MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodothermus marinus DSM 4252 chromosome

Total Repeats: 72471

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_013501	GCC	2	6	153524	153529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315717
3502	NC_013501	CACG	2	8	153628	153635	25 %	0 %	25 %	50 %	268315717
3503	NC_013501	CGA	2	6	153664	153669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315717
3504	NC_013501	CCG	2	6	153679	153684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315717
3505	NC_013501	TAC	2	6	153692	153697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315717
3506	NC_013501	GCC	2	6	153707	153712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315717
3507	NC_013501	GCT	2	6	153830	153835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315718
3508	NC_013501	CTGG	2	8	153839	153846	0 %	25 %	50 %	25 %	268315718
3509	NC_013501	GGC	2	6	153968	153973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315718
3510	NC_013501	GCG	2	6	154050	154055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315718
3511	NC_013501	TACGG	2	10	154064	154073	20 %	20 %	40 %	20 %	268315718
3512	NC_013501	ACA	2	6	154085	154090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268315718
3513	NC_013501	ATG	2	6	154203	154208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268315718
3514	NC_013501	CGC	2	6	154215	154220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315718
3515	NC_013501	GCT	2	6	154221	154226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315718
3516	NC_013501	TTC	2	6	154236	154241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268315718
3517	NC_013501	GTC	2	6	154257	154262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315718
3518	NC_013501	TTG	2	6	154266	154271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268315718
3519	NC_013501	TAT	2	6	154290	154295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268315718
3520	NC_013501	CGG	2	6	154345	154350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315718
3521	NC_013501	TGG	2	6	154403	154408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315718
3522	NC_013501	ATC	2	6	154416	154421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315718
3523	NC_013501	GGTG	2	8	154439	154446	0 %	25 %	75 %	0 %	268315718
3524	NC_013501	GGC	2	6	154461	154466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315718
3525	NC_013501	CGA	2	6	154520	154525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315718
3526	NC_013501	GGT	2	6	154553	154558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315718
3527	NC_013501	GCCAAT	2	12	154572	154583	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	268315718
3528	NC_013501	GC	3	6	154588	154593	0 %	0 %	50 %	50 %	268315718
3529	NC_013501	TGA	2	6	154642	154647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268315718
3530	NC_013501	GGC	2	6	154670	154675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315718
3531	NC_013501	TCG	2	6	154680	154685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315718
3532	NC_013501	A	6	6	154701	154706	100 %	0 %	0 %	0 %	268315718
3533	NC_013501	TCG	2	6	154711	154716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315718
3534	NC_013501	TGC	2	6	154750	154755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315718
3535	NC_013501	TTCGCC	2	12	154797	154808	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	268315718
3536	NC_013501	GAC	2	6	154868	154873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315718
3537	NC_013501	GTG	2	6	154972	154977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315719
3538	NC_013501	GAC	2	6	154978	154983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315719
3539	NC_013501	GCC	2	6	154999	155004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315719
3540	NC_013501	GCA	2	6	155019	155024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315719
3541	NC_013501	GCG	2	6	155034	155039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315719
3542	NC_013501	TGC	2	6	155153	155158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315719
3543	NC_013501	GCA	2	6	155166	155171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315719
3544	NC_013501	TCCT	2	8	155214	155221	0 %	50 %	0 %	50 %	268315719
3545	NC_013501	CTG	2	6	155410	155415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315719
3546	NC_013501	TGG	2	6	155449	155454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315719
3547	NC_013501	CGGT	2	8	155492	155499	0 %	25 %	50 %	25 %	268315719
3548	NC_013501	TGG	2	6	155501	155506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315719
3549	NC_013501	GAGC	2	8	155698	155705	25 %	0 %	50 %	25 %	268315719
3550	NC_013501	CTG	2	6	155716	155721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315719
3551	NC_013501	CGG	2	6	155734	155739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315719
3552	NC_013501	A	7	7	155748	155754	100 %	0 %	0 %	0 %	268315719
3553	NC_013501	GCT	2	6	155815	155820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315719
3554	NC_013501	CG	3	6	155921	155926	0 %	0 %	50 %	50 %	268315719
3555	NC_013501	CAG	2	6	156079	156084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315719
3556	NC_013501	CCTGA	2	10	156085	156094	20 %	20 %	20 %	40 %	268315719
3557	NC_013501	CGA	2	6	156129	156134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315719
3558	NC_013501	GCG	2	6	156139	156144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315719
3559	NC_013501	GT	3	6	156177	156182	0 %	50 %	50 %	0 %	268315719
3560	NC_013501	GCC	2	6	156267	156272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315719
3561	NC_013501	CGT	2	6	156296	156301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315719
3562	NC_013501	GAG	2	6	156343	156348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268315719
