MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodobacter capsulatus SB 1003 chromosome

Total Repeats: 84093

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_014034	ATCG	2	8	228065	228072	25 %	25 %	25 %	25 %	294675748
5003	NC_014034	GGC	2	6	228251	228256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294675748
5004	NC_014034	GCA	2	6	228265	228270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294675748
5005	NC_014034	TCG	2	6	228285	228290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294675748
5006	NC_014034	GGT	2	6	228307	228312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294675748
5007	NC_014034	CGGG	2	8	228328	228335	0 %	0 %	75 %	25 %	294675748
5008	NC_014034	CG	4	8	228343	228350	0 %	0 %	50 %	50 %	294675748
5009	NC_014034	CGC	3	9	228383	228391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294675748
5010	NC_014034	GCG	2	6	228406	228411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294675748
5011	NC_014034	GAA	2	6	228415	228420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294675748
5012	NC_014034	GGT	2	6	228460	228465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294675748
5013	NC_014034	TGC	2	6	228510	228515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294675748
5014	NC_014034	CGG	3	9	228534	228542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294675748
5015	NC_014034	GGC	2	6	228614	228619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294675748
5016	NC_014034	CGC	2	6	228709	228714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294675748
5017	NC_014034	CCG	2	6	228715	228720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294675748
5018	NC_014034	GCC	2	6	228743	228748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294675748
5019	NC_014034	CCG	2	6	228758	228763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294675748
5020	NC_014034	CCG	2	6	228786	228791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294675748
5021	NC_014034	GGC	2	6	228799	228804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294675748
5022	NC_014034	GCGCG	2	10	228837	228846	0 %	0 %	60 %	40 %	294675748
5023	NC_014034	GCTG	2	8	228889	228896	0 %	25 %	50 %	25 %	294675748
5024	NC_014034	GGC	2	6	228928	228933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294675748
5025	NC_014034	GGC	2	6	228960	228965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294675748
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5027	NC_014034	GCT	2	6	229021	229026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294675748
5028	NC_014034	CGA	2	6	229030	229035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294675748
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5030	NC_014034	CCG	2	6	229067	229072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294675748
5031	NC_014034	CGGG	2	8	229073	229080	0 %	0 %	75 %	25 %	294675748
5032	NC_014034	GACCT	2	10	229124	229133	20 %	20 %	20 %	40 %	294675748
5033	NC_014034	GCTG	2	8	229198	229205	0 %	25 %	50 %	25 %	294675748
5034	NC_014034	CGG	2	6	229265	229270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294675748
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5037	NC_014034	CGA	2	6	229507	229512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294675749
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5040	NC_014034	GCG	2	6	229710	229715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294675749
5041	NC_014034	CAT	2	6	229717	229722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294675749
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5049	NC_014034	CGG	4	12	230203	230214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294675750
5050	NC_014034	GCG	2	6	230253	230258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294675750
5051	NC_014034	ACC	2	6	230280	230285	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294675750
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5053	NC_014034	TGG	2	6	230416	230421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294675750
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5055	NC_014034	TTCC	2	8	230624	230631	0 %	50 %	0 %	50 %	294675751
5056	NC_014034	CCG	2	6	230638	230643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294675751
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5060	NC_014034	CGC	2	6	230913	230918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294675751
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5103	NC_014034	CCG	2	6	232815	232820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294675753
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5105	NC_014034	CG	3	6	232850	232855	0 %	0 %	50 %	50 %	294675753
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5112	NC_014034	GCGGT	2	10	233208	233217	0 %	20 %	60 %	20 %	294675753
5113	NC_014034	GC	3	6	233291	233296	0 %	0 %	50 %	50 %	294675754
5114	NC_014034	CCG	2	6	233328	233333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294675754
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5118	NC_014034	CGA	2	6	233477	233482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294675754
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5120	NC_014034	GGC	2	6	233519	233524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294675754
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5122	NC_014034	TGC	2	6	233557	233562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294675754
5123	NC_014034	GCC	2	6	233594	233599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294675754
5124	NC_014034	GCGG	2	8	233618	233625	0 %	0 %	75 %	25 %	294675754
5125	NC_014034	TGG	2	6	233653	233658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294675754
5126	NC_014034	CGGCTG	2	12	233676	233687	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	294675754
5127	NC_014034	GCG	2	6	233690	233695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294675754
5128	NC_014034	CG	4	8	233732	233739	0 %	0 %	50 %	50 %	294675754
5129	NC_014034	GGGC	2	8	233741	233748	0 %	0 %	75 %	25 %	294675754
5130	NC_014034	GCCT	2	8	233751	233758	0 %	25 %	25 %	50 %	294675754
5131	NC_014034	CGG	2	6	233788	233793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294675754
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5135	NC_014034	CGA	2	6	233900	233905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294675754
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5144	NC_014034	GCC	2	6	234195	234200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294675755
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5153	NC_014034	GC	3	6	234507	234512	0 %	0 %	50 %	50 %	294675756
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5156	NC_014034	CG	3	6	234744	234749	0 %	0 %	50 %	50 %	294675756
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5164	NC_014034	GCC	2	6	235155	235160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294675757
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5172	NC_014034	TGC	2	6	235534	235539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294675757
5173	NC_014034	TGCGGC	2	12	235546	235557	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	294675757
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5187	NC_014034	CGC	2	6	236735	236740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294675758
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5192	NC_014034	CGGGT	2	10	237101	237110	0 %	20 %	60 %	20 %	294675759
5193	NC_014034	TTG	2	6	237145	237150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294675759
