MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodothermus marinus DSM 4252 chromosome

Total Repeats: 72471

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_013501	GCC	2	6	174489	174494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315738
4002	NC_013501	AGC	2	6	174547	174552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315738
4003	NC_013501	CCA	2	6	174563	174568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268315738
4004	NC_013501	GAT	2	6	174588	174593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268315738
4005	NC_013501	TCA	2	6	174671	174676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315738
4006	NC_013501	ATC	2	6	174721	174726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315738
4007	NC_013501	CAC	2	6	174864	174869	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268315738
4008	NC_013501	CAGGT	2	10	174910	174919	20 %	20 %	40 %	20 %	268315738
4009	NC_013501	ATG	3	9	174973	174981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268315738
4010	NC_013501	AGCC	2	8	175030	175037	25 %	0 %	25 %	50 %	268315738
4011	NC_013501	CCG	2	6	175088	175093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315738
4012	NC_013501	CAG	2	6	175191	175196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315738
4013	NC_013501	GCGCC	2	10	175202	175211	0 %	0 %	40 %	60 %	268315738
4014	NC_013501	TGA	2	6	175217	175222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268315738
4015	NC_013501	GAC	2	6	175266	175271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315738
4016	NC_013501	GCC	2	6	175278	175283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315738
4017	NC_013501	CAC	2	6	175284	175289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268315738
4018	NC_013501	GCC	2	6	175321	175326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315738
4019	NC_013501	CTG	2	6	175335	175340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315738
4020	NC_013501	GAT	2	6	175353	175358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268315738
4021	NC_013501	CCA	2	6	175397	175402	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268315738
4022	NC_013501	TGA	2	6	175478	175483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268315738
4023	NC_013501	TGA	2	6	175547	175552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268315738
4024	NC_013501	GCC	2	6	175564	175569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315738
4025	NC_013501	GCG	3	9	175613	175621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315738
4026	NC_013501	ATC	2	6	175693	175698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315738
4027	NC_013501	GCC	2	6	175702	175707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315738
4028	NC_013501	CGGC	2	8	175755	175762	0 %	0 %	50 %	50 %	268315738
4029	NC_013501	CAG	2	6	175824	175829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315738
4030	NC_013501	GGCG	2	8	175863	175870	0 %	0 %	75 %	25 %	268315738
4031	NC_013501	GCC	2	6	175926	175931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315738
4032	NC_013501	CAG	2	6	175935	175940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315738
4033	NC_013501	ACG	2	6	175945	175950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315738
4034	NC_013501	GCCA	2	8	176061	176068	25 %	0 %	25 %	50 %	268315738
4035	NC_013501	TCC	2	6	176077	176082	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268315739
4036	NC_013501	CATG	2	8	176096	176103	25 %	25 %	25 %	25 %	268315739
4037	NC_013501	TCG	2	6	176158	176163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315739
4038	NC_013501	GCA	2	6	176195	176200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315739
4039	NC_013501	TGC	2	6	176254	176259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315739
4040	NC_013501	CGT	2	6	176261	176266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315739
4041	NC_013501	CCGG	2	8	176362	176369	0 %	0 %	50 %	50 %	268315739
4042	NC_013501	GGC	2	6	176409	176414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315739
4043	NC_013501	CTGGTT	2	12	176463	176474	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	268315739
4044	NC_013501	GAA	2	6	176478	176483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268315739
4045	NC_013501	CACAC	2	10	176521	176530	40 %	0 %	0 %	60 %	268315739
4046	NC_013501	CCA	2	6	176574	176579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268315739
4047	NC_013501	GCG	2	6	176600	176605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315739
4048	NC_013501	CCT	2	6	176622	176627	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268315740
4049	NC_013501	GCC	2	6	176691	176696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315740
4050	NC_013501	CTG	2	6	176726	176731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315740
4051	NC_013501	CTG	2	6	176744	176749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315740
4052	NC_013501	CGGC	2	8	176940	176947	0 %	0 %	50 %	50 %	268315741
4053	NC_013501	GCCG	2	8	177006	177013	0 %	0 %	50 %	50 %	268315741
4054	NC_013501	CATGAG	2	12	177033	177044	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	268315741
4055	NC_013501	GCC	2	6	177103	177108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315741
4056	NC_013501	AGC	2	6	177238	177243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315741
4057	NC_013501	CG	3	6	177259	177264	0 %	0 %	50 %	50 %	268315741
4058	NC_013501	GCA	2	6	177278	177283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315741
4059	NC_013501	GAT	2	6	177291	177296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268315741
4060	NC_013501	CG	3	6	177299	177304	0 %	0 %	50 %	50 %	268315741
