MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rothia mucilaginosa DY-18 chromosome

Total Repeats: 43738

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013715	GCC	2	6	26284	26289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457113
502	NC_013715	CCCG	2	8	26295	26302	0 %	0 %	25 %	75 %	283457113
503	NC_013715	CGC	2	6	26347	26352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457113
504	NC_013715	ACG	2	6	26387	26392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457113
505	NC_013715	CGC	2	6	26415	26420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457113
506	NC_013715	CAC	2	6	26443	26448	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457113
507	NC_013715	GCTCG	2	10	26481	26490	0 %	20 %	40 %	40 %	283457113
508	NC_013715	ATT	2	6	26503	26508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283457113
509	NC_013715	GGCT	2	8	26521	26528	0 %	25 %	50 %	25 %	283457113
510	NC_013715	CGG	2	6	26529	26534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457113
511	NC_013715	GC	3	6	26547	26552	0 %	0 %	50 %	50 %	283457113
512	NC_013715	ACG	2	6	26555	26560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457113
513	NC_013715	GCT	2	6	26611	26616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457113
514	NC_013715	GGC	2	6	26688	26693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457113
515	NC_013715	GAA	2	6	26704	26709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457113
516	NC_013715	CTC	2	6	26715	26720	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283457113
517	NC_013715	CCT	2	6	26723	26728	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283457113
518	NC_013715	ATT	2	6	26737	26742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283457113
519	NC_013715	AGT	2	6	26791	26796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457113
520	NC_013715	ATC	2	6	26797	26802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457113
521	NC_013715	CCG	2	6	26807	26812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457113
522	NC_013715	CTGG	2	8	26901	26908	0 %	25 %	50 %	25 %	283457113
523	NC_013715	ATC	2	6	26962	26967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457113
524	NC_013715	ATG	2	6	27067	27072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457113
525	NC_013715	CTT	2	6	27084	27089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283457113
526	NC_013715	GAA	3	9	27157	27165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457113
527	NC_013715	ACC	2	6	27238	27243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457113
528	NC_013715	CGC	2	6	27292	27297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457113
529	NC_013715	GAA	2	6	27322	27327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457113
530	NC_013715	AGC	2	6	27332	27337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457113
531	NC_013715	GCC	2	6	27388	27393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457113
532	NC_013715	TCG	2	6	27395	27400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457113
533	NC_013715	ACG	2	6	27446	27451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457113
534	NC_013715	GTG	2	6	27460	27465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457113
535	NC_013715	GCAG	2	8	27486	27493	25 %	0 %	50 %	25 %	283457113
536	NC_013715	CTC	2	6	27504	27509	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283457113
537	NC_013715	TTC	2	6	27521	27526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283457113
538	NC_013715	CCG	2	6	27536	27541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457113
539	NC_013715	GAA	2	6	27573	27578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457113
540	NC_013715	GTG	2	6	27613	27618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457113
541	NC_013715	CGCC	2	8	27626	27633	0 %	0 %	25 %	75 %	283457113
542	NC_013715	CT	3	6	27879	27884	0 %	50 %	0 %	50 %	283457114
543	NC_013715	CCTC	2	8	27900	27907	0 %	25 %	0 %	75 %	283457114
544	NC_013715	T	6	6	27915	27920	0 %	100 %	0 %	0 %	283457114
545	NC_013715	GCG	2	6	27921	27926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457114
546	NC_013715	CTGG	2	8	27961	27968	0 %	25 %	50 %	25 %	283457114
547	NC_013715	GACCC	2	10	28043	28052	20 %	0 %	20 %	60 %	283457114
548	NC_013715	TCC	2	6	28085	28090	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283457114
549	NC_013715	GC	3	6	28111	28116	0 %	0 %	50 %	50 %	283457114
550	NC_013715	CCG	2	6	28123	28128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457114
551	NC_013715	GCT	2	6	28142	28147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457114
552	NC_013715	GCT	2	6	28157	28162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457114
553	NC_013715	TTG	2	6	28305	28310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283457114
554	NC_013715	CCA	2	6	28365	28370	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457114
555	NC_013715	GC	3	6	28385	28390	0 %	0 %	50 %	50 %	283457114
556	NC_013715	TAGG	2	8	28391	28398	25 %	25 %	50 %	0 %	283457114
557	NC_013715	CGGTG	2	10	28464	28473	0 %	20 %	60 %	20 %	283457115
558	NC_013715	GGT	2	6	28480	28485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457115
559	NC_013715	TGG	2	6	28547	28552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457115
560	NC_013715	AGC	2	6	28568	28573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457115
561	NC_013715	CGC	2	6	28609	28614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457115
562	NC_013715	TGA	2	6	28620	28625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457115
563	NC_013715	GAC	2	6	28651	28656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457115
