MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodothermus marinus DSM 4252 chromosome

Total Repeats: 72471

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_013501	T	6	6	68201	68206	0 %	100 %	0 %	0 %	268315643
1502	NC_013501	GAA	2	6	68224	68229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268315643
1503	NC_013501	GCT	2	6	68319	68324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315643
1504	NC_013501	CTG	2	6	68341	68346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315643
1505	NC_013501	AGG	2	6	68357	68362	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268315643
1506	NC_013501	CAG	2	6	68570	68575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315644
1507	NC_013501	GAG	2	6	68594	68599	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268315644
1508	NC_013501	GGCT	2	8	68607	68614	0 %	25 %	50 %	25 %	268315644
1509	NC_013501	GCG	2	6	68617	68622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315644
1510	NC_013501	CAG	2	6	68636	68641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315644
1511	NC_013501	GCC	2	6	68642	68647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315644
1512	NC_013501	AACG	2	8	68648	68655	50 %	0 %	25 %	25 %	268315644
1513	NC_013501	GC	3	6	68684	68689	0 %	0 %	50 %	50 %	268315644
1514	NC_013501	CGT	2	6	68770	68775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315644
1515	NC_013501	ACC	2	6	68783	68788	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268315644
1516	NC_013501	AACCTG	2	12	68816	68827	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	268315644
1517	NC_013501	GCC	2	6	68879	68884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315644
1518	NC_013501	AGG	2	6	69138	69143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268315644
1519	NC_013501	CTG	2	6	69251	69256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315644
1520	NC_013501	AGC	2	6	69297	69302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315644
1521	NC_013501	GCC	2	6	69311	69316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315644
1522	NC_013501	CCA	2	6	69354	69359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268315644
1523	NC_013501	TC	3	6	69463	69468	0 %	50 %	0 %	50 %	268315644
1524	NC_013501	ACG	2	6	69491	69496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315644
1525	NC_013501	ACA	2	6	69531	69536	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268315644
1526	NC_013501	CAG	2	6	69551	69556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315644
1527	NC_013501	CAG	2	6	69617	69622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315644
1528	NC_013501	GGC	2	6	69628	69633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315644
1529	NC_013501	GCC	2	6	69650	69655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315644
1530	NC_013501	TCG	2	6	69708	69713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315644
1531	NC_013501	ACT	2	6	69804	69809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315644
1532	NC_013501	CTG	2	6	69899	69904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315645
1533	NC_013501	CTG	2	6	69929	69934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315645
1534	NC_013501	GTG	2	6	69935	69940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315645
1535	NC_013501	GGC	2	6	69950	69955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315645
1536	NC_013501	GGT	2	6	70033	70038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315645
1537	NC_013501	GAGGTG	2	12	70064	70075	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	268315645
1538	NC_013501	TCG	2	6	70104	70109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315645
1539	NC_013501	CCGG	2	8	70165	70172	0 %	0 %	50 %	50 %	268315645
1540	NC_013501	GCA	2	6	70192	70197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315645
1541	NC_013501	GGC	2	6	70330	70335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315645
1542	NC_013501	CAT	2	6	70441	70446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315645
1543	NC_013501	CCAG	2	8	70512	70519	25 %	0 %	25 %	50 %	268315645
1544	NC_013501	GAT	2	6	70534	70539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268315645
1545	NC_013501	CG	3	6	70546	70551	0 %	0 %	50 %	50 %	268315645
1546	NC_013501	ATGGAA	2	12	70562	70573	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	268315645
1547	NC_013501	ACG	2	6	70590	70595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315645
1548	NC_013501	GTG	2	6	70667	70672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315645
1549	NC_013501	GCT	2	6	70828	70833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315645
1550	NC_013501	CCG	2	6	70835	70840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315645
1551	NC_013501	CCG	2	6	70968	70973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315645
1552	NC_013501	AGA	2	6	71002	71007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268315645
1553	NC_013501	GGT	2	6	71017	71022	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315645
1554	NC_013501	CGA	2	6	71077	71082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315645
1555	NC_013501	ATC	2	6	71129	71134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315645
1556	NC_013501	CAG	2	6	71189	71194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315645
1557	NC_013501	CAT	2	6	71212	71217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315645
1558	NC_013501	CGAC	2	8	71263	71270	25 %	0 %	25 %	50 %	268315646
1559	NC_013501	CAG	2	6	71328	71333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315646
1560	NC_013501	CAT	2	6	71387	71392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315646
1561	NC_013501	CGG	2	6	71456	71461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315646