4061	NC_013501	TGA	2	6	177305	177310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268315741
4062	NC_013501	AGC	2	6	177316	177321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315741
4063	NC_013501	TCG	2	6	177331	177336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315741
4064	NC_013501	ACG	2	6	177364	177369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315741
4065	NC_013501	CAG	2	6	177375	177380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315741
4066	NC_013501	GGC	2	6	177382	177387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315741
4067	NC_013501	CAT	2	6	177453	177458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315741
4068	NC_013501	ACG	2	6	177529	177534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315741
4069	NC_013501	TGGC	2	8	177535	177542	0 %	25 %	50 %	25 %	268315741
4070	NC_013501	CGG	2	6	177598	177603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315741
4071	NC_013501	CA	3	6	177636	177641	50 %	0 %	0 %	50 %	268315741
4072	NC_013501	GCC	2	6	177723	177728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315741
4073	NC_013501	TTCG	2	8	177752	177759	0 %	50 %	25 %	25 %	268315741
4074	NC_013501	TCC	2	6	177766	177771	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268315741
4075	NC_013501	ATG	2	6	177990	177995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268315742
4076	NC_013501	GACG	2	8	178067	178074	25 %	0 %	50 %	25 %	268315742
4077	NC_013501	ATC	2	6	178077	178082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315742
4078	NC_013501	GAA	2	6	178149	178154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268315742
4079	NC_013501	GGC	2	6	178156	178161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315742
4080	NC_013501	GTG	2	6	178185	178190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315742
4081	NC_013501	AGG	2	6	178204	178209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268315742
4082	NC_013501	CTT	2	6	178316	178321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268315742
4083	NC_013501	GGGCG	2	10	178340	178349	0 %	0 %	80 %	20 %	268315742
4084	NC_013501	GAC	2	6	178413	178418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315742
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4086	NC_013501	GCTCAC	2	12	178439	178450	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	268315742
4087	NC_013501	CCA	2	6	178469	178474	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268315742
4088	NC_013501	CGC	2	6	178475	178480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315742
4089	NC_013501	CGC	2	6	178511	178516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315742
4090	NC_013501	GCG	2	6	178546	178551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315742
4091	NC_013501	GGC	2	6	178556	178561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315742
4092	NC_013501	CAT	2	6	178583	178588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315742
4093	NC_013501	CTG	2	6	178590	178595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315742
4094	NC_013501	CAT	2	6	178599	178604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315742
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4101	NC_013501	CG	3	6	178879	178884	0 %	0 %	50 %	50 %	268315742
4102	NC_013501	GCCGG	2	10	178931	178940	0 %	0 %	60 %	40 %	268315742
4103	NC_013501	AAC	2	6	179064	179069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268315743
4104	NC_013501	CTG	2	6	179085	179090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315743
4105	NC_013501	GAA	2	6	179121	179126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268315743
4106	NC_013501	GAA	2	6	179199	179204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268315743
4107	NC_013501	CG	4	8	179237	179244	0 %	0 %	50 %	50 %	268315743
4108	NC_013501	GTG	2	6	179256	179261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315743
4109	NC_013501	GGC	2	6	179303	179308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315743
4110	NC_013501	TCGC	2	8	179315	179322	0 %	25 %	25 %	50 %	268315743
4111	NC_013501	CCA	2	6	179363	179368	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268315743
4112	NC_013501	GGGA	2	8	179419	179426	25 %	0 %	75 %	0 %	268315743
4113	NC_013501	CTC	2	6	179481	179486	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268315743
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4118	NC_013501	ACA	2	6	179617	179622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268315743
4119	NC_013501	TGC	2	6	179638	179643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315743
4120	NC_013501	GCTG	2	8	179692	179699	0 %	25 %	50 %	25 %	268315743
4121	NC_013501	GCCG	2	8	179786	179793	0 %	0 %	50 %	50 %	268315743
4122	NC_013501	ATC	2	6	179842	179847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315743
4123	NC_013501	GGGCT	2	10	179974	179983	0 %	20 %	60 %	20 %	268315744
4124	NC_013501	CTT	2	6	180072	180077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268315744
4125	NC_013501	GAA	2	6	180112	180117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268315744
4126	NC_013501	TGG	2	6	180119	180124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315744
4127	NC_013501	GGT	2	6	180153	180158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315744
4128	NC_013501	GTC	2	6	180224	180229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315744
4129	NC_013501	GCTC	2	8	180257	180264	0 %	25 %	25 %	50 %	268315744
4130	NC_013501	TGG	2	6	180472	180477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315744
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4136	NC_013501	GCT	2	6	180669	180674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315744
