MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodothermus marinus DSM 4252 chromosome

Total Repeats: 72471

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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54002	NC_013501	CGG	2	6	2445175	2445180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317643
54003	NC_013501	GTA	2	6	2445205	2445210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268317643
54004	NC_013501	GCCG	2	8	2445222	2445229	0 %	0 %	50 %	50 %	268317643
54005	NC_013501	CAG	2	6	2445232	2445237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317643
54006	NC_013501	CCA	2	6	2445240	2445245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268317643
54007	NC_013501	GTC	2	6	2445273	2445278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317643
54008	NC_013501	CAG	2	6	2445298	2445303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317643
54009	NC_013501	GTC	2	6	2445334	2445339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317643
54010	NC_013501	GCCT	2	8	2445340	2445347	0 %	25 %	25 %	50 %	268317643
54011	NC_013501	CGAT	2	8	2445398	2445405	25 %	25 %	25 %	25 %	268317643
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54013	NC_013501	GC	3	6	2445455	2445460	0 %	0 %	50 %	50 %	268317643
54014	NC_013501	CCA	2	6	2445465	2445470	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268317643
54015	NC_013501	CAT	2	6	2445577	2445582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268317643
54016	NC_013501	TGG	2	6	2445591	2445596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268317643
54017	NC_013501	CCA	2	6	2445627	2445632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268317643
54018	NC_013501	CCT	2	6	2445657	2445662	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268317643
54019	NC_013501	GCCGG	2	10	2445708	2445717	0 %	0 %	60 %	40 %	268317643
54020	NC_013501	CTT	2	6	2445786	2445791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268317643
54021	NC_013501	CGCC	2	8	2445843	2445850	0 %	0 %	25 %	75 %	268317643
54022	NC_013501	CG	3	6	2445853	2445858	0 %	0 %	50 %	50 %	268317643
54023	NC_013501	GAC	2	6	2445904	2445909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317643
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54033	NC_013501	CAC	2	6	2446210	2446215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268317643
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54051	NC_013501	TGC	2	6	2447081	2447086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317643
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54053	NC_013501	T	6	6	2447365	2447370	0 %	100 %	0 %	0 %	268317644
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54061	NC_013501	GCCC	2	8	2447668	2447675	0 %	0 %	25 %	75 %	268317644
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54115	NC_013501	CG	3	6	2450111	2450116	0 %	0 %	50 %	50 %	268317648
54116	NC_013501	AGC	2	6	2450194	2450199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317648
54117	NC_013501	CCG	2	6	2450209	2450214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268317648
54118	NC_013501	CG	3	6	2450222	2450227	0 %	0 %	50 %	50 %	268317648
54119	NC_013501	TCC	2	6	2450242	2450247	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268317648
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54122	NC_013501	CCAGC	2	10	2450388	2450397	20 %	0 %	20 %	60 %	268317648
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54135	NC_013501	GCG	2	6	2450926	2450931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317648
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54140	NC_013501	GCG	2	6	2451188	2451193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317649
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54143	NC_013501	GCA	2	6	2451316	2451321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317649
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54145	NC_013501	GCC	2	6	2451356	2451361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268317649
54146	NC_013501	CCG	2	6	2451382	2451387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268317649
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54151	NC_013501	GCG	2	6	2451594	2451599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317649
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54176	NC_013501	CGG	2	6	2453057	2453062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317650
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54178	NC_013501	GAC	2	6	2453229	2453234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317650
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54199	NC_013501	CAT	2	6	2454236	2454241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268317651
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54202	NC_013501	TGG	2	6	2454405	2454410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268317651
54203	NC_013501	GCT	2	6	2454433	2454438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317651
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54206	NC_013501	CCGGT	2	10	2454504	2454513	0 %	20 %	40 %	40 %	268317651
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54208	NC_013501	A	6	6	2454627	2454632	100 %	0 %	0 %	0 %	268317651
54209	NC_013501	CTG	2	6	2454641	2454646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317651
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54212	NC_013501	TTC	2	6	2454797	2454802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268317651
