MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Robiginitalea biformata HTCC2501 chromosome

Total Repeats: 59751

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_013222	TGA	2	6	59156	59161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260060638
1002	NC_013222	C	6	6	59223	59228	0 %	0 %	0 %	100 %	260060638
1003	NC_013222	TGG	2	6	59354	59359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260060638
1004	NC_013222	GAT	2	6	59451	59456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260060638
1005	NC_013222	CAGGAT	2	12	59457	59468	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	260060638
1006	NC_013222	TTCC	2	8	59535	59542	0 %	50 %	0 %	50 %	260060638
1007	NC_013222	TGA	2	6	59611	59616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260060639
1008	NC_013222	GGC	2	6	59627	59632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260060639
1009	NC_013222	A	7	7	59645	59651	100 %	0 %	0 %	0 %	260060639
1010	NC_013222	AG	3	6	59690	59695	50 %	0 %	50 %	0 %	260060639
1011	NC_013222	CCA	2	6	59752	59757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260060639
1012	NC_013222	CAG	2	6	59762	59767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260060639
1013	NC_013222	A	6	6	59789	59794	100 %	0 %	0 %	0 %	260060639
1014	NC_013222	ATG	2	6	59916	59921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260060639
1015	NC_013222	ACC	2	6	59934	59939	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260060639
1016	NC_013222	GTA	2	6	60002	60007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260060639
1017	NC_013222	CTT	2	6	60016	60021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260060639
1018	NC_013222	CTG	2	6	60077	60082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060639
1019	NC_013222	CGGC	2	8	60145	60152	0 %	0 %	50 %	50 %	260060639
1020	NC_013222	TTCCCG	2	12	60239	60250	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	260060639
1021	NC_013222	GAAGG	2	10	60278	60287	40 %	0 %	60 %	0 %	260060639
1022	NC_013222	ACC	3	9	60363	60371	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260060639
1023	NC_013222	CGAA	2	8	60510	60517	50 %	0 %	25 %	25 %	260060639
1024	NC_013222	GCC	2	6	60598	60603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260060639
1025	NC_013222	GTC	2	6	60630	60635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060639
1026	NC_013222	CCAGAC	2	12	60644	60655	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	260060639
1027	NC_013222	T	6	6	60786	60791	0 %	100 %	0 %	0 %	260060639
1028	NC_013222	GTT	2	6	61020	61025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260060640
1029	NC_013222	GCT	2	6	61053	61058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060640
1030	NC_013222	GCC	2	6	61096	61101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260060640
1031	NC_013222	CAG	2	6	61110	61115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260060640
1032	NC_013222	GTA	2	6	61172	61177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260060641
1033	NC_013222	ATC	2	6	61185	61190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260060641
1034	NC_013222	GGC	2	6	61252	61257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260060641
1035	NC_013222	GCA	2	6	61300	61305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260060641
1036	NC_013222	TCA	2	6	61465	61470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260060641
1037	NC_013222	GCC	2	6	61515	61520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260060641
1038	NC_013222	AGC	2	6	61521	61526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260060641
1039	NC_013222	CGG	2	6	61531	61536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260060641
1040	NC_013222	G	6	6	61562	61567	0 %	0 %	100 %	0 %	260060641
1041	NC_013222	AAC	2	6	61608	61613	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260060641
1042	NC_013222	CTT	2	6	61672	61677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260060641
1043	NC_013222	TCT	2	6	61729	61734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260060642
1044	NC_013222	CAA	2	6	61746	61751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260060642
1045	NC_013222	TCGT	2	8	61792	61799	0 %	50 %	25 %	25 %	260060642
1046	NC_013222	ATA	2	6	61827	61832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260060642
1047	NC_013222	AAC	2	6	61897	61902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260060642
1048	NC_013222	CCG	2	6	61940	61945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260060642
1049	NC_013222	CCG	2	6	62057	62062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260060642
1050	NC_013222	CCA	2	6	62138	62143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260060642
1051	NC_013222	TGG	2	6	62168	62173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260060642
1052	NC_013222	GGT	2	6	62178	62183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260060642
1053	NC_013222	TAA	2	6	62231	62236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260060642
1054	NC_013222	GCG	2	6	62277	62282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260060642
1055	NC_013222	GAGCC	2	10	62312	62321	20 %	0 %	40 %	40 %	260060642
1056	NC_013222	CAA	2	6	62360	62365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260060642
1057	NC_013222	TCC	2	6	62498	62503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260060643
1058	NC_013222	TCC	2	6	62560	62565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260060643
1059	NC_013222	TTG	2	6	62569	62574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260060643
1060	NC_013222	TTCC	2	8	62635	62642	0 %	50 %	0 %	50 %	260060643
