MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rothia dentocariosa ATCC 17931 chromosome

Total Repeats: 41771

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_014643	TCA	2	6	360630	360635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311112009
6002	NC_014643	GCC	2	6	360743	360748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311112009
6003	NC_014643	CCG	3	9	360863	360871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311112009
6004	NC_014643	ATC	2	6	360964	360969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311112009
6005	NC_014643	CCA	2	6	360996	361001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311112009
6006	NC_014643	AAT	2	6	361039	361044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	311112009
6007	NC_014643	TTC	2	6	361124	361129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311112009
6008	NC_014643	GCC	2	6	361160	361165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311112009
6009	NC_014643	TGT	2	6	361173	361178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	311112009
6010	NC_014643	GCA	2	6	361197	361202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311112009
6011	NC_014643	T	6	6	361423	361428	0 %	100 %	0 %	0 %	311112010
6012	NC_014643	CCG	2	6	361456	361461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311112010
6013	NC_014643	GAA	2	6	361491	361496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	311112010
6014	NC_014643	CGG	2	6	361559	361564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311112010
6015	NC_014643	CGA	2	6	361574	361579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311112010
6016	NC_014643	CGG	2	6	361618	361623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311112010
6017	NC_014643	CCT	2	6	361633	361638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	311112010
6018	NC_014643	CCG	2	6	361654	361659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311112010
6019	NC_014643	GCCT	2	8	361802	361809	0 %	25 %	25 %	50 %	311112010
6020	NC_014643	TCA	2	6	361913	361918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311112010
6021	NC_014643	GTC	2	6	361950	361955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311112010
6022	NC_014643	ATC	2	6	361981	361986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311112010
6023	NC_014643	GCA	2	6	362243	362248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311112010
6024	NC_014643	TGCGC	2	10	362372	362381	0 %	20 %	40 %	40 %	311112010
6025	NC_014643	CCA	2	6	362394	362399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311112010
6026	NC_014643	CAT	2	6	362450	362455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311112010
6027	NC_014643	GCG	2	6	362471	362476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311112010
6028	NC_014643	AGA	2	6	362570	362575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	311112010
6029	NC_014643	ACCCGA	2	12	362601	362612	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	311112010
6030	NC_014643	GCG	2	6	362729	362734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311112010
6031	NC_014643	CAG	2	6	362849	362854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311112010
6032	NC_014643	GC	3	6	362907	362912	0 %	0 %	50 %	50 %	311112010
6033	NC_014643	CTT	2	6	362922	362927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311112010
6034	NC_014643	TTC	2	6	362941	362946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311112010
6035	NC_014643	TGCTC	2	10	362986	362995	0 %	40 %	20 %	40 %	311112010
6036	NC_014643	TGCGCC	2	12	363291	363302	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	311112011
6037	NC_014643	GCT	2	6	363308	363313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311112011
6038	NC_014643	CTTC	2	8	363389	363396	0 %	50 %	0 %	50 %	311112011
6039	NC_014643	GAGG	2	8	363402	363409	25 %	0 %	75 %	0 %	311112011
6040	NC_014643	TCT	2	6	363440	363445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311112011
6041	NC_014643	CAG	2	6	363491	363496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311112011
6042	NC_014643	CGC	3	9	363500	363508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311112011
6043	NC_014643	GCC	2	6	363513	363518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311112011
6044	NC_014643	TTC	2	6	363558	363563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311112011
6045	NC_014643	TTC	2	6	363627	363632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311112011
6046	NC_014643	TG	3	6	363650	363655	0 %	50 %	50 %	0 %	311112011
6047	NC_014643	TCC	2	6	363774	363779	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	311112012
6048	NC_014643	CCT	2	6	363784	363789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	311112012
6049	NC_014643	AGC	2	6	363869	363874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311112012
6050	NC_014643	CAG	2	6	363899	363904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311112012
6051	NC_014643	GTA	2	6	363968	363973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311112012
6052	NC_014643	TGA	2	6	364051	364056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311112012
6053	NC_014643	TGC	2	6	364115	364120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311112012
6054	NC_014643	AGC	2	6	364124	364129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311112012
6055	NC_014643	TTC	2	6	364137	364142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311112012
6056	NC_014643	GCG	2	6	364175	364180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311112012
6057	NC_014643	GAACCT	2	12	364785	364796	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	311112013
6058	NC_014643	A	6	6	364846	364851	100 %	0 %	0 %	0 %	311112013
6059	NC_014643	TA	3	6	364914	364919	50 %	50 %	0 %	0 %	311112013
6060	NC_014643	CTGC	2	8	364929	364936	0 %	25 %	25 %	50 %	311112013
6061	NC_014643	GCC	2	6	364957	364962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311112013
6062	NC_014643	CGC	2	6	365036	365041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311112013
6063	NC_014643	GCAC	2	8	365051	365058	25 %	0 %	25 %	50 %	311112013
