MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Rothia dentocariosa ATCC 17931 chromosome

Total Repeats: 1155

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014643	CGCCA	2	10	1661	1670	20 %	0 %	20 %	60 %	311111672
2	NC_014643	GGTCT	2	10	1984	1993	0 %	40 %	40 %	20 %	311111672
3	NC_014643	CAAAG	2	10	2961	2970	60 %	0 %	20 %	20 %	311111672
4	NC_014643	CTTCG	2	10	4909	4918	0 %	40 %	20 %	40 %	311111674
5	NC_014643	TTGCC	2	10	5568	5577	0 %	40 %	20 %	40 %	311111674
6	NC_014643	TGGCT	2	10	9313	9322	0 %	40 %	40 %	20 %	311111676
7	NC_014643	GAAGA	2	10	14147	14156	60 %	0 %	40 %	0 %	311111681
8	NC_014643	TTCCG	2	10	21113	21122	0 %	40 %	20 %	40 %	311111688
9	NC_014643	CAGAT	2	10	21289	21298	40 %	20 %	20 %	20 %	311111688
10	NC_014643	AGATA	2	10	23539	23548	60 %	20 %	20 %	0 %	311111692
11	NC_014643	GAAGC	2	10	23844	23853	40 %	0 %	40 %	20 %	311111692
12	NC_014643	ATCAG	2	10	24815	24824	40 %	20 %	20 %	20 %	311111693
13	NC_014643	CCGTT	2	10	27896	27905	0 %	40 %	20 %	40 %	311111696
14	NC_014643	CGAAG	2	10	35295	35304	40 %	0 %	40 %	20 %	311111700
15	NC_014643	TCTGC	2	10	36295	36304	0 %	40 %	20 %	40 %	311111701
16	NC_014643	TCCTT	2	10	36516	36525	0 %	60 %	0 %	40 %	311111701
17	NC_014643	CGGGG	2	10	37879	37888	0 %	0 %	80 %	20 %	311111702
18	NC_014643	TTCAG	2	10	44329	44338	20 %	40 %	20 %	20 %	311111708
19	NC_014643	CTGCT	2	10	45754	45763	0 %	40 %	20 %	40 %	311111711
20	NC_014643	TGCAT	2	10	48552	48561	20 %	40 %	20 %	20 %	311111715
21	NC_014643	TCCGG	2	10	51748	51757	0 %	20 %	40 %	40 %	311111718
22	NC_014643	CAATA	2	10	52610	52619	60 %	20 %	0 %	20 %	311111718
23	NC_014643	CGGTT	2	10	53030	53039	0 %	40 %	40 %	20 %	311111718
24	NC_014643	GCGCC	2	10	53317	53326	0 %	0 %	40 %	60 %	311111719
25	NC_014643	CGTGC	2	10	57619	57628	0 %	20 %	40 %	40 %	311111721
26	NC_014643	ACGAT	2	10	59535	59544	40 %	20 %	20 %	20 %	311111723
27	NC_014643	TGCTT	2	10	60996	61005	0 %	60 %	20 %	20 %	311111725
28	NC_014643	CGTCC	2	10	62377	62386	0 %	20 %	20 %	60 %	311111726
29	NC_014643	TAAGA	2	10	64337	64346	60 %	20 %	20 %	0 %	311111727
30	NC_014643	ACTGC	2	10	67481	67490	20 %	20 %	20 %	40 %	311111731
31	NC_014643	ATCGA	2	10	69548	69557	40 %	20 %	20 %	20 %	311111732
32	NC_014643	TTCCA	2	10	77308	77317	20 %	40 %	0 %	40 %	311111738
33	NC_014643	GCGAT	2	10	83674	83683	20 %	20 %	40 %	20 %	311111745
34	NC_014643	ACGTG	2	10	88436	88445	20 %	20 %	40 %	20 %	311111749
35	NC_014643	ATCGC	2	10	89673	89682	20 %	20 %	20 %	40 %	311111751
36	NC_014643	TACTG	2	10	92286	92295	20 %	40 %	20 %	20 %	311111753
37	NC_014643	TGCTG	2	10	92675	92684	0 %	40 %	40 %	20 %	311111753