1061	NC_013222	GAT	2	6	62664	62669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260060643
1062	NC_013222	TCT	2	6	62891	62896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260060643
1063	NC_013222	GCT	2	6	62978	62983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060643
1064	NC_013222	A	6	6	63060	63065	100 %	0 %	0 %	0 %	260060643
1065	NC_013222	ACC	2	6	63073	63078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260060643
1066	NC_013222	TCT	2	6	63113	63118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260060643
1067	NC_013222	G	6	6	63534	63539	0 %	0 %	100 %	0 %	260060644
1068	NC_013222	AGC	2	6	63661	63666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260060644
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1070	NC_013222	CCA	2	6	63827	63832	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260060645
1071	NC_013222	ATA	2	6	63909	63914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260060645
1072	NC_013222	GAT	2	6	63933	63938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260060645
1073	NC_013222	T	6	6	64061	64066	0 %	100 %	0 %	0 %	260060645
1074	NC_013222	AGA	2	6	64160	64165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260060646
1075	NC_013222	GAATAC	2	12	64170	64181	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	260060646
1076	NC_013222	GCG	2	6	64242	64247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260060646
1077	NC_013222	AAT	2	6	64278	64283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260060646
1078	NC_013222	AAAGAA	2	12	64335	64346	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	260060646
1079	NC_013222	GC	3	6	64407	64412	0 %	0 %	50 %	50 %	260060646
1080	NC_013222	CTC	2	6	64434	64439	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260060646
1081	NC_013222	T	6	6	64454	64459	0 %	100 %	0 %	0 %	260060646
1082	NC_013222	CGG	2	6	64517	64522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260060646
1083	NC_013222	GCG	2	6	64636	64641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260060646
1084	NC_013222	C	6	6	64680	64685	0 %	0 %	0 %	100 %	260060646
1085	NC_013222	CGC	2	6	64709	64714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260060646
1086	NC_013222	CGA	2	6	64748	64753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260060646
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1088	NC_013222	ATG	2	6	64855	64860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260060646
1089	NC_013222	TCG	2	6	64933	64938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060646
1090	NC_013222	AGG	2	6	64982	64987	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260060646
1091	NC_013222	GAA	2	6	65025	65030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260060646
1092	NC_013222	CAT	2	6	65034	65039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260060646
1093	NC_013222	GCGG	2	8	65063	65070	0 %	0 %	75 %	25 %	260060646
1094	NC_013222	GTG	2	6	65101	65106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260060646
1095	NC_013222	GAA	2	6	65220	65225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260060647
1096	NC_013222	AGA	2	6	65228	65233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260060647
1097	NC_013222	TGC	2	6	65279	65284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060647
1098	NC_013222	GTT	2	6	65330	65335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260060647
1099	NC_013222	TGG	2	6	65429	65434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260060647
1100	NC_013222	ATC	2	6	65461	65466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260060647
1101	NC_013222	CCCG	2	8	65539	65546	0 %	0 %	25 %	75 %	260060647
1102	NC_013222	CTG	2	6	65547	65552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060647
1103	NC_013222	ACCG	2	8	65563	65570	25 %	0 %	25 %	50 %	260060647
1104	NC_013222	CAT	2	6	65577	65582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260060647
1105	NC_013222	GCT	2	6	65592	65597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060647
1106	NC_013222	AGG	2	6	65602	65607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260060647
1107	NC_013222	TCC	2	6	65647	65652	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260060647
1108	NC_013222	TCC	2	6	65659	65664	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260060647
1109	NC_013222	CAT	2	6	65739	65744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260060647
1110	NC_013222	T	6	6	65761	65766	0 %	100 %	0 %	0 %	260060647
1111	NC_013222	GTT	2	6	65777	65782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260060647
1112	NC_013222	TTC	2	6	65797	65802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260060647
1113	NC_013222	GCT	2	6	65855	65860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060648
1114	NC_013222	ATC	2	6	66018	66023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260060648
1115	NC_013222	ATA	2	6	66036	66041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260060648
1116	NC_013222	AAC	2	6	66047	66052	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260060648
1117	NC_013222	T	6	6	66066	66071	0 %	100 %	0 %	0 %	260060648
1118	NC_013222	GCA	2	6	66079	66084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260060648
1119	NC_013222	GCC	2	6	66092	66097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260060648
1120	NC_013222	AAC	2	6	66171	66176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260060648
1121	NC_013222	GCC	2	6	66207	66212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260060648
1122	NC_013222	ACCC	2	8	66213	66220	25 %	0 %	0 %	75 %	260060648
1123	NC_013222	TCC	2	6	66421	66426	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260060648
