MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Robiginitalea biformata HTCC2501 chromosome

Total Repeats: 59751

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_013222	CGG	2	6	86807	86812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260060662
1502	NC_013222	AAAC	2	8	86845	86852	75 %	0 %	0 %	25 %	260060662
1503	NC_013222	GCA	2	6	86883	86888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260060663
1504	NC_013222	CTG	2	6	87009	87014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060663
1505	NC_013222	A	6	6	87028	87033	100 %	0 %	0 %	0 %	260060663
1506	NC_013222	G	6	6	87097	87102	0 %	0 %	100 %	0 %	260060663
1507	NC_013222	AC	3	6	87125	87130	50 %	0 %	0 %	50 %	260060663
1508	NC_013222	TGG	2	6	87190	87195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260060663
1509	NC_013222	CAT	2	6	87239	87244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260060663
1510	NC_013222	GCG	2	6	87419	87424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260060663
1511	NC_013222	TGA	2	6	87484	87489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260060663
1512	NC_013222	ACG	2	6	87547	87552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260060663
1513	NC_013222	ACC	2	6	87594	87599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260060663
1514	NC_013222	CTG	2	6	87644	87649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060663
1515	NC_013222	GAA	2	6	87711	87716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260060663
1516	NC_013222	CCT	2	6	87835	87840	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260060663
1517	NC_013222	TG	3	6	87876	87881	0 %	50 %	50 %	0 %	260060663
1518	NC_013222	CAT	2	6	87899	87904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260060663
1519	NC_013222	TCC	2	6	87931	87936	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260060663
1520	NC_013222	C	6	6	87935	87940	0 %	0 %	0 %	100 %	260060663
1521	NC_013222	AAGC	2	8	87944	87951	50 %	0 %	25 %	25 %	260060663
1522	NC_013222	ATG	2	6	88071	88076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260060663
1523	NC_013222	CTGG	2	8	88139	88146	0 %	25 %	50 %	25 %	260060663
1524	NC_013222	TGC	2	6	88324	88329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060663
1525	NC_013222	ACG	2	6	88360	88365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260060663
1526	NC_013222	CGGC	2	8	88444	88451	0 %	0 %	50 %	50 %	260060663
1527	NC_013222	GAC	2	6	88651	88656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260060664
1528	NC_013222	GTG	2	6	88681	88686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260060664
1529	NC_013222	A	6	6	88687	88692	100 %	0 %	0 %	0 %	260060664
1530	NC_013222	GAA	2	6	88723	88728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260060664
1531	NC_013222	C	7	7	88763	88769	0 %	0 %	0 %	100 %	260060664
1532	NC_013222	GGA	2	6	88776	88781	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260060664
1533	NC_013222	ACC	2	6	88796	88801	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260060664
1534	NC_013222	G	6	6	88890	88895	0 %	0 %	100 %	0 %	260060664
1535	NC_013222	CCGC	2	8	89037	89044	0 %	0 %	25 %	75 %	260060664
1536	NC_013222	AGC	2	6	89096	89101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260060664
1537	NC_013222	G	6	6	89203	89208	0 %	0 %	100 %	0 %	260060664
1538	NC_013222	CGG	2	6	89304	89309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260060664
1539	NC_013222	GCT	2	6	89384	89389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060664
1540	NC_013222	CAC	2	6	89436	89441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260060664
1541	NC_013222	GAC	2	6	89494	89499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260060664
1542	NC_013222	GCG	2	6	89618	89623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260060664
1543	NC_013222	CCT	2	6	89730	89735	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260060664
1544	NC_013222	GCA	2	6	89747	89752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260060664
1545	NC_013222	TGG	2	6	89825	89830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260060664
1546	NC_013222	TG	3	6	89842	89847	0 %	50 %	50 %	0 %	260060664
1547	NC_013222	ACG	2	6	89924	89929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260060664
1548	NC_013222	AGG	2	6	89942	89947	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260060664
1549	NC_013222	CCA	2	6	89970	89975	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260060664
1550	NC_013222	CAG	2	6	90000	90005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260060664
1551	NC_013222	CGGAC	2	10	90125	90134	20 %	0 %	40 %	40 %	260060664
1552	NC_013222	GCG	2	6	90158	90163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260060664
1553	NC_013222	CCT	2	6	90174	90179	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260060664