38	NC_014643	GACGG	2	10	102928	102937	20 %	0 %	60 %	20 %	311111760
39	NC_014643	GCCGC	2	10	106760	106769	0 %	0 %	40 %	60 %	311111762
40	NC_014643	GCTCA	2	10	110163	110172	20 %	20 %	20 %	40 %	311111762
41	NC_014643	CCACA	2	10	110298	110307	40 %	0 %	0 %	60 %	311111762
42	NC_014643	GGGCT	2	10	116287	116296	0 %	20 %	60 %	20 %	311111765
43	NC_014643	AAATC	2	10	118835	118844	60 %	20 %	0 %	20 %	311111768
44	NC_014643	AGTAA	2	10	123772	123781	60 %	20 %	20 %	0 %	311111774
45	NC_014643	ATTAA	2	10	123821	123830	60 %	40 %	0 %	0 %	311111774
46	NC_014643	AGCTC	2	10	128153	128162	20 %	20 %	20 %	40 %	311111777
47	NC_014643	GCGCG	2	10	128285	128294	0 %	0 %	60 %	40 %	311111777
48	NC_014643	GCGCG	2	10	130043	130052	0 %	0 %	60 %	40 %	311111778
49	NC_014643	CGCAG	2	10	130522	130531	20 %	0 %	40 %	40 %	311111778
50	NC_014643	CGGCG	2	10	134344	134353	0 %	0 %	60 %	40 %	311111782
51	NC_014643	GGATG	2	10	137626	137635	20 %	20 %	60 %	0 %	311111785
52	NC_014643	CGGTT	2	10	143346	143355	0 %	40 %	40 %	20 %	311111791
53	NC_014643	CGCTG	2	10	145911	145920	0 %	20 %	40 %	40 %	311111793
54	NC_014643	GCGCC	2	10	146336	146345	0 %	0 %	40 %	60 %	311111793
55	NC_014643	GAATA	2	10	146535	146544	60 %	20 %	20 %	0 %	311111793
56	NC_014643	GGCGC	2	10	147132	147141	0 %	0 %	60 %	40 %	311111794
57	NC_014643	GGCTG	2	10	148625	148634	0 %	20 %	60 %	20 %	311111795
58	NC_014643	TCGCT	2	10	148847	148856	0 %	40 %	20 %	40 %	311111795
59	NC_014643	CGGTT	2	10	150387	150396	0 %	40 %	40 %	20 %	311111796
60	NC_014643	GAAGG	2	10	154042	154051	40 %	0 %	60 %	0 %	311111800
61	NC_014643	GCCGC	2	10	155104	155113	0 %	0 %	40 %	60 %	311111802
62	NC_014643	CGTGG	2	10	156453	156462	0 %	20 %	60 %	20 %	311111803
63	NC_014643	GGTAT	2	10	159044	159053	20 %	40 %	40 %	0 %	311111805
64	NC_014643	CGCTG	2	10	160566	160575	0 %	20 %	40 %	40 %	311111807
65	NC_014643	CATTG	2	10	160897	160906	20 %	40 %	20 %	20 %	311111807
66	NC_014643	CAGCC	2	10	162320	162329	20 %	0 %	20 %	60 %	311111809
67	NC_014643	GCCAC	2	10	162985	162994	20 %	0 %	20 %	60 %	311111809
68	NC_014643	GCATC	2	10	167443	167452	20 %	20 %	20 %	40 %	311111812
69	NC_014643	TCCCC	2	10	169544	169553	0 %	20 %	0 %	80 %	311111815
70	NC_014643	CGACC	2	10	171933	171942	20 %	0 %	20 %	60 %	311111816
71	NC_014643	GGCGA	2	10	172072	172081	20 %	0 %	60 %	20 %	311111816
72	NC_014643	CCACG	2	10	174820	174829	20 %	0 %	20 %	60 %	311111819
73	NC_014643	AACGT	2	10	177941	177950	40 %	20 %	20 %	20 %	311111822
74	NC_014643	CCCAG	2	10	178638	178647	20 %	0 %	20 %	60 %	311111824
75	NC_014643	GGCGC	2	10	187335	187344	0 %	0 %	60 %	40 %	311111833
