MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Rothia mucilaginosa DY-18 chromosome

Total Repeats: 33644

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013715	GCC	2	6	49	54	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457090
2	NC_013715	CGG	2	6	59	64	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457090
3	NC_013715	TTC	2	6	120	125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283457090
4	NC_013715	TCA	2	6	131	136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457090
5	NC_013715	GAG	2	6	172	177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283457090
6	NC_013715	GAT	2	6	258	263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457090
7	NC_013715	CCG	2	6	368	373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457090
8	NC_013715	TAC	2	6	391	396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457090
9	NC_013715	TGA	2	6	438	443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457090
10	NC_013715	GCA	2	6	504	509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457090
11	NC_013715	GCT	2	6	511	516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457090
12	NC_013715	CGG	2	6	581	586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457090
13	NC_013715	CAG	2	6	598	603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457090
14	NC_013715	AGC	2	6	740	745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457090
15	NC_013715	CGG	2	6	777	782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457090
16	NC_013715	CTG	2	6	805	810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457090
17	NC_013715	GAG	2	6	874	879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283457090
18	NC_013715	TGA	3	9	909	917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457090
19	NC_013715	TCG	2	6	922	927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457090
20	NC_013715	TTC	2	6	956	961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283457090
21	NC_013715	CGA	2	6	998	1003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457090
22	NC_013715	GGA	2	6	1005	1010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283457090
23	NC_013715	TTC	2	6	1012	1017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283457090
24	NC_013715	ACC	2	6	1040	1045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457090
25	NC_013715	GCC	2	6	1074	1079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457090
26	NC_013715	AGC	2	6	1082	1087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457090
27	NC_013715	GAA	2	6	1185	1190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457090
28	NC_013715	GCC	2	6	1300	1305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457090
29	NC_013715	GAA	2	6	1311	1316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457090
30	NC_013715	GCC	2	6	1317	1322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457090
31	NC_013715	GGT	2	6	1381	1386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457090
32	NC_013715	TCT	2	6	1509	1514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283457090
33	NC_013715	GGC	2	6	1561	1566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457090
34	NC_013715	ACG	2	6	1576	1581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457090
35	NC_013715	AGC	2	6	1676	1681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457090
36	NC_013715	CTG	2	6	2593	2598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457091
37	NC_013715	GCT	2	6	2946	2951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457091
38	NC_013715	GGC	2	6	3063	3068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457091
39	NC_013715	TGC	2	6	3071	3076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457091
40	NC_013715	CGC	2	6	3184	3189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457091
41	NC_013715	ACC	2	6	3190	3195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457091
42	NC_013715	GGT	2	6	3264	3269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457091
43	NC_013715	GCT	2	6	3292	3297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457091
44	NC_013715	TGA	2	6	3384	3389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457091
45	NC_013715	TGA	2	6	3429	3434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457091
46	NC_013715	CTG	2	6	3589	3594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457091
47	NC_013715	GCC	2	6	3633	3638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457092
48	NC_013715	GTT	2	6	3758	3763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283457092
49	NC_013715	CTG	2	6	3783	3788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457092
50	NC_013715	CGG	2	6	3802	3807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457092
51	NC_013715	TTG	2	6	3853	3858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283457092
52	NC_013715	GCG	2	6	3873	3878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457092
53	NC_013715	GCA	2	6	3971	3976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457092
54	NC_013715	GGA	2	6	4094	4099	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283457092
55	NC_013715	CGG	2	6	4123	4128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457092
56	NC_013715	GTC	3	9	4129	4137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457092
57	NC_013715	GGT	2	6	4172	4177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457092
58	NC_013715	GCT	2	6	4226	4231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457092
59	NC_013715	AGC	2	6	4294	4299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457092
60	NC_013715	GCT	2	6	4319	4324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457092
61	NC_013715	CGC	2	6	4368	4373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457092
62	NC_013715	GCG	2	6	4467	4472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457092
63	NC_013715	AGG	2	6	4495	4500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283457092
64	NC_013715	CTG	2	6	4587	4592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457092
65	NC_013715	GGT	2	6	4596	4601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457092
66	NC_013715	CTC	2	6	4694	4699	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283457092
67	NC_013715	TTC	2	6	4706	4711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283457092
68	NC_013715	TGA	2	6	4727	4732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457092
69	NC_013715	GGA	2	6	4835	4840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283457092
70	NC_013715	CGG	2	6	4870	4875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457092
71	NC_013715	TTC	2	6	6041	6046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283457093
72	NC_013715	CAT	2	6	6055	6060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457093
73	NC_013715	CAG	2	6	6109	6114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457093
74	NC_013715	CAC	2	6	6214	6219	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457093
75	NC_013715	CGA	2	6	6249	6254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457093
76	NC_013715	GGC	4	12	6418	6429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457093
77	NC_013715	TGG	2	6	6441	6446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457093
78	NC_013715	GTG	2	6	6469	6474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457093
79	NC_013715	GGT	2	6	6547	6552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457093
80	NC_013715	CAG	2	6	6679	6684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457093
81	NC_013715	TCG	2	6	6740	6745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457093
82	NC_013715	GAA	2	6	6771	6776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457093
83	NC_013715	GAG	2	6	6901	6906	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283457093
84	NC_013715	CCG	2	6	7325	7330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457093
85	NC_013715	GAC	2	6	7365	7370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457093
86	NC_013715	CCG	2	6	7371	7376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457093