3563	NC_013501	GGC	2	6	156378	156383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315719
3564	NC_013501	GAG	2	6	156436	156441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268315719
3565	NC_013501	GCA	2	6	156459	156464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315719
3566	NC_013501	GAA	2	6	156481	156486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268315719
3567	NC_013501	GAA	2	6	156502	156507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268315719
3568	NC_013501	GAG	2	6	156538	156543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268315719
3569	NC_013501	AGC	2	6	156569	156574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315719
3570	NC_013501	GCA	2	6	156630	156635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315719
3571	NC_013501	CCA	2	6	156663	156668	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268315719
3572	NC_013501	GCT	2	6	156700	156705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315719
3573	NC_013501	CGA	2	6	156709	156714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315719
3574	NC_013501	GC	3	6	156727	156732	0 %	0 %	50 %	50 %	268315719
3575	NC_013501	GGC	2	6	156753	156758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315719
3576	NC_013501	CGAT	2	8	156785	156792	25 %	25 %	25 %	25 %	268315719
3577	NC_013501	GTGC	2	8	156796	156803	0 %	25 %	50 %	25 %	268315719
3578	NC_013501	TGC	2	6	156812	156817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315719
3579	NC_013501	GAG	2	6	156826	156831	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268315719
3580	NC_013501	GC	4	8	156834	156841	0 %	0 %	50 %	50 %	268315719
3581	NC_013501	CGA	2	6	156859	156864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315719
3582	NC_013501	TTTG	2	8	156897	156904	0 %	75 %	25 %	0 %	268315719
3583	NC_013501	AGT	2	6	156970	156975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268315719
3584	NC_013501	GTG	3	9	156979	156987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315719
3585	NC_013501	AGC	2	6	157170	157175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315719
3586	NC_013501	CGT	2	6	157209	157214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315719
3587	NC_013501	CAG	2	6	157261	157266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315719
3588	NC_013501	CTG	2	6	157279	157284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315719
3589	NC_013501	CGGC	2	8	157336	157343	0 %	0 %	50 %	50 %	268315719
3590	NC_013501	TTC	2	6	157348	157353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268315719
3591	NC_013501	CTG	2	6	157468	157473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315719
3592	NC_013501	GCC	2	6	157482	157487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315719
3593	NC_013501	TTC	2	6	157570	157575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268315719
3594	NC_013501	GGA	2	6	157647	157652	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268315719
3595	NC_013501	CGCTG	2	10	157677	157686	0 %	20 %	40 %	40 %	268315719
3596	NC_013501	ACGCTG	2	12	157756	157767	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	268315719
3597	NC_013501	GAA	2	6	157768	157773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268315719
3598	NC_013501	GCA	2	6	157790	157795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315719
3599	NC_013501	GCT	2	6	157827	157832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315719
3600	NC_013501	A	6	6	157858	157863	100 %	0 %	0 %	0 %	268315719
3601	NC_013501	TTC	2	6	157918	157923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268315719
3602	NC_013501	AGC	2	6	158037	158042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315720
3603	NC_013501	CTC	2	6	158063	158068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268315720
3604	NC_013501	GCG	2	6	158069	158074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315720
3605	NC_013501	CG	3	6	158128	158133	0 %	0 %	50 %	50 %	268315720
3606	NC_013501	TTC	2	6	158156	158161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268315720
3607	NC_013501	GAT	2	6	158204	158209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268315720
3608	NC_013501	CG	3	6	158218	158223	0 %	0 %	50 %	50 %	268315720
3609	NC_013501	CTC	2	6	158267	158272	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268315720
3610	NC_013501	TGT	2	6	158329	158334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268315720
3611	NC_013501	CGT	3	9	158335	158343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315720
3612	NC_013501	TGC	2	6	158382	158387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315720
3613	NC_013501	T	6	6	158401	158406	0 %	100 %	0 %	0 %	268315720
3614	NC_013501	GC	3	6	158451	158456	0 %	0 %	50 %	50 %	268315720
3615	NC_013501	CG	3	6	158475	158480	0 %	0 %	50 %	50 %	268315720
3616	NC_013501	CAC	2	6	158531	158536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268315720
3617	NC_013501	CCA	2	6	158579	158584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268315720
3618	NC_013501	CG	3	6	158611	158616	0 %	0 %	50 %	50 %	268315720
3619	NC_013501	TCG	2	6	158619	158624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315720
3620	NC_013501	GCC	2	6	158634	158639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315720
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3980	NC_013501	CTGC	2	8	173834	173841	0 %	25 %	25 %	50 %	268315737
3981	NC_013501	CGT	2	6	173844	173849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315737
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3983	NC_013501	CGG	2	6	173889	173894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315737
3984	NC_013501	CAG	2	6	173904	173909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315737
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