MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodothermus marinus DSM 4252 chromosome

Total Repeats: 72471

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
71501	NC_013501	TCG	2	6	3216590	3216595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318312
71502	NC_013501	GTC	2	6	3216608	3216613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318312
71503	NC_013501	GGCC	2	8	3216624	3216631	0 %	0 %	50 %	50 %	268318312
71504	NC_013501	TC	3	6	3216686	3216691	0 %	50 %	0 %	50 %	268318312
71505	NC_013501	GCT	2	6	3216699	3216704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318312
71506	NC_013501	GCT	2	6	3216723	3216728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318312
71507	NC_013501	CGT	2	6	3216774	3216779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318312
71508	NC_013501	CAT	2	6	3216819	3216824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318312
71509	NC_013501	CGG	2	6	3216831	3216836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268318312
71510	NC_013501	GCCCT	2	10	3216877	3216886	0 %	20 %	20 %	60 %	268318312
71511	NC_013501	CTG	2	6	3216904	3216909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318312
71512	NC_013501	ATC	2	6	3216916	3216921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318312
71513	NC_013501	CTG	2	6	3217000	3217005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318312
71514	NC_013501	GCC	2	6	3217006	3217011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268318312
71515	NC_013501	GCA	2	6	3217048	3217053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318313
71516	NC_013501	GAG	2	6	3217076	3217081	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268318313
71517	NC_013501	TGC	2	6	3217116	3217121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318313
71518	NC_013501	GGC	2	6	3217127	3217132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268318313
71519	NC_013501	CCG	2	6	3217152	3217157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268318313
71520	NC_013501	GCC	2	6	3217161	3217166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268318313
71521	NC_013501	CACG	2	8	3217168	3217175	25 %	0 %	25 %	50 %	268318313
71522	NC_013501	GCCG	2	8	3217213	3217220	0 %	0 %	50 %	50 %	268318313
71523	NC_013501	CGAT	2	8	3217239	3217246	25 %	25 %	25 %	25 %	268318313
71524	NC_013501	CGG	2	6	3217320	3217325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268318313
71525	NC_013501	GAT	2	6	3217346	3217351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318313
71526	NC_013501	T	6	6	3217377	3217382	0 %	100 %	0 %	0 %	268318313
71527	NC_013501	CGG	2	6	3217429	3217434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268318313
71528	NC_013501	GCC	2	6	3217446	3217451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268318313
71529	NC_013501	CG	3	6	3217512	3217517	0 %	0 %	50 %	50 %	268318313
71530	NC_013501	CG	3	6	3217596	3217601	0 %	0 %	50 %	50 %	268318313
71531	NC_013501	ACA	2	6	3217614	3217619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268318313
71532	NC_013501	CAC	2	6	3217642	3217647	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268318313
71533	NC_013501	CTA	3	9	3217699	3217707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318313
71534	NC_013501	GCG	3	9	3217767	3217775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268318313
71535	NC_013501	TCA	2	6	3217776	3217781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318313
71536	NC_013501	CGG	2	6	3217782	3217787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268318313
71537	NC_013501	ACGA	2	8	3217796	3217803	50 %	0 %	25 %	25 %	268318313
71538	NC_013501	ACG	2	6	3217839	3217844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318313
71539	NC_013501	GCC	2	6	3217846	3217851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268318313
71540	NC_013501	GCC	2	6	3217927	3217932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268318313
71541	NC_013501	CGG	2	6	3217950	3217955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268318313
71542	NC_013501	CAT	2	6	3217960	3217965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318313
71543	NC_013501	CTG	2	6	3218024	3218029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318313
71544	NC_013501	CG	3	6	3218100	3218105	0 %	0 %	50 %	50 %	268318313
71545	NC_013501	CGC	2	6	3218115	3218120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268318313
71546	NC_013501	CATC	2	8	3218152	3218159	25 %	25 %	0 %	50 %	268318313
71547	NC_013501	TAC	2	6	3218180	3218185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318313
71548	NC_013501	TGGCC	2	10	3218233	3218242	0 %	20 %	40 %	40 %	268318313
71549	NC_013501	CTG	2	6	3218297	3218302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318313
71550	NC_013501	GGCCGA	2	12	3218314	3218325	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	268318313
71551	NC_013501	TG	3	6	3218337	3218342	0 %	50 %	50 %	0 %	268318313
71552	NC_013501	CGC	2	6	3218379	3218384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268318313
71553	NC_013501	TGG	2	6	3218397	3218402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268318313
71554	NC_013501	CGCTGG	2	12	3218457	3218468	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	268318313
71555	NC_013501	GGA	2	6	3218479	3218484	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268318313
71556	NC_013501	ACT	2	6	3218553	3218558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318313
71557	NC_013501	GCG	2	6	3218559	3218564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268318313
71558	NC_013501	GCT	2	6	3218572	3218577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318313
71559	NC_013501	GCG	2	6	3218601	3218606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268318313
71560	NC_013501	GCG	2	6	3218637	3218642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268318313
71561	NC_013501	CCG	2	6	3218705	3218710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268318313
71562	NC_013501	CTG	2	6	3218711	3218716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318313
71563	NC_013501	CTG	2	6	3218723	3218728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318313
71564	NC_013501	ACCT	2	8	3218732	3218739	25 %	25 %	0 %	50 %	268318313
71565	NC_013501	CAG	2	6	3218741	3218746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318313
71566	NC_013501	GCC	2	6	3218768	3218773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268318313
71567	NC_013501	ATG	2	6	3218842	3218847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318313
71568	NC_013501	CACC	2	8	3220799	3220806	25 %	0 %	0 %	75 %	268318314
71569	NC_013501	CTG	2	6	3220894	3220899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318314
71570	NC_013501	GCT	2	6	3220971	3220976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318314
71571	NC_013501	GTA	2	6	3220988	3220993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318314
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71573	NC_013501	CG	3	6	3221046	3221051	0 %	0 %	50 %	50 %	268318314
71574	NC_013501	AAG	2	6	3221111	3221116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318314
71575	NC_013501	GGAA	2	8	3221156	3221163	50 %	0 %	50 %	0 %	268318314
71576	NC_013501	AAG	2	6	3221198	3221203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318314
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71583	NC_013501	GCT	2	6	3221444	3221449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318315
71584	NC_013501	GGC	2	6	3221461	3221466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268318315
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71587	NC_013501	CGA	2	6	3221617	3221622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318315
71588	NC_013501	GCAC	2	8	3221644	3221651	25 %	0 %	25 %	50 %	268318315
71589	NC_013501	CGA	2	6	3221717	3221722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318315
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71597	NC_013501	CCGG	2	8	3221918	3221925	0 %	0 %	50 %	50 %	268318315
71598	NC_013501	CGT	2	6	3221933	3221938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318315
71599	NC_013501	CGC	2	6	3222062	3222067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268318315
71600	NC_013501	GCGG	2	8	3222101	3222108	0 %	0 %	75 %	25 %	268318315
71601	NC_013501	CTG	2	6	3222135	3222140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318315
71602	NC_013501	CAA	2	6	3222185	3222190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268318315
71603	NC_013501	CGGC	2	8	3222230	3222237	0 %	0 %	50 %	50 %	268318315
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71615	NC_013501	CTG	2	6	3222669	3222674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318315
71616	NC_013501	CGCC	2	8	3222722	3222729	0 %	0 %	25 %	75 %	268318315
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