MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodomicrobium vannielii ATCC 17100 chromosome

Total Repeats: 83208

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_014664	GCG	2	6	249907	249912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113002
5502	NC_014664	CTCG	2	8	249929	249936	0 %	25 %	25 %	50 %	312113002
5503	NC_014664	CGG	2	6	249953	249958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113002
5504	NC_014664	CCCG	2	8	250007	250014	0 %	0 %	25 %	75 %	312113002
5505	NC_014664	GAAG	2	8	250022	250029	50 %	0 %	50 %	0 %	312113002
5506	NC_014664	CGC	2	6	250043	250048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113002
5507	NC_014664	CTG	2	6	250138	250143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113002
5508	NC_014664	GCG	2	6	250265	250270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113003
5509	NC_014664	AAGA	2	8	250325	250332	75 %	0 %	25 %	0 %	312113003
5510	NC_014664	ATC	2	6	250340	250345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312113003
5511	NC_014664	GGC	2	6	250361	250366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113003
5512	NC_014664	ATG	2	6	250403	250408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312113003
5513	NC_014664	CAG	2	6	250412	250417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113003
5514	NC_014664	CTT	2	6	250430	250435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312113003
5515	NC_014664	CGG	2	6	250477	250482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113003
5516	NC_014664	CAT	2	6	250498	250503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312113003
5517	NC_014664	CGT	2	6	250509	250514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113003
5518	NC_014664	GAA	2	6	250519	250524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312113003
5519	NC_014664	GCC	2	6	250526	250531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113003
5520	NC_014664	CGG	2	6	250594	250599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113003
5521	NC_014664	GCG	2	6	250620	250625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113003
5522	NC_014664	CAT	2	6	250633	250638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312113003
5523	NC_014664	TGC	2	6	250695	250700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113003
5524	NC_014664	GCG	2	6	250725	250730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113003
5525	NC_014664	CG	4	8	250747	250754	0 %	0 %	50 %	50 %	312113003
5526	NC_014664	TCA	2	6	250770	250775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312113003
5527	NC_014664	TCG	2	6	250776	250781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113003
5528	NC_014664	AAC	2	6	250814	250819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312113003
5529	NC_014664	CGG	2	6	250827	250832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113003
5530	NC_014664	GGC	2	6	250853	250858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113003
5531	NC_014664	TCA	2	6	250881	250886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312113003
5532	NC_014664	GAC	2	6	250892	250897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113003
5533	NC_014664	GCA	2	6	250960	250965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113003
5534	NC_014664	TCG	2	6	251001	251006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113003
5535	NC_014664	CCA	2	6	251049	251054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312113003
5536	NC_014664	GCC	2	6	251068	251073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113003
5537	NC_014664	TCT	2	6	251104	251109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312113003
5538	NC_014664	GTCG	2	8	251132	251139	0 %	25 %	50 %	25 %	312113003
5539	NC_014664	TCG	2	6	251190	251195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113003
5540	NC_014664	CCCT	2	8	251201	251208	0 %	25 %	0 %	75 %	312113003
5541	NC_014664	ACG	2	6	251220	251225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113003
5542	NC_014664	GCC	2	6	251282	251287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113004
5543	NC_014664	ACG	3	9	251304	251312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113004
5544	NC_014664	GAG	2	6	251399	251404	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312113004
5545	NC_014664	GCC	4	12	251414	251425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113004
5546	NC_014664	GCTC	2	8	251514	251521	0 %	25 %	25 %	50 %	312113004
5547	NC_014664	CGA	2	6	251550	251555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113004
5548	NC_014664	ACG	2	6	251724	251729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113004
5549	NC_014664	ATC	2	6	251732	251737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312113004
5550	NC_014664	CCT	2	6	251782	251787	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312113004
5551	NC_014664	TGC	2	6	251886	251891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113004
5552	NC_014664	ACGC	2	8	251895	251902	25 %	0 %	25 %	50 %	312113004
5553	NC_014664	CG	3	6	251934	251939	0 %	0 %	50 %	50 %	312113004
5554	NC_014664	TCG	2	6	251970	251975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113004
5555	NC_014664	ATG	2	6	252011	252016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312113004