6064	NC_014643	CAG	2	6	365073	365078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311112013
6065	NC_014643	TGC	2	6	365084	365089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311112013
6066	NC_014643	GTTC	2	8	365106	365113	0 %	50 %	25 %	25 %	311112013
6067	NC_014643	GCCGC	2	10	365133	365142	0 %	0 %	40 %	60 %	311112013
6068	NC_014643	CAG	2	6	365164	365169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311112013
6069	NC_014643	TCA	2	6	365333	365338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311112013
6070	NC_014643	AAT	2	6	365668	365673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	311112013
6071	NC_014643	CCA	2	6	365709	365714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311112013
6072	NC_014643	C	6	6	365809	365814	0 %	0 %	0 %	100 %	311112013
6073	NC_014643	GTC	2	6	365819	365824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311112013
6074	NC_014643	CAGCAT	2	12	365975	365986	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	311112014
6075	NC_014643	CAG	2	6	366173	366178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311112014
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6078	NC_014643	GA	3	6	366366	366371	50 %	0 %	50 %	0 %	311112014
6079	NC_014643	GAA	2	6	366383	366388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	311112014
6080	NC_014643	CGC	2	6	366482	366487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311112014
6081	NC_014643	CGG	2	6	366514	366519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311112014
6082	NC_014643	TGG	2	6	366619	366624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311112014
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6084	NC_014643	GCCA	2	8	366729	366736	25 %	0 %	25 %	50 %	311112014
6085	NC_014643	CCCA	2	8	366768	366775	25 %	0 %	0 %	75 %	311112014
6086	NC_014643	TCG	2	6	366856	366861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311112014
6087	NC_014643	TGG	2	6	366880	366885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311112014
6088	NC_014643	GCG	2	6	366912	366917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311112014
6089	NC_014643	GGT	2	6	367352	367357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311112015
6090	NC_014643	GCT	2	6	367450	367455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311112015
6091	NC_014643	CGG	2	6	367456	367461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311112015
6092	NC_014643	GAC	2	6	367624	367629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311112015
6093	NC_014643	CAT	2	6	367640	367645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311112015
6094	NC_014643	GCC	2	6	367682	367687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311112015
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6099	NC_014643	GCG	2	6	368177	368182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311112016
6100	NC_014643	AACC	2	8	368253	368260	50 %	0 %	0 %	50 %	311112016
6101	NC_014643	GTG	2	6	368264	368269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311112016
6102	NC_014643	CAG	2	6	368298	368303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311112016
6103	NC_014643	CTT	2	6	368305	368310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311112016
6104	NC_014643	CAG	2	6	368319	368324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311112016
6105	NC_014643	AGC	2	6	368413	368418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311112016
6106	NC_014643	ATG	2	6	368441	368446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311112016
6107	NC_014643	GCG	2	6	368495	368500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311112016
6108	NC_014643	CCTG	2	8	368501	368508	0 %	25 %	25 %	50 %	311112016
6109	NC_014643	TAA	2	6	368520	368525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	311112016
6110	NC_014643	CTT	3	9	368536	368544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311112016
6111	NC_014643	GTT	2	6	369014	369019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	311112017
6112	NC_014643	AGGAGC	2	12	369030	369041	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	311112017
6113	NC_014643	CTG	2	6	369121	369126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311112017
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6115	NC_014643	A	6	6	369370	369375	100 %	0 %	0 %	0 %	311112017
6116	NC_014643	T	6	6	369402	369407	0 %	100 %	0 %	0 %	311112017
6117	NC_014643	CCA	2	6	369414	369419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311112017
6118	NC_014643	AAC	2	6	369423	369428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	311112017
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6242	NC_014643	GCG	2	6	378433	378438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311112025
6243	NC_014643	CGA	2	6	378491	378496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311112025
6244	NC_014643	CGG	2	6	378679	378684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311112025
6245	NC_014643	GCA	2	6	378697	378702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311112025
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6351	NC_014643	GCG	2	6	385845	385850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311112028
6352	NC_014643	GCG	2	6	385892	385897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311112028
6353	NC_014643	ACG	2	6	385996	386001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311112028
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6355	NC_014643	ACG	2	6	386052	386057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311112028
6356	NC_014643	ATG	2	6	386059	386064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311112028
6357	NC_014643	GCA	2	6	386087	386092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311112028
6358	NC_014643	ATG	2	6	386182	386187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311112028
6359	NC_014643	CTG	2	6	386206	386211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311112028
6360	NC_014643	GCT	2	6	386250	386255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311112028
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