MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Rhodobacter capsulatus SB 1003 plasmid pRCB133

Total Repeats: 330

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014035	GC	3	6	492	497	0 %	0 %	50 %	50 %	294679056
2	NC_014035	CG	3	6	1730	1735	0 %	0 %	50 %	50 %	294679058
3	NC_014035	CG	3	6	2462	2467	0 %	0 %	50 %	50 %	294679059
4	NC_014035	GC	3	6	2648	2653	0 %	0 %	50 %	50 %	294679059
5	NC_014035	CG	3	6	2701	2706	0 %	0 %	50 %	50 %	294679059
6	NC_014035	CG	3	6	3537	3542	0 %	0 %	50 %	50 %	294679060
7	NC_014035	CG	3	6	3952	3957	0 %	0 %	50 %	50 %	294679060
8	NC_014035	GC	3	6	4138	4143	0 %	0 %	50 %	50 %	294679060
9	NC_014035	GC	3	6	4192	4197	0 %	0 %	50 %	50 %	294679060
10	NC_014035	CG	3	6	4249	4254	0 %	0 %	50 %	50 %	294679060
11	NC_014035	CG	3	6	4658	4663	0 %	0 %	50 %	50 %	294679061
12	NC_014035	CG	3	6	4870	4875	0 %	0 %	50 %	50 %	294679061
13	NC_014035	GC	3	6	5325	5330	0 %	0 %	50 %	50 %	294679062
14	NC_014035	GC	3	6	5401	5406	0 %	0 %	50 %	50 %	294679062
15	NC_014035	CG	3	6	5477	5482	0 %	0 %	50 %	50 %	294679062
16	NC_014035	CG	3	6	6090	6095	0 %	0 %	50 %	50 %	294679063
17	NC_014035	CG	3	6	6582	6587	0 %	0 %	50 %	50 %	294679063
18	NC_014035	CG	3	6	6595	6600	0 %	0 %	50 %	50 %	294679063
19	NC_014035	CG	3	6	6724	6729	0 %	0 %	50 %	50 %	294679063
20	NC_014035	CG	3	6	7302	7307	0 %	0 %	50 %	50 %	294679064
21	NC_014035	GC	4	8	7323	7330	0 %	0 %	50 %	50 %	294679064
22	NC_014035	CG	3	6	7523	7528	0 %	0 %	50 %	50 %	294679064
23	NC_014035	CG	3	6	7604	7609	0 %	0 %	50 %	50 %	294679064
24	NC_014035	CG	3	6	7657	7662	0 %	0 %	50 %	50 %	294679064
25	NC_014035	GC	3	6	7761	7766	0 %	0 %	50 %	50 %	294679064
26	NC_014035	GC	3	6	8379	8384	0 %	0 %	50 %	50 %	294679065
27	NC_014035	CG	3	6	8896	8901	0 %	0 %	50 %	50 %	294679066
28	NC_014035	CG	4	8	9060	9067	0 %	0 %	50 %	50 %	294679066
29	NC_014035	GC	3	6	9115	9120	0 %	0 %	50 %	50 %	294679066
30	NC_014035	TC	3	6	9554	9559	0 %	50 %	0 %	50 %	294679067
31	NC_014035	GC	3	6	9566	9571	0 %	0 %	50 %	50 %	294679067
32	NC_014035	CG	3	6	9711	9716	0 %	0 %	50 %	50 %	294679067
33	NC_014035	GC	4	8	10229	10236	0 %	0 %	50 %	50 %	294679067
34	NC_014035	GC	3	6	11168	11173	0 %	0 %	50 %	50 %	294679068
35	NC_014035	CG	3	6	11256	11261	0 %	0 %	50 %	50 %	294679068
36	NC_014035	CG	3	6	12738	12743	0 %	0 %	50 %	50 %	294679071
37	NC_014035	AT	3	6	12922	12927	50 %	50 %	0 %	0 %	294679071
38	NC_014035	GC	3	6	13756	13761	0 %	0 %	50 %	50 %	294679073
39	NC_014035	TC	3	6	14168	14173	0 %	50 %	0 %	50 %	294679073
40	NC_014035	CG	3	6	14278	14283	0 %	0 %	50 %	50 %	294679073
41	NC_014035	CG	3	6	14625	14630	0 %	0 %	50 %	50 %	294679074
42	NC_014035	CG	3	6	15040	15045	0 %	0 %	50 %	50 %	294679075
43	NC_014035	CG	3	6	15051	15056	0 %	0 %	50 %	50 %	294679075
44	NC_014035	GC	3	6	15337	15342	0 %	0 %	50 %	50 %	294679075
45	NC_014035	CG	3	6	15402	15407	0 %	0 %	50 %	50 %	294679075
46	NC_014035	CG	3	6	15653	15658	0 %	0 %	50 %	50 %	294679076
47	NC_014035	GC	3	6	15937	15942	0 %	0 %	50 %	50 %	294679076