5556	NC_014664	CGC	2	6	252034	252039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113004
5557	NC_014664	CG	3	6	252057	252062	0 %	0 %	50 %	50 %	312113004
5558	NC_014664	GCC	2	6	252095	252100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113004
5559	NC_014664	ATCC	2	8	252110	252117	25 %	25 %	0 %	50 %	312113004
5560	NC_014664	CGG	2	6	252150	252155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113004
5561	NC_014664	GACGG	2	10	252191	252200	20 %	0 %	60 %	20 %	312113004
5562	NC_014664	CTC	2	6	252209	252214	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312113004
5563	NC_014664	GCG	2	6	252231	252236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113004
5564	NC_014664	CG	4	8	252238	252245	0 %	0 %	50 %	50 %	312113004
5565	NC_014664	CGC	2	6	252256	252261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113004
5566	NC_014664	CCG	2	6	252279	252284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113004
5567	NC_014664	TCG	2	6	252357	252362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113004
5568	NC_014664	CG	3	6	252361	252366	0 %	0 %	50 %	50 %	312113004
5569	NC_014664	CGAAG	2	10	252454	252463	40 %	0 %	40 %	20 %	312113004
5570	NC_014664	CTCG	2	8	252487	252494	0 %	25 %	25 %	50 %	312113004
5571	NC_014664	CGG	2	6	252507	252512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113004
5572	NC_014664	ACG	2	6	252545	252550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113004
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5577	NC_014664	GCTC	2	8	252645	252652	0 %	25 %	25 %	50 %	312113004
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5582	NC_014664	CGA	2	6	252751	252756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113004
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5588	NC_014664	TGC	2	6	252965	252970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113005
5589	NC_014664	TCG	2	6	253007	253012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113005
5590	NC_014664	GAA	2	6	253030	253035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312113005
5591	NC_014664	CGT	3	9	253104	253112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113005
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5593	NC_014664	CGG	3	9	253137	253145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113005
5594	NC_014664	TTCC	2	8	253177	253184	0 %	50 %	0 %	50 %	312113005
5595	NC_014664	CG	3	6	253222	253227	0 %	0 %	50 %	50 %	312113005
5596	NC_014664	AAG	3	9	253258	253266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312113005
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5601	NC_014664	GCC	2	6	253487	253492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113005
5602	NC_014664	GC	4	8	253563	253570	0 %	0 %	50 %	50 %	312113005
5603	NC_014664	CAC	2	6	253623	253628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312113005
5604	NC_014664	TCG	2	6	253697	253702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113005
5605	NC_014664	GC	3	6	253717	253722	0 %	0 %	50 %	50 %	312113005
5606	NC_014664	GCCT	2	8	253754	253761	0 %	25 %	25 %	50 %	312113005
5607	NC_014664	ACG	2	6	253805	253810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113005
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5609	NC_014664	AACG	2	8	253864	253871	50 %	0 %	25 %	25 %	312113005
5610	NC_014664	GCGG	2	8	253888	253895	0 %	0 %	75 %	25 %	312113005
5611	NC_014664	CTT	2	6	253916	253921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312113005
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5613	NC_014664	CTAC	2	8	253979	253986	25 %	25 %	0 %	50 %	312113005
5614	NC_014664	CG	3	6	254085	254090	0 %	0 %	50 %	50 %	312113005
5615	NC_014664	CT	3	6	254120	254125	0 %	50 %	0 %	50 %	312113005
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5620	NC_014664	GGC	2	6	254280	254285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113005
5621	NC_014664	AAG	2	6	254389	254394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312113006
5622	NC_014664	GGC	2	6	254441	254446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113006
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5624	NC_014664	AAG	2	6	254689	254694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312113007
5625	NC_014664	AGGCG	2	10	254726	254735	20 %	0 %	60 %	20 %	312113007
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5645	NC_014664	GGC	2	6	255813	255818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113009
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5681	NC_014664	CCTT	2	8	257662	257669	0 %	50 %	0 %	50 %	312113011
5682	NC_014664	CGA	3	9	257713	257721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113011
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5721	NC_014664	CGGG	2	8	259935	259942	0 %	0 %	75 %	25 %	312113012
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5728	NC_014664	CGT	2	6	260112	260117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113012
5729	NC_014664	GCA	2	6	260129	260134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113012
5730	NC_014664	ACG	2	6	260202	260207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113012
5731	NC_014664	GCCGC	2	10	260211	260220	0 %	0 %	40 %	60 %	312113012
5732	NC_014664	GC	5	10	260255	260264	0 %	0 %	50 %	50 %	312113012
5733	NC_014664	GCC	2	6	260351	260356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113012