564	NC_013715	GAC	2	6	28669	28674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457115
565	NC_013715	GAA	2	6	28699	28704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457115
566	NC_013715	AGA	2	6	28731	28736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457115
567	NC_013715	AGA	2	6	28757	28762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457115
568	NC_013715	GC	3	6	28985	28990	0 %	0 %	50 %	50 %	283457116
569	NC_013715	GCC	2	6	29041	29046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457116
570	NC_013715	GTGC	2	8	29089	29096	0 %	25 %	50 %	25 %	283457116
571	NC_013715	GCC	2	6	29218	29223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457116
572	NC_013715	TTC	2	6	29284	29289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283457116
573	NC_013715	TTC	2	6	29293	29298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283457116
574	NC_013715	CA	3	6	29638	29643	50 %	0 %	0 %	50 %	283457117
575	NC_013715	GGT	2	6	29647	29652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457117
576	NC_013715	CCA	2	6	29790	29795	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457117
577	NC_013715	TGC	2	6	29798	29803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457117
578	NC_013715	GGCG	2	8	29824	29831	0 %	0 %	75 %	25 %	283457117
579	NC_013715	CGC	2	6	29905	29910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457117
580	NC_013715	GTC	2	6	29971	29976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457117
581	NC_013715	TCG	2	6	30009	30014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457117
582	NC_013715	GTC	2	6	30056	30061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457117
583	NC_013715	CACGG	2	10	30319	30328	20 %	0 %	40 %	40 %	283457117
584	NC_013715	CGC	2	6	30417	30422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457117
585	NC_013715	A	6	6	30430	30435	100 %	0 %	0 %	0 %	283457117
586	NC_013715	GCC	2	6	30443	30448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457117
587	NC_013715	ACCG	2	8	30464	30471	25 %	0 %	25 %	50 %	283457117
588	NC_013715	CAC	2	6	30478	30483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457117
589	NC_013715	AG	3	6	30550	30555	50 %	0 %	50 %	0 %	283457118
590	NC_013715	TCT	3	9	30625	30633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283457118
591	NC_013715	AGGCC	2	10	30670	30679	20 %	0 %	40 %	40 %	283457118
592	NC_013715	GCA	2	6	30682	30687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457118
593	NC_013715	CGCC	2	8	30727	30734	0 %	0 %	25 %	75 %	283457118
594	NC_013715	TCT	2	6	30838	30843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283457118
595	NC_013715	GCC	2	6	30854	30859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457118
596	NC_013715	GAA	3	9	30944	30952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457118
597	NC_013715	CAG	2	6	30953	30958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457118
598	NC_013715	GCC	2	6	31002	31007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457118
599	NC_013715	GGC	2	6	31091	31096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457118
600	NC_013715	GAA	2	6	31184	31189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457118
601	NC_013715	TCT	2	6	31221	31226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283457118
602	NC_013715	GAAC	2	8	31301	31308	50 %	0 %	25 %	25 %	283457118
603	NC_013715	GGC	3	9	31441	31449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457119
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605	NC_013715	CAG	2	6	31504	31509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457119
606	NC_013715	CAGG	2	8	31513	31520	25 %	0 %	50 %	25 %	283457119
607	NC_013715	CCG	2	6	31595	31600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457119
608	NC_013715	GCG	4	12	31634	31645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457119
609	NC_013715	GAA	3	9	31657	31665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457119
610	NC_013715	CAT	2	6	31687	31692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457119
611	NC_013715	TGA	2	6	31695	31700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457119
612	NC_013715	CAG	2	6	31777	31782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457119
613	NC_013715	TCG	2	6	31793	31798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457119
614	NC_013715	GAA	2	6	31927	31932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457119
615	NC_013715	ACGA	2	8	31945	31952	50 %	0 %	25 %	25 %	283457119
616	NC_013715	ACCTG	2	10	31964	31973	20 %	20 %	20 %	40 %	283457119
617	NC_013715	GCC	2	6	31976	31981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457119
618	NC_013715	AGCAAT	2	12	31990	32001	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	283457119
619	NC_013715	GGT	2	6	32005	32010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457119
620	NC_013715	CAA	2	6	32034	32039	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283457119
621	NC_013715	TGG	2	6	32049	32054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457119
622	NC_013715	CGC	2	6	32080	32085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457119
623	NC_013715	CCA	2	6	32214	32219	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457119
624	NC_013715	AAC	2	6	32251	32256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283457119
625	NC_013715	GCT	2	6	32339	32344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457120
626	NC_013715	CTC	2	6	32397	32402	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283457120
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628	NC_013715	TCG	2	6	32488	32493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457120
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