1554	NC_013222	GAA	2	6	90201	90206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260060664
1555	NC_013222	CAC	2	6	90222	90227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260060664
1556	NC_013222	CTG	2	6	90250	90255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060664
1557	NC_013222	GGC	2	6	90261	90266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260060664
1558	NC_013222	GCC	2	6	90272	90277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260060664
1559	NC_013222	AATTC	2	10	90296	90305	40 %	40 %	0 %	20 %	260060664
1560	NC_013222	TTC	2	6	90313	90318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260060664
1561	NC_013222	CTG	2	6	90544	90549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060664
1562	NC_013222	GGGCC	2	10	90555	90564	0 %	0 %	60 %	40 %	260060664
1563	NC_013222	GCC	2	6	90568	90573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260060664
1564	NC_013222	CTG	2	6	90574	90579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060664
1565	NC_013222	ATT	2	6	90588	90593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260060664
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1567	NC_013222	GGA	2	6	90606	90611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260060664
1568	NC_013222	GAC	2	6	90619	90624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260060664
1569	NC_013222	TGC	2	6	90687	90692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060664
1570	NC_013222	TGG	2	6	90794	90799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260060664
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1572	NC_013222	CCA	2	6	91019	91024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260060665
1573	NC_013222	ACC	2	6	91177	91182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260060665
1574	NC_013222	CTG	2	6	91213	91218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060665
1575	NC_013222	GC	3	6	91249	91254	0 %	0 %	50 %	50 %	260060665
1576	NC_013222	GCC	2	6	91273	91278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260060665
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1581	NC_013222	ATCC	2	8	91493	91500	25 %	25 %	0 %	50 %	260060665
1582	NC_013222	CTG	2	6	91506	91511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060665
1583	NC_013222	GTC	2	6	91530	91535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060665
1584	NC_013222	CAA	2	6	91641	91646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260060665
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1592	NC_013222	GAA	2	6	92257	92262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260060666
1593	NC_013222	TCA	2	6	92319	92324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260060666
1594	NC_013222	CCA	2	6	92415	92420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260060666
1595	NC_013222	CGTGT	2	10	92428	92437	0 %	40 %	40 %	20 %	260060666
1596	NC_013222	C	7	7	92482	92488	0 %	0 %	0 %	100 %	260060666
1597	NC_013222	GTG	2	6	92561	92566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260060666
1598	NC_013222	AGG	2	6	92606	92611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260060666
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1604	NC_013222	AGAA	2	8	92903	92910	75 %	0 %	25 %	0 %	260060666
1605	NC_013222	CAA	2	6	92941	92946	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260060666
1606	NC_013222	GGC	2	6	92947	92952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260060666
1607	NC_013222	GAT	2	6	92983	92988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260060666
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1609	NC_013222	GGA	2	6	93094	93099	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260060666
1610	NC_013222	CCAG	2	8	93123	93130	25 %	0 %	25 %	50 %	260060666
1611	NC_013222	CGG	2	6	93201	93206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260060666
1612	NC_013222	GAA	2	6	93259	93264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260060666
1613	NC_013222	CAG	2	6	93331	93336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260060666
1614	NC_013222	AGA	2	6	93375	93380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260060666
1615	NC_013222	ATG	2	6	93383	93388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260060666
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1617	NC_013222	CGG	3	9	93733	93741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260060667
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1620	NC_013222	TGT	2	6	93823	93828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260060667
1621	NC_013222	TTG	2	6	93849	93854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260060667
1622	NC_013222	AAAAT	2	10	93861	93870	80 %	20 %	0 %	0 %	260060667
1623	NC_013222	GTGC	2	8	93933	93940	0 %	25 %	50 %	25 %	260060667