5734	NC_014664	GTC	2	6	260368	260373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113012
5735	NC_014664	AGC	2	6	260384	260389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113012
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5737	NC_014664	CTT	2	6	260515	260520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312113012
5738	NC_014664	AGG	2	6	260522	260527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312113012
5739	NC_014664	ATG	3	9	260528	260536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312113012
5740	NC_014664	CCCG	2	8	260562	260569	0 %	0 %	25 %	75 %	312113012
5741	NC_014664	AGCGC	2	10	260570	260579	20 %	0 %	40 %	40 %	312113012
5742	NC_014664	AGCC	2	8	260588	260595	25 %	0 %	25 %	50 %	312113012
5743	NC_014664	TGG	2	6	260604	260609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312113012
5744	NC_014664	CGCGA	2	10	260615	260624	20 %	0 %	40 %	40 %	312113012
5745	NC_014664	CCG	2	6	260631	260636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113012
5746	NC_014664	CGT	2	6	260655	260660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113012
5747	NC_014664	CG	3	6	260693	260698	0 %	0 %	50 %	50 %	312113012
5748	NC_014664	CGA	2	6	260721	260726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113012
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5750	NC_014664	TCG	3	9	260735	260743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113012
5751	NC_014664	CCG	2	6	260783	260788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113012
5752	NC_014664	CCG	2	6	260811	260816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113012
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5755	NC_014664	TCG	2	6	260966	260971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113012
5756	NC_014664	CG	3	6	260998	261003	0 %	0 %	50 %	50 %	312113012
5757	NC_014664	A	7	7	261018	261024	100 %	0 %	0 %	0 %	312113012
5758	NC_014664	GCG	2	6	261038	261043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113012
5759	NC_014664	CGA	2	6	261084	261089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113012
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5763	NC_014664	CCGCG	2	10	261192	261201	0 %	0 %	40 %	60 %	312113012
5764	NC_014664	CGC	3	9	261235	261243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113012
5765	NC_014664	GCC	2	6	261257	261262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113012
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5780	NC_014664	GCG	2	6	261685	261690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113012
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5782	NC_014664	CGG	2	6	261747	261752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113012
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5834	NC_014664	GC	3	6	263324	263329	0 %	0 %	50 %	50 %	312113013
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5846	NC_014664	GAGG	2	8	263666	263673	25 %	0 %	75 %	0 %	312113013
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5852	NC_014664	GGAAG	2	10	263788	263797	40 %	0 %	60 %	0 %	312113013
5853	NC_014664	CGG	2	6	263824	263829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113013
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5857	NC_014664	CGC	2	6	263935	263940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113013
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5862	NC_014664	GCCGC	2	10	264010	264019	0 %	0 %	40 %	60 %	312113013
5863	NC_014664	GCGGTC	2	12	264053	264064	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	312113013
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5865	NC_014664	TCG	2	6	264175	264180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113013
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5975	NC_014664	CG	3	6	268315	268320	0 %	0 %	50 %	50 %	312113017
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5986	NC_014664	GCG	2	6	268957	268962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113017
5987	NC_014664	GCG	2	6	268980	268985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113017
5988	NC_014664	CAT	2	6	269039	269044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312113017
5989	NC_014664	GAT	2	6	269105	269110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312113017
5990	NC_014664	GC	4	8	269111	269118	0 %	0 %	50 %	50 %	312113017
5991	NC_014664	CGA	2	6	269147	269152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113017
5992	NC_014664	GCA	2	6	269156	269161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113017
5993	NC_014664	CGG	3	9	269254	269262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113017
5994	NC_014664	TCG	2	6	269311	269316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113017
5995	NC_014664	GC	3	6	269339	269344	0 %	0 %	50 %	50 %	312113017
5996	NC_014664	ACGCG	2	10	269365	269374	20 %	0 %	40 %	40 %	312113017
5997	NC_014664	GCGCT	2	10	269400	269409	0 %	20 %	40 %	40 %	312113017
5998	NC_014664	TGGC	2	8	269414	269421	0 %	25 %	50 %	25 %	312113017
5999	NC_014664	CGG	2	6	269458	269463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113017
6000	NC_014664	GGGGCT	2	12	269534	269545	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	312113017

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