MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Robiginitalea biformata HTCC2501 chromosome

Total Repeats: 59751

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_013222	A	7	7	141585	141591	100 %	0 %	0 %	0 %	260060700
2502	NC_013222	GGCT	2	8	141689	141696	0 %	25 %	50 %	25 %	260060700
2503	NC_013222	GTT	2	6	141826	141831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260060701
2504	NC_013222	GTA	2	6	141838	141843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260060701
2505	NC_013222	CCA	2	6	142056	142061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260060701
2506	NC_013222	TCC	2	6	142094	142099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260060701
2507	NC_013222	GAT	2	6	142108	142113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260060701
2508	NC_013222	CCAGGG	2	12	142191	142202	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	260060701
2509	NC_013222	A	8	8	142485	142492	100 %	0 %	0 %	0 %	260060701
2510	NC_013222	CCT	2	6	142655	142660	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260060702
2511	NC_013222	CTT	2	6	142707	142712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260060702
2512	NC_013222	TCT	2	6	142799	142804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260060702
2513	NC_013222	CTT	2	6	142851	142856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260060702
2514	NC_013222	CTT	2	6	142863	142868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260060702
2515	NC_013222	CCA	2	6	142898	142903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260060702
2516	NC_013222	TGG	2	6	142922	142927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260060702
2517	NC_013222	GAA	3	9	142938	142946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260060702
2518	NC_013222	CAG	2	6	142947	142952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260060702
2519	NC_013222	CCG	2	6	142988	142993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260060702
2520	NC_013222	T	6	6	143007	143012	0 %	100 %	0 %	0 %	260060702
2521	NC_013222	TTA	2	6	143014	143019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260060702
2522	NC_013222	T	6	6	143039	143044	0 %	100 %	0 %	0 %	260060703
2523	NC_013222	TTC	2	6	143118	143123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260060703
2524	NC_013222	TCG	2	6	143134	143139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060703
2525	NC_013222	GTTC	2	8	143237	143244	0 %	50 %	25 %	25 %	260060703
2526	NC_013222	AT	3	6	143254	143259	50 %	50 %	0 %	0 %	260060703
2527	NC_013222	AAT	2	6	143295	143300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260060703
2528	NC_013222	GAT	2	6	143320	143325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260060703
2529	NC_013222	TC	3	6	143398	143403	0 %	50 %	0 %	50 %	260060703
2530	NC_013222	CTC	2	6	143424	143429	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260060703
2531	NC_013222	CGA	2	6	143432	143437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260060703
2532	NC_013222	TTG	2	6	143452	143457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260060703
2533	NC_013222	TTC	2	6	143476	143481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260060703
2534	NC_013222	CAC	2	6	143490	143495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260060703
2535	NC_013222	CGG	2	6	143505	143510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260060703
2536	NC_013222	GGC	2	6	143518	143523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260060703
2537	NC_013222	TGG	3	9	143555	143563	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260060703
2538	NC_013222	CAG	2	6	143583	143588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260060703
2539	NC_013222	TCCC	2	8	143683	143690	0 %	25 %	0 %	75 %	260060704
2540	NC_013222	GAA	2	6	143726	143731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260060704
2541	NC_013222	TTC	2	6	143754	143759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260060704
2542	NC_013222	GGT	2	6	143771	143776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260060704
2543	NC_013222	CAG	2	6	143852	143857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260060704
2544	NC_013222	CGA	2	6	143863	143868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260060704
2545	NC_013222	ACAA	2	8	143871	143878	75 %	0 %	0 %	25 %	260060704
2546	NC_013222	AAC	2	6	143925	143930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260060704
2547	NC_013222	ATG	2	6	143967	143972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260060704
2548	NC_013222	ACTT	2	8	144126	144133	25 %	50 %	0 %	25 %	260060705
2549	NC_013222	GAT	2	6	144161	144166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260060705
2550	NC_013222	ATG	2	6	144210	144215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260060705
2551	NC_013222	AGA	2	6	144223	144228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260060705
2552	NC_013222	GAT	2	6	144236	144241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260060705
2553	NC_013222	CGT	2	6	144263	144268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060705
2554	NC_013222	CCG	2	6	144447	144452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260060705
2555	NC_013222	TAG	2	6	144513	144518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260060705
2556	NC_013222	CCG	2	6	144573	144578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260060705
2557	NC_013222	TCT	2	6	144591	144596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260060705
2558	NC_013222	CAGA	2	8	144680	144687	50 %	0 %	25 %	25 %	260060705
2559	NC_013222	C	6	6	144714	144719	0 %	0 %	0 %	100 %	260060705
2560	NC_013222	GTC	2	6	144758	144763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060705
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2565	NC_013222	CAG	2	6	145669	145674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260060706
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2570	NC_013222	CTTC	2	8	145968	145975	0 %	50 %	0 %	50 %	260060706
2571	NC_013222	GTC	2	6	146060	146065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060706
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2579	NC_013222	CGT	2	6	146605	146610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060707
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2581	NC_013222	CTG	2	6	147013	147018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060707
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2583	NC_013222	GTGG	2	8	147139	147146	0 %	25 %	75 %	0 %	260060707
