MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Robiginitalea biformata HTCC2501 chromosome

Total Repeats: 59751

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013222	TCC	2	6	30959	30964	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260060614
502	NC_013222	GAT	2	6	30979	30984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260060614
503	NC_013222	CCA	2	6	31005	31010	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260060614
504	NC_013222	CGC	2	6	31026	31031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260060614
505	NC_013222	TCC	2	6	31085	31090	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260060614
506	NC_013222	CGG	2	6	31188	31193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260060614
507	NC_013222	TCC	2	6	31346	31351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260060614
508	NC_013222	ATT	2	6	31420	31425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260060614
509	NC_013222	CTG	2	6	31507	31512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060614
510	NC_013222	ATCGGC	2	12	31531	31542	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	260060614
511	NC_013222	CCGTCC	2	12	31571	31582	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	260060614
512	NC_013222	TCG	2	6	31583	31588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060614
513	NC_013222	GTCCC	2	10	31619	31628	0 %	20 %	20 %	60 %	260060614
514	NC_013222	GTCC	2	8	31663	31670	0 %	25 %	25 %	50 %	260060614
515	NC_013222	CCGTCC	2	12	31700	31711	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	260060614
516	NC_013222	GGT	2	6	31726	31731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260060614
517	NC_013222	CAC	2	6	31747	31752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260060614
518	NC_013222	TCC	2	6	31757	31762	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260060614
519	NC_013222	GGAA	2	8	31797	31804	50 %	0 %	50 %	0 %	260060614
520	NC_013222	CCA	2	6	31833	31838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260060614
521	NC_013222	GGAT	2	8	31870	31877	25 %	25 %	50 %	0 %	260060614
522	NC_013222	CTT	2	6	32022	32027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260060614
523	NC_013222	CGT	2	6	32071	32076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060614
524	NC_013222	GCC	2	6	32125	32130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260060614
525	NC_013222	GTT	2	6	32161	32166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260060614
526	NC_013222	TGC	2	6	32184	32189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060614
527	NC_013222	GATGGT	2	12	32272	32283	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	260060614
528	NC_013222	TTG	2	6	32303	32308	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260060614
529	NC_013222	TAA	2	6	32318	32323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260060614
530	NC_013222	GGT	2	6	32373	32378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260060614
531	NC_013222	TCG	2	6	32427	32432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060614
532	NC_013222	GAC	2	6	32443	32448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260060614
533	NC_013222	GAT	2	6	32467	32472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260060614
534	NC_013222	GGT	2	6	32488	32493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260060614
535	NC_013222	TCG	2	6	32498	32503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060614
536	NC_013222	GTC	2	6	32542	32547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060614
537	NC_013222	TTG	2	6	32600	32605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260060614
538	NC_013222	CCG	2	6	32625	32630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260060614
539	NC_013222	GCG	2	6	32687	32692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260060614
540	NC_013222	GCTCCC	2	12	32695	32706	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	260060614
541	NC_013222	GCTGAC	2	12	32710	32721	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	260060614
542	NC_013222	CTG	2	6	32785	32790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060614
543	NC_013222	CGT	2	6	32805	32810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060614
544	NC_013222	CAC	2	6	32959	32964	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260060614
545	NC_013222	CGG	2	6	33036	33041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260060614
546	NC_013222	CCG	2	6	33050	33055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260060614
547	NC_013222	CCGTC	2	10	33096	33105	0 %	20 %	20 %	60 %	260060614
548	NC_013222	GCC	2	6	33145	33150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260060614
549	NC_013222	GTT	2	6	33214	33219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260060614
550	NC_013222	CTG	2	6	33232	33237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060614
551	NC_013222	GTC	2	6	33238	33243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060614
552	NC_013222	CGT	2	6	33267	33272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060614
553	NC_013222	CCA	2	6	33351	33356	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260060614
554	NC_013222	CGG	2	6	33438	33443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260060614
555	NC_013222	ATC	2	6	33448	33453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260060614
556	NC_013222	GTG	2	6	33530	33535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260060614
557	NC_013222	CCG	2	6	33536	33541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260060614
558	NC_013222	TCG	2	6	33590	33595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060614
