MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodobacter capsulatus SB 1003 plasmid pRCB133

Total Repeats: 2987

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014035	CCGG	2	8	46302	46309	0 %	0 %	50 %	50 %	294679114
1002	NC_014035	GCA	2	6	46352	46357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294679114
1003	NC_014035	GATC	2	8	46358	46365	25 %	25 %	25 %	25 %	294679114
1004	NC_014035	AGCG	2	8	46423	46430	25 %	0 %	50 %	25 %	294679114
1005	NC_014035	CCGG	2	8	46443	46450	0 %	0 %	50 %	50 %	294679114
1006	NC_014035	GAT	2	6	46475	46480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294679114
1007	NC_014035	TTTC	2	8	47040	47047	0 %	75 %	0 %	25 %	294679115
1008	NC_014035	CTA	2	6	47152	47157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294679115
1009	NC_014035	CGG	2	6	47164	47169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294679115
1010	NC_014035	CCG	2	6	47195	47200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294679115
1011	NC_014035	CG	3	6	47205	47210	0 %	0 %	50 %	50 %	294679115
1012	NC_014035	GCG	2	6	47232	47237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294679115
1013	NC_014035	GTCG	2	8	47275	47282	0 %	25 %	50 %	25 %	294679115
1014	NC_014035	CGG	2	6	47302	47307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294679115
1015	NC_014035	AGGC	2	8	47316	47323	25 %	0 %	50 %	25 %	294679115
1016	NC_014035	GCC	2	6	47383	47388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294679115
1017	NC_014035	CATC	2	8	47431	47438	25 %	25 %	0 %	50 %	294679115
1018	NC_014035	CCA	2	6	47445	47450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294679115
1019	NC_014035	TTC	3	9	47642	47650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294679115
1020	NC_014035	CCGG	2	8	47663	47670	0 %	0 %	50 %	50 %	294679115
1021	NC_014035	CCAG	2	8	47688	47695	25 %	0 %	25 %	50 %	294679115
1022	NC_014035	GGT	2	6	47701	47706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294679115
1023	NC_014035	TGCGC	2	10	47737	47746	0 %	20 %	40 %	40 %	294679115
1024	NC_014035	TTC	2	6	47759	47764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294679115
1025	NC_014035	CGG	2	6	47781	47786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294679115
1026	NC_014035	GC	3	6	47832	47837	0 %	0 %	50 %	50 %	294679115
1027	NC_014035	TC	3	6	47857	47862	0 %	50 %	0 %	50 %	294679115
1028	NC_014035	ACC	2	6	47906	47911	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294679115
1029	NC_014035	TCA	2	6	47949	47954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294679115
1030	NC_014035	CG	3	6	48139	48144	0 %	0 %	50 %	50 %	294679116
1031	NC_014035	GAA	2	6	48172	48177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294679116
1032	NC_014035	GC	3	6	48193	48198	0 %	0 %	50 %	50 %	294679116
1033	NC_014035	ACT	2	6	48266	48271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294679116
1034	NC_014035	CG	3	6	48293	48298	0 %	0 %	50 %	50 %	294679116
1035	NC_014035	CCA	2	6	48299	48304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294679116
1036	NC_014035	GCT	3	9	48333	48341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294679116
1037	NC_014035	GC	3	6	48452	48457	0 %	0 %	50 %	50 %	294679116
1038	NC_014035	ACC	2	6	48686	48691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294679116
1039	NC_014035	GTC	2	6	48699	48704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294679116
1040	NC_014035	GTT	2	6	48801	48806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294679116
1041	NC_014035	CGG	2	6	48843	48848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294679116
1042	NC_014035	GTCG	2	8	48861	48868	0 %	25 %	50 %	25 %	294679116
1043	NC_014035	ACC	2	6	48922	48927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294679116
1044	NC_014035	GC	3	6	48929	48934	0 %	0 %	50 %	50 %	294679116
1045	NC_014035	GAT	2	6	48948	48953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294679116
1046	NC_014035	CGG	3	9	48980	48988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294679116
1047	NC_014035	GGC	2	6	48993	48998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294679116
1048	NC_014035	CGG	2	6	49008	49013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294679116
1049	NC_014035	CCG	2	6	49024	49029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294679116
1050	NC_014035	GGTGCA	2	12	49137	49148	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	294679116
1051	NC_014035	GAA	2	6	49189	49194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294679116
1052	NC_014035	ATGCG	2	10	49202	49211	20 %	20 %	40 %	20 %	294679116
1053	NC_014035	TGC	2	6	49214	49219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294679116
1054	NC_014035	GCTG	2	8	49226	49233	0 %	25 %	50 %	25 %	294679116
1055	NC_014035	CTG	2	6	49252	49257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294679116
1056	NC_014035	GCC	2	6	49294	49299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294679116
1057	NC_014035	GGC	2	6	49350	49355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294679116
1058	NC_014035	CGC	2	6	49383	49388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294679116
1059	NC_014035	GC	3	6	49424	49429	0 %	0 %	50 %	50 %	294679116
1060	NC_014035	CGG	2	6	49439	49444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294679116
1061	NC_014035	GCG	2	6	49447	49452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294679116
1062	NC_014035	TGG	2	6	49454	49459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294679116
1063	NC_014035	TGA	3	9	49619	49627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294679116
1064	NC_014035	CGG	2	6	49628	49633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294679116