54213	NC_013501	CTG	2	6	2454803	2454808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317651
54214	NC_013501	GAA	2	6	2454860	2454865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268317651
54215	NC_013501	CGA	2	6	2454904	2454909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317651
54216	NC_013501	CTG	2	6	2454911	2454916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317651
54217	NC_013501	TGC	2	6	2454972	2454977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317651
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54221	NC_013501	TGG	2	6	2455092	2455097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268317651
54222	NC_013501	GCC	2	6	2455108	2455113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268317651
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54225	NC_013501	ATT	2	6	2455264	2455269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268317651
54226	NC_013501	GCT	2	6	2455270	2455275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317652
54227	NC_013501	CTT	2	6	2455301	2455306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268317652
54228	NC_013501	CGT	2	6	2455325	2455330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317652
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54230	NC_013501	TGA	2	6	2455381	2455386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268317652
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54337	NC_013501	CACG	2	8	2461663	2461670	25 %	0 %	25 %	50 %	268317657
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54339	NC_013501	CGA	3	9	2461720	2461728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317657
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54343	NC_013501	AAC	2	6	2461811	2461816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268317657
54344	NC_013501	GAC	2	6	2461823	2461828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317657
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54461	NC_013501	CCT	2	6	2467253	2467258	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268317662
54462	NC_013501	ATC	2	6	2467261	2467266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268317662
54463	NC_013501	CGC	2	6	2467298	2467303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268317662
54464	NC_013501	GGC	2	6	2467333	2467338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317662
54465	NC_013501	TGA	2	6	2467363	2467368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268317662
54466	NC_013501	CAG	2	6	2467386	2467391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317662
54467	NC_013501	CGG	2	6	2467445	2467450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317662
54468	NC_013501	GTCG	2	8	2467460	2467467	0 %	25 %	50 %	25 %	268317662
54469	NC_013501	CGA	2	6	2467523	2467528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317662
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54472	NC_013501	GCG	2	6	2467613	2467618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317662
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54474	NC_013501	TTC	2	6	2467665	2467670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268317662
54475	NC_013501	TCCA	2	8	2467811	2467818	25 %	25 %	0 %	50 %	268317662
54476	NC_013501	CAT	2	6	2467851	2467856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268317662
54477	NC_013501	CGT	2	6	2467895	2467900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317662
54478	NC_013501	GC	3	6	2467908	2467913	0 %	0 %	50 %	50 %	268317662
54479	NC_013501	GCA	2	6	2468150	2468155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317662
54480	NC_013501	CAG	2	6	2468226	2468231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317662
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54483	NC_013501	GAT	2	6	2468363	2468368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268317662
54484	NC_013501	CGG	2	6	2468417	2468422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317662
54485	NC_013501	CGG	2	6	2468433	2468438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317662
54486	NC_013501	TCA	2	6	2468444	2468449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268317662
54487	NC_013501	GTC	2	6	2468474	2468479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317662
54488	NC_013501	CCA	2	6	2468486	2468491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268317662
54489	NC_013501	CGC	2	6	2468533	2468538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268317662
54490	NC_013501	GGC	2	6	2468589	2468594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317662
54491	NC_013501	AGC	2	6	2468668	2468673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317662
54492	NC_013501	CG	3	6	2468710	2468715	0 %	0 %	50 %	50 %	268317662
54493	NC_013501	A	6	6	2468739	2468744	100 %	0 %	0 %	0 %	268317662
54494	NC_013501	GGC	2	6	2468745	2468750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268317662
54495	NC_013501	GCAC	2	8	2468801	2468808	25 %	0 %	25 %	50 %	268317662
54496	NC_013501	TCG	2	6	2468887	2468892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268317662
54497	NC_013501	GCC	2	6	2468906	2468911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268317662
54498	NC_013501	ACC	2	6	2468947	2468952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268317662
54499	NC_013501	CAC	2	6	2468979	2468984	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268317662
54500	NC_013501	CAG	2	6	2469024	2469029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268317662

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