MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodothermus marinus DSM 4252 chromosome

Total Repeats: 72471

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013501	GTC	2	6	23452	23457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315602
502	NC_013501	ACCG	2	8	23481	23488	25 %	0 %	25 %	50 %	268315602
503	NC_013501	GGT	2	6	23505	23510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315602
504	NC_013501	CCG	2	6	23521	23526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315602
505	NC_013501	CGT	2	6	23532	23537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315602
506	NC_013501	ATC	2	6	23648	23653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315602
507	NC_013501	CAG	2	6	23704	23709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315602
508	NC_013501	AGC	2	6	23717	23722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315602
509	NC_013501	GCT	3	9	23875	23883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315603
510	NC_013501	CTG	3	9	23885	23893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315603
511	NC_013501	ACG	2	6	23934	23939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315603
512	NC_013501	CGT	2	6	24049	24054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315603
513	NC_013501	CCGACC	2	12	24075	24086	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	268315603
514	NC_013501	GC	3	6	24191	24196	0 %	0 %	50 %	50 %	268315603
515	NC_013501	GAA	2	6	24200	24205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268315603
516	NC_013501	CTG	2	6	24218	24223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315603
517	NC_013501	ATC	2	6	24266	24271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315603
518	NC_013501	ACA	2	6	24324	24329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268315603
519	NC_013501	CGA	2	6	24330	24335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315603
520	NC_013501	GAG	2	6	24461	24466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268315603
521	NC_013501	TCG	2	6	24477	24482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315603
522	NC_013501	CAT	2	6	24487	24492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315603
523	NC_013501	CAT	2	6	24496	24501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315603
524	NC_013501	TGG	2	6	24531	24536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315603
525	NC_013501	GACCT	2	10	24557	24566	20 %	20 %	20 %	40 %	268315603
526	NC_013501	GGA	2	6	24646	24651	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268315603
527	NC_013501	GC	3	6	24738	24743	0 %	0 %	50 %	50 %	268315603
528	NC_013501	CGA	2	6	24760	24765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315603
529	NC_013501	AAG	2	6	24800	24805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268315603
530	NC_013501	TCA	2	6	24855	24860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315603
531	NC_013501	CAC	2	6	24880	24885	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268315603
532	NC_013501	GTT	3	9	25210	25218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268315604
533	NC_013501	CTA	2	6	25339	25344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315604
534	NC_013501	GCT	2	6	25372	25377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315604
535	NC_013501	CTG	2	6	25475	25480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315604
536	NC_013501	GCA	2	6	25504	25509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315604
537	NC_013501	CGG	2	6	25563	25568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315604
538	NC_013501	GCTGG	2	10	25576	25585	0 %	20 %	60 %	20 %	268315604
539	NC_013501	CCG	2	6	25618	25623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315604
540	NC_013501	ACG	2	6	25653	25658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315604
541	NC_013501	CGGG	2	8	25688	25695	0 %	0 %	75 %	25 %	268315604
542	NC_013501	CGG	2	6	25699	25704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315604
543	NC_013501	GAT	2	6	25705	25710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268315604
544	NC_013501	CAC	2	6	25744	25749	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268315604
545	NC_013501	ACT	2	6	25779	25784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315604
546	NC_013501	CGG	2	6	25826	25831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315604
547	NC_013501	TTC	2	6	25832	25837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268315604
548	NC_013501	TCA	2	6	25848	25853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315604
549	NC_013501	GCC	2	6	25866	25871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315604
550	NC_013501	GAAAC	2	10	25890	25899	60 %	0 %	20 %	20 %	268315604
551	NC_013501	ACG	2	6	25921	25926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315605
552	NC_013501	GGC	2	6	25965	25970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315605
553	NC_013501	CGG	2	6	26057	26062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315605
554	NC_013501	CTG	2	6	26064	26069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315605
555	NC_013501	CCG	2	6	26082	26087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315605
556	NC_013501	GC	4	8	26098	26105	0 %	0 %	50 %	50 %	268315605
557	NC_013501	GAA	2	6	26124	26129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268315605
558	NC_013501	CAG	2	6	26142	26147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315605
559	NC_013501	GGC	2	6	26154	26159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315605
560	NC_013501	TTC	3	9	26220	26228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268315605
561	NC_013501	CAGC	2	8	26237	26244	25 %	0 %	25 %	50 %	268315605
562	NC_013501	CAC	2	6	26268	26273	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268315605
563	NC_013501	CCT	2	6	26285	26290	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268315605
564	NC_013501	AGCG	2	8	26401	26408	25 %	0 %	50 %	25 %	268315605
565	NC_013501	GCT	2	6	26460	26465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315605
566	NC_013501	GGT	2	6	26468	26473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315605
567	NC_013501	CTC	2	6	26499	26504	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268315605
568	NC_013501	CTT	2	6	26511	26516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268315605
569	NC_013501	CGC	2	6	26519	26524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315605