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5221	NC_014034	CGG	3	9	238060	238068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294675760
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5224	NC_014034	CTTCTG	2	12	238292	238303	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	294675761
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5226	NC_014034	GGCGCA	2	12	238315	238326	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	294675761
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5229	NC_014034	GCC	2	6	238418	238423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294675761
5230	NC_014034	GGC	3	9	238447	238455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294675761
5231	NC_014034	GCT	2	6	238465	238470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294675761
5232	NC_014034	CGT	2	6	238474	238479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294675761
5233	NC_014034	AAAG	2	8	238509	238516	75 %	0 %	25 %	0 %	294675761
5234	NC_014034	TTC	2	6	238532	238537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294675761
5235	NC_014034	G	6	6	238582	238587	0 %	0 %	100 %	0 %	294675762
5236	NC_014034	TGG	2	6	238588	238593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294675762
5237	NC_014034	CGG	3	9	238615	238623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294675762
5238	NC_014034	TTCCTG	2	12	238626	238637	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	294675762
5239	NC_014034	ACG	2	6	238693	238698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294675762
5240	NC_014034	TCG	2	6	238746	238751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294675762
5241	NC_014034	TGC	2	6	238768	238773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294675762
5242	NC_014034	ATC	2	6	238788	238793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294675762
5243	NC_014034	TGG	2	6	238825	238830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294675762
5244	NC_014034	GTC	2	6	238848	238853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294675762
5245	NC_014034	CGG	2	6	238869	238874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294675762
5246	NC_014034	GC	3	6	238889	238894	0 %	0 %	50 %	50 %	294675762
5247	NC_014034	GC	3	6	238925	238930	0 %	0 %	50 %	50 %	294675762
5248	NC_014034	GAC	2	6	239019	239024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294675762
5249	NC_014034	GCC	2	6	239091	239096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294675762
5250	NC_014034	CTG	2	6	239154	239159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294675762
5251	NC_014034	CGA	2	6	239339	239344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294675763
5252	NC_014034	GCT	2	6	239408	239413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294675763
5253	NC_014034	CAT	2	6	239450	239455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294675763
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5256	NC_014034	ACGC	2	8	239532	239539	25 %	0 %	25 %	50 %	294675763
5257	NC_014034	CGA	2	6	239570	239575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294675763
5258	NC_014034	ATC	2	6	239598	239603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294675763
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5261	NC_014034	TGA	2	6	239831	239836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294675763
5262	NC_014034	GCG	2	6	239902	239907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294675763
5263	NC_014034	CGA	2	6	240028	240033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294675763
5264	NC_014034	GCAA	2	8	240070	240077	50 %	0 %	25 %	25 %	294675763
5265	NC_014034	TCG	2	6	240085	240090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294675763
5266	NC_014034	TCGA	2	8	240096	240103	25 %	25 %	25 %	25 %	294675763
5267	NC_014034	CTG	2	6	240120	240125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294675763
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5271	NC_014034	GATC	2	8	240353	240360	25 %	25 %	25 %	25 %	294675763
5272	NC_014034	GAA	3	9	240456	240464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294675764
5273	NC_014034	ATC	2	6	240472	240477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294675764
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5275	NC_014034	GC	3	6	240515	240520	0 %	0 %	50 %	50 %	294675764
5276	NC_014034	CATCG	2	10	240549	240558	20 %	20 %	20 %	40 %	294675764
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5280	NC_014034	CGG	3	9	240662	240670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294675764
5281	NC_014034	TCA	2	6	240707	240712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294675764
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5320	NC_014034	CGG	2	6	242971	242976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294675765
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5324	NC_014034	GGGC	2	8	243109	243116	0 %	0 %	75 %	25 %	294675766
5325	NC_014034	GTC	2	6	243143	243148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294675766
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5333	NC_014034	CG	4	8	243444	243451	0 %	0 %	50 %	50 %	294675766
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5345	NC_014034	CGG	2	6	244077	244082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294675767
5346	NC_014034	ATCG	2	8	244096	244103	25 %	25 %	25 %	25 %	294675767
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5349	NC_014034	GC	3	6	244262	244267	0 %	0 %	50 %	50 %	294675767
5350	NC_014034	GTG	2	6	244298	244303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294675767
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5353	NC_014034	CGG	2	6	244401	244406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294675767
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5355	NC_014034	GAT	2	6	244578	244583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294675768
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5357	NC_014034	GCCG	2	8	244637	244644	0 %	0 %	50 %	50 %	294675768
5358	NC_014034	CGG	2	6	244659	244664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294675768
5359	NC_014034	G	6	6	244668	244673	0 %	0 %	100 %	0 %	294675768
5360	NC_014034	GCG	2	6	244692	244697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294675768
5361	NC_014034	TCGG	2	8	244771	244778	0 %	25 %	50 %	25 %	294675768
5362	NC_014034	ACC	2	6	244786	244791	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294675768
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5364	NC_014034	G	6	6	244868	244873	0 %	0 %	100 %	0 %	294675768
5365	NC_014034	TGC	2	6	244928	244933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294675768
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5485	NC_014034	CGC	2	6	249649	249654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294675772
5486	NC_014034	GC	3	6	249678	249683	0 %	0 %	50 %	50 %	294675772
5487	NC_014034	TCG	2	6	249696	249701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294675772
5488	NC_014034	TGG	3	9	249705	249713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294675772
5489	NC_014034	CCG	2	6	249714	249719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294675772
5490	NC_014034	GCC	2	6	249767	249772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294675772
5491	NC_014034	GAT	2	6	249781	249786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294675772
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