MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ralstonia solanacearum CFBP2957 chromosome complete genome

Total Repeats: 81659

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014307	GCG	2	6	25941	25946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702393
502	NC_014307	TTG	2	6	25969	25974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300702393
503	NC_014307	TGG	2	6	25981	25986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300702393
504	NC_014307	TGG	2	6	25990	25995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300702393
505	NC_014307	GC	5	10	26047	26056	0 %	0 %	50 %	50 %	300702393
506	NC_014307	AT	3	6	26076	26081	50 %	50 %	0 %	0 %	300702393
507	NC_014307	CCG	2	6	26146	26151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300702393
508	NC_014307	ATG	2	6	26277	26282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300702393
509	NC_014307	GATG	2	8	26313	26320	25 %	25 %	50 %	0 %	300702393
510	NC_014307	TGT	2	6	27013	27018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300702394
511	NC_014307	GAA	2	6	27075	27080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300702394
512	NC_014307	ACGAAT	2	12	27106	27117	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	300702394
513	NC_014307	GAA	2	6	27156	27161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300702394
514	NC_014307	GAT	2	6	27189	27194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300702394
515	NC_014307	TGA	2	6	27241	27246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300702394
516	NC_014307	GAG	2	6	27309	27314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300702394
517	NC_014307	GGA	2	6	27362	27367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300702394
518	NC_014307	GC	4	8	27419	27426	0 %	0 %	50 %	50 %	300702394
519	NC_014307	GAT	2	6	27452	27457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300702395
520	NC_014307	CCT	2	6	27594	27599	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300702395
521	NC_014307	AGG	2	6	27609	27614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300702395
522	NC_014307	GCG	2	6	27665	27670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702395
523	NC_014307	AAC	2	6	27677	27682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300702395
524	NC_014307	ACCA	2	8	27746	27753	50 %	0 %	0 %	50 %	300702395
525	NC_014307	ACA	2	6	27762	27767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300702395
526	NC_014307	GCT	2	6	27806	27811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702395
527	NC_014307	AC	3	6	27858	27863	50 %	0 %	0 %	50 %	300702395
528	NC_014307	CCCA	2	8	27910	27917	25 %	0 %	0 %	75 %	300702395
529	NC_014307	AGT	2	6	27921	27926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300702395
530	NC_014307	GCAA	2	8	28040	28047	50 %	0 %	25 %	25 %	300702396
531	NC_014307	CAG	2	6	28062	28067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702396
532	NC_014307	ACG	2	6	28138	28143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702396
533	NC_014307	TTC	2	6	28152	28157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300702396
534	NC_014307	GCATTG	2	12	28270	28281	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	300702396
535	NC_014307	AC	3	6	28293	28298	50 %	0 %	0 %	50 %	300702396
536	NC_014307	AC	3	6	28321	28326	50 %	0 %	0 %	50 %	300702396
537	NC_014307	CGA	2	6	28343	28348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702396
538	NC_014307	TCCC	2	8	28368	28375	0 %	25 %	0 %	75 %	300702396
539	NC_014307	AAG	2	6	28446	28451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300702396
540	NC_014307	GCG	2	6	28465	28470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702396
541	NC_014307	ACG	2	6	28571	28576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702397
542	NC_014307	AAGAC	2	10	28604	28613	60 %	0 %	20 %	20 %	300702397
543	NC_014307	CG	4	8	28670	28677	0 %	0 %	50 %	50 %	300702397
544	NC_014307	GGTT	2	8	28718	28725	0 %	50 %	50 %	0 %	300702397
545	NC_014307	GGT	2	6	28872	28877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300702397
546	NC_014307	CGT	2	6	28971	28976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702397
547	NC_014307	TGC	2	6	29048	29053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702397
548	NC_014307	CAG	2	6	29191	29196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702397
549	NC_014307	AGCG	2	8	29250	29257	25 %	0 %	50 %	25 %	300702397
550	NC_014307	AGC	2	6	29334	29339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702397
551	NC_014307	GCC	2	6	29344	29349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300702397
552	NC_014307	TTGC	2	8	29385	29392	0 %	50 %	25 %	25 %	300702398
553	NC_014307	GAT	2	6	29441	29446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300702398
554	NC_014307	GC	3	6	29464	29469	0 %	0 %	50 %	50 %	300702398
555	NC_014307	GCG	2	6	29505	29510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702398
556	NC_014307	TGG	2	6	29518	29523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300702398
557	NC_014307	GCGCC	2	10	29589	29598	0 %	0 %	40 %	60 %	300702398
558	NC_014307	GAC	2	6	29647	29652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702398
559	NC_014307	TCG	2	6	29727	29732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702398
560	NC_014307	TCA	2	6	29740	29745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300702398
561	NC_014307	GCC	2	6	29757	29762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300702398
562	NC_014307	CGG	2	6	29825	29830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702398
563	NC_014307	GGGT	2	8	29871	29878	0 %	25 %	75 %	0 %	300702398
564	NC_014307	CGG	2	6	29914	29919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702398
