MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rothia dentocariosa ATCC 17931 chromosome

Total Repeats: 41771

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014643	GAA	2	6	35617	35622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	311111701
502	NC_014643	CAGA	2	8	35668	35675	50 %	0 %	25 %	25 %	311111701
503	NC_014643	AG	3	6	35687	35692	50 %	0 %	50 %	0 %	311111701
504	NC_014643	CATG	2	8	35737	35744	25 %	25 %	25 %	25 %	311111701
505	NC_014643	CTC	2	6	35830	35835	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	311111701
506	NC_014643	TCT	2	6	35970	35975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311111701
507	NC_014643	GATT	2	8	36018	36025	25 %	50 %	25 %	0 %	311111701
508	NC_014643	TGC	2	6	36066	36071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311111701
509	NC_014643	GGC	2	6	36129	36134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311111701
510	NC_014643	TCTGC	2	10	36295	36304	0 %	40 %	20 %	40 %	311111701
511	NC_014643	TCA	2	6	36342	36347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311111701
512	NC_014643	TGA	2	6	36435	36440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311111701
513	NC_014643	TCCTT	2	10	36516	36525	0 %	60 %	0 %	40 %	311111701
514	NC_014643	CAG	2	6	36581	36586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311111701
515	NC_014643	AAC	2	6	36600	36605	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	311111701
516	NC_014643	TGA	2	6	36615	36620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311111701
517	NC_014643	CTT	2	6	36778	36783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311111701
518	NC_014643	GGGC	2	8	36873	36880	0 %	0 %	75 %	25 %	311111701
519	NC_014643	GAA	2	6	36886	36891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	311111701
520	NC_014643	TTC	2	6	36911	36916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311111701
521	NC_014643	CGG	2	6	36992	36997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311111701
522	NC_014643	A	6	6	37082	37087	100 %	0 %	0 %	0 %	311111701
523	NC_014643	GC	3	6	37108	37113	0 %	0 %	50 %	50 %	311111701
524	NC_014643	ATCC	2	8	37120	37127	25 %	25 %	0 %	50 %	311111702
525	NC_014643	CGA	2	6	37142	37147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311111702
526	NC_014643	CGT	2	6	37244	37249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311111702
527	NC_014643	GGT	2	6	37267	37272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311111702
528	NC_014643	AGT	2	6	37274	37279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311111702
529	NC_014643	GGCACG	2	12	37319	37330	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	311111702
530	NC_014643	AT	3	6	37384	37389	50 %	50 %	0 %	0 %	311111702
531	NC_014643	GC	3	6	37410	37415	0 %	0 %	50 %	50 %	311111702
532	NC_014643	TCGT	2	8	37417	37424	0 %	50 %	25 %	25 %	311111702
533	NC_014643	TTC	2	6	37436	37441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311111702
534	NC_014643	GTG	3	9	37485	37493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311111702
535	NC_014643	TGC	3	9	37523	37531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311111702
536	NC_014643	CGT	2	6	37568	37573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311111702
537	NC_014643	GCA	2	6	37637	37642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311111702
538	NC_014643	ACT	2	6	37643	37648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311111702
539	NC_014643	ATT	2	6	37651	37656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	311111702
540	NC_014643	GAGT	2	8	37712	37719	25 %	25 %	50 %	0 %	311111702
541	NC_014643	TCT	2	6	37733	37738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311111702
542	NC_014643	GGTA	2	8	37808	37815	25 %	25 %	50 %	0 %	311111702
543	NC_014643	CACT	2	8	37834	37841	25 %	25 %	0 %	50 %	311111702
544	NC_014643	CGGGG	2	10	37879	37888	0 %	0 %	80 %	20 %	311111702
545	NC_014643	ACC	2	6	37949	37954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311111702
546	NC_014643	CCG	2	6	38010	38015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311111702
547	NC_014643	TCA	2	6	38078	38083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311111702
548	NC_014643	GTG	2	6	38146	38151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311111702
549	NC_014643	GTT	2	6	38187	38192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	311111702
550	NC_014643	TGA	2	6	38195	38200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311111702
551	NC_014643	ACG	2	6	38318	38323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311111703
552	NC_014643	TGA	2	6	38332	38337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311111703
553	NC_014643	TAT	2	6	38512	38517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	311111703
554	NC_014643	GTG	2	6	38598	38603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311111703
555	NC_014643	CTC	2	6	38630	38635	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	311111703
556	NC_014643	GGT	2	6	38688	38693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311111703
557	NC_014643	GGGA	2	8	38814	38821	25 %	0 %	75 %	0 %	311111703
558	NC_014643	TC	3	6	38842	38847	0 %	50 %	0 %	50 %	311111703
559	NC_014643	TGG	2	6	38904	38909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311111703
560	NC_014643	CAG	2	6	39009	39014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311111703
561	NC_014643	GCAG	2	8	39040	39047	25 %	0 %	50 %	25 %	311111703
562	NC_014643	CTA	2	6	39069	39074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311111703
563	NC_014643	AAG	2	6	39273	39278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	311111704
564	NC_014643	GAA	2	6	39285	39290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	311111704
565	NC_014643	A	6	6	39401	39406	100 %	0 %	0 %	0 %	311111704