48	NC_014035	GC	3	6	16098	16103	0 %	0 %	50 %	50 %	294679076
49	NC_014035	GC	3	6	16115	16120	0 %	0 %	50 %	50 %	294679076
50	NC_014035	CG	4	8	16413	16420	0 %	0 %	50 %	50 %	294679077
51	NC_014035	GC	3	6	16509	16514	0 %	0 %	50 %	50 %	294679078
52	NC_014035	GC	3	6	16633	16638	0 %	0 %	50 %	50 %	294679078
53	NC_014035	GC	3	6	16914	16919	0 %	0 %	50 %	50 %	294679078
54	NC_014035	GC	3	6	16949	16954	0 %	0 %	50 %	50 %	294679078
55	NC_014035	GC	3	6	17039	17044	0 %	0 %	50 %	50 %	294679078
56	NC_014035	CG	3	6	17448	17453	0 %	0 %	50 %	50 %	294679079
57	NC_014035	CG	3	6	18119	18124	0 %	0 %	50 %	50 %	294679081
58	NC_014035	GC	3	6	18512	18517	0 %	0 %	50 %	50 %	294679081
59	NC_014035	CG	3	6	18547	18552	0 %	0 %	50 %	50 %	294679081
60	NC_014035	CG	3	6	18882	18887	0 %	0 %	50 %	50 %	294679081
61	NC_014035	GC	3	6	19519	19524	0 %	0 %	50 %	50 %	294679083
62	NC_014035	CG	3	6	19773	19778	0 %	0 %	50 %	50 %	294679083
63	NC_014035	GC	3	6	20334	20339	0 %	0 %	50 %	50 %	294679084
64	NC_014035	GC	3	6	20781	20786	0 %	0 %	50 %	50 %	294679085
65	NC_014035	CG	3	6	22465	22470	0 %	0 %	50 %	50 %	294679088
66	NC_014035	GC	3	6	23361	23366	0 %	0 %	50 %	50 %	294679090
67	NC_014035	CG	3	6	23741	23746	0 %	0 %	50 %	50 %	294679091
68	NC_014035	CG	3	6	24428	24433	0 %	0 %	50 %	50 %	294679092
69	NC_014035	CG	3	6	24489	24494	0 %	0 %	50 %	50 %	294679092
70	NC_014035	CG	3	6	24787	24792	0 %	0 %	50 %	50 %	294679092
71	NC_014035	GC	3	6	24818	24823	0 %	0 %	50 %	50 %	294679092
72	NC_014035	CG	3	6	25081	25086	0 %	0 %	50 %	50 %	294679093
73	NC_014035	GC	3	6	25291	25296	0 %	0 %	50 %	50 %	294679093
74	NC_014035	CG	3	6	25595	25600	0 %	0 %	50 %	50 %	294679093
75	NC_014035	CG	3	6	25683	25688	0 %	0 %	50 %	50 %	294679093
76	NC_014035	CG	3	6	26919	26924	0 %	0 %	50 %	50 %	294679096
77	NC_014035	GC	3	6	27010	27015	0 %	0 %	50 %	50 %	294679096
78	NC_014035	GC	4	8	27355	27362	0 %	0 %	50 %	50 %	294679096
79	NC_014035	CG	3	6	27544	27549	0 %	0 %	50 %	50 %	294679096
80	NC_014035	CG	3	6	28155	28160	0 %	0 %	50 %	50 %	294679097
81	NC_014035	GC	3	6	28577	28582	0 %	0 %	50 %	50 %	294679097
82	NC_014035	GC	3	6	28665	28670	0 %	0 %	50 %	50 %	294679098
83	NC_014035	CG	3	6	28672	28677	0 %	0 %	50 %	50 %	294679098
84	NC_014035	GC	3	6	30151	30156	0 %	0 %	50 %	50 %	294679100
85	NC_014035	GA	3	6	30258	30263	50 %	0 %	50 %	0 %	294679100
86	NC_014035	GC	3	6	30472	30477	0 %	0 %	50 %	50 %	294679100
87	NC_014035	GA	3	6	30818	30823	50 %	0 %	50 %	0 %	294679100
88	NC_014035	CG	3	6	31088	31093	0 %	0 %	50 %	50 %	294679101
89	NC_014035	CG	3	6	31293	31298	0 %	0 %	50 %	50 %	294679101
90	NC_014035	CG	3	6	31601	31606	0 %	0 %	50 %	50 %	294679101
91	NC_014035	GC	3	6	32397	32402	0 %	0 %	50 %	50 %	294679102
92	NC_014035	GA	3	6	32546	32551	50 %	0 %	50 %	0 %	294679102
93	NC_014035	GC	3	6	33416	33421	0 %	0 %	50 %	50 %	294679103
94	NC_014035	GC	3	6	33705	33710	0 %	0 %	50 %	50 %	294679103
95	NC_014035	GC	3	6	33901	33906	0 %	0 %	50 %	50 %	294679103
96	NC_014035	CG	4	8	34202	34209	0 %	0 %	50 %	50 %	294679104
