MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ralstonia solanacearum str. PSI07 chromosome

Total Repeats: 84760

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4503	NC_014311	CCA	3	9	193225	193233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300689886
4504	NC_014311	CGG	2	6	193264	193269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300689886
4505	NC_014311	CCAG	2	8	193270	193277	25 %	0 %	25 %	50 %	300689886
4506	NC_014311	CGGC	2	8	193291	193298	0 %	0 %	50 %	50 %	300689886
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4511	NC_014311	CAGC	2	8	193378	193385	25 %	0 %	25 %	50 %	300689886
4512	NC_014311	CGATG	2	10	193393	193402	20 %	20 %	40 %	20 %	300689886
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4519	NC_014311	CG	3	6	193598	193603	0 %	0 %	50 %	50 %	300689886
4520	NC_014311	GC	4	8	193619	193626	0 %	0 %	50 %	50 %	300689886
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4742	NC_014311	TGCC	2	8	201065	201072	0 %	25 %	25 %	50 %	300689897
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4744	NC_014311	AGC	2	6	201253	201258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300689897
4745	NC_014311	GCT	2	6	201278	201283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300689897
4746	NC_014311	TGGC	2	8	201350	201357	0 %	25 %	50 %	25 %	300689898
4747	NC_014311	CG	4	8	201394	201401	0 %	0 %	50 %	50 %	300689898
4748	NC_014311	GCT	2	6	201442	201447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300689898
4749	NC_014311	TCA	2	6	201492	201497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300689898
4750	NC_014311	GTG	2	6	201514	201519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300689898
4751	NC_014311	GC	3	6	201528	201533	0 %	0 %	50 %	50 %	300689898
4752	NC_014311	ACG	2	6	201561	201566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300689898
4753	NC_014311	CTG	2	6	201725	201730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300689898
4754	NC_014311	GTG	2	6	201752	201757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300689898
4755	NC_014311	GAC	2	6	201785	201790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300689898
4756	NC_014311	CCG	2	6	201843	201848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300689899
4757	NC_014311	TGGCCG	2	12	201866	201877	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	300689899
4758	NC_014311	CT	3	6	201920	201925	0 %	50 %	0 %	50 %	300689899
4759	NC_014311	CTG	2	6	201955	201960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300689899
4760	NC_014311	CTG	2	6	201985	201990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300689899
4761	NC_014311	GCC	2	6	202047	202052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300689899
4762	NC_014311	GCT	2	6	202071	202076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300689899
4763	NC_014311	CG	4	8	202103	202110	0 %	0 %	50 %	50 %	300689899
4764	NC_014311	CTCG	2	8	202125	202132	0 %	25 %	25 %	50 %	300689899
4765	NC_014311	GGC	2	6	202168	202173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300689899
4766	NC_014311	GCT	3	9	202227	202235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300689899
4767	NC_014311	CGG	2	6	202239	202244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300689899
4768	NC_014311	CGC	2	6	202302	202307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300689899
4769	NC_014311	TCG	2	6	202412	202417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300689899
4770	NC_014311	ACC	2	6	202432	202437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300689899
4771	NC_014311	TGC	2	6	202469	202474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300689899
4772	NC_014311	CAT	2	6	202500	202505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300689899
4773	NC_014311	GCA	2	6	202590	202595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300689899
4774	NC_014311	TGG	2	6	202598	202603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300689899
4775	NC_014311	GC	3	6	202609	202614	0 %	0 %	50 %	50 %	300689899
4776	NC_014311	GGT	2	6	202629	202634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300689899
4777	NC_014311	CTG	2	6	202639	202644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300689899
4778	NC_014311	CG	3	6	202682	202687	0 %	0 %	50 %	50 %	300689899
4779	NC_014311	CGG	2	6	202710	202715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300689899
4780	NC_014311	CACG	2	8	202719	202726	25 %	0 %	25 %	50 %	300689899
4781	NC_014311	CGG	2	6	202761	202766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300689899
4782	NC_014311	CAC	2	6	202767	202772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300689899
4783	NC_014311	TCG	2	6	202805	202810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300689899
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4785	NC_014311	GCT	2	6	202863	202868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300689899
4786	NC_014311	TCT	2	6	202874	202879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300689899
4787	NC_014311	CTG	2	6	202885	202890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300689899
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4789	NC_014311	TCG	2	6	203027	203032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300689899
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4794	NC_014311	TAC	2	6	203245	203250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300689899
