MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rothia mucilaginosa DY-18 chromosome

Total Repeats: 43738

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_013715	GGA	2	6	280674	280679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283457344
5502	NC_013715	GGT	2	6	280689	280694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457344
5503	NC_013715	CGG	2	6	280715	280720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457344
5504	NC_013715	CGG	2	6	280754	280759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457344
5505	NC_013715	GGT	2	6	280767	280772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457344
5506	NC_013715	CG	3	6	280795	280800	0 %	0 %	50 %	50 %	283457344
5507	NC_013715	CCCGC	2	10	280822	280831	0 %	0 %	20 %	80 %	283457344
5508	NC_013715	CGT	2	6	280833	280838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457344
5509	NC_013715	GGC	2	6	280886	280891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457344
5510	NC_013715	GCC	2	6	280893	280898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457344
5511	NC_013715	GCG	2	6	281020	281025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457344
5512	NC_013715	TTCGG	2	10	281049	281058	0 %	40 %	40 %	20 %	283457344
5513	NC_013715	CTG	3	9	281070	281078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457344
5514	NC_013715	CGC	2	6	281086	281091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457344
5515	NC_013715	GA	3	6	281465	281470	50 %	0 %	50 %	0 %	283457345
5516	NC_013715	CCT	2	6	281504	281509	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283457345
5517	NC_013715	CAC	2	6	281544	281549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457345
5518	NC_013715	GAA	3	9	281553	281561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457345
5519	NC_013715	GC	3	6	281591	281596	0 %	0 %	50 %	50 %	283457345
5520	NC_013715	TTG	2	6	281637	281642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283457345
5521	NC_013715	ACC	2	6	281645	281650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457345
5522	NC_013715	GAA	2	6	281654	281659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457345
5523	NC_013715	GCA	2	6	281666	281671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457345
5524	NC_013715	GGC	2	6	281684	281689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457345
5525	NC_013715	CGG	2	6	281719	281724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457345
5526	NC_013715	GGC	2	6	281738	281743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457345
5527	NC_013715	GAA	2	6	281765	281770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457345
5528	NC_013715	GAA	2	6	281861	281866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457345
5529	NC_013715	TAC	2	6	281867	281872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457345
5530	NC_013715	CTG	2	6	281882	281887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457345
5531	NC_013715	AGC	2	6	281946	281951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457345
5532	NC_013715	GCT	2	6	281954	281959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457345
5533	NC_013715	GCA	2	6	282041	282046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457345
5534	NC_013715	GTT	2	6	282074	282079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283457345
5535	NC_013715	GAC	2	6	282200	282205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457345
5536	NC_013715	CGT	2	6	282367	282372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457345
5537	NC_013715	TGG	2	6	282427	282432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457345
5538	NC_013715	CGA	2	6	282481	282486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457345
5539	NC_013715	CGG	2	6	282517	282522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457345
5540	NC_013715	GCA	2	6	282584	282589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457345
5541	NC_013715	CAA	2	6	282619	282624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283457345
5542	NC_013715	CGC	2	6	282638	282643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457345
5543	NC_013715	ACC	2	6	282660	282665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457345
5544	NC_013715	GTT	2	6	282671	282676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283457345
5545	NC_013715	GCA	2	6	282710	282715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457345
5546	NC_013715	GCTC	2	8	282718	282725	0 %	25 %	25 %	50 %	283457345
5547	NC_013715	CGCA	2	8	282840	282847	25 %	0 %	25 %	50 %	283457347
5548	NC_013715	GCA	2	6	282853	282858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457347
5549	NC_013715	GCG	2	6	282875	282880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457347
5550	NC_013715	CAC	2	6	282900	282905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457347
5551	NC_013715	GCA	2	6	283030	283035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457347
5552	NC_013715	TCG	3	9	283067	283075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457347
5553	NC_013715	TCA	2	6	283076	283081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457347
5554	NC_013715	GCT	2	6	283123	283128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457347
5555	NC_013715	CAT	2	6	283167	283172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457347
5556	NC_013715	CAT	2	6	283191	283196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457347
5557	NC_013715	GAG	2	6	283204	283209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283457347
5558	NC_013715	TGGT	2	8	283214	283221	0 %	50 %	50 %	0 %	283457347
5559	NC_013715	GGCAAG	2	12	283243	283254	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	283457347
5560	NC_013715	CAC	2	6	283323	283328	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457347
5561	NC_013715	TGG	2	6	283341	283346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457347
5562	NC_013715	CAT	2	6	283353	283358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457347
5563	NC_013715	CAC	2	6	283362	283367	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457347
5564	NC_013715	GGT	2	6	283438	283443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457347
5565	NC_013715	GAG	2	6	283450	283455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283457347
5566	NC_013715	TGC	2	6	283458	283463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457347
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5568	NC_013715	TCC	2	6	283570	283575	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283457347
5569	NC_013715	GAA	2	6	283590	283595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	283457347
5570	NC_013715	AGC	2	6	283608	283613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457347
5571	NC_013715	AGT	2	6	283679	283684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457347
5572	NC_013715	TGA	2	6	283861	283866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457348