570	NC_013501	GGC	2	6	26529	26534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315605
571	NC_013501	CCGT	2	8	26540	26547	0 %	25 %	25 %	50 %	268315605
572	NC_013501	CAG	3	9	26580	26588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315605
573	NC_013501	GAT	2	6	26598	26603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268315605
574	NC_013501	CAC	2	6	26670	26675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268315605
575	NC_013501	CCA	2	6	26750	26755	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268315605
576	NC_013501	TGG	3	9	26780	26788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315605
577	NC_013501	CCGGCA	2	12	26840	26851	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	268315605
578	NC_013501	CCGGC	2	10	26905	26914	0 %	0 %	40 %	60 %	268315605
579	NC_013501	CTG	3	9	27122	27130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315606
580	NC_013501	CGG	2	6	27144	27149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315606
581	NC_013501	TGC	2	6	27183	27188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315606
582	NC_013501	GCC	2	6	27200	27205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315606
583	NC_013501	T	6	6	27270	27275	0 %	100 %	0 %	0 %	268315606
584	NC_013501	TTCGG	2	10	27335	27344	0 %	40 %	40 %	20 %	268315606
585	NC_013501	CAG	2	6	27470	27475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315606
586	NC_013501	CTT	2	6	27496	27501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268315606
587	NC_013501	TTC	2	6	27536	27541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268315606
588	NC_013501	GGCC	2	8	27547	27554	0 %	0 %	50 %	50 %	268315606
589	NC_013501	TTC	2	6	27566	27571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268315606
590	NC_013501	CGGGC	2	10	27572	27581	0 %	0 %	60 %	40 %	268315606
591	NC_013501	GATCA	2	10	27597	27606	40 %	20 %	20 %	20 %	268315606
592	NC_013501	GGC	2	6	27661	27666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315607
593	NC_013501	ACG	2	6	27756	27761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315607
594	NC_013501	G	6	6	27781	27786	0 %	0 %	100 %	0 %	268315607
595	NC_013501	GCTCCC	2	12	27796	27807	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	268315607
596	NC_013501	GAA	3	9	27884	27892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268315607
597	NC_013501	CTC	2	6	27941	27946	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268315607
598	NC_013501	CGT	2	6	27961	27966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315607
599	NC_013501	TGA	2	6	28000	28005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268315607
600	NC_013501	AGC	2	6	28101	28106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315607
601	NC_013501	TCG	2	6	28170	28175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315607
602	NC_013501	CG	3	6	28174	28179	0 %	0 %	50 %	50 %	268315607
603	NC_013501	ATG	2	6	28254	28259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268315607
604	NC_013501	CGA	2	6	28271	28276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315608
605	NC_013501	AGC	2	6	28299	28304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315608
606	NC_013501	CTT	2	6	28334	28339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268315608
607	NC_013501	CAC	2	6	28367	28372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268315608
608	NC_013501	CTT	2	6	28421	28426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268315608
609	NC_013501	GCA	3	9	28504	28512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315608
610	NC_013501	T	6	6	28548	28553	0 %	100 %	0 %	0 %	268315608
611	NC_013501	GTC	2	6	28640	28645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315608
612	NC_013501	GCA	2	6	28660	28665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315608
613	NC_013501	CGCAC	2	10	28927	28936	20 %	0 %	20 %	60 %	268315609
614	NC_013501	TGG	2	6	28976	28981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315609
615	NC_013501	CCGG	2	8	28999	29006	0 %	0 %	50 %	50 %	268315609
616	NC_013501	TGG	2	6	29008	29013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315609
617	NC_013501	TTG	2	6	29048	29053	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268315609
618	NC_013501	TGG	3	9	29057	29065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315609
619	NC_013501	GC	3	6	29079	29084	0 %	0 %	50 %	50 %	268315609
620	NC_013501	CGT	2	6	29090	29095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315609
621	NC_013501	GCT	3	9	29106	29114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315609
622	NC_013501	GTGC	2	8	29115	29122	0 %	25 %	50 %	25 %	268315609
623	NC_013501	GCC	2	6	29134	29139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315609
624	NC_013501	CAC	2	6	29159	29164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268315609
625	NC_013501	CGACA	2	10	29181	29190	40 %	0 %	20 %	40 %	268315609
626	NC_013501	AGA	2	6	29213	29218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268315609
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631	NC_013501	TGC	2	6	29363	29368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315609
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643	NC_013501	CTG	2	6	29677	29682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315609
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750	NC_013501	GC	3	6	34297	34302	0 %	0 %	50 %	50 %	268315612
751	NC_013501	GCCG	2	8	34385	34392	0 %	0 %	50 %	50 %	268315612
752	NC_013501	TCCG	2	8	34405	34412	0 %	25 %	25 %	50 %	268315612
753	NC_013501	GC	3	6	34427	34432	0 %	0 %	50 %	50 %	268315612
754	NC_013501	CGC	2	6	34468	34473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315612
755	NC_013501	CGG	2	6	34474	34479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315612
756	NC_013501	CGG	2	6	34524	34529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315612
757	NC_013501	TCG	2	6	34543	34548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315612
758	NC_013501	CGA	2	6	34556	34561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315612
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761	NC_013501	CGCGC	2	10	34686	34695	0 %	0 %	40 %	60 %	268315612
762	NC_013501	TCGG	2	8	34755	34762	0 %	25 %	50 %	25 %	268315612
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769	NC_013501	CG	3	6	35041	35046	0 %	0 %	50 %	50 %	268315612
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