MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodomicrobium vannielii ATCC 17100 chromosome

Total Repeats: 83208

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_014664	CGAG	2	8	227953	227960	25 %	0 %	50 %	25 %	312112983
5002	NC_014664	ATG	2	6	227961	227966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312112983
5003	NC_014664	CCG	2	6	228080	228085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112984
5004	NC_014664	CCG	2	6	228092	228097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112984
5005	NC_014664	GCA	2	6	228152	228157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112984
5006	NC_014664	CAA	2	6	228164	228169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312112984
5007	NC_014664	GAA	2	6	228171	228176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312112984
5008	NC_014664	CG	3	6	228185	228190	0 %	0 %	50 %	50 %	312112984
5009	NC_014664	TGA	2	6	228191	228196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312112984
5010	NC_014664	AGC	2	6	228202	228207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112984
5011	NC_014664	TGA	2	6	228284	228289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312112984
5012	NC_014664	GCCGTA	2	12	228345	228356	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	312112984
5013	NC_014664	GAT	2	6	228363	228368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312112984
5014	NC_014664	AGC	2	6	228391	228396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112984
5015	NC_014664	GC	3	6	228395	228400	0 %	0 %	50 %	50 %	312112984
5016	NC_014664	CGA	2	6	228413	228418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112984
5017	NC_014664	GCC	2	6	228420	228425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112984
5018	NC_014664	GAC	2	6	228426	228431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112984
5019	NC_014664	CAC	2	6	228445	228450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312112984
5020	NC_014664	CG	3	6	228465	228470	0 %	0 %	50 %	50 %	312112984
5021	NC_014664	GAG	2	6	228498	228503	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312112984
5022	NC_014664	CGG	2	6	228510	228515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112984
5023	NC_014664	ACGAG	2	10	228542	228551	40 %	0 %	40 %	20 %	312112984
5024	NC_014664	CGTG	2	8	228787	228794	0 %	25 %	50 %	25 %	312112985
5025	NC_014664	ATCG	2	8	228805	228812	25 %	25 %	25 %	25 %	312112985
5026	NC_014664	GCG	2	6	228821	228826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112985
5027	NC_014664	TCC	2	6	228885	228890	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312112985
5028	NC_014664	ACG	2	6	228971	228976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112985
5029	NC_014664	TCG	2	6	229044	229049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112985
5030	NC_014664	CGG	2	6	229084	229089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112985
5031	NC_014664	CG	3	6	229139	229144	0 %	0 %	50 %	50 %	312112985
5032	NC_014664	CGA	2	6	229183	229188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112985
5033	NC_014664	CGC	2	6	229192	229197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112985
5034	NC_014664	CGCGG	2	10	229201	229210	0 %	0 %	60 %	40 %	312112985
5035	NC_014664	GGC	3	9	229217	229225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112985
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5037	NC_014664	GAC	2	6	229241	229246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112985
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5039	NC_014664	CGC	2	6	229539	229544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112985
5040	NC_014664	GGC	2	6	229607	229612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112985
5041	NC_014664	GCG	2	6	229660	229665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112985
5042	NC_014664	CTG	2	6	229687	229692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112985
5043	NC_014664	GGC	2	6	229706	229711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112985
5044	NC_014664	CGG	2	6	229774	229779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112985
5045	NC_014664	GGC	2	6	229816	229821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112985
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5047	NC_014664	GTG	2	6	229838	229843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	312112985
5048	NC_014664	AGCG	2	8	229899	229906	25 %	0 %	50 %	25 %	312112986
5049	NC_014664	GAA	2	6	229951	229956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312112986
5050	NC_014664	GGC	2	6	230047	230052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112986
5051	NC_014664	TGA	2	6	230090	230095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312112986
5052	NC_014664	CGCGGG	2	12	230101	230112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112986
5053	NC_014664	TCG	2	6	230120	230125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112986
5054	NC_014664	GAG	2	6	230128	230133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312112986
5055	NC_014664	CCG	2	6	230170	230175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112986
5056	NC_014664	CG	3	6	230194	230199	0 %	0 %	50 %	50 %	312112986
5057	NC_014664	GAA	2	6	230272	230277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312112986
