	4	8	50998	51005	0 %	0 %	50 %	50 %	312112838
1110	NC_014664	ACGAC	2	10	51058	51067	40 %	0 %	20 %	40 %	312112838
1111	NC_014664	GC	3	6	51073	51078	0 %	0 %	50 %	50 %	312112838
1112	NC_014664	CGG	2	6	51133	51138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112838
1113	NC_014664	CG	3	6	51166	51171	0 %	0 %	50 %	50 %	312112838
1114	NC_014664	CTCGC	2	10	51192	51201	0 %	20 %	20 %	60 %	312112838
1115	NC_014664	GAAG	2	8	51224	51231	50 %	0 %	50 %	0 %	312112838
1116	NC_014664	GCG	2	6	51277	51282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112838
1117	NC_014664	CGA	2	6	51302	51307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112838
1118	NC_014664	CG	3	6	51328	51333	0 %	0 %	50 %	50 %	312112838
1119	NC_014664	GCTG	2	8	51356	51363	0 %	25 %	50 %	25 %	312112838
1120	NC_014664	GGC	2	6	51366	51371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112838
1121	NC_014664	CGG	2	6	51379	51384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112838
1122	NC_014664	CGGCG	2	10	51407	51416	0 %	0 %	60 %	40 %	312112838
1123	NC_014664	GC	3	6	51479	51484	0 %	0 %	50 %	50 %	312112838
1124	NC_014664	GGC	2	6	51485	51490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112838
1125	NC_014664	GCC	2	6	51503	51508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112838
1126	NC_014664	CAT	2	6	51512	51517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312112838
1127	NC_014664	GGTC	2	8	51521	51528	0 %	25 %	50 %	25 %	312112838
1128	NC_014664	CG	3	6	51558	51563	0 %	0 %	50 %	50 %	312112838
1129	NC_014664	TGC	2	6	51630	51635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112838
1130	NC_014664	GCC	2	6	51664	51669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112838
1131	NC_014664	CGG	2	6	51680	51685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112838
1132	NC_014664	CGG	2	6	51764	51769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112838
1133	NC_014664	GGGCA	2	10	51804	51813	20 %	0 %	60 %	20 %	312112838
1134	NC_014664	CGC	2	6	51815	51820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112838
1135	NC_014664	GC	3	6	51939	51944	0 %	0 %	50 %	50 %	312112839
1136	NC_014664	CTCGGT	2	12	52054	52065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112839
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1155	NC_014664	CCG	2	6	53001	53006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112840
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1157	NC_014664	GCAGGC	2	12	53072	53083	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	312112840
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1226	NC_014664	GAC	2	6	56199	56204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112844
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1232	NC_014664	TCT	2	6	56672	56677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312112845
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1237	NC_014664	CGC	2	6	56789	56794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112845
1238	NC_014664	CGA	2	6	56957	56962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112845
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1240	NC_014664	GGCT	2	8	57024	57031	0 %	25 %	50 %	25 %	312112845
1241	NC_014664	GCG	2	6	57058	57063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112845
1242	NC_014664	CCGCAG	2	12	57123	57134	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	312112845
1243	NC_014664	TCC	2	6	57604	57609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312112846
1244	NC_014664	GGCCTT	2	12	57642	57653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112846
1245	NC_014664	GCC	2	6	57709	57714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112846
1246	NC_014664	GC	4	8	57778	57785	0 %	0 %	50 %	50 %	312112846
1247	NC_014664	CG	3	6	57803	57808	0 %	0 %	50 %	50 %	312112846
1248	NC_014664	GGCC	2	8	57825	57832	0 %	0 %	50 %	50 %	312112846
1249	NC_014664	ACA	2	6	57857	57862	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312112846
1250	NC_014664	GCG	2	6	57863	57868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112846
1251	NC_014664	GCA	2	6	57908	57913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112846
1252	NC_014664	GCA	2	6	58017	58022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112846
1253	NC_014664	ACA	3	9	58049	58057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312112846
1254	NC_014664	GCC	2	6	58072	58077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112846
1255	NC_014664	CTC	2	6	58123	58128	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312112846
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1258	NC_014664	GGCGCA	2	12	58269	58280	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	312112846
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1262	NC_014664	CGA	2	6	58428	58433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112846
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1273	NC_014664	CAG	2	6	58741	58746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112846
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1279	NC_014664	GTC	2	6	58948	58953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112846
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1367	NC_014664	TGCG	2	8	63209	63216	0 %	25 %	50 %	25 %	312112848
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1369	NC_014664	GCC	2	6	63293	63298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112848
1370	NC_014664	ACG	2	6	63330	63335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112848
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1372	NC_014664	CGA	2	6	63466	63471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112848
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1374	NC_014664	GCT	2	6	63559	63564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112848
1375	NC_014664	TCA	2	6	63642	63647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312112848
1376	NC_014664	GCC	2	6	63682	63687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112848
1377	NC_014664	GACG	2	8	63721	63728	25 %	0 %	50 %	25 %	312112848
1378	NC_014664	GC	4	8	63737	63744	0 %	0 %	50 %	50 %	312112848
1379	NC_014664	CCG	2	6	63809	63814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112848
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1381	NC_014664	TGGCGC	2	12	63852	63863	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	312112848
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1383	NC_014664	CGG	2	6	63885	63890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112848
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1386	NC_014664	GAA	2	6	63989	63994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312112848
1387	NC_014664	GGA	2	6	64000	64005	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312112848
1388	NC_014664	GCGCC	2	10	64015	64024	0 %	0 %	40 %	60 %	312112848
1389	NC_014664	GCC	3	9	64034	64042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112848
1390	NC_014664	GGC	2	6	64054	64059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112848
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1402	NC_014664	TCG	2	6	65204	65209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112849
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1413	NC_014664	GCG	2	6	65684	65689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112849
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1492	NC_014664	GCG	2	6	68975	68980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112853
1493	NC_014664	AGC	2	6	69034	69039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112853
1494	NC_014664	ACAGC	2	10	69041	69050	40 %	0 %	20 %	40 %	312112853
1495	NC_014664	GC	4	8	69057	69064	0 %	0 %	50 %	50 %	312112853
1496	NC_014664	CCT	2	6	69116	69121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312112853
1497	NC_014664	TCGCCT	2	12	69122	69133	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	312112853
1498	NC_014664	GGCGG	2	10	69152	69161	0 %	0 %	80 %	20 %	312112853
1499	NC_014664	TGC	2	6	69188	69193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112853
1500	NC_014664	GC	3	6	69203	69208	0 %	0 %	50 %	50 %	312112853

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