1562	NC_013501	CTA	2	6	71465	71470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315646
1563	NC_013501	GAC	2	6	71502	71507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315646
1564	NC_013501	CAA	2	6	71525	71530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268315646
1565	NC_013501	GCG	2	6	71633	71638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315646
1566	NC_013501	CG	3	6	71637	71642	0 %	0 %	50 %	50 %	268315646
1567	NC_013501	GGC	2	6	71651	71656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315646
1568	NC_013501	CGG	2	6	71711	71716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315646
1569	NC_013501	CAGCGC	2	12	71718	71729	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	268315646
1570	NC_013501	CAA	2	6	71753	71758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268315646
1571	NC_013501	ATC	2	6	71766	71771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315646
1572	NC_013501	CGA	2	6	71777	71782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315646
1573	NC_013501	CTCGA	2	10	71796	71805	20 %	20 %	20 %	40 %	268315646
1574	NC_013501	GAG	2	6	71814	71819	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268315646
1575	NC_013501	GCT	2	6	71837	71842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315646
1576	NC_013501	GCT	2	6	71861	71866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315646
1577	NC_013501	GGT	2	6	71867	71872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315646
1578	NC_013501	CACG	2	8	71873	71880	25 %	0 %	25 %	50 %	268315646
1579	NC_013501	CAC	2	6	71895	71900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268315646
1580	NC_013501	CCG	2	6	71903	71908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315646
1581	NC_013501	CGA	2	6	71942	71947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315646
1582	NC_013501	CTG	2	6	71964	71969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315646
1583	NC_013501	GACCTG	2	12	71973	71984	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	268315646
1584	NC_013501	CGG	2	6	71989	71994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315646
1585	NC_013501	GAC	3	9	72030	72038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315647
1586	NC_013501	CTG	2	6	72039	72044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315647
1587	NC_013501	GGC	2	6	72068	72073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315647
1588	NC_013501	CGGCG	2	10	72103	72112	0 %	0 %	60 %	40 %	268315647
1589	NC_013501	GGT	2	6	72146	72151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315647
1590	NC_013501	AAG	2	6	72166	72171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268315647
1591	NC_013501	TGC	2	6	72181	72186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315647
1592	NC_013501	CGGC	2	8	72275	72282	0 %	0 %	50 %	50 %	268315647
1593	NC_013501	GGACAG	2	12	72291	72302	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	268315647
1594	NC_013501	GCC	3	9	72442	72450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315647
1595	NC_013501	GCA	2	6	72524	72529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315647
1596	NC_013501	CAG	2	6	72627	72632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315647
1597	NC_013501	CGAC	2	8	72670	72677	25 %	0 %	25 %	50 %	268315647
1598	NC_013501	CCA	2	6	72685	72690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268315647
1599	NC_013501	TCG	2	6	72693	72698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315647
1600	NC_013501	GCG	2	6	72716	72721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315648
1601	NC_013501	GGAGC	2	10	72724	72733	20 %	0 %	60 %	20 %	268315648
1602	NC_013501	CGT	2	6	72785	72790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315648
1603	NC_013501	GCG	2	6	72853	72858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315648
1604	NC_013501	GGT	2	6	72871	72876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315648
1605	NC_013501	T	6	6	72929	72934	0 %	100 %	0 %	0 %	268315648
1606	NC_013501	GCC	2	6	72959	72964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315648
1607	NC_013501	ACC	2	6	72987	72992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268315648
1608	NC_013501	GC	3	6	73009	73014	0 %	0 %	50 %	50 %	268315648
1609	NC_013501	CGT	2	6	73054	73059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315648
1610	NC_013501	GTTCG	2	10	73110	73119	0 %	40 %	40 %	20 %	268315648
1611	NC_013501	CTG	2	6	73187	73192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315648
1612	NC_013501	GCC	3	9	73203	73211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315648
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1615	NC_013501	CGGC	2	8	73255	73262	0 %	0 %	50 %	50 %	268315648
1616	NC_013501	TCA	2	6	73266	73271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315648
1617	NC_013501	AATC	2	8	73343	73350	50 %	25 %	0 %	25 %	268315648
1618	NC_013501	CCA	2	6	73360	73365	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268315648
1619	NC_013501	GCC	2	6	73366	73371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315648
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1622	NC_013501	CG	4	8	73444	73451	0 %	0 %	50 %	50 %	268315648
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1996	NC_013501	GGCG	2	8	89733	89740	0 %	0 %	75 %	25 %	268315659
1997	NC_013501	GCA	2	6	89841	89846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315659
1998	NC_013501	GC	3	6	89941	89946	0 %	0 %	50 %	50 %	268315659
1999	NC_013501	GGC	2	6	89959	89964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315659
2000	NC_013501	CGC	2	6	90013	90018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315659

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