MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodomicrobium vannielii ATCC 17100 chromosome

Total Repeats: 83208

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014664	CGCC	2	8	22857	22864	0 %	0 %	25 %	75 %	312112813
502	NC_014664	AT	3	6	22895	22900	50 %	50 %	0 %	0 %	312112813
503	NC_014664	GC	4	8	22968	22975	0 %	0 %	50 %	50 %	312112813
504	NC_014664	GCG	2	6	22989	22994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112813
505	NC_014664	TCG	2	6	23011	23016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112813
506	NC_014664	GCT	2	6	23020	23025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112813
507	NC_014664	ACG	2	6	23031	23036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112813
508	NC_014664	CCGCC	2	10	23079	23088	0 %	0 %	20 %	80 %	312112813
509	NC_014664	CGA	2	6	23338	23343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112814
510	NC_014664	A	6	6	23354	23359	100 %	0 %	0 %	0 %	312112814
511	NC_014664	TCCA	2	8	23360	23367	25 %	25 %	0 %	50 %	312112814
512	NC_014664	CTT	2	6	23484	23489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312112814
513	NC_014664	GC	3	6	23501	23506	0 %	0 %	50 %	50 %	312112814
514	NC_014664	CG	3	6	23605	23610	0 %	0 %	50 %	50 %	312112814
515	NC_014664	CCG	2	6	23617	23622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112814
516	NC_014664	AGC	2	6	23653	23658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112814
517	NC_014664	GAT	2	6	23771	23776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312112814
518	NC_014664	CGG	2	6	23813	23818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112814
519	NC_014664	CG	3	6	23839	23844	0 %	0 %	50 %	50 %	312112814
520	NC_014664	TTC	2	6	23850	23855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312112814
521	NC_014664	GC	3	6	23924	23929	0 %	0 %	50 %	50 %	312112814
522	NC_014664	GAGC	2	8	24026	24033	25 %	0 %	50 %	25 %	312112814
523	NC_014664	GCT	2	6	24044	24049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112814
524	NC_014664	GAC	3	9	24144	24152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112814
525	NC_014664	TATC	2	8	24197	24204	25 %	50 %	0 %	25 %	312112814
526	NC_014664	ACG	2	6	24214	24219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112814
527	NC_014664	GC	3	6	24253	24258	0 %	0 %	50 %	50 %	312112814
528	NC_014664	GC	3	6	24278	24283	0 %	0 %	50 %	50 %	312112814
529	NC_014664	CAT	2	6	24368	24373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312112814
530	NC_014664	CGA	2	6	24386	24391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112814
531	NC_014664	TGG	2	6	24475	24480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312112814
532	NC_014664	CGG	2	6	24500	24505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112814
533	NC_014664	CGA	2	6	24532	24537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112814
534	NC_014664	GATC	2	8	24545	24552	25 %	25 %	25 %	25 %	312112814
535	NC_014664	CAGC	2	8	24593	24600	25 %	0 %	25 %	50 %	312112814
536	NC_014664	GAT	2	6	24602	24607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312112814
537	NC_014664	GT	3	6	24618	24623	0 %	50 %	50 %	0 %	312112814
538	NC_014664	CG	3	6	24721	24726	0 %	0 %	50 %	50 %	312112814
539	NC_014664	CAT	2	6	24746	24751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312112814
540	NC_014664	GCG	2	6	24769	24774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112814
541	NC_014664	AGG	2	6	24799	24804	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312112814
542	NC_014664	AGC	2	6	24815	24820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112814
543	NC_014664	CGA	3	9	24928	24936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112815
544	NC_014664	TCG	2	6	24954	24959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112815
545	NC_014664	GATC	2	8	25056	25063	25 %	25 %	25 %	25 %	312112815
546	NC_014664	GTC	2	6	25066	25071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112815
547	NC_014664	GC	5	10	25094	25103	0 %	0 %	50 %	50 %	312112815
548	NC_014664	TTC	2	6	25289	25294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312112815
549	NC_014664	CG	3	6	25316	25321	0 %	0 %	50 %	50 %	312112815
550	NC_014664	GCC	2	6	25332	25337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112815
551	NC_014664	CGAC	2	8	25377	25384	25 %	0 %	25 %	50 %	312112815
552	NC_014664	GC	3	6	25423	25428	0 %	0 %	50 %	50 %	312112815
553	NC_014664	GAT	2	6	25558	25563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312112815