76	NC_014643	TTCGA	2	10	187692	187701	20 %	40 %	20 %	20 %	311111833
77	NC_014643	CCCCG	2	10	198366	198375	0 %	0 %	20 %	80 %	311111846
78	NC_014643	CCTCG	2	10	199962	199971	0 %	20 %	20 %	60 %	311111848
79	NC_014643	CCGTG	2	10	202383	202392	0 %	20 %	40 %	40 %	311111852
80	NC_014643	CTGTA	2	10	203148	203157	20 %	40 %	20 %	20 %	311111853
81	NC_014643	CTGCA	2	10	204355	204364	20 %	20 %	20 %	40 %	311111855
82	NC_014643	ATCCC	2	10	208417	208426	20 %	20 %	0 %	60 %	311111860
83	NC_014643	CCGCA	2	10	210588	210597	20 %	0 %	20 %	60 %	311111864
84	NC_014643	CATGG	2	10	210705	210714	20 %	20 %	40 %	20 %	311111864
85	NC_014643	TGGCA	2	10	213400	213409	20 %	20 %	40 %	20 %	311111867
86	NC_014643	TGCGC	2	10	213632	213641	0 %	20 %	40 %	40 %	311111867
87	NC_014643	GAGAA	2	10	216163	216172	60 %	0 %	40 %	0 %	311111870
88	NC_014643	GCGCA	2	10	218196	218205	20 %	0 %	40 %	40 %	311111871
89	NC_014643	CGCTG	2	10	219129	219138	0 %	20 %	40 %	40 %	311111872
90	NC_014643	ATACG	2	10	220563	220572	40 %	20 %	20 %	20 %	311111874
91	NC_014643	GAATG	2	10	227310	227319	40 %	20 %	40 %	0 %	311111879
92	NC_014643	AGGGC	2	10	229346	229355	20 %	0 %	60 %	20 %	311111881
93	NC_014643	GAGCA	2	10	232019	232028	40 %	0 %	40 %	20 %	311111884
94	NC_014643	CGCAT	2	10	233667	233676	20 %	20 %	20 %	40 %	311111884
95	NC_014643	GCATC	2	10	233914	233923	20 %	20 %	20 %	40 %	311111884
96	NC_014643	GTGTG	2	10	238103	238112	0 %	40 %	60 %	0 %	311111888
97	NC_014643	CGAGT	2	10	238501	238510	20 %	20 %	40 %	20 %	311111888
98	NC_014643	CCTGA	2	10	241155	241164	20 %	20 %	20 %	40 %	311111890
99	NC_014643	CGATT	2	10	241832	241841	20 %	40 %	20 %	20 %	311111890
100	NC_014643	GATGC	2	10	241890	241899	20 %	20 %	40 %	20 %	311111890
101	NC_014643	CGAAG	2	10	242393	242402	40 %	0 %	40 %	20 %	311111890
102	NC_014643	ACGGT	2	10	244547	244556	20 %	20 %	40 %	20 %	311111893
103	NC_014643	ATTTT	2	10	249788	249797	20 %	80 %	0 %	0 %	311111900
104	NC_014643	TCACC	2	10	252528	252537	20 %	20 %	0 %	60 %	311111904
105	NC_014643	TGCGT	2	10	254597	254606	0 %	40 %	40 %	20 %	311111906
106	NC_014643	TCGGC	2	10	255148	255157	0 %	20 %	40 %	40 %	311111906
107	NC_014643	CACCG	2	10	257605	257614	20 %	0 %	20 %	60 %	311111909
108	NC_014643	CAGAG	2	10	258202	258211	40 %	0 %	40 %	20 %	311111909
109	NC_014643	GACGG	2	10	258409	258418	20 %	0 %	60 %	20 %	311111909
110	NC_014643	CACGC	2	10	260841	260850	20 %	0 %	20 %	60 %	311111913
111	NC_014643	CGGAA	2	10	263498	263507	40 %	0 %	40 %	20 %	311111916
112	NC_014643	CAGCG	2	10	265336	265345	20 %	0 %	40 %	40 %	311111917
