MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodomicrobium vannielii ATCC 17100 chromosome

Total Repeats: 83208

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_014664	CG	4	8	269552	269559	0 %	0 %	50 %	50 %	312113017
6002	NC_014664	GAG	2	6	269567	269572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312113017
6003	NC_014664	CGG	2	6	269576	269581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113017
6004	NC_014664	CGG	2	6	269609	269614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113017
6005	NC_014664	AGC	2	6	269792	269797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113018
6006	NC_014664	CGCGA	2	10	269847	269856	20 %	0 %	40 %	40 %	312113018
6007	NC_014664	AGG	2	6	269944	269949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312113018
6008	NC_014664	ACG	2	6	269962	269967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113018
6009	NC_014664	CG	3	6	270089	270094	0 %	0 %	50 %	50 %	312113018
6010	NC_014664	CGT	2	6	270101	270106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113018
6011	NC_014664	GCG	2	6	270111	270116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113018
6012	NC_014664	GAC	3	9	270150	270158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113018
6013	NC_014664	GCG	3	9	270198	270206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113018
6014	NC_014664	CG	3	6	270205	270210	0 %	0 %	50 %	50 %	312113018
6015	NC_014664	CGT	2	6	270221	270226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113018
6016	NC_014664	CGC	2	6	270256	270261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113018
6017	NC_014664	GTCG	2	8	270337	270344	0 %	25 %	50 %	25 %	312113018
6018	NC_014664	GCG	2	6	270355	270360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113018
6019	NC_014664	CCGAC	2	10	270383	270392	20 %	0 %	20 %	60 %	312113018
6020	NC_014664	CTTCG	2	10	270402	270411	0 %	40 %	20 %	40 %	312113018
6021	NC_014664	CTT	2	6	270449	270454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312113018
6022	NC_014664	CAA	2	6	270464	270469	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312113018
6023	NC_014664	GGGC	2	8	270557	270564	0 %	0 %	75 %	25 %	312113018
6024	NC_014664	GCT	2	6	270618	270623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113018
6025	NC_014664	CTCG	2	8	270624	270631	0 %	25 %	25 %	50 %	312113018
6026	NC_014664	T	6	6	270656	270661	0 %	100 %	0 %	0 %	312113018
6027	NC_014664	CGC	2	6	270688	270693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113018
6028	NC_014664	GC	3	6	270730	270735	0 %	0 %	50 %	50 %	312113018
6029	NC_014664	TTC	2	6	270756	270761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312113018
6030	NC_014664	TCT	2	6	270784	270789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312113018
6031	NC_014664	TAT	2	6	270804	270809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	312113018
6032	NC_014664	GAGC	2	8	270829	270836	25 %	0 %	50 %	25 %	312113018
6033	NC_014664	GC	3	6	271182	271187	0 %	0 %	50 %	50 %	312113019
6034	NC_014664	GGC	2	6	271192	271197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113019
6035	NC_014664	GGC	2	6	271223	271228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113019
6036	NC_014664	CAC	2	6	271237	271242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312113019
6037	NC_014664	CTT	2	6	271277	271282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312113019
6038	NC_014664	TCC	2	6	271521	271526	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312113019
6039	NC_014664	TGG	2	6	271546	271551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312113019
6040	NC_014664	GAT	2	6	271576	271581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312113019
6041	NC_014664	CCGC	2	8	271587	271594	0 %	0 %	25 %	75 %	312113019
6042	NC_014664	CAA	2	6	271606	271611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312113019
6043	NC_014664	TCGA	2	8	271617	271624	25 %	25 %	25 %	25 %	312113019
6044	NC_014664	GCG	2	6	271636	271641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113019
6045	NC_014664	TG	4	8	271758	271765	0 %	50 %	50 %	0 %	312113019
6046	NC_014664	GC	3	6	271838	271843	0 %	0 %	50 %	50 %	312113019
6047	NC_014664	GAA	2	6	271868	271873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312113019
6048	NC_014664	TTTC	2	8	271885	271892	0 %	75 %	0 %	25 %	312113019
6049	NC_014664	GC	3	6	271951	271956	0 %	0 %	50 %	50 %	312113019
6050	NC_014664	CGTC	2	8	271960	271967	0 %	25 %	25 %	50 %	312113019
6051	NC_014664	GC	3	6	272027	272032	0 %	0 %	50 %	50 %	312113020
6052	NC_014664	CCA	3	9	272103	272111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312113020
6053	NC_014664	GC	3	6	272126	272131	0 %	0 %	50 %	50 %	312113020
6054	NC_014664	CAG	2	6	272179	272184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113020
6055	NC_014664	CGC	2	6	272194	272199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113020
6056	NC_014664	GAT	2	6	272221	272226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312113020
6057	NC_014664	ACG	2	6	272240	272245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113020
6058	NC_014664	GC	3	6	272268	272273	0 %	0 %	50 %	50 %	312113020
6059	NC_014664	GCT	2	6	272310	272315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113020
6060	NC_014664	GGGC	2	8	272349	272356	0 %	0 %	75 %	25 %	312113020
6061	NC_014664	GC	3	6	272398	272403	0 %	0 %	50 %	50 %	312113020
6062	NC_014664	GTC	2	6	272444	272449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113020
6063	NC_014664	GGC	2	6	272986	272991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113021
6064	NC_014664	CTG	2	6	273039	273044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113021
6065	NC_014664	CGG	3	9	273079	273087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113021
6066	NC_014664	CGA	3	9	273121	273129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113021
6067	NC_014664	CGC	2	6	273137	273142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113021
6068	NC_014664	GCGCC	2	10	273145	273154	0 %	0 %	40 %	60 %	312113021
6069	NC_014664	CG	3	6	273188	273193	0 %	0 %	50 %	50 %	312113021
6070	NC_014664	GC	3	6	273229	273234	0 %	0 %	50 %	50 %	312113021
6071	NC_014664	GGC	2	6	273254	273259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113021
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6074	NC_014664	GAT	2	6	273322	273327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312113021
