MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rothia mucilaginosa DY-18 chromosome

Total Repeats: 43738

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_013715	GCG	2	6	51776	51781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457136
1002	NC_013715	TGAT	2	8	51825	51832	25 %	50 %	25 %	0 %	283457136
1003	NC_013715	AAC	2	6	51836	51841	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283457136
1004	NC_013715	TGG	2	6	51858	51863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457136
1005	NC_013715	GAG	2	6	51914	51919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283457136
1006	NC_013715	CTG	2	6	51932	51937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457136
1007	NC_013715	GCG	2	6	52059	52064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457136
1008	NC_013715	TAC	2	6	52073	52078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457136
1009	NC_013715	CCG	2	6	52102	52107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457136
1010	NC_013715	GGT	2	6	52112	52117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457136
1011	NC_013715	GC	3	6	52132	52137	0 %	0 %	50 %	50 %	283457136
1012	NC_013715	GAG	3	9	52157	52165	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283457136
1013	NC_013715	CGC	2	6	52166	52171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457136
1014	NC_013715	TAC	2	6	52172	52177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457136
1015	NC_013715	GGC	2	6	52282	52287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457137
1016	NC_013715	GAA	2	6	52294	52299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457137
1017	NC_013715	CGT	2	6	52330	52335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457137
1018	NC_013715	ATC	2	6	52392	52397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457138
1019	NC_013715	GAA	2	6	52413	52418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457138
1020	NC_013715	TCT	2	6	52474	52479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283457138
1021	NC_013715	CTTCT	2	10	52537	52546	0 %	60 %	0 %	40 %	283457138
1022	NC_013715	CTT	2	6	52552	52557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283457138
1023	NC_013715	GTG	2	6	52573	52578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457138
1024	NC_013715	CAG	2	6	52588	52593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457138
1025	NC_013715	CGC	2	6	52621	52626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457138
1026	NC_013715	CTT	2	6	52756	52761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283457138
1027	NC_013715	CT	3	6	52778	52783	0 %	50 %	0 %	50 %	283457138
1028	NC_013715	CT	3	6	52799	52804	0 %	50 %	0 %	50 %	283457138
1029	NC_013715	GCT	2	6	52813	52818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457138
1030	NC_013715	GT	3	6	52847	52852	0 %	50 %	50 %	0 %	283457138
1031	NC_013715	CGGT	2	8	52892	52899	0 %	25 %	50 %	25 %	283457138
1032	NC_013715	GCT	2	6	52959	52964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457138
1033	NC_013715	TGCTTC	2	12	52970	52981	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	283457138
1034	NC_013715	GTC	2	6	53027	53032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457138
1035	NC_013715	GTC	2	6	53061	53066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457138
1036	NC_013715	ATG	2	6	53086	53091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457138
1037	NC_013715	CTG	2	6	53104	53109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457138
1038	NC_013715	AGC	2	6	53246	53251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457138
1039	NC_013715	CTG	2	6	53282	53287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457138
1040	NC_013715	GGC	2	6	53322	53327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457138
1041	NC_013715	CCG	2	6	53365	53370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457138
1042	NC_013715	GGT	2	6	53400	53405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457138
1043	NC_013715	GGC	2	6	53526	53531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457138
1044	NC_013715	TG	3	6	53542	53547	0 %	50 %	50 %	0 %	283457138
1045	NC_013715	CTT	2	6	53584	53589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283457138
1046	NC_013715	GGC	2	6	53668	53673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457138
1047	NC_013715	TAA	2	6	53695	53700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283457138
1048	NC_013715	CGCC	2	8	53966	53973	0 %	0 %	25 %	75 %	283457139
1049	NC_013715	CAC	2	6	53978	53983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457139
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1051	NC_013715	TAC	2	6	54025	54030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457139
1052	NC_013715	CCG	3	9	54050	54058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457139
1053	NC_013715	TCT	2	6	54077	54082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283457139
1054	NC_013715	CCG	2	6	54095	54100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457139
1055	NC_013715	TGG	2	6	54122	54127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457139
1056	NC_013715	GCC	2	6	54197	54202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457139
1057	NC_013715	TGCC	2	8	54259	54266	0 %	25 %	25 %	50 %	283457139
1058	NC_013715	CTG	2	6	54301	54306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457139
1059	NC_013715	CCG	3	9	54335	54343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457139
1060	NC_013715	CTCCAT	2	12	54357	54368	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	283457139
1061	NC_013715	GC	3	6	54396	54401	0 %	0 %	50 %	50 %	283457139
1062	NC_013715	CCG	2	6	54455	54460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457139
1063	NC_013715	CGC	2	6	54474	54479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457139
1064	NC_013715	GTG	3	9	54541	54549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457139
1065	NC_013715	CGC	2	6	54565	54570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457139
1066	NC_013715	GCC	2	6	54582	54587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457139
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1069	NC_013715	GCA	2	6	54755	54760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457139
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1072	NC_013715	CGGTG	2	10	54864	54873	0 %	20 %	60 %	20 %	283457139
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1074	NC_013715	CGCGTG	2	12	55024	55035	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	283457139