554	NC_014664	TGC	2	6	25569	25574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112815
555	NC_014664	GAT	2	6	25627	25632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312112815
556	NC_014664	CGA	2	6	25657	25662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112815
557	NC_014664	TGCA	2	8	25680	25687	25 %	25 %	25 %	25 %	312112815
558	NC_014664	CTG	2	6	25718	25723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112815
559	NC_014664	TTC	2	6	25745	25750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312112815
560	NC_014664	GGC	2	6	25771	25776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112815
561	NC_014664	GCCC	2	8	25786	25793	0 %	0 %	25 %	75 %	312112815
562	NC_014664	GGT	2	6	25834	25839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312112815
563	NC_014664	GCC	2	6	26075	26080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112816
564	NC_014664	TCG	2	6	26092	26097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112816
565	NC_014664	TGA	2	6	26104	26109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312112816
566	NC_014664	GAT	2	6	26192	26197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312112816
567	NC_014664	GGC	2	6	26333	26338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112816
568	NC_014664	AGT	2	6	26341	26346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312112816
569	NC_014664	TGA	2	6	26392	26397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312112816
570	NC_014664	TGA	2	6	26428	26433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312112816
571	NC_014664	CTG	2	6	26489	26494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112816
572	NC_014664	GCA	2	6	26509	26514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112816
573	NC_014664	CG	3	6	26521	26526	0 %	0 %	50 %	50 %	312112816
574	NC_014664	TTG	2	6	26538	26543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312112816
575	NC_014664	CTTC	2	8	26566	26573	0 %	50 %	0 %	50 %	312112816
576	NC_014664	GCC	2	6	26664	26669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112816
577	NC_014664	TCG	2	6	26670	26675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112816
578	NC_014664	GTG	2	6	26708	26713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312112816
579	NC_014664	CG	3	6	26746	26751	0 %	0 %	50 %	50 %	312112816
580	NC_014664	GCC	2	6	26753	26758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112816
581	NC_014664	GCC	3	9	27083	27091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112817
582	NC_014664	CTT	2	6	27113	27118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312112817
583	NC_014664	CGT	2	6	27149	27154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112817
584	NC_014664	GC	4	8	27161	27168	0 %	0 %	50 %	50 %	312112817
585	NC_014664	GCC	2	6	27203	27208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112817
586	NC_014664	CGG	3	9	27253	27261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112817
587	NC_014664	GCG	2	6	27267	27272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112817
588	NC_014664	AGGTCG	2	12	27294	27305	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	312112817
589	NC_014664	GCCT	2	8	27317	27324	0 %	25 %	25 %	50 %	312112817
590	NC_014664	GC	4	8	27331	27338	0 %	0 %	50 %	50 %	312112817
591	NC_014664	CGCC	2	8	27382	27389	0 %	0 %	25 %	75 %	312112817
592	NC_014664	GC	3	6	27407	27412	0 %	0 %	50 %	50 %	312112817
593	NC_014664	TCA	2	6	27451	27456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312112817
594	NC_014664	CGT	2	6	27475	27480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112817
595	NC_014664	CCTT	2	8	27513	27520	0 %	50 %	0 %	50 %	312112817
596	NC_014664	GCG	2	6	27588	27593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112817
597	NC_014664	CTT	2	6	27659	27664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312112817
598	NC_014664	CGG	2	6	27670	27675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112817
599	NC_014664	TGC	2	6	27681	27686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112817
600	NC_014664	CAAGCG	2	12	27691	27702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112817
601	NC_014664	CG	3	6	27715	27720	0 %	0 %	50 %	50 %	312112817
602	NC_014664	CGG	2	6	27748	27753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112817
603	NC_014664	CCGC	2	8	27888	27895	0 %	0 %	25 %	75 %	312112817
604	NC_014664	TGAC	2	8	27976	27983	25 %	25 %	25 %	25 %	312112817
605	NC_014664	GGT	2	6	27989	27994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312112817