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4802	NC_014311	CGC	2	6	203413	203418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300689899
4803	NC_014311	GGCT	2	8	203452	203459	0 %	25 %	50 %	25 %	300689899
4804	NC_014311	CGC	2	6	203498	203503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300689899
4805	NC_014311	TCG	2	6	203507	203512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300689899
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4808	NC_014311	TTGGC	2	10	204028	204037	0 %	40 %	40 %	20 %	300689900
4809	NC_014311	TCG	2	6	204112	204117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300689900
4810	NC_014311	GATT	2	8	204175	204182	25 %	50 %	25 %	0 %	300689900
4811	NC_014311	GCA	2	6	204200	204205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300689900
4812	NC_014311	CGAG	2	8	204299	204306	25 %	0 %	50 %	25 %	300689900
4813	NC_014311	CAGT	2	8	204322	204329	25 %	25 %	25 %	25 %	300689900
4814	NC_014311	ACC	2	6	204429	204434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300689901
4815	NC_014311	TAC	2	6	204437	204442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300689901
4816	NC_014311	TGC	2	6	204513	204518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300689901
4817	NC_014311	GTC	2	6	204597	204602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300689901
4818	NC_014311	CTT	2	6	204659	204664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300689901
4819	NC_014311	TGA	2	6	204673	204678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300689901
4820	NC_014311	TCA	2	6	204699	204704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300689901
4821	NC_014311	TCG	2	6	204816	204821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300689901
4822	NC_014311	GCA	2	6	204851	204856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300689901
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4824	NC_014311	TCA	2	6	204954	204959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300689901
4825	NC_014311	CGA	2	6	204979	204984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300689901
4826	NC_014311	TCG	2	6	205004	205009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300689901
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4828	NC_014311	ACG	2	6	205113	205118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300689901
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4831	NC_014311	GACG	2	8	205230	205237	25 %	0 %	50 %	25 %	300689901
4832	NC_014311	G	6	6	205317	205322	0 %	0 %	100 %	0 %	300689901
4833	NC_014311	GAA	2	6	205454	205459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300689901
4834	NC_014311	CGA	2	6	205468	205473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300689901
4835	NC_014311	GCG	2	6	205501	205506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300689902
4836	NC_014311	ACCGA	2	10	205538	205547	40 %	0 %	20 %	40 %	300689902
4837	NC_014311	CG	3	6	205580	205585	0 %	0 %	50 %	50 %	300689902
4838	NC_014311	GGTC	2	8	205604	205611	0 %	25 %	50 %	25 %	300689902
4839	NC_014311	CTG	2	6	205639	205644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300689902
4840	NC_014311	GCAACT	2	12	205656	205667	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	300689902
4841	NC_014311	CTT	2	6	205753	205758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300689902
4842	NC_014311	GC	3	6	205916	205921	0 %	0 %	50 %	50 %	300689902
4843	NC_014311	TCGC	2	8	205932	205939	0 %	25 %	25 %	50 %	300689902
4844	NC_014311	TGCT	2	8	205970	205977	0 %	50 %	25 %	25 %	300689902
4845	NC_014311	GGT	2	6	206050	206055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300689902
4846	NC_014311	AGGT	2	8	206084	206091	25 %	25 %	50 %	0 %	300689902
4847	NC_014311	ACG	2	6	206182	206187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300689902
4848	NC_014311	GCA	2	6	206232	206237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300689902
4849	NC_014311	GGT	2	6	206253	206258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300689902
4850	NC_014311	TCA	2	6	207221	207226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300689903
4851	NC_014311	AACA	2	8	207315	207322	75 %	0 %	0 %	25 %	300689903
4852	NC_014311	G	6	6	207326	207331	0 %	0 %	100 %	0 %	300689903
4853	NC_014311	AAG	2	6	207342	207347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300689903
4854	NC_014311	GCG	2	6	207418	207423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300689903
4855	NC_014311	GAG	2	6	207438	207443	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300689903
4856	NC_014311	TGA	2	6	207461	207466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300689903
4857	NC_014311	TGC	2	6	207584	207589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300689903
4858	NC_014311	TGG	2	6	207625	207630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300689903
4859	NC_014311	CAAT	2	8	207632	207639	50 %	25 %	0 %	25 %	300689903
4860	NC_014311	C	6	6	207668	207673	0 %	0 %	0 %	100 %	300689903
4861	NC_014311	CGC	2	6	207680	207685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300689903
4862	NC_014311	AGG	2	6	207716	207721	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300689903
4863	NC_014311	CGC	2	6	207767	207772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300689903
4864	NC_014311	GC	3	6	207823	207828	0 %	0 %	50 %	50 %	300689903
4865	NC_014311	TGA	2	6	207829	207834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300689903