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1082	NC_013715	GCA	2	6	55539	55544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457140
1083	NC_013715	TCG	2	6	55658	55663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457140
1084	NC_013715	GCCC	2	8	55695	55702	0 %	0 %	25 %	75 %	283457140
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1088	NC_013715	CAC	2	6	55822	55827	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457140
1089	NC_013715	GC	3	6	55837	55842	0 %	0 %	50 %	50 %	283457140
1090	NC_013715	TCC	2	6	55847	55852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283457140
1091	NC_013715	CAC	2	6	55939	55944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457140
1092	NC_013715	GC	4	8	55964	55971	0 %	0 %	50 %	50 %	283457140
1093	NC_013715	GCC	2	6	56054	56059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457140
1094	NC_013715	GAG	2	6	56180	56185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283457140
1095	NC_013715	AGGA	2	8	56213	56220	50 %	0 %	50 %	0 %	283457140
1096	NC_013715	GC	3	6	56299	56304	0 %	0 %	50 %	50 %	283457140
1097	NC_013715	GAA	2	6	56314	56319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457140
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1100	NC_013715	GC	3	6	56410	56415	0 %	0 %	50 %	50 %	283457140
1101	NC_013715	CA	3	6	56425	56430	50 %	0 %	0 %	50 %	283457140
1102	NC_013715	TGAC	2	8	56480	56487	25 %	25 %	25 %	25 %	283457141
1103	NC_013715	CACC	2	8	56601	56608	25 %	0 %	0 %	75 %	283457141
1104	NC_013715	CGCA	2	8	56652	56659	25 %	0 %	25 %	50 %	283457141
1105	NC_013715	ACG	2	6	56660	56665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457141
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1107	NC_013715	CGAC	2	8	56690	56697	25 %	0 %	25 %	50 %	283457141
1108	NC_013715	TGG	2	6	56748	56753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457141
1109	NC_013715	TTC	2	6	56765	56770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283457141
1110	NC_013715	CCT	2	6	56808	56813	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283457141
1111	NC_013715	CCCT	2	8	56878	56885	0 %	25 %	0 %	75 %	283457141
1112	NC_013715	CGG	2	6	56906	56911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457141
1113	NC_013715	GAAG	2	8	56991	56998	50 %	0 %	50 %	0 %	283457141
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1121	NC_013715	ACC	2	6	57584	57589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457141
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1124	NC_013715	CGG	2	6	57687	57692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457141
1125	NC_013715	CAT	2	6	57693	57698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457141
1126	NC_013715	GGA	2	6	57705	57710	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283457141
1127	NC_013715	GC	3	6	57735	57740	0 %	0 %	50 %	50 %	283457141
1128	NC_013715	CCG	2	6	57764	57769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457141
1129	NC_013715	ACA	2	6	57794	57799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283457141
1130	NC_013715	TCC	2	6	57877	57882	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283457141
1131	NC_013715	TTC	2	6	57901	57906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283457141
1132	NC_013715	ATG	2	6	57929	57934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457141
1133	NC_013715	ATC	2	6	57947	57952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457141
1134	NC_013715	AAG	2	6	57974	57979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457141
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1136	NC_013715	GCT	2	6	58009	58014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457141
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1139	NC_013715	CGC	2	6	58161	58166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457141
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1142	NC_013715	GTT	2	6	58276	58281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283457141
1143	NC_013715	CTGGGC	2	12	58525	58536	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	283457141
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1145	NC_013715	AAC	2	6	58627	58632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283457141
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1148	NC_013715	AGC	2	6	58677	58682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457141
1149	NC_013715	GCCCC	2	10	58845	58854	0 %	0 %	20 %	80 %	283457141
1150	NC_013715	CG	3	6	58880	58885	0 %	0 %	50 %	50 %	283457141
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1162	NC_013715	CGG	2	6	59325	59330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457141
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1166	NC_013715	GCA	2	6	59518	59523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457141
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1235	NC_013715	CGC	2	6	63175	63180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457144
1236	NC_013715	CAT	3	9	63242	63250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457144
1237	NC_013715	CCTACC	2	12	63259	63270	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	283457144
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1241	NC_013715	C	6	6	63364	63369	0 %	0 %	0 %	100 %	283457144
1242	NC_013715	ACG	2	6	63577	63582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457144
1243	NC_013715	CTT	2	6	63668	63673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283457144
1244	NC_013715	CAC	2	6	63782	63787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457144
1245	NC_013715	CGC	3	9	63806	63814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457144
1246	NC_013715	CTG	2	6	63843	63848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457144
1247	NC_013715	CAC	2	6	63917	63922	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457144
1248	NC_013715	GAG	2	6	63942	63947	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283457144
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1496	NC_013715	CTG	3	9	76223	76231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457156
1497	NC_013715	GAAT	2	8	76270	76277	50 %	25 %	25 %	0 %	283457156
1498	NC_013715	CAG	2	6	76322	76327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457156
1499	NC_013715	GATGAA	2	12	76352	76363	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	283457156
1500	NC_013715	TCA	2	6	76396	76401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457156

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