566	NC_014643	AGTCGT	2	12	39497	39508	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	311111704
567	NC_014643	AGC	2	6	39576	39581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311111704
568	NC_014643	GAG	2	6	39677	39682	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	311111704
569	NC_014643	GGC	2	6	39705	39710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311111704
570	NC_014643	CCT	2	6	39830	39835	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	311111704
571	NC_014643	GT	3	6	39875	39880	0 %	50 %	50 %	0 %	311111704
572	NC_014643	TTG	2	6	40798	40803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	311111705
573	NC_014643	CTG	2	6	40848	40853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311111705
574	NC_014643	ATA	2	6	40879	40884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	311111705
575	NC_014643	GAT	2	6	40890	40895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311111705
576	NC_014643	TAA	2	6	40910	40915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	311111705
577	NC_014643	CGA	2	6	41012	41017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311111705
578	NC_014643	AAT	2	6	41061	41066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	311111705
579	NC_014643	GAA	2	6	41128	41133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	311111705
580	NC_014643	CTG	2	6	41160	41165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311111705
581	NC_014643	ATA	2	6	41178	41183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	311111705
582	NC_014643	CTG	2	6	41271	41276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311111705
583	NC_014643	CTG	3	9	41322	41330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311111705
584	NC_014643	GAA	2	6	41344	41349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	311111705
585	NC_014643	GAT	2	6	41365	41370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311111705
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587	NC_014643	CTG	2	6	41412	41417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311111705
588	NC_014643	CTG	2	6	41487	41492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311111705
589	NC_014643	CTG	2	6	41505	41510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311111705
590	NC_014643	CTG	2	6	41574	41579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311111705
591	NC_014643	GAA	2	6	41620	41625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	311111705
592	NC_014643	TGC	2	6	41647	41652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311111705
593	NC_014643	GAG	2	6	41668	41673	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	311111705
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595	NC_014643	CTG	2	6	41705	41710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311111705
596	NC_014643	GCT	2	6	41720	41725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311111705
597	NC_014643	ACC	2	6	41739	41744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311111705
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599	NC_014643	CTG	3	9	41793	41801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311111705
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606	NC_014643	ACC	2	6	42390	42395	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311111706
607	NC_014643	ACC	2	6	42411	42416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311111706
608	NC_014643	AAT	2	6	42447	42452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	311111706
609	NC_014643	CAA	2	6	42476	42481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	311111706
610	NC_014643	CAG	2	6	42557	42562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311111706
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612	NC_014643	GCA	2	6	42619	42624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311111706
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614	NC_014643	GCG	2	6	43120	43125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311111707
615	NC_014643	CCAG	2	8	43179	43186	25 %	0 %	25 %	50 %	311111707
616	NC_014643	AAT	2	6	43333	43338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	311111707
617	NC_014643	ATT	2	6	43342	43347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	311111707
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621	NC_014643	C	6	6	43467	43472	0 %	0 %	0 %	100 %	311111708
622	NC_014643	GCTT	2	8	43572	43579	0 %	50 %	25 %	25 %	311111708
623	NC_014643	CTTT	2	8	43598	43605	0 %	75 %	0 %	25 %	311111708
624	NC_014643	TCC	2	6	43612	43617	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	311111708
625	NC_014643	GCA	2	6	43649	43654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311111708
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627	NC_014643	GA	3	6	43907	43912	50 %	0 %	50 %	0 %	311111708
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751	NC_014643	TCCGG	2	10	51748	51757	0 %	20 %	40 %	40 %	311111718
752	NC_014643	GGC	2	6	51782	51787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311111718
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754	NC_014643	CG	3	6	52014	52019	0 %	0 %	50 %	50 %	311111718
755	NC_014643	CCA	2	6	52107	52112	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311111718
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874	NC_014643	GCA	2	6	60873	60878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311111725
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877	NC_014643	ATT	2	6	61061	61066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	311111725
878	NC_014643	TC	3	6	61084	61089	0 %	50 %	0 %	50 %	311111725
879	NC_014643	TTG	2	6	61093	61098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	311111725
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