87	NC_013715	CTG	2	6	7384	7389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457093
88	NC_013715	CTC	2	6	7425	7430	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283457093
89	NC_013715	TGG	2	6	7460	7465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457093
90	NC_013715	GGT	2	6	7480	7485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457093
91	NC_013715	GAT	2	6	7602	7607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457093
92	NC_013715	GAC	2	6	7633	7638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457093
93	NC_013715	CTG	3	9	7717	7725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457093
94	NC_013715	GCC	2	6	7785	7790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457093
95	NC_013715	TGA	2	6	7851	7856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457093
96	NC_013715	GTG	2	6	7868	7873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457093
97	NC_013715	GAA	2	6	7878	7883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457093
98	NC_013715	ACC	2	6	7960	7965	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457093
99	NC_013715	CGC	2	6	7978	7983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457093
100	NC_013715	CTG	2	6	7987	7992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457093
101	NC_013715	GCG	2	6	8014	8019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457093
102	NC_013715	TCT	2	6	8030	8035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283457093
103	NC_013715	CAG	2	6	8080	8085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457093
104	NC_013715	GAA	2	6	8204	8209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457094
105	NC_013715	CAG	2	6	8210	8215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457094
106	NC_013715	ACC	2	6	8268	8273	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457095
107	NC_013715	TTA	2	6	8343	8348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283457095
108	NC_013715	CCG	2	6	8395	8400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457095
109	NC_013715	ACG	2	6	8418	8423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457095
110	NC_013715	ACG	2	6	8601	8606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457095
111	NC_013715	ACG	2	6	8706	8711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457095
112	NC_013715	CTG	2	6	8756	8761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457095
113	NC_013715	TTC	2	6	8770	8775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283457095
114	NC_013715	CCG	2	6	8807	8812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457095
115	NC_013715	GAA	2	6	8854	8859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457095
116	NC_013715	CCA	2	6	8868	8873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457095
117	NC_013715	ATG	2	6	8874	8879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457095
118	NC_013715	GCT	2	6	8881	8886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457095
119	NC_013715	GGT	2	6	9004	9009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457095
120	NC_013715	GGA	2	6	9016	9021	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283457095
121	NC_013715	TCA	2	6	9105	9110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457095
122	NC_013715	AAC	2	6	9221	9226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283457095
123	NC_013715	TTG	2	6	9279	9284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283457095
124	NC_013715	GGA	2	6	9388	9393	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283457095
125	NC_013715	CTG	2	6	9416	9421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457095
126	NC_013715	CGC	2	6	9461	9466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457095
127	NC_013715	TGA	2	6	9478	9483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457095
128	NC_013715	TGA	2	6	9517	9522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457095
129	NC_013715	CGT	2	6	9557	9562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457095
130	NC_013715	GCT	2	6	9566	9571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457095
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132	NC_013715	ATC	2	6	9638	9643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457095
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134	NC_013715	GAG	3	9	9776	9784	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283457095
135	NC_013715	GTG	2	6	9788	9793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457095
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250	NC_013715	CGA	2	6	17570	17575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457102
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252	NC_013715	GTT	2	6	17589	17594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283457102
253	NC_013715	TAA	2	6	17679	17684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283457102
254	NC_013715	CAC	2	6	17812	17817	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457103
255	NC_013715	ACC	2	6	17908	17913	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457103
256	NC_013715	GCG	2	6	17962	17967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457103
257	NC_013715	GGC	2	6	18027	18032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457103
258	NC_013715	GCA	2	6	18134	18139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457103
259	NC_013715	ATG	2	6	18174	18179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457103
260	NC_013715	TGG	2	6	18180	18185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457103
261	NC_013715	TCA	2	6	18217	18222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457103
262	NC_013715	ATG	2	6	18312	18317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457103
263	NC_013715	GGC	2	6	18417	18422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457103
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277	NC_013715	TGG	2	6	19049	19054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457105
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279	NC_013715	ATG	2	6	19181	19186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457105
280	NC_013715	GCT	2	6	19217	19222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457105
281	NC_013715	CTA	2	6	19258	19263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457105
282	NC_013715	GGT	2	6	19286	19291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457105
283	NC_013715	CTT	2	6	19312	19317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283457105
284	NC_013715	AGG	2	6	19334	19339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283457105
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287	NC_013715	GCA	2	6	19519	19524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457105
288	NC_013715	GGT	2	6	19536	19541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457105
289	NC_013715	CCT	2	6	19925	19930	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283457106
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291	NC_013715	CGC	2	6	20019	20024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457106
292	NC_013715	CCA	2	6	20063	20068	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457106
293	NC_013715	GAC	2	6	20076	20081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457106
294	NC_013715	CCT	2	6	20099	20104	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283457106
295	NC_013715	CTC	2	6	20118	20123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283457106
296	NC_013715	CTC	2	6	20127	20132	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283457106
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369	NC_013715	TCC	2	6	25027	25032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283457112
370	NC_013715	ATG	2	6	25075	25080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457112
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376	NC_013715	TCC	2	6	25492	25497	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283457112
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