5573	NC_013715	TG	4	8	283873	283880	0 %	50 %	50 %	0 %	283457348
5574	NC_013715	TATT	2	8	284039	284046	25 %	75 %	0 %	0 %	283457348
5575	NC_013715	TGA	2	6	284047	284052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457348
5576	NC_013715	TAA	2	6	284115	284120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283457348
5577	NC_013715	GGA	2	6	284130	284135	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283457348
5578	NC_013715	TGG	2	6	284188	284193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457348
5579	NC_013715	ACT	2	6	284206	284211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457348
5580	NC_013715	ATT	2	6	284234	284239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283457348
5581	NC_013715	TTC	2	6	284328	284333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	283457348
5582	NC_013715	TTTG	2	8	284341	284348	0 %	75 %	25 %	0 %	283457348
5583	NC_013715	TAT	2	6	284380	284385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283457348
5584	NC_013715	ATT	2	6	284501	284506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283457348
5585	NC_013715	AT	3	6	284535	284540	50 %	50 %	0 %	0 %	283457348
5586	NC_013715	GGT	2	6	284641	284646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457348
5587	NC_013715	ATA	3	9	284703	284711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	283457348
5588	NC_013715	GGCT	2	8	284729	284736	0 %	25 %	50 %	25 %	283457348
5589	NC_013715	TTA	2	6	284753	284758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	283457348
5590	NC_013715	TGGGA	2	10	284796	284805	20 %	20 %	60 %	0 %	283457348
5591	NC_013715	GA	3	6	284804	284809	50 %	0 %	50 %	0 %	283457348
5592	NC_013715	TCA	2	6	284839	284844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457348
5593	NC_013715	T	6	6	284883	284888	0 %	100 %	0 %	0 %	283457348
5594	NC_013715	TTG	2	6	284988	284993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	283457348
5595	NC_013715	AAAAGA	2	12	285007	285018	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	283457348
5596	NC_013715	CTA	2	6	285022	285027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457348
5597	NC_013715	TAC	2	6	285040	285045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457348
5598	NC_013715	CAG	2	6	285067	285072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457348
5599	NC_013715	TAC	2	6	285089	285094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	283457348
5600	NC_013715	TC	3	6	285457	285462	0 %	50 %	0 %	50 %	283457349
5601	NC_013715	AGGC	2	8	285478	285485	25 %	0 %	50 %	25 %	283457349
5602	NC_013715	CGT	2	6	285500	285505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457349
5603	NC_013715	GCA	2	6	285516	285521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457349
5604	NC_013715	CGC	2	6	285533	285538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457349
5605	NC_013715	AAC	2	6	285588	285593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283457349
5606	NC_013715	GGC	2	6	285594	285599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	283457349
5607	NC_013715	TCC	2	6	285615	285620	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283457349
5608	NC_013715	AAC	2	6	285621	285626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	283457349
5609	NC_013715	GAC	2	6	285702	285707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457349
5610	NC_013715	TCC	2	6	285804	285809	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	283457349
5611	NC_013715	TGG	2	6	285819	285824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457349
5612	NC_013715	ACCGGC	2	12	285849	285860	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	283457349
5613	NC_013715	GCA	2	6	285871	285876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457349
5614	NC_013715	ACC	2	6	286014	286019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457349
5615	NC_013715	CAGGC	2	10	286036	286045	20 %	0 %	40 %	40 %	283457349
5616	NC_013715	CCG	2	6	286069	286074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457349
5617	NC_013715	ACCG	2	8	286094	286101	25 %	0 %	25 %	50 %	283457349
5618	NC_013715	ACC	2	6	286152	286157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	283457349
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5742	NC_013715	ATG	2	6	292042	292047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457354
5743	NC_013715	GCT	2	6	292065	292070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	283457354
5744	NC_013715	AGT	2	6	292119	292124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457354
5745	NC_013715	GCGCC	2	10	292143	292152	0 %	0 %	40 %	60 %	283457354
5746	NC_013715	TTCC	2	8	292188	292195	0 %	50 %	0 %	50 %	283457354
5747	NC_013715	GGT	2	6	292407	292412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	283457354
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5750	NC_013715	GCC	2	6	292481	292486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457354
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5752	NC_013715	GAG	2	6	292588	292593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	283457354
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5754	NC_013715	GAC	2	6	292657	292662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457354
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5759	NC_013715	GCC	2	6	292838	292843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457354
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5770	NC_013715	CGC	2	6	293444	293449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457355
5771	NC_013715	GC	3	6	293466	293471	0 %	0 %	50 %	50 %	283457355
5772	NC_013715	GCGCC	2	10	293495	293504	0 %	0 %	40 %	60 %	283457355
5773	NC_013715	GAACC	2	10	293505	293514	40 %	0 %	20 %	40 %	283457355
5774	NC_013715	AGC	2	6	293542	293547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457355
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5814	NC_013715	GCTGAA	2	12	296043	296054	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	283457358
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5828	NC_013715	GGTCTG	2	12	296794	296805	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	283457358
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5981	NC_013715	CAG	2	6	304893	304898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	283457367
5982	NC_013715	CGCGC	2	10	304912	304921	0 %	0 %	40 %	60 %	283457367
5983	NC_013715	CGC	2	6	304971	304976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457367
5984	NC_013715	GCC	2	6	305035	305040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457367
5985	NC_013715	GCC	2	6	305080	305085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	283457367
5986	NC_013715	GCAC	2	8	305099	305106	25 %	0 %	25 %	50 %	283457367
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5993	NC_013715	TGA	2	6	305313	305318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	283457367
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