MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodothermus marinus DSM 4252 chromosome

Total Repeats: 72471

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_013501	TGT	2	6	271773	271778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268315831
6002	NC_013501	GAA	2	6	271791	271796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268315831
6003	NC_013501	CGT	2	6	271976	271981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315832
6004	NC_013501	AC	3	6	272028	272033	50 %	0 %	0 %	50 %	268315832
6005	NC_013501	GCC	2	6	272051	272056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315832
6006	NC_013501	GAG	2	6	272144	272149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268315832
6007	NC_013501	GGC	2	6	272371	272376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315832
6008	NC_013501	CTG	2	6	272396	272401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315832
6009	NC_013501	GAA	2	6	272447	272452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268315832
6010	NC_013501	TGC	2	6	272472	272477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315832
6011	NC_013501	GCC	2	6	272478	272483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315832
6012	NC_013501	GGC	2	6	272628	272633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315832
6013	NC_013501	GGC	2	6	272644	272649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315832
6014	NC_013501	GCG	2	6	272669	272674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315832
6015	NC_013501	GCA	2	6	272709	272714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315832
6016	NC_013501	TGG	2	6	272772	272777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315832
6017	NC_013501	GCG	2	6	272791	272796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315832
6018	NC_013501	GCG	2	6	272896	272901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315832
6019	NC_013501	CTG	2	6	272951	272956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315832
6020	NC_013501	GCG	2	6	273058	273063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315832
6021	NC_013501	GGC	2	6	273079	273084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315832
6022	NC_013501	CGG	2	6	273214	273219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315833
6023	NC_013501	CTG	3	9	273241	273249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315833
6024	NC_013501	ACC	2	6	273268	273273	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268315833
6025	NC_013501	GCTG	2	8	273302	273309	0 %	25 %	50 %	25 %	268315833
6026	NC_013501	GCT	2	6	273369	273374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315833
6027	NC_013501	GCC	2	6	273412	273417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315833
6028	NC_013501	CTA	2	6	273447	273452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315833
6029	NC_013501	TTCCGT	2	12	273455	273466	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	268315833
6030	NC_013501	CATCCG	2	12	273495	273506	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	268315833
6031	NC_013501	CGCT	2	8	273526	273533	0 %	25 %	25 %	50 %	268315833
6032	NC_013501	GGCCG	2	10	273549	273558	0 %	0 %	60 %	40 %	268315833
6033	NC_013501	TCG	2	6	273569	273574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315833
6034	NC_013501	GCT	2	6	273600	273605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315833
6035	NC_013501	CGC	2	6	273614	273619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315833
6036	NC_013501	CTG	2	6	273628	273633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315833
6037	NC_013501	TCCG	2	8	273687	273694	0 %	25 %	25 %	50 %	268315833
6038	NC_013501	CGA	2	6	273716	273721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315833
6039	NC_013501	GCT	2	6	273747	273752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315833
6040	NC_013501	GCC	2	6	273786	273791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315833
6041	NC_013501	CTGG	2	8	273831	273838	0 %	25 %	50 %	25 %	268315833
6042	NC_013501	TTC	2	6	273844	273849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268315833
6043	NC_013501	CTG	2	6	273862	273867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315833
6044	NC_013501	CGG	2	6	273885	273890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315833
6045	NC_013501	CGC	2	6	273916	273921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315833
6046	NC_013501	CGG	2	6	273928	273933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315833
6047	NC_013501	CTG	3	9	273952	273960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315833
6048	NC_013501	CTG	2	6	274006	274011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315833
6049	NC_013501	AGG	2	6	274013	274018	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268315833
6050	NC_013501	TGG	2	6	274024	274029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315833
6051	NC_013501	GCCG	2	8	274035	274042	0 %	0 %	50 %	50 %	268315833
6052	NC_013501	TACCTG	2	12	274069	274080	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	268315833
6053	NC_013501	TGC	2	6	274121	274126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315833
6054	NC_013501	GGCC	2	8	274164	274171	0 %	0 %	50 %	50 %	268315833
6055	NC_013501	TCG	2	6	274172	274177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315833
6056	NC_013501	ATC	2	6	274216	274221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315833
6057	NC_013501	CCCG	2	8	274245	274252	0 %	0 %	25 %	75 %	268315833
6058	NC_013501	CGG	2	6	274282	274287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315833
6059	NC_013501	GCTGG	2	10	274290	274299	0 %	20 %	60 %	20 %	268315833
6060	NC_013501	CTGAT	2	10	274348	274357	20 %	40 %	20 %	20 %	268315833
6061	NC_013501	TCT	2	6	274474	274479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268315834
6062	NC_013501	GGCG	2	8	274493	274500	0 %	0 %	75 %	25 %	268315834
6063	NC_013501	GC	3	6	274531	274536	0 %	0 %	50 %	50 %	268315834
6064	NC_013501	TCC	2	6	274553	274558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268315834
6065	NC_013501	GGT	2	6	274559	274564	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268315834
6066	NC_013501	CCTTT	2	10	274571	274580	0 %	60 %	0 %	40 %	268315834
6067	NC_013501	ACCTT	2	10	274605	274614	20 %	40 %	0 %	40 %	268315834
6068	NC_013501	GC	3	6	274668	274673	0 %	0 %	50 %	50 %	268315834
6069	NC_013501	TCG	2	6	274705	274710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315834
6070	NC_013501	ACC	2	6	274728	274733	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268315834
6071	NC_013501	GAC	2	6	274790	274795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315834
6072	NC_013501	GAC	2	6	274851	274856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315834
