MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rothia dentocariosa ATCC 17931 chromosome

Total Repeats: 41771

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_014643	ACC	2	6	303229	303234	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311111961
5002	NC_014643	CTG	2	6	303298	303303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311111961
5003	NC_014643	GTC	2	6	303319	303324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311111961
5004	NC_014643	AGCC	2	8	303354	303361	25 %	0 %	25 %	50 %	311111961
5005	NC_014643	GCC	2	6	303827	303832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311111962
5006	NC_014643	GTA	2	6	303887	303892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	311111962
5007	NC_014643	CTGCC	2	10	303893	303902	0 %	20 %	20 %	60 %	311111962
5008	NC_014643	A	6	6	304033	304038	100 %	0 %	0 %	0 %	311111962
5009	NC_014643	TGC	2	6	304071	304076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311111962
5010	NC_014643	TTAT	2	8	304759	304766	25 %	75 %	0 %	0 %	311111963
5011	NC_014643	GCC	2	6	304791	304796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311111963
5012	NC_014643	GCA	2	6	304800	304805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311111963
5013	NC_014643	CGGA	2	8	304823	304830	25 %	0 %	50 %	25 %	311111963
5014	NC_014643	CCAG	2	8	304844	304851	25 %	0 %	25 %	50 %	311111963
5015	NC_014643	ATT	2	6	304898	304903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	311111963
5016	NC_014643	GAG	2	6	304924	304929	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	311111963
5017	NC_014643	GAA	3	9	304967	304975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	311111963
5018	NC_014643	GCC	2	6	304977	304982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311111963
5019	NC_014643	CTG	2	6	305048	305053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311111963
5020	NC_014643	CA	3	6	305061	305066	50 %	0 %	0 %	50 %	311111963
5021	NC_014643	CGC	2	6	305162	305167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311111963
5022	NC_014643	CTG	2	6	305189	305194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311111963
5023	NC_014643	CCCA	2	8	305215	305222	25 %	0 %	0 %	75 %	311111963
5024	NC_014643	AAAG	2	8	305223	305230	75 %	0 %	25 %	0 %	311111963
5025	NC_014643	CTG	2	6	305356	305361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311111963
5026	NC_014643	CTG	2	6	305381	305386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311111963
5027	NC_014643	CAG	2	6	305422	305427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311111963
5028	NC_014643	GCC	2	6	305508	305513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311111963
5029	NC_014643	GGT	2	6	305528	305533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311111963
5030	NC_014643	CGT	2	6	305552	305557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311111963
5031	NC_014643	CGT	2	6	305620	305625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311111963
5032	NC_014643	TCG	2	6	305739	305744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311111963
5033	NC_014643	CTT	2	6	305783	305788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311111963
5034	NC_014643	ACC	2	6	306035	306040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311111963
5035	NC_014643	CAG	2	6	306073	306078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311111963
5036	NC_014643	TCT	2	6	306103	306108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311111963
5037	NC_014643	TGG	2	6	306117	306122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311111963
5038	NC_014643	CGC	2	6	306145	306150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311111963
5039	NC_014643	CTT	2	6	306260	306265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311111963
5040	NC_014643	CAT	2	6	306331	306336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311111963
5041	NC_014643	GCA	2	6	306418	306423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311111963
5042	NC_014643	GCC	2	6	306473	306478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311111963
5043	NC_014643	TGT	2	6	306509	306514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	311111963
5044	NC_014643	TGT	2	6	306613	306618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	311111963
5045	NC_014643	CTTA	2	8	307063	307070	25 %	50 %	0 %	25 %	311111964
5046	NC_014643	CGC	2	6	307153	307158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311111964
5047	NC_014643	TCG	2	6	307170	307175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311111964
5048	NC_014643	CCTCGA	2	12	307237	307248	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	311111964
5049	NC_014643	CGG	2	6	307290	307295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311111964
5050	NC_014643	TCAC	2	8	307329	307336	25 %	25 %	0 %	50 %	311111964
5051	NC_014643	GCA	2	6	307383	307388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311111965
5052	NC_014643	GCG	2	6	307423	307428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311111965
5053	NC_014643	CTT	2	6	307483	307488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311111965
5054	NC_014643	CAGC	2	8	307506	307513	25 %	0 %	25 %	50 %	311111965
5055	NC_014643	CAC	2	6	307583	307588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311111966
5056	NC_014643	CAC	2	6	307717	307722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311111966
5057	NC_014643	CTT	2	6	307764	307769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311111966
5058	NC_014643	ACGG	2	8	307775	307782	25 %	0 %	50 %	25 %	311111966
5059	NC_014643	GCC	2	6	307923	307928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311111966
5060	NC_014643	GTG	2	6	307953	307958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	311111966