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6079	NC_014664	CGA	2	6	273538	273543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113021
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6105	NC_014664	CAG	2	6	274348	274353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113022
6106	NC_014664	GGT	2	6	274425	274430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312113022
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6108	NC_014664	CGA	2	6	274527	274532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113022
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6112	NC_014664	GCG	2	6	274720	274725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113023
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6116	NC_014664	GC	3	6	274926	274931	0 %	0 %	50 %	50 %	312113023
6117	NC_014664	TCC	2	6	274947	274952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312113023
6118	NC_014664	CGC	2	6	274996	275001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113023
6119	NC_014664	CG	3	6	275015	275020	0 %	0 %	50 %	50 %	312113023
6120	NC_014664	GAG	2	6	275066	275071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312113023
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6122	NC_014664	ATG	2	6	275109	275114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312113023
6123	NC_014664	TGA	2	6	275278	275283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312113023
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6243	NC_014664	GCC	2	6	280439	280444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113029
6244	NC_014664	CGCT	3	12	280445	280456	0 %	25 %	25 %	50 %	312113029
6245	NC_014664	AGA	2	6	280473	280478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312113029
6246	NC_014664	GCT	3	9	280493	280501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113029
6247	NC_014664	GCG	2	6	280502	280507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113029
6248	NC_014664	GC	3	6	280514	280519	0 %	0 %	50 %	50 %	312113029
6249	NC_014664	GAC	2	6	280523	280528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113029
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6251	NC_014664	CTCACG	2	12	280601	280612	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	312113029
6252	NC_014664	CGCGTG	2	12	280724	280735	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	312113029
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6256	NC_014664	CG	3	6	280862	280867	0 %	0 %	50 %	50 %	312113029
6257	NC_014664	TGCC	2	8	280873	280880	0 %	25 %	25 %	50 %	312113029
6258	NC_014664	GC	3	6	280894	280899	0 %	0 %	50 %	50 %	312113029
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6260	NC_014664	CG	3	6	280946	280951	0 %	0 %	50 %	50 %	312113029
6261	NC_014664	CG	3	6	281004	281009	0 %	0 %	50 %	50 %	312113029
6262	NC_014664	TCG	2	6	281022	281027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113029
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6264	NC_014664	CG	3	6	281046	281051	0 %	0 %	50 %	50 %	312113029
6265	NC_014664	GCC	2	6	281102	281107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113029
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6272	NC_014664	CGC	2	6	281220	281225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113029
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6352	NC_014664	CACGG	2	10	284874	284883	20 %	0 %	40 %	40 %	312113035
6353	NC_014664	GAC	2	6	284888	284893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113035
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6357	NC_014664	ATC	2	6	285102	285107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312113035
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6362	NC_014664	GCA	2	6	285232	285237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113035
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6364	NC_014664	CG	3	6	285294	285299	0 %	0 %	50 %	50 %	312113035
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6366	NC_014664	CTT	2	6	285344	285349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312113035
6367	NC_014664	GAC	2	6	285353	285358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113035
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6369	NC_014664	CTT	2	6	285419	285424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312113035
6370	NC_014664	GTG	2	6	285435	285440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312113035
6371	NC_014664	CGA	2	6	285445	285450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113035
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6381	NC_014664	CGA	2	6	285963	285968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113036
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6394	NC_014664	CTG	2	6	286615	286620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113037
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6443	NC_014664	TCG	2	6	288659	288664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113039
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6484	NC_014664	ACCG	2	8	290503	290510	25 %	0 %	25 %	50 %	312113041
6485	NC_014664	CG	4	8	290538	290545	0 %	0 %	50 %	50 %	312113041
6486	NC_014664	GCC	2	6	290547	290552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113041
6487	NC_014664	GAC	2	6	290589	290594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113041
6488	NC_014664	GCC	2	6	290612	290617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113041
6489	NC_014664	CGGC	2	8	290667	290674	0 %	0 %	50 %	50 %	312113041
6490	NC_014664	GCT	3	9	290694	290702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113041
6491	NC_014664	ACGA	2	8	290707	290714	50 %	0 %	25 %	25 %	312113041
6492	NC_014664	GCG	2	6	290760	290765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113041
6493	NC_014664	GC	3	6	290775	290780	0 %	0 %	50 %	50 %	312113041
6494	NC_014664	GATC	2	8	290790	290797	25 %	25 %	25 %	25 %	312113041
6495	NC_014664	CTCG	2	8	290865	290872	0 %	25 %	25 %	50 %	312113041
6496	NC_014664	GAG	2	6	291034	291039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312113041
6497	NC_014664	CG	3	6	291081	291086	0 %	0 %	50 %	50 %	312113041
6498	NC_014664	CGC	2	6	291196	291201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113041
6499	NC_014664	GAG	2	6	291208	291213	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312113041
6500	NC_014664	GCG	2	6	291222	291227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113041

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