4137	NC_013501	CTGGC	2	10	180721	180730	0 %	20 %	40 %	40 %	268315744
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4141	NC_013501	GGA	2	6	180846	180851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268315744
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4144	NC_013501	GAAG	2	8	181005	181012	50 %	0 %	50 %	0 %	268315745
4145	NC_013501	CGA	2	6	181035	181040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315745
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4148	NC_013501	GAT	2	6	181246	181251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268315745
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4151	NC_013501	TGA	2	6	181365	181370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268315745
4152	NC_013501	GGT	2	6	181442	181447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315746
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4157	NC_013501	AGCAA	2	10	181723	181732	60 %	0 %	20 %	20 %	268315746
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4185	NC_013501	AT	3	6	183356	183361	50 %	50 %	0 %	0 %	268315748
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4204	NC_013501	CGA	2	6	185290	185295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315751
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4206	NC_013501	GTA	2	6	185397	185402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268315751
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4210	NC_013501	CG	3	6	185752	185757	0 %	0 %	50 %	50 %	268315752
4211	NC_013501	GGC	2	6	185783	185788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315752
4212	NC_013501	GATC	2	8	185814	185821	25 %	25 %	25 %	25 %	268315752
4213	NC_013501	CGA	2	6	185873	185878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315752
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4217	NC_013501	GTG	2	6	186045	186050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315753
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4223	NC_013501	CGGC	2	8	186387	186394	0 %	0 %	50 %	50 %	268315753
4224	NC_013501	CGG	2	6	186430	186435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315753
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4230	NC_013501	CAG	2	6	186659	186664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315753
4231	NC_013501	GCA	2	6	186697	186702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315753
4232	NC_013501	GCT	2	6	192546	192551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315754
4233	NC_013501	CGA	2	6	192600	192605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315754
4234	NC_013501	TCG	2	6	192620	192625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315754
4235	NC_013501	CACC	2	8	192641	192648	25 %	0 %	0 %	75 %	268315754
4236	NC_013501	GGCCC	2	10	192739	192748	0 %	0 %	40 %	60 %	268315754
4237	NC_013501	TGG	2	6	192752	192757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315754
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4239	NC_013501	ACC	2	6	192833	192838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268315754
4240	NC_013501	GCT	2	6	192865	192870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315754
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4242	NC_013501	GCCC	2	8	192913	192920	0 %	0 %	25 %	75 %	268315754
4243	NC_013501	TCGCT	2	10	192937	192946	0 %	40 %	20 %	40 %	268315754
4244	NC_013501	GGC	2	6	192950	192955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315754
4245	NC_013501	CGT	2	6	192990	192995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315754
4246	NC_013501	GGCG	2	8	193041	193048	0 %	0 %	75 %	25 %	268315754
4247	NC_013501	GAA	2	6	193222	193227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268315754
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4273	NC_013501	G	6	6	194331	194336	0 %	0 %	100 %	0 %	268315754
4274	NC_013501	GCACC	2	10	194380	194389	20 %	0 %	20 %	60 %	268315754
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4282	NC_013501	GC	3	6	194552	194557	0 %	0 %	50 %	50 %	268315754
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4483	NC_013501	GGC	2	6	203455	203460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315764
4484	NC_013501	CG	3	6	203493	203498	0 %	0 %	50 %	50 %	268315764
4485	NC_013501	GCCG	2	8	203574	203581	0 %	0 %	50 %	50 %	268315764
4486	NC_013501	CGA	2	6	203613	203618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315764
4487	NC_013501	TCA	2	6	203646	203651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315764
4488	NC_013501	GCTTC	2	10	203655	203664	0 %	40 %	20 %	40 %	268315764
4489	NC_013501	CCG	2	6	203738	203743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315764
4490	NC_013501	GCG	2	6	203766	203771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315764
4491	NC_013501	TGCGGG	2	12	203813	203824	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	268315765
4492	NC_013501	GGC	2	6	203835	203840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315765
4493	NC_013501	GGC	2	6	203885	203890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315765
4494	NC_013501	CGGT	2	8	203997	204004	0 %	25 %	50 %	25 %	268315765
4495	NC_013501	CGG	2	6	204026	204031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315765
4496	NC_013501	AGG	2	6	204046	204051	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268315765
4497	NC_013501	GCT	2	6	204093	204098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315765
4498	NC_013501	AGCCG	2	10	204103	204112	20 %	0 %	40 %	40 %	268315765
4499	NC_013501	AGCC	2	8	204130	204137	25 %	0 %	25 %	50 %	268315765
4500	NC_013501	GC	4	8	204228	204235	0 %	0 %	50 %	50 %	268315765

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