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2587	NC_013222	CTG	2	6	147400	147405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060708
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2589	NC_013222	ACC	2	6	147449	147454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260060708
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2591	NC_013222	C	6	6	147727	147732	0 %	0 %	0 %	100 %	260060708
2592	NC_013222	CGG	2	6	147765	147770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260060708
2593	NC_013222	T	6	6	147915	147920	0 %	100 %	0 %	0 %	260060709
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2602	NC_013222	CTT	2	6	148250	148255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260060709
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2604	NC_013222	GAA	2	6	148428	148433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260060709
2605	NC_013222	GTC	2	6	148531	148536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060709
2606	NC_013222	CGT	2	6	148667	148672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060709
2607	NC_013222	TCT	2	6	148742	148747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260060709
2608	NC_013222	GCCT	2	8	148789	148796	0 %	25 %	25 %	50 %	260060709
2609	NC_013222	GGCCT	2	10	148821	148830	0 %	20 %	40 %	40 %	260060709
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2612	NC_013222	TTC	2	6	149289	149294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260060710
2613	NC_013222	CCGG	2	8	149318	149325	0 %	0 %	50 %	50 %	260060710
2614	NC_013222	T	6	6	149337	149342	0 %	100 %	0 %	0 %	260060710
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2617	NC_013222	CAT	2	6	149466	149471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260060710
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2621	NC_013222	TCC	2	6	149611	149616	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260060710
2622	NC_013222	TCC	2	6	149626	149631	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260060710
2623	NC_013222	TAA	2	6	149650	149655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260060710
2624	NC_013222	TCG	2	6	149710	149715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060710
2625	NC_013222	ACC	2	6	149800	149805	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260060710
2626	NC_013222	CATA	2	8	149882	149889	50 %	25 %	0 %	25 %	260060710
2627	NC_013222	GA	3	6	150019	150024	50 %	0 %	50 %	0 %	260060710
2628	NC_013222	ACC	2	6	150130	150135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260060710
2629	NC_013222	TCC	2	6	150181	150186	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260060710
2630	NC_013222	CAG	2	6	150198	150203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260060710
2631	NC_013222	TTC	2	6	150222	150227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260060710
2632	NC_013222	TCA	2	6	150233	150238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260060710
2633	NC_013222	CCT	2	6	150302	150307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260060710
2634	NC_013222	GGTT	2	8	150356	150363	0 %	50 %	50 %	0 %	260060710
2635	NC_013222	T	6	6	150417	150422	0 %	100 %	0 %	0 %	260060710
2636	NC_013222	CAT	2	6	150498	150503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260060710
2637	NC_013222	TCG	2	6	150538	150543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060710
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2639	NC_013222	TTC	2	6	150594	150599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260060710
2640	NC_013222	GCCGT	2	10	150997	151006	0 %	20 %	40 %	40 %	260060710
2641	NC_013222	GGCC	2	8	151016	151023	0 %	0 %	50 %	50 %	260060710
2642	NC_013222	ACC	2	6	151030	151035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260060710
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2644	NC_013222	ACC	2	6	151150	151155	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260060710
2645	NC_013222	GGT	2	6	151247	151252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260060710
2646	NC_013222	GGC	2	6	151355	151360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260060710
2647	NC_013222	CCG	2	6	151430	151435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260060710
2648	NC_013222	ATTC	2	8	151445	151452	25 %	50 %	0 %	25 %	260060710
2649	NC_013222	TG	3	6	151488	151493	0 %	50 %	50 %	0 %	260060710
2650	NC_013222	GGA	2	6	151532	151537	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260060710
2651	NC_013222	T	7	7	151542	151548	0 %	100 %	0 %	0 %	260060710
2652	NC_013222	GGT	2	6	151568	151573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260060710
2653	NC_013222	CTG	2	6	151593	151598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060710
2654	NC_013222	GGT	2	6	151673	151678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260060710
2655	NC_013222	GAT	2	6	151680	151685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260060710
2656	NC_013222	TCC	2	6	151753	151758	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260060710
2657	NC_013222	CAC	2	6	151866	151871	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260060710
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2659	NC_013222	CAC	2	6	151929	151934	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260060710
2660	NC_013222	TCC	2	6	151960	151965	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260060710
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2664	NC_013222	A	8	8	152063	152070	100 %	0 %	0 %	0 %	260060710
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2684	NC_013222	GCCT	2	8	153165	153172	0 %	25 %	25 %	50 %	260060711
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2732	NC_013222	GCT	2	6	155912	155917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060714
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2739	NC_013222	CACGG	2	10	156362	156371	20 %	0 %	40 %	40 %	260060715
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2741	NC_013222	CCA	2	6	156429	156434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260060715
2742	NC_013222	ATCGG	2	10	156494	156503	20 %	20 %	40 %	20 %	260060715
2743	NC_013222	TGG	2	6	156630	156635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260060715
2744	NC_013222	TGG	2	6	156669	156674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260060715
2745	NC_013222	TGG	2	6	156729	156734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260060715
2746	NC_013222	CAGG	2	8	156905	156912	25 %	0 %	50 %	25 %	260060715
2747	NC_013222	A	6	6	156932	156937	100 %	0 %	0 %	0 %	260060715