97	NC_014035	GC	3	6	34398	34403	0 %	0 %	50 %	50 %	294679104
98	NC_014035	CG	3	6	34571	34576	0 %	0 %	50 %	50 %	294679104
99	NC_014035	CG	3	6	35536	35541	0 %	0 %	50 %	50 %	294679105
100	NC_014035	GC	3	6	35553	35558	0 %	0 %	50 %	50 %	294679105
101	NC_014035	GC	3	6	35624	35629	0 %	0 %	50 %	50 %	294679105
102	NC_014035	GC	3	6	36767	36772	0 %	0 %	50 %	50 %	294679106
103	NC_014035	CG	3	6	36869	36874	0 %	0 %	50 %	50 %	294679106
104	NC_014035	CG	3	6	37038	37043	0 %	0 %	50 %	50 %	294679106
105	NC_014035	GC	3	6	37253	37258	0 %	0 %	50 %	50 %	294679107
106	NC_014035	GC	4	8	37415	37422	0 %	0 %	50 %	50 %	294679107
107	NC_014035	GC	3	6	37441	37446	0 %	0 %	50 %	50 %	294679107
108	NC_014035	TC	3	6	39764	39769	0 %	50 %	0 %	50 %	294679108
109	NC_014035	CT	3	6	39771	39776	0 %	50 %	0 %	50 %	294679108
110	NC_014035	CG	3	6	40156	40161	0 %	0 %	50 %	50 %	294679109
111	NC_014035	GC	3	6	40228	40233	0 %	0 %	50 %	50 %	294679109
112	NC_014035	GC	4	8	40571	40578	0 %	0 %	50 %	50 %	294679109
113	NC_014035	CG	3	6	40754	40759	0 %	0 %	50 %	50 %	294679110
114	NC_014035	GC	3	6	41245	41250	0 %	0 %	50 %	50 %	294679110
115	NC_014035	CG	3	6	41652	41657	0 %	0 %	50 %	50 %	294679111
116	NC_014035	CG	3	6	42048	42053	0 %	0 %	50 %	50 %	294679111
117	NC_014035	GC	3	6	42839	42844	0 %	0 %	50 %	50 %	294679112
118	NC_014035	GC	3	6	42926	42931	0 %	0 %	50 %	50 %	294679112
119	NC_014035	GC	3	6	43150	43155	0 %	0 %	50 %	50 %	294679112
120	NC_014035	GC	4	8	43584	43591	0 %	0 %	50 %	50 %	294679113
121	NC_014035	CG	3	6	44020	44025	0 %	0 %	50 %	50 %	294679113
122	NC_014035	GC	4	8	44261	44268	0 %	0 %	50 %	50 %	294679113
123	NC_014035	GA	3	6	44377	44382	50 %	0 %	50 %	0 %	294679113
124	NC_014035	CG	3	6	45155	45160	0 %	0 %	50 %	50 %	294679113
125	NC_014035	GC	3	6	45328	45333	0 %	0 %	50 %	50 %	294679113
126	NC_014035	GC	3	6	45570	45575	0 %	0 %	50 %	50 %	294679114
127	NC_014035	GC	3	6	45846	45851	0 %	0 %	50 %	50 %	294679114
128	NC_014035	CG	3	6	46001	46006	0 %	0 %	50 %	50 %	294679114
129	NC_014035	AC	3	6	46142	46147	50 %	0 %	0 %	50 %	294679114
130	NC_014035	CG	3	6	47205	47210	0 %	0 %	50 %	50 %	294679115
131	NC_014035	GC	3	6	47832	47837	0 %	0 %	50 %	50 %	294679115
132	NC_014035	TC	3	6	47857	47862	0 %	50 %	0 %	50 %	294679115
133	NC_014035	CG	3	6	48139	48144	0 %	0 %	50 %	50 %	294679116
134	NC_014035	GC	3	6	48193	48198	0 %	0 %	50 %	50 %	294679116
135	NC_014035	CG	3	6	48293	48298	0 %	0 %	50 %	50 %	294679116
136	NC_014035	GC	3	6	48452	48457	0 %	0 %	50 %	50 %	294679116
137	NC_014035	GC	3	6	48929	48934	0 %	0 %	50 %	50 %	294679116
138	NC_014035	GC	3	6	49424	49429	0 %	0 %	50 %	50 %	294679116
139	NC_014035	GC	3	6	50694	50699	0 %	0 %	50 %	50 %	294679117
140	NC_014035	CG	3	6	50831	50836	0 %	0 %	50 %	50 %	294679118
141	NC_014035	GC	3	6	50954	50959	0 %	0 %	50 %	50 %	294679118
142	NC_014035	GC	3	6	51634	51639	0 %	0 %	50 %	50 %	294679119
143	NC_014035	GC	3	6	51682	51687	0 %	0 %	50 %	50 %	294679119
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.