113	NC_014643	TCCCC	2	10	268314	268323	0 %	20 %	0 %	80 %	311111920
114	NC_014643	CGCAC	2	10	269519	269528	20 %	0 %	20 %	60 %	311111921
115	NC_014643	TGCGC	2	10	271484	271493	0 %	20 %	40 %	40 %	311111923
116	NC_014643	GGGTG	2	10	271709	271718	0 %	20 %	80 %	0 %	311111923
117	NC_014643	CGGCG	2	10	271811	271820	0 %	0 %	60 %	40 %	311111923
118	NC_014643	GCCCG	2	10	272457	272466	0 %	0 %	40 %	60 %	311111924
119	NC_014643	CGCTG	2	10	275448	275457	0 %	20 %	40 %	40 %	311111927
120	NC_014643	GCACG	2	10	280268	280277	20 %	0 %	40 %	40 %	311111931
121	NC_014643	TAGCG	2	10	282293	282302	20 %	20 %	40 %	20 %	311111933
122	NC_014643	CGGTT	2	10	286330	286339	0 %	40 %	40 %	20 %	311111938
123	NC_014643	GGTAC	2	10	288697	288706	20 %	20 %	40 %	20 %	311111939
124	NC_014643	GCACC	2	10	295436	295445	20 %	0 %	20 %	60 %	311111949
125	NC_014643	ATGCC	2	10	296431	296440	20 %	20 %	20 %	40 %	311111950
126	NC_014643	GTAAG	2	10	298115	298124	40 %	20 %	40 %	0 %	311111952
127	NC_014643	CACGC	2	10	298492	298501	20 %	0 %	20 %	60 %	311111952
128	NC_014643	GCTTT	2	10	300775	300784	0 %	60 %	20 %	20 %	311111956
129	NC_014643	TTGCG	2	10	301914	301923	0 %	40 %	40 %	20 %	311111958
130	NC_014643	CTGCC	2	10	303893	303902	0 %	20 %	20 %	60 %	311111962
131	NC_014643	AGCTG	2	10	308437	308446	20 %	20 %	40 %	20 %	311111967
132	NC_014643	ACCAC	2	10	309674	309683	40 %	0 %	0 %	60 %	311111970
133	NC_014643	GAACA	2	10	310872	310881	60 %	0 %	20 %	20 %	311111972
134	NC_014643	ATCAA	2	10	312824	312833	60 %	20 %	0 %	20 %	311111976
135	NC_014643	TGCAG	2	10	315317	315326	20 %	20 %	40 %	20 %	311111977
136	NC_014643	GGGCA	2	10	316227	316236	20 %	0 %	60 %	20 %	311111977
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138	NC_014643	TTACC	2	10	326839	326848	20 %	40 %	0 %	40 %	311111983
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142	NC_014643	CGGAA	2	10	334670	334679	40 %	0 %	40 %	20 %	311111988
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145	NC_014643	CGTGC	2	10	336487	336496	0 %	20 %	40 %	40 %	311111989
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147	NC_014643	CGGTA	2	10	340715	340724	20 %	20 %	40 %	20 %	311111991
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253	NC_014643	ATCGC	2	10	556985	556994	20 %	20 %	20 %	40 %	311112174
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258	NC_014643	GAGCA	2	10	569187	569196	40 %	0 %	40 %	20 %	311112185
259	NC_014643	CCCGG	2	10	569376	569385	0 %	0 %	40 %	60 %	311112185
260	NC_014643	CGTTG	2	10	571512	571521	0 %	40 %	40 %	20 %	311112187
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