1624	NC_013222	CGG	2	6	93976	93981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260060667
1625	NC_013222	TCG	2	6	93988	93993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060667
1626	NC_013222	ATC	2	6	94014	94019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260060667
1627	NC_013222	GTC	2	6	94142	94147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060667
1628	NC_013222	GGC	2	6	94148	94153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260060667
1629	NC_013222	ATC	2	6	94203	94208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260060667
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1631	NC_013222	GTC	2	6	94298	94303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060667
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1651	NC_013222	TGG	2	6	95338	95343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260060668
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1655	NC_013222	CATC	2	8	95665	95672	25 %	25 %	0 %	50 %	260060668
1656	NC_013222	CA	3	6	95673	95678	50 %	0 %	0 %	50 %	260060668
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1744	NC_013222	TGA	2	6	99996	100001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260060672
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1748	NC_013222	TCGGG	2	10	100368	100377	0 %	20 %	60 %	20 %	260060672
1749	NC_013222	GCCG	2	8	100407	100414	0 %	0 %	50 %	50 %	260060672
1750	NC_013222	GGC	3	9	100465	100473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260060672
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1753	NC_013222	CTG	2	6	100508	100513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060672
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1767	NC_013222	CGGC	2	8	100982	100989	0 %	0 %	50 %	50 %	260060672
1768	NC_013222	CGGCG	2	10	101142	101151	0 %	0 %	60 %	40 %	260060672
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1868	NC_013222	TGG	2	6	106924	106929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260060675
1869	NC_013222	T	6	6	106940	106945	0 %	100 %	0 %	0 %	260060675
1870	NC_013222	TCC	2	6	106950	106955	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260060675
1871	NC_013222	TACC	2	8	106966	106973	25 %	25 %	0 %	50 %	260060675
1872	NC_013222	GGCCTT	2	12	106994	107005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060675
1873	NC_013222	GAC	2	6	107006	107011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260060675
1874	NC_013222	TTCCTG	2	12	107054	107065	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	260060675
1875	NC_013222	GTT	2	6	107071	107076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260060675
1876	NC_013222	CTTC	2	8	107086	107093	0 %	50 %	0 %	50 %	260060675
1877	NC_013222	TCC	2	6	107106	107111	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260060675
1878	NC_013222	TTC	2	6	107368	107373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260060676
1879	NC_013222	TCC	3	9	107405	107413	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260060676
1880	NC_013222	ATA	2	6	107495	107500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260060676
1881	NC_013222	CTC	2	6	107506	107511	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260060676
1882	NC_013222	TCC	3	9	107543	107551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260060676
1883	NC_013222	GGCC	2	8	107592	107599	0 %	0 %	50 %	50 %	260060676
1884	NC_013222	TGT	2	6	107607	107612	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260060676
1885	NC_013222	CCT	2	6	107640	107645	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260060676
1886	NC_013222	CGGGC	2	10	107705	107714	0 %	0 %	60 %	40 %	260060676
1887	NC_013222	GTT	2	6	107743	107748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260060676
1888	NC_013222	CACC	2	8	107832	107839	25 %	0 %	0 %	75 %	260060676
1889	NC_013222	GTC	2	6	107851	107856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060676
1890	NC_013222	CTT	2	6	107905	107910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260060676
1891	NC_013222	TGA	2	6	107916	107921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260060676
1892	NC_013222	TGG	2	6	107948	107953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260060676
1893	NC_013222	GCT	2	6	107958	107963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060676
1894	NC_013222	ATG	2	6	107990	107995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260060676
1895	NC_013222	TTG	2	6	108005	108010	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260060676
1896	NC_013222	GAT	2	6	108031	108036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260060676
1897	NC_013222	GTTC	2	8	108102	108109	0 %	50 %	25 %	25 %	260060676
1898	NC_013222	CAG	2	6	108121	108126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260060676