4866	NC_014311	GGC	2	6	207884	207889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300689903
4867	NC_014311	ACA	2	6	207893	207898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300689903
4868	NC_014311	CGC	2	6	207965	207970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300689903
4869	NC_014311	TCT	2	6	207989	207994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300689903
4870	NC_014311	T	7	7	208013	208019	0 %	100 %	0 %	0 %	300689903
4871	NC_014311	GCT	2	6	208036	208041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300689903
4872	NC_014311	CGA	2	6	208124	208129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300689903
4873	NC_014311	GCTTG	2	10	208261	208270	0 %	40 %	40 %	20 %	300689904
4874	NC_014311	GGA	2	6	208342	208347	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300689904
4875	NC_014311	CTCG	2	8	208358	208365	0 %	25 %	25 %	50 %	300689904
4876	NC_014311	GAAG	2	8	208385	208392	50 %	0 %	50 %	0 %	300689904
4877	NC_014311	CCT	2	6	208414	208419	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300689904
4878	NC_014311	GTC	2	6	208520	208525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300689904
4879	NC_014311	TG	3	6	208547	208552	0 %	50 %	50 %	0 %	300689904
4880	NC_014311	AACC	2	8	208558	208565	50 %	0 %	0 %	50 %	300689904
4881	NC_014311	TCT	2	6	208580	208585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300689904
4882	NC_014311	CCG	2	6	208653	208658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300689904
4883	NC_014311	TCC	2	6	208734	208739	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300689904
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4885	NC_014311	GGTA	2	8	208832	208839	25 %	25 %	50 %	0 %	300689904
4886	NC_014311	AGT	2	6	208979	208984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300689906
4887	NC_014311	TGC	2	6	208996	209001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300689906
4888	NC_014311	TG	3	6	209002	209007	0 %	50 %	50 %	0 %	300689906
4889	NC_014311	CTC	2	6	209039	209044	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300689906
4890	NC_014311	GTT	2	6	209049	209054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300689906
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4892	NC_014311	CG	3	6	209067	209072	0 %	0 %	50 %	50 %	300689906
4893	NC_014311	GATGCC	2	12	209140	209151	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	300689906
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4895	NC_014311	GCT	2	6	209187	209192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300689906
4896	NC_014311	AGT	2	6	209211	209216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300689906
4897	NC_014311	GCG	2	6	209241	209246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300689906
4898	NC_014311	TGCGT	2	10	209252	209261	0 %	40 %	40 %	20 %	300689906
4899	NC_014311	CCG	2	6	209289	209294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300689906
4900	NC_014311	GCG	2	6	209304	209309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300689906
4901	NC_014311	GCG	2	6	209316	209321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300689906
4902	NC_014311	TGA	2	6	209322	209327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300689906
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4912	NC_014311	CCGC	2	8	209642	209649	0 %	0 %	25 %	75 %	300689907
4913	NC_014311	TCA	2	6	209669	209674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300689907
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4972	NC_014311	ATGG	2	8	211876	211883	25 %	25 %	50 %	0 %	300689910
4973	NC_014311	ATCC	2	8	211976	211983	25 %	25 %	0 %	50 %	300689911
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4981	NC_014311	CAGA	2	8	212330	212337	50 %	0 %	25 %	25 %	300689911
4982	NC_014311	GGTC	2	8	212588	212595	0 %	25 %	50 %	25 %	300689911
4983	NC_014311	CAC	2	6	212596	212601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300689911
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4986	NC_014311	ATC	2	6	212853	212858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300689911
4987	NC_014311	CAT	2	6	212891	212896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300689911
4988	NC_014311	TCT	2	6	212899	212904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300689911
4989	NC_014311	TCC	2	6	212964	212969	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300689911
4990	NC_014311	GCG	2	6	212971	212976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300689911
4991	NC_014311	ATC	2	6	213037	213042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300689911
4992	NC_014311	AC	3	6	213050	213055	50 %	0 %	0 %	50 %	300689911
4993	NC_014311	TCAA	2	8	213299	213306	50 %	25 %	0 %	25 %	300689912
4994	NC_014311	TCC	2	6	213333	213338	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300689912
4995	NC_014311	CTC	2	6	213344	213349	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300689912
4996	NC_014311	GC	3	6	213379	213384	0 %	0 %	50 %	50 %	300689912
4997	NC_014311	TCC	2	6	213459	213464	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300689912
4998	NC_014311	CTT	2	6	213470	213475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300689912
4999	NC_014311	GCG	2	6	213487	213492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300689912
5000	NC_014311	CGG	2	6	213496	213501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300689912

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