1124	NC_013222	GAG	2	6	66536	66541	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260060648
1125	NC_013222	CAG	2	6	66575	66580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260060648
1126	NC_013222	GCT	2	6	66874	66879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060649
1127	NC_013222	GC	3	6	66917	66922	0 %	0 %	50 %	50 %	260060649
1128	NC_013222	CAT	2	6	67073	67078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260060649
1129	NC_013222	CTT	2	6	67177	67182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260060649
1130	NC_013222	CCA	3	9	67183	67191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260060649
1131	NC_013222	AAT	2	6	67205	67210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260060649
1132	NC_013222	CTT	2	6	67213	67218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260060649
1133	NC_013222	CTGG	2	8	67220	67227	0 %	25 %	50 %	25 %	260060649
1134	NC_013222	TCC	2	6	67251	67256	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260060649
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1143	NC_013222	GGCCA	2	10	67451	67460	20 %	0 %	40 %	40 %	260060649
1144	NC_013222	CTT	2	6	67485	67490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260060649
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1151	NC_013222	GCCG	2	8	67783	67790	0 %	0 %	50 %	50 %	260060650
1152	NC_013222	GCT	2	6	67824	67829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060650
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1156	NC_013222	GTC	2	6	67995	68000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060651
1157	NC_013222	GTC	2	6	68013	68018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060651
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1162	NC_013222	GTCCAG	2	12	68627	68638	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	260060652
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1165	NC_013222	TTCC	2	8	68777	68784	0 %	50 %	0 %	50 %	260060652
1166	NC_013222	GTT	2	6	68804	68809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260060652
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1230	NC_013222	CCTT	2	8	72045	72052	0 %	50 %	0 %	50 %	260060652
1231	NC_013222	GTA	2	6	72113	72118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260060652
1232	NC_013222	TCC	2	6	72156	72161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260060652
1233	NC_013222	GTT	2	6	72227	72232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260060652
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1238	NC_013222	GTG	2	6	72453	72458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260060652
1239	NC_013222	TCCG	2	8	72502	72509	0 %	25 %	25 %	50 %	260060652
1240	NC_013222	TCC	2	6	72510	72515	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260060652
1241	NC_013222	GTCC	2	8	72574	72581	0 %	25 %	25 %	50 %	260060652
1242	NC_013222	ATG	2	6	72657	72662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260060652
1243	NC_013222	G	6	6	72679	72684	0 %	0 %	100 %	0 %	260060652
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1245	NC_013222	CGGG	2	8	72859	72866	0 %	0 %	75 %	25 %	260060652
1246	NC_013222	ATC	2	6	73034	73039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260060652
1247	NC_013222	C	6	6	73057	73062	0 %	0 %	0 %	100 %	260060652
1248	NC_013222	GCA	2	6	73153	73158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260060652
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1250	NC_013222	CCG	2	6	73346	73351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260060652
1251	NC_013222	CCT	2	6	73474	73479	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260060652
1252	NC_013222	GCC	2	6	73486	73491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260060652
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1365	NC_013222	A	6	6	79539	79544	100 %	0 %	0 %	0 %	260060656
1366	NC_013222	AAT	2	6	79547	79552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260060656
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1371	NC_013222	GAAGAG	2	12	79803	79814	50 %	0 %	50 %	0 %	260060656
1372	NC_013222	AAT	2	6	79957	79962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260060656
1373	NC_013222	TCC	2	6	79963	79968	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260060656
1374	NC_013222	TGC	2	6	80008	80013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060656
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1376	NC_013222	CCG	2	6	80306	80311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260060657
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1378	NC_013222	TCC	2	6	80350	80355	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260060657
1379	NC_013222	TCAAT	2	10	80516	80525	40 %	40 %	0 %	20 %	260060657
1380	NC_013222	TAG	2	6	80530	80535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260060657
1381	NC_013222	TGC	2	6	80546	80551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060657
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1384	NC_013222	GGTC	2	8	80624	80631	0 %	25 %	50 %	25 %	260060657
1385	NC_013222	TCCAGG	2	12	80653	80664	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	260060657
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1496	NC_013222	CCTG	2	8	86501	86508	0 %	25 %	25 %	50 %	260060661
1497	NC_013222	GCC	2	6	86515	86520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260060661
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1499	NC_013222	CTC	2	6	86610	86615	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260060661
1500	NC_013222	TTCA	2	8	86649	86656	25 %	50 %	0 %	25 %	260060661

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