1899	NC_013222	CGG	2	6	108159	108164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260060676
1900	NC_013222	GCC	2	6	108267	108272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260060676
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1913	NC_013222	CCGG	2	8	109011	109018	0 %	0 %	50 %	50 %	260060677
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1945	NC_013222	GTT	2	6	110295	110300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260060678
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1947	NC_013222	CTG	2	6	110386	110391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060678
1948	NC_013222	TCA	3	9	110393	110401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260060678
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1951	NC_013222	CTG	2	6	110491	110496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060678
1952	NC_013222	GGA	2	6	110556	110561	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260060678
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1954	NC_013222	ATC	2	6	110579	110584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260060678
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1959	NC_013222	GCA	2	6	110728	110733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260060679
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1962	NC_013222	GCGG	2	8	110819	110826	0 %	0 %	75 %	25 %	260060679
1963	NC_013222	TGC	2	6	110860	110865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060679
1964	NC_013222	TCG	2	6	110922	110927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060679
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1966	NC_013222	TGCC	2	8	111025	111032	0 %	25 %	25 %	50 %	260060679
1967	NC_013222	GGA	2	6	111034	111039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260060679
1968	NC_013222	CTG	2	6	111041	111046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060679
1969	NC_013222	CTG	2	6	111134	111139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060679
1970	NC_013222	CG	3	6	111145	111150	0 %	0 %	50 %	50 %	260060679
1971	NC_013222	GGC	2	6	111179	111184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260060679
1972	NC_013222	CTG	2	6	111239	111244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060679
1973	NC_013222	A	6	6	111257	111262	100 %	0 %	0 %	0 %	260060679
1974	NC_013222	CTTC	2	8	111342	111349	0 %	50 %	0 %	50 %	260060680
1975	NC_013222	A	6	6	111353	111358	100 %	0 %	0 %	0 %	260060680
1976	NC_013222	GGC	2	6	111389	111394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260060680
1977	NC_013222	ACC	2	6	111410	111415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260060680
1978	NC_013222	ATC	3	9	111464	111472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260060680
1979	NC_013222	G	7	7	111647	111653	0 %	0 %	100 %	0 %	260060680
1980	NC_013222	CCT	2	6	111663	111668	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260060680
1981	NC_013222	CTG	2	6	111692	111697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060680
1982	NC_013222	TGG	2	6	111705	111710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260060680
1983	NC_013222	TGG	2	6	111744	111749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260060680
1984	NC_013222	GCCGCG	2	12	111854	111865	0 %	0 %	50 %	50 %	260060680
1985	NC_013222	CTA	2	6	111874	111879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260060680
1986	NC_013222	CTC	2	6	112255	112260	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260060681
1987	NC_013222	GTTT	2	8	112266	112273	0 %	75 %	25 %	0 %	260060681
1988	NC_013222	T	7	7	112271	112277	0 %	100 %	0 %	0 %	260060681
1989	NC_013222	CCG	2	6	112378	112383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260060681
1990	NC_013222	GAT	2	6	112401	112406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260060681
1991	NC_013222	T	6	6	112414	112419	0 %	100 %	0 %	0 %	260060681
1992	NC_013222	ATG	2	6	112465	112470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260060681
1993	NC_013222	TCC	2	6	112480	112485	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260060681
1994	NC_013222	CTG	2	6	112495	112500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060681
1995	NC_013222	GCC	2	6	112591	112596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260060681
1996	NC_013222	TGG	2	6	112598	112603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260060681
1997	NC_013222	CTG	2	6	112690	112695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060681
1998	NC_013222	GGAC	2	8	112715	112722	25 %	0 %	50 %	25 %	260060681
1999	NC_013222	CCATC	2	10	112814	112823	20 %	20 %	0 %	60 %	260060681
2000	NC_013222	TTC	2	6	112840	112845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260060681

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