MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodothermus marinus DSM 4252 chromosome

Total Repeats: 72471

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2502	NC_013501	TTCG	2	8	111752	111759	0 %	50 %	25 %	25 %	268315678
2503	NC_013501	CCG	2	6	111762	111767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315678
2504	NC_013501	GTA	2	6	111812	111817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268315678
2505	NC_013501	ACC	2	6	111912	111917	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268315678
2506	NC_013501	GAA	2	6	111950	111955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268315678
2507	NC_013501	AGGTC	2	10	111967	111976	20 %	20 %	40 %	20 %	268315678
2508	NC_013501	CG	3	6	111979	111984	0 %	0 %	50 %	50 %	268315678
2509	NC_013501	GCCGGC	2	12	112006	112017	0 %	0 %	50 %	50 %	268315678
2510	NC_013501	GCC	2	6	112023	112028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315678
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2512	NC_013501	GCG	2	6	112067	112072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315678
2513	NC_013501	GCG	2	6	112155	112160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315678
2514	NC_013501	CAG	2	6	112178	112183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315678
2515	NC_013501	GC	3	6	112206	112211	0 %	0 %	50 %	50 %	268315678
2516	NC_013501	CTC	2	6	112220	112225	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268315678
2517	NC_013501	GTAG	2	8	112276	112283	25 %	25 %	50 %	0 %	268315678
2518	NC_013501	CCT	2	6	112288	112293	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268315678
2519	NC_013501	GC	4	8	112345	112352	0 %	0 %	50 %	50 %	268315678
2520	NC_013501	TCG	2	6	112383	112388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315678
2521	NC_013501	T	7	7	112409	112415	0 %	100 %	0 %	0 %	268315678
2522	NC_013501	GTC	2	6	112422	112427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315678
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2524	NC_013501	TCC	2	6	112475	112480	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268315679
2525	NC_013501	CAG	2	6	112597	112602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315679
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2529	NC_013501	CTT	2	6	112782	112787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268315679
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2554	NC_013501	CG	3	6	114419	114424	0 %	0 %	50 %	50 %	268315680
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2557	NC_013501	TCG	2	6	114758	114763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315681
2558	NC_013501	TTC	2	6	114820	114825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268315681
2559	NC_013501	GCT	2	6	114861	114866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315681
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2561	NC_013501	CAC	2	6	114892	114897	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268315681
2562	NC_013501	GCGG	2	8	114994	115001	0 %	0 %	75 %	25 %	268315681
2563	NC_013501	CCG	2	6	115046	115051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315681
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2593	NC_013501	GC	4	8	116045	116052	0 %	0 %	50 %	50 %	268315682
2594	NC_013501	CGG	2	6	116070	116075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315682
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2601	NC_013501	GTT	2	6	116301	116306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268315682
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2744	NC_013501	GGT	2	6	121300	121305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315687
2745	NC_013501	TCA	2	6	121313	121318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315687
2746	NC_013501	CG	3	6	121376	121381	0 %	0 %	50 %	50 %	268315687
2747	NC_013501	CGT	2	6	121388	121393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315687
2748	NC_013501	GGCC	2	8	121448	121455	0 %	0 %	50 %	50 %	268315687
2749	NC_013501	CAT	2	6	121521	121526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315687
2750	NC_013501	ACC	2	6	121586	121591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268315687
2751	NC_013501	CCGC	2	8	121631	121638	0 %	0 %	25 %	75 %	268315687
2752	NC_013501	GAG	2	6	121675	121680	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268315687
2753	NC_013501	CTA	2	6	121707	121712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315687
2754	NC_013501	CGG	2	6	121806	121811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315687
2755	NC_013501	CAG	2	6	121825	121830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315687
2756	NC_013501	CTT	2	6	122599	122604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268315688
2757	NC_013501	AGGGCG	2	12	122610	122621	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	268315688
2758	NC_013501	CGG	2	6	122651	122656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315688
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2762	NC_013501	C	6	6	122760	122765	0 %	0 %	0 %	100 %	268315688
2763	NC_013501	G	6	6	122855	122860	0 %	0 %	100 %	0 %	268315688
2764	NC_013501	GCG	2	6	122889	122894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315688
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2771	NC_013501	C	6	6	123100	123105	0 %	0 %	0 %	100 %	268315688
2772	NC_013501	GCG	3	9	123123	123131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315688
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2774	NC_013501	GGATCG	2	12	123252	123263	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	268315688
2775	NC_013501	CGAA	2	8	123271	123278	50 %	0 %	25 %	25 %	268315688
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2851	NC_013501	GCG	2	6	126430	126435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315693
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2854	NC_013501	CAG	2	6	126486	126491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315693
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2856	NC_013501	TTCG	2	8	126531	126538	0 %	50 %	25 %	25 %	268315693
2857	NC_013501	CGA	2	6	126563	126568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315693
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2859	NC_013501	CCGC	2	8	126712	126719	0 %	0 %	25 %	75 %	268315693
2860	NC_013501	AGA	2	6	126722	126727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268315693
2861	NC_013501	TTG	2	6	126808	126813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268315693
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2863	NC_013501	GCC	2	6	126858	126863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315693
2864	NC_013501	GCA	2	6	126902	126907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315693
2865	NC_013501	ATA	2	6	126936	126941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268315693
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2983	NC_013501	GCG	2	6	132169	132174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315698
2984	NC_013501	CTC	2	6	132213	132218	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268315698
2985	NC_013501	GAG	2	6	132222	132227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268315698
2986	NC_013501	CCA	2	6	132292	132297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268315698
2987	NC_013501	CGTA	2	8	132302	132309	25 %	25 %	25 %	25 %	268315698
2988	NC_013501	GCC	2	6	132384	132389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315698
2989	NC_013501	GCCC	2	8	132504	132511	0 %	0 %	25 %	75 %	268315699
2990	NC_013501	CAG	2	6	132524	132529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315699
2991	NC_013501	GCC	2	6	132542	132547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315699
2992	NC_013501	GAT	2	6	132584	132589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268315699
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2999	NC_013501	CGA	2	6	133001	133006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315700
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