565	NC_014307	GGC	2	6	29970	29975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702398
566	NC_014307	GGT	2	6	30045	30050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300702398
567	NC_014307	G	6	6	30059	30064	0 %	0 %	100 %	0 %	300702398
568	NC_014307	TGC	2	6	30089	30094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702398
569	NC_014307	AGT	2	6	30129	30134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300702398
570	NC_014307	GCG	2	6	30192	30197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702398
571	NC_014307	CG	3	6	30281	30286	0 %	0 %	50 %	50 %	300702398
572	NC_014307	GCAC	2	8	30314	30321	25 %	0 %	25 %	50 %	300702398
573	NC_014307	CGC	2	6	30336	30341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300702398
574	NC_014307	TGC	2	6	30418	30423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702398
575	NC_014307	ACCGC	2	10	30472	30481	20 %	0 %	20 %	60 %	300702398
576	NC_014307	ATG	2	6	30484	30489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300702398
577	NC_014307	TA	3	6	30541	30546	50 %	50 %	0 %	0 %	300702399
578	NC_014307	GAA	2	6	30562	30567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300702399
579	NC_014307	AAAC	2	8	30630	30637	75 %	0 %	0 %	25 %	300702399
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581	NC_014307	CT	3	6	30970	30975	0 %	50 %	0 %	50 %	300702400
582	NC_014307	GCAAT	2	10	30993	31002	40 %	20 %	20 %	20 %	300702400
583	NC_014307	CCA	2	6	31052	31057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300702400
584	NC_014307	CA	3	6	31120	31125	50 %	0 %	0 %	50 %	300702400
585	NC_014307	AGC	2	6	31344	31349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702401
586	NC_014307	GCG	2	6	31440	31445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702401
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588	NC_014307	CGG	2	6	31697	31702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702401
589	NC_014307	AGGT	2	8	31704	31711	25 %	25 %	50 %	0 %	300702401
590	NC_014307	GC	3	6	31765	31770	0 %	0 %	50 %	50 %	300702401
591	NC_014307	TGG	2	6	31833	31838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300702401
592	NC_014307	GCA	2	6	31856	31861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702401
593	NC_014307	CAA	2	6	31864	31869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300702401
594	NC_014307	TGAC	2	8	31953	31960	25 %	25 %	25 %	25 %	300702402
595	NC_014307	CG	4	8	32026	32033	0 %	0 %	50 %	50 %	300702402
596	NC_014307	GT	3	6	32091	32096	0 %	50 %	50 %	0 %	300702402
597	NC_014307	CTC	2	6	32142	32147	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300702402
598	NC_014307	TATC	2	8	32174	32181	25 %	50 %	0 %	25 %	300702402
599	NC_014307	TCTG	2	8	32209	32216	0 %	50 %	25 %	25 %	300702402
600	NC_014307	AAG	2	6	32244	32249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300702402
601	NC_014307	ACA	2	6	32482	32487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300702403
602	NC_014307	CGA	2	6	32516	32521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300702403
603	NC_014307	GCG	2	6	32567	32572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702403
604	NC_014307	AGCTG	2	10	32577	32586	20 %	20 %	40 %	20 %	300702403
605	NC_014307	CGG	2	6	32604	32609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702404
606	NC_014307	CG	3	6	32682	32687	0 %	0 %	50 %	50 %	300702404
607	NC_014307	CTT	2	6	32688	32693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300702404
608	NC_014307	T	6	6	32709	32714	0 %	100 %	0 %	0 %	300702404
609	NC_014307	GGGC	2	8	32727	32734	0 %	0 %	75 %	25 %	300702404
610	NC_014307	ACGAT	2	10	32750	32759	40 %	20 %	20 %	20 %	300702404
611	NC_014307	GCT	2	6	32790	32795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702404
612	NC_014307	ATC	2	6	32819	32824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300702404
613	NC_014307	CTTG	2	8	32829	32836	0 %	50 %	25 %	25 %	300702404
614	NC_014307	CTG	2	6	32871	32876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702404
615	NC_014307	CA	3	6	32952	32957	50 %	0 %	0 %	50 %	300702404
616	NC_014307	GAG	2	6	33004	33009	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300702404
617	NC_014307	CAT	2	6	33013	33018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300702404
618	NC_014307	CGG	2	6	33084	33089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702404
619	NC_014307	GT	3	6	33149	33154	0 %	50 %	50 %	0 %	300702404
620	NC_014307	GCG	2	6	33414	33419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300702405
621	NC_014307	GCTT	2	8	33533	33540	0 %	50 %	25 %	25 %	300702405
622	NC_014307	GTT	2	6	33601	33606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300702405
623	NC_014307	AGA	2	6	33642	33647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300702405
624	NC_014307	CG	3	6	33661	33666	0 %	0 %	50 %	50 %	300702405
625	NC_014307	TGG	3	9	33675	33683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300702405
626	NC_014307	TGC	2	6	33725	33730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300702405
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628	NC_014307	TGG	2	6	33806	33811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300702406
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755	NC_014307	GGGTT	2	10	40443	40452	0 %	40 %	60 %	0 %	300702412
756	NC_014307	TC	3	6	40513	40518	0 %	50 %	0 %	50 %	300702412
757	NC_014307	GCC	3	9	40550	40558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300702412
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762	NC_014307	TGG	2	6	40750	40755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300702412
763	NC_014307	A	7	7	40801	40807	100 %	0 %	0 %	0 %	300702412
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