2748	NC_013222	GCT	3	9	156949	156957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060715
2749	NC_013222	TAC	2	6	157010	157015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260060715
2750	NC_013222	AG	3	6	157048	157053	50 %	0 %	50 %	0 %	260060715
2751	NC_013222	CAG	2	6	157066	157071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260060715
2752	NC_013222	TAC	2	6	157154	157159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260060715
2753	NC_013222	TGG	2	6	157191	157196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260060715
2754	NC_013222	CTT	3	9	157204	157212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260060715
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2758	NC_013222	T	6	6	157439	157444	0 %	100 %	0 %	0 %	260060715
2759	NC_013222	ATG	2	6	157451	157456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260060715
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2852	NC_013222	TCG	2	6	163193	163198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060721
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2857	NC_013222	GTC	2	6	163414	163419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060721
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2861	NC_013222	ATGC	2	8	163659	163666	25 %	25 %	25 %	25 %	260060721
2862	NC_013222	GCA	2	6	163788	163793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260060722
2863	NC_013222	CTCG	2	8	163878	163885	0 %	25 %	25 %	50 %	260060722
2864	NC_013222	TCG	2	6	164069	164074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060722
2865	NC_013222	CCG	2	6	164249	164254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260060722
2866	NC_013222	GCCA	2	8	164364	164371	25 %	0 %	25 %	50 %	260060722
2867	NC_013222	TCC	2	6	164372	164377	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260060722
2868	NC_013222	GTT	2	6	164395	164400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260060722
2869	NC_013222	ACC	2	6	164408	164413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260060722
2870	NC_013222	CGT	2	6	164505	164510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060722
2871	NC_013222	GTC	2	6	164557	164562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060722
2872	NC_013222	GCC	2	6	164657	164662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260060722
2873	NC_013222	AGCC	2	8	164693	164700	25 %	0 %	25 %	50 %	260060722
2874	NC_013222	GCG	2	6	164701	164706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260060722
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2878	NC_013222	TTCCAG	2	12	164851	164862	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	260060722
2879	NC_013222	GCT	2	6	164880	164885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060722
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2883	NC_013222	GA	3	6	164987	164992	50 %	0 %	50 %	0 %	260060722
2884	NC_013222	C	6	6	165038	165043	0 %	0 %	0 %	100 %	260060722
2885	NC_013222	GCC	2	6	165050	165055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260060722
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2887	NC_013222	GAT	2	6	165272	165277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260060723
2888	NC_013222	GCA	2	6	165295	165300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260060723
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2891	NC_013222	ATG	2	6	165405	165410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260060723
2892	NC_013222	CAC	2	6	165446	165451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260060723
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2897	NC_013222	AGC	2	6	165645	165650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260060723
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2966	NC_013222	GCA	2	6	168850	168855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260060726
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2970	NC_013222	CAG	2	6	169034	169039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260060726
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2972	NC_013222	TCC	2	6	169170	169175	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260060726
2973	NC_013222	GC	3	6	169197	169202	0 %	0 %	50 %	50 %	260060726
2974	NC_013222	G	6	6	169273	169278	0 %	0 %	100 %	0 %	260060726
2975	NC_013222	GGT	2	6	169282	169287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260060726
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2978	NC_013222	G	6	6	169345	169350	0 %	0 %	100 %	0 %	260060726
2979	NC_013222	AAG	2	6	169359	169364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260060726
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2981	NC_013222	CTG	2	6	169681	169686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060727
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2983	NC_013222	TCC	2	6	169700	169705	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260060727
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2985	NC_013222	G	6	6	169841	169846	0 %	0 %	100 %	0 %	260060727
2986	NC_013222	CCG	2	6	169919	169924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260060727
2987	NC_013222	ACC	2	6	170003	170008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260060727
2988	NC_013222	GC	3	6	170027	170032	0 %	0 %	50 %	50 %	260060727
2989	NC_013222	TGG	2	6	170051	170056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260060727
2990	NC_013222	GGC	2	6	170097	170102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260060727
2991	NC_013222	ACC	2	6	170146	170151	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260060727
2992	NC_013222	TCCGGG	2	12	170222	170233	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	260060727
2993	NC_013222	GAA	2	6	170250	170255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260060727
2994	NC_013222	GCC	2	6	170265	170270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260060727
2995	NC_013222	TGA	2	6	170363	170368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260060727
2996	NC_013222	GGA	2	6	170436	170441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260060727
2997	NC_013222	CCT	2	6	170492	170497	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260060727
2998	NC_013222	GAA	2	6	170614	170619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260060727
2999	NC_013222	GCCC	2	8	170640	170647	0 %	0 %	25 %	75 %	260060727
3000	NC_013222	CCG	2	6	170675	170680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260060727

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