5061	NC_014643	GCG	2	6	308052	308057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311111967
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5063	NC_014643	GCG	3	9	308085	308093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311111967
5064	NC_014643	CGG	2	6	308104	308109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311111967
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5067	NC_014643	GAA	2	6	308220	308225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	311111967
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5069	NC_014643	GCC	2	6	308304	308309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311111967
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5072	NC_014643	AGCTG	2	10	308437	308446	20 %	20 %	40 %	20 %	311111967
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5081	NC_014643	TTCA	2	8	308910	308917	25 %	50 %	0 %	25 %	311111968
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5087	NC_014643	GGGT	2	8	309267	309274	0 %	25 %	75 %	0 %	311111969
5088	NC_014643	CGTC	2	8	309335	309342	0 %	25 %	25 %	50 %	311111969
5089	NC_014643	AAT	2	6	309376	309381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	311111969
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5093	NC_014643	ACG	2	6	309529	309534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311111970
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5101	NC_014643	GCCT	2	8	309718	309725	0 %	25 %	25 %	50 %	311111970
5102	NC_014643	CCTT	2	8	309839	309846	0 %	50 %	0 %	50 %	311111970
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5106	NC_014643	GA	3	6	310011	310016	50 %	0 %	50 %	0 %	311111970
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5121	NC_014643	AGC	2	6	310719	310724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311111972
5122	NC_014643	CGT	2	6	310733	310738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311111972
5123	NC_014643	GCC	2	6	310741	310746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311111972
5124	NC_014643	CAT	2	6	310760	310765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311111972
5125	NC_014643	CGAT	2	8	310861	310868	25 %	25 %	25 %	25 %	311111972
5126	NC_014643	GAACA	2	10	310872	310881	60 %	0 %	20 %	20 %	311111972
5127	NC_014643	AGC	2	6	310917	310922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311111972
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5130	NC_014643	TGC	2	6	311010	311015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311111972
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5134	NC_014643	CAC	2	6	311171	311176	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	311111972
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5153	NC_014643	CAG	2	6	311934	311939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	311111973
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5161	NC_014643	GTT	3	9	312598	312606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	311111975
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5214	NC_014643	TGCAG	2	10	315317	315326	20 %	20 %	40 %	20 %	311111977
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5229	NC_014643	TG	3	6	316087	316092	0 %	50 %	50 %	0 %	311111977
5230	NC_014643	GC	3	6	316167	316172	0 %	0 %	50 %	50 %	311111977
5231	NC_014643	TCC	2	6	316186	316191	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	311111977
5232	NC_014643	GGGCA	2	10	316227	316236	20 %	0 %	60 %	20 %	311111977
5233	NC_014643	CAA	2	6	316303	316308	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	311111977
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5241	NC_014643	AAGG	2	8	317303	317310	50 %	0 %	50 %	0 %	311111978
5242	NC_014643	CTC	2	6	317366	317371	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	311111978
5243	NC_014643	TCA	2	6	317439	317444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311111978
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5245	NC_014643	AGG	2	6	317466	317471	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	311111978
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5361	NC_014643	TTA	2	6	324710	324715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	311111982
5362	NC_014643	GC	3	6	324753	324758	0 %	0 %	50 %	50 %	311111982
5363	NC_014643	TCT	3	9	324762	324770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311111982
5364	NC_014643	CTT	2	6	324841	324846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311111982
5365	NC_014643	TCA	2	6	324917	324922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	311111982
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5367	NC_014643	TCT	2	6	325059	325064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311111982
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5482	NC_014643	GCG	2	6	332489	332494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311111987
5483	NC_014643	TCGT	2	8	332507	332514	0 %	50 %	25 %	25 %	311111987
5484	NC_014643	CGG	3	9	332538	332546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311111987
5485	NC_014643	CTT	2	6	332611	332616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	311111987
5486	NC_014643	CGG	3	9	332634	332642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	311111987
5487	NC_014643	CCG	2	6	332730	332735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311111987
5488	NC_014643	AAT	2	6	332737	332742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	311111987
5489	NC_014643	TCG	2	6	332757	332762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	311111987
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5491	NC_014643	GCC	2	6	332779	332784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	311111987
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5495	NC_014643	GGGT	2	8	333109	333116	0 %	25 %	75 %	0 %	311111987
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