1065	NC_014035	CGA	2	6	49664	49669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294679116
1066	NC_014035	CAT	3	9	49680	49688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294679116
1067	NC_014035	GGC	2	6	49698	49703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294679116
1068	NC_014035	GAT	2	6	49716	49721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294679116
1069	NC_014035	TTC	2	6	49747	49752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294679116
1070	NC_014035	GCC	2	6	49801	49806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294679116
1071	NC_014035	GCC	2	6	49810	49815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294679116
1072	NC_014035	TGC	2	6	49919	49924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294679116
1073	NC_014035	CAT	2	6	49986	49991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294679116
1074	NC_014035	CGG	2	6	50000	50005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294679116
1075	NC_014035	GCT	2	6	50019	50024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294679116
1076	NC_014035	GCT	3	9	50031	50039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294679116
1077	NC_014035	GCG	2	6	50065	50070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294679116
1078	NC_014035	CTG	2	6	50071	50076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294679116
1079	NC_014035	ATC	2	6	50092	50097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294679116
1080	NC_014035	GGC	2	6	50112	50117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294679116
1081	NC_014035	GGC	2	6	50124	50129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294679116
1082	NC_014035	CGCC	2	8	50168	50175	0 %	0 %	25 %	75 %	294679116
1083	NC_014035	GGT	2	6	50579	50584	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294679117
1084	NC_014035	GGT	3	9	50639	50647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294679117
1085	NC_014035	CGA	2	6	50667	50672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294679117
1086	NC_014035	GC	3	6	50694	50699	0 %	0 %	50 %	50 %	294679117
1087	NC_014035	ATC	2	6	50713	50718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294679117
1088	NC_014035	CTG	2	6	50811	50816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294679118
1089	NC_014035	CGT	2	6	50819	50824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294679118
1090	NC_014035	CG	3	6	50831	50836	0 %	0 %	50 %	50 %	294679118
1091	NC_014035	GCC	2	6	50846	50851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294679118
1092	NC_014035	TCA	2	6	50892	50897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294679118
1093	NC_014035	GC	3	6	50954	50959	0 %	0 %	50 %	50 %	294679118
1094	NC_014035	GGA	2	6	51025	51030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294679118
1095	NC_014035	CCG	2	6	51054	51059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294679118
1096	NC_014035	CGC	2	6	51091	51096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294679118
1097	NC_014035	CAG	3	9	51374	51382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294679119
1098	NC_014035	GATCAG	2	12	51395	51406	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	294679119
1099	NC_014035	CGC	2	6	51431	51436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294679119
1100	NC_014035	CGG	3	9	51475	51483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294679119
1101	NC_014035	AGC	2	6	51492	51497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294679119
1102	NC_014035	GCGG	2	8	51550	51557	0 %	0 %	75 %	25 %	294679119
1103	NC_014035	TCA	2	6	51583	51588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294679119
1104	NC_014035	GCC	2	6	51611	51616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294679119
1105	NC_014035	GC	3	6	51634	51639	0 %	0 %	50 %	50 %	294679119
1106	NC_014035	GGC	2	6	51662	51667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294679119
1107	NC_014035	GC	3	6	51682	51687	0 %	0 %	50 %	50 %	294679119
1108	NC_014035	CCA	2	6	51694	51699	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294679119
1109	NC_014035	CGC	2	6	51707	51712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294679119
1110	NC_014035	C	6	6	51736	51741	0 %	0 %	0 %	100 %	294679119
1111	NC_014035	GC	3	6	51761	51766	0 %	0 %	50 %	50 %	294679119
1112	NC_014035	CCG	2	6	51802	51807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294679119
1113	NC_014035	GCG	3	9	51849	51857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294679119
1114	NC_014035	CGCC	2	8	51943	51950	0 %	0 %	25 %	75 %	294679119
1115	NC_014035	GC	3	6	51962	51967	0 %	0 %	50 %	50 %	294679119
1116	NC_014035	CCGC	2	8	51998	52005	0 %	0 %	25 %	75 %	294679119
1117	NC_014035	GAT	2	6	52007	52012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294679119
1118	NC_014035	CAG	2	6	52091	52096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294679119
1119	NC_014035	C	6	6	52111	52116	0 %	0 %	0 %	100 %	294679119
1120	NC_014035	ACG	2	6	52128	52133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294679119
1121	NC_014035	CAG	2	6	52142	52147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294679119
1122	NC_014035	GCC	2	6	52164	52169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294679119
1123	NC_014035	GCA	2	6	52171	52176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294679119
1124	NC_014035	CGG	2	6	52225	52230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294679119
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1126	NC_014035	C	6	6	52249	52254	0 %	0 %	0 %	100 %	294679119
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