5058	NC_014664	GAA	3	9	230289	230297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	312112986
5059	NC_014664	CGC	2	6	230307	230312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112986
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5061	NC_014664	CCA	2	6	230363	230368	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312112987
5062	NC_014664	GCG	2	6	230390	230395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112987
5063	NC_014664	TTC	2	6	230398	230403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	312112987
5064	NC_014664	CCA	2	6	230430	230435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	312112987
5065	NC_014664	CAG	2	6	230440	230445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112987
5066	NC_014664	TCG	2	6	230501	230506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112987
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5069	NC_014664	CTGC	2	8	230565	230572	0 %	25 %	25 %	50 %	312112987
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5074	NC_014664	TCG	2	6	230651	230656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112987
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5085	NC_014664	AGAT	2	8	230965	230972	50 %	25 %	25 %	0 %	312112987
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5095	NC_014664	CGG	2	6	231317	231322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112987
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5105	NC_014664	GC	3	6	231652	231657	0 %	0 %	50 %	50 %	312112988
5106	NC_014664	GAT	2	6	231668	231673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312112988
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5109	NC_014664	CGG	2	6	231775	231780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112988
5110	NC_014664	GCGCC	2	10	231781	231790	0 %	0 %	40 %	60 %	312112988
5111	NC_014664	CGG	2	6	231883	231888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112988
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5119	NC_014664	GTC	2	6	232196	232201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112988
5120	NC_014664	GC	3	6	232242	232247	0 %	0 %	50 %	50 %	312112988
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5122	NC_014664	CG	3	6	232345	232350	0 %	0 %	50 %	50 %	312112988
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5124	NC_014664	TCG	2	6	232413	232418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112988
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5244	NC_014664	CGCC	2	8	237654	237661	0 %	0 %	25 %	75 %	312112993
5245	NC_014664	CCG	2	6	237677	237682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112993
5246	NC_014664	CGC	2	6	237748	237753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112993
5247	NC_014664	CG	3	6	237775	237780	0 %	0 %	50 %	50 %	312112993
5248	NC_014664	GGA	2	6	237796	237801	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	312112993
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5251	NC_014664	CTG	2	6	237878	237883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112993
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5253	NC_014664	CGC	2	6	237894	237899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112993
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5265	NC_014664	GGC	2	6	238716	238721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112994
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5350	NC_014664	CGA	2	6	242422	242427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112995
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5358	NC_014664	GCGG	2	8	242935	242942	0 %	0 %	75 %	25 %	312112996
5359	NC_014664	CGG	2	6	242967	242972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112996
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5364	NC_014664	CGG	2	6	243176	243181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112996
5365	NC_014664	GGC	2	6	243220	243225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112996
5366	NC_014664	GCGAG	2	10	243237	243246	20 %	0 %	60 %	20 %	312112996
5367	NC_014664	ACA	2	6	243308	243313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	312112996
5368	NC_014664	CGA	2	6	243339	243344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112996
5369	NC_014664	CGG	2	6	243381	243386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112996
5370	NC_014664	TGC	2	6	243431	243436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112996
5371	NC_014664	TCA	2	6	243491	243496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312112996
5372	NC_014664	GCC	2	6	243513	243518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112996
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5374	NC_014664	CG	5	10	243581	243590	0 %	0 %	50 %	50 %	312112996
5375	NC_014664	GGC	2	6	243600	243605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112996
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5377	NC_014664	CCG	2	6	243694	243699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112997
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5379	NC_014664	CG	4	8	243872	243879	0 %	0 %	50 %	50 %	312112997
5380	NC_014664	CAG	2	6	243942	243947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112997
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5382	NC_014664	GCT	2	6	244194	244199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112998