606	NC_014664	CGC	2	6	28010	28015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112817
607	NC_014664	GC	3	6	28028	28033	0 %	0 %	50 %	50 %	312112817
608	NC_014664	CG	3	6	28106	28111	0 %	0 %	50 %	50 %	312112817
609	NC_014664	TGA	2	6	28126	28131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312112817
610	NC_014664	GC	3	6	28196	28201	0 %	0 %	50 %	50 %	312112817
611	NC_014664	GTC	3	9	28220	28228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112817
612	NC_014664	TTG	2	6	28240	28245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	312112817
613	NC_014664	TCA	3	9	28571	28579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312112818
614	NC_014664	GGTCC	2	10	28653	28662	0 %	20 %	40 %	40 %	312112818
615	NC_014664	ACG	2	6	28682	28687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112818
616	NC_014664	ATC	2	6	28729	28734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312112818
617	NC_014664	AGG	2	6	28742	28747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312112818
618	NC_014664	CCT	2	6	28764	28769	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312112818
619	NC_014664	GC	3	6	28968	28973	0 %	0 %	50 %	50 %	312112818
620	NC_014664	GAA	2	6	29040	29045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312112818
621	NC_014664	CGACG	2	10	29049	29058	20 %	0 %	40 %	40 %	312112818
622	NC_014664	GGC	2	6	29061	29066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112818
623	NC_014664	CGA	2	6	29151	29156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112818
624	NC_014664	AGA	2	6	30050	30055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312112819
625	NC_014664	ACT	2	6	30169	30174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312112819
626	NC_014664	TC	3	6	30234	30239	0 %	50 %	0 %	50 %	312112819
627	NC_014664	CCT	2	6	30559	30564	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312112820
628	NC_014664	GCGG	2	8	30592	30599	0 %	0 %	75 %	25 %	312112820
629	NC_014664	TCG	2	6	30617	30622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112820
630	NC_014664	TCGC	2	8	30630	30637	0 %	25 %	25 %	50 %	312112820
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653	NC_014664	GCG	2	6	31780	31785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112821
654	NC_014664	GCG	2	6	31814	31819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112821
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659	NC_014664	TGG	2	6	32098	32103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312112821
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668	NC_014664	ATC	2	6	32446	32451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312112821
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748	NC_014664	CGTCTC	2	12	35935	35946	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	312112823
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751	NC_014664	CTC	2	6	36007	36012	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312112823
752	NC_014664	GC	3	6	36021	36026	0 %	0 %	50 %	50 %	312112823
753	NC_014664	GCC	2	6	36056	36061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112823
754	NC_014664	GCG	2	6	36065	36070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112823
755	NC_014664	GGC	2	6	36128	36133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112824
756	NC_014664	GTC	2	6	36137	36142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112824
757	NC_014664	CGA	3	9	36166	36174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112824
758	NC_014664	CGC	2	6	36223	36228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112824
759	NC_014664	GAT	2	6	36230	36235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312112824
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761	NC_014664	GAA	2	6	36302	36307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312112824
762	NC_014664	GC	3	6	36383	36388	0 %	0 %	50 %	50 %	312112824
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764	NC_014664	GC	3	6	36442	36447	0 %	0 %	50 %	50 %	312112824
765	NC_014664	TCG	2	6	36475	36480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112824
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768	NC_014664	GCCGC	2	10	36530	36539	0 %	0 %	40 %	60 %	312112824
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881	NC_014664	GAA	2	6	41427	41432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312112828
882	NC_014664	TC	3	6	41445	41450	0 %	50 %	0 %	50 %	312112828
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