6073	NC_013501	GAG	2	6	274857	274862	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268315834
6074	NC_013501	CGG	2	6	274907	274912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315834
6075	NC_013501	GAG	2	6	274926	274931	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268315834
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6078	NC_013501	CAA	2	6	275054	275059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268315834
6079	NC_013501	GC	3	6	275062	275067	0 %	0 %	50 %	50 %	268315834
6080	NC_013501	CTG	2	6	275073	275078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315834
6081	NC_013501	CGA	2	6	275081	275086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315834
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6084	NC_013501	ATCG	2	8	275217	275224	25 %	25 %	25 %	25 %	268315834
6085	NC_013501	GAG	2	6	275241	275246	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268315834
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6087	NC_013501	TGC	2	6	275294	275299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315835
6088	NC_013501	CGGC	2	8	275309	275316	0 %	0 %	50 %	50 %	268315835
6089	NC_013501	CGGG	2	8	275319	275326	0 %	0 %	75 %	25 %	268315835
6090	NC_013501	GCC	2	6	275410	275415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315835
6091	NC_013501	TGGG	2	8	275431	275438	0 %	25 %	75 %	0 %	268315835
6092	NC_013501	GACCT	2	10	275449	275458	20 %	20 %	20 %	40 %	268315835
6093	NC_013501	TCGAT	2	10	275492	275501	20 %	40 %	20 %	20 %	268315835
6094	NC_013501	GCT	2	6	275529	275534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315835
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6099	NC_013501	CACC	2	8	275690	275697	25 %	0 %	0 %	75 %	268315835
6100	NC_013501	GTC	2	6	275743	275748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315835
6101	NC_013501	CAC	2	6	275760	275765	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268315835
6102	NC_013501	CGG	2	6	275788	275793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315835
6103	NC_013501	CGGC	2	8	275796	275803	0 %	0 %	50 %	50 %	268315835
6104	NC_013501	GCG	2	6	275809	275814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315835
6105	NC_013501	CGG	2	6	275823	275828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315835
6106	NC_013501	GAC	2	6	275842	275847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315835
6107	NC_013501	CCCG	2	8	275877	275884	0 %	0 %	25 %	75 %	268315835
6108	NC_013501	CTCG	2	8	275886	275893	0 %	25 %	25 %	50 %	268315835
6109	NC_013501	TTC	2	6	275920	275925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268315835
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6111	NC_013501	GC	3	6	275945	275950	0 %	0 %	50 %	50 %	268315835
6112	NC_013501	ACT	2	6	275966	275971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315835
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6115	NC_013501	CTT	2	6	276069	276074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268315835
6116	NC_013501	ACG	2	6	276077	276082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315835
6117	NC_013501	GCC	2	6	276083	276088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315835
6118	NC_013501	AGC	2	6	276128	276133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315835
6119	NC_013501	CGGC	3	12	276172	276183	0 %	0 %	50 %	50 %	268315835
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6121	NC_013501	TGC	2	6	276248	276253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315835
6122	NC_013501	CGC	2	6	276300	276305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315835
6123	NC_013501	TGGCCG	2	12	276416	276427	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	268315835
6124	NC_013501	CGA	2	6	276477	276482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315835
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6126	NC_013501	GGC	2	6	276497	276502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315835
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6128	NC_013501	GCCG	2	8	276708	276715	0 %	0 %	50 %	50 %	268315835
6129	NC_013501	GGAC	2	8	276735	276742	25 %	0 %	50 %	25 %	268315835
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6232	NC_013501	GGCAC	2	10	281597	281606	20 %	0 %	40 %	40 %	268315842
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6241	NC_013501	CTT	2	6	282159	282164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268315842
6242	NC_013501	CTG	2	6	282169	282174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315842
6243	NC_013501	AGGC	2	8	282338	282345	25 %	0 %	50 %	25 %	268315843
6244	NC_013501	GCA	2	6	282352	282357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315843
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6250	NC_013501	CCAG	2	8	282493	282500	25 %	0 %	25 %	50 %	268315843
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6355	NC_013501	GCCG	2	8	287827	287834	0 %	0 %	50 %	50 %	268315847
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6482	NC_013501	AAT	2	6	293461	293466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268315850
6483	NC_013501	CG	3	6	293517	293522	0 %	0 %	50 %	50 %	268315850
6484	NC_013501	CAG	2	6	293534	293539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315850
6485	NC_013501	TGA	2	6	293592	293597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268315850
6486	NC_013501	CGA	2	6	293608	293613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268315850
6487	NC_013501	CAGG	2	8	293648	293655	25 %	0 %	50 %	25 %	268315850
6488	NC_013501	CGACTA	2	12	294066	294077	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	268315851
6489	NC_013501	GCC	2	6	294084	294089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315851
6490	NC_013501	CCG	2	6	294109	294114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268315851
6491	NC_013501	GTC	2	6	294115	294120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315851
6492	NC_013501	CAC	2	6	294171	294176	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268315851
6493	NC_013501	GCT	2	6	294183	294188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315851
6494	NC_013501	TCA	2	6	294257	294262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315851
6495	NC_013501	TTC	2	6	294298	294303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268315851
6496	NC_013501	TAC	2	6	294373	294378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268315851
6497	NC_013501	TG	3	6	294385	294390	0 %	50 %	50 %	0 %	268315851
6498	NC_013501	GGGC	2	8	294395	294402	0 %	0 %	75 %	25 %	268315851
6499	NC_013501	TCG	2	6	294416	294421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268315851
6500	NC_013501	GCG	2	6	294464	294469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268315851

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