5383	NC_014664	CG	4	8	244222	244229	0 %	0 %	50 %	50 %	312112998
5384	NC_014664	CGT	2	6	244236	244241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112998
5385	NC_014664	GC	4	8	244323	244330	0 %	0 %	50 %	50 %	312112998
5386	NC_014664	GGGCG	2	10	244338	244347	0 %	0 %	80 %	20 %	312112998
5387	NC_014664	GCC	2	6	244425	244430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112998
5388	NC_014664	CGATC	2	10	244581	244590	20 %	20 %	20 %	40 %	312112998
5389	NC_014664	TGC	2	6	244599	244604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112998
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5393	NC_014664	GGC	2	6	244756	244761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112998
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5396	NC_014664	CGT	2	6	244872	244877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112998
5397	NC_014664	CG	3	6	244895	244900	0 %	0 %	50 %	50 %	312112998
5398	NC_014664	CAT	2	6	244923	244928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312112998
5399	NC_014664	CG	3	6	244940	244945	0 %	0 %	50 %	50 %	312112998
5400	NC_014664	T	7	7	245424	245430	0 %	100 %	0 %	0 %	312112999
5401	NC_014664	CGC	2	6	245461	245466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312112999
5402	NC_014664	CCAGC	2	10	245501	245510	20 %	0 %	20 %	60 %	312112999
5403	NC_014664	GA	3	6	245543	245548	50 %	0 %	50 %	0 %	312112999
5404	NC_014664	CG	3	6	245677	245682	0 %	0 %	50 %	50 %	312112999
5405	NC_014664	CAGG	2	8	245831	245838	25 %	0 %	50 %	25 %	312112999
5406	NC_014664	TCG	2	6	245880	245885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312112999
5407	NC_014664	GCCGGT	2	12	245906	245917	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	312112999
5408	NC_014664	GGCG	2	8	245927	245934	0 %	0 %	75 %	25 %	312112999
5409	NC_014664	GGC	2	6	245986	245991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312112999
5410	NC_014664	CCACG	2	10	246046	246055	20 %	0 %	20 %	60 %	312112999
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5413	NC_014664	CCGCG	3	15	246197	246211	0 %	0 %	40 %	60 %	312112999
5414	NC_014664	CGA	2	6	246253	246258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312112999
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5416	NC_014664	GTA	2	6	246281	246286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	312112999
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5427	NC_014664	GCGG	2	8	246833	246840	0 %	0 %	75 %	25 %	312113000
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5431	NC_014664	CGG	2	6	246971	246976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113000
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5443	NC_014664	GC	3	6	247312	247317	0 %	0 %	50 %	50 %	312113000
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5446	NC_014664	CCG	2	6	247494	247499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	312113000
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5454	NC_014664	CGA	2	6	247863	247868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113000
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5457	NC_014664	GGCG	2	8	248148	248155	0 %	0 %	75 %	25 %	312113001
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5471	NC_014664	GCG	2	6	248471	248476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113001
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5475	NC_014664	GGC	2	6	248721	248726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113001
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5480	NC_014664	GGC	2	6	248836	248841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113001
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5482	NC_014664	TGC	2	6	248894	248899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113001
5483	NC_014664	GAC	3	9	248908	248916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113001
5484	NC_014664	CCGCG	2	10	248943	248952	0 %	0 %	40 %	60 %	312113001
5485	NC_014664	TCG	2	6	248972	248977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113001
5486	NC_014664	GCGG	2	8	249099	249106	0 %	0 %	75 %	25 %	312113001
5487	NC_014664	CCT	2	6	249266	249271	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312113002
5488	NC_014664	GTC	2	6	249369	249374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	312113002
5489	NC_014664	GCACGG	2	12	249400	249411	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	312113002
5490	NC_014664	CCT	2	6	249416	249421	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	312113002
5491	NC_014664	CGG	2	6	249511	249516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113002
5492	NC_014664	TCGG	2	8	249525	249532	0 %	25 %	50 %	25 %	312113002
5493	NC_014664	CGG	2	6	249587	249592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	312113002
5494	NC_014664	GC	5	10	249619	249628	0 %	0 %	50 %	50 %	312113002
5495	NC_014664	CT	3	6	249673	249678	0 %	50 %	0 %	50 %	312113002
5496	NC_014664	TCA	2	6	249730	249735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	312113002
5497	NC_014664	CG	3	6	249764	249769	0 %	0 %	50 %	50 %	312113002
5498	NC_014664	CGA	2	6	249799	249804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	312113002
5499	NC_014664	CG	3	6	249821	249826	0 %	0 %	50 %	50 %	312113002
5500	NC_014664	CCGCG	2	10	249873	249882	0 %	0 %	40 %	60 %	312113002

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