559	NC_013222	CGT	2	6	33619	33624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060614
560	NC_013222	CGT	2	6	33696	33701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060614
561	NC_013222	CGT	2	6	33747	33752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060614
562	NC_013222	CAC	2	6	33772	33777	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260060614
563	NC_013222	G	6	6	33780	33785	0 %	0 %	100 %	0 %	260060614
564	NC_013222	CCG	2	6	33809	33814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260060614
565	NC_013222	CGC	2	6	33853	33858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260060614
566	NC_013222	AAC	2	6	33940	33945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260060614
567	NC_013222	TCG	2	6	33953	33958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060614
568	NC_013222	CGA	2	6	33979	33984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260060614
569	NC_013222	TGG	2	6	34008	34013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260060614
570	NC_013222	CGT	2	6	34059	34064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060614
571	NC_013222	C	7	7	34195	34201	0 %	0 %	0 %	100 %	260060614
572	NC_013222	TCCC	2	8	34246	34253	0 %	25 %	0 %	75 %	260060614
573	NC_013222	TCG	2	6	34289	34294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060614
574	NC_013222	TCC	2	6	34332	34337	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260060614
575	NC_013222	GTG	2	6	34388	34393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260060614
576	NC_013222	GTG	2	6	34418	34423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260060614
577	NC_013222	CGC	2	6	34449	34454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260060614
578	NC_013222	CCG	2	6	34464	34469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260060614
579	NC_013222	CGC	2	6	34476	34481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260060614
580	NC_013222	CCG	2	6	34547	34552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260060614
581	NC_013222	TAAAAC	2	12	34566	34577	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	260060614
582	NC_013222	GTC	3	9	34633	34641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060614
583	NC_013222	TTG	2	6	34766	34771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260060614
584	NC_013222	GTT	2	6	34885	34890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260060614
585	NC_013222	CTTC	2	8	34922	34929	0 %	50 %	0 %	50 %	260060614
586	NC_013222	ACC	2	6	34931	34936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260060614
587	NC_013222	GCC	2	6	34997	35002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260060614
588	NC_013222	CCA	2	6	35320	35325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260060615
589	NC_013222	CGG	2	6	35547	35552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260060615
590	NC_013222	GCT	2	6	35569	35574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060615
591	NC_013222	CCA	2	6	35644	35649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260060615
592	NC_013222	CCT	2	6	35674	35679	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260060615
593	NC_013222	CTG	2	6	35723	35728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060615
594	NC_013222	GC	3	6	35757	35762	0 %	0 %	50 %	50 %	260060615
595	NC_013222	TTC	2	6	35931	35936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260060615
596	NC_013222	TCC	2	6	35940	35945	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260060615
597	NC_013222	CCTGGG	2	12	36013	36024	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	260060615
598	NC_013222	ATA	2	6	36096	36101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260060615
599	NC_013222	CGGG	2	8	36309	36316	0 %	0 %	75 %	25 %	260060616
600	NC_013222	CAC	2	6	36403	36408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260060616
601	NC_013222	G	6	6	36432	36437	0 %	0 %	100 %	0 %	260060616
602	NC_013222	CGGG	2	8	36561	36568	0 %	0 %	75 %	25 %	260060616
603	NC_013222	ACCA	2	8	36610	36617	50 %	0 %	0 %	50 %	260060616
604	NC_013222	CGC	2	6	36724	36729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260060616
605	NC_013222	GCCC	2	8	36763	36770	0 %	0 %	25 %	75 %	260060616
606	NC_013222	CGG	2	6	36771	36776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260060616
607	NC_013222	T	6	6	36787	36792	0 %	100 %	0 %	0 %	260060616
608	NC_013222	ATC	2	6	36899	36904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260060617
609	NC_013222	GT	3	6	36920	36925	0 %	50 %	50 %	0 %	260060617
610	NC_013222	T	6	6	36925	36930	0 %	100 %	0 %	0 %	260060617
611	NC_013222	AAT	2	6	36945	36950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260060617
612	NC_013222	GAG	2	6	36956	36961	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260060617
613	NC_013222	GTT	2	6	37035	37040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260060617
614	NC_013222	T	8	8	37193	37200	0 %	100 %	0 %	0 %	260060617
615	NC_013222	ACCG	2	8	37220	37227	25 %	0 %	25 %	50 %	260060617
616	NC_013222	AGAT	2	8	37247	37254	50 %	25 %	25 %	0 %	260060617
617	NC_013222	A	6	6	37255	37260	100 %	0 %	0 %	0 %	260060617
618	NC_013222	CAG	2	6	37267	37272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260060617
619	NC_013222	GGT	2	6	37293	37298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260060617
620	NC_013222	TCG	2	6	37319	37324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060617
621	NC_013222	GCG	2	6	37348	37353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260060617
622	NC_013222	CAG	2	6	37399	37404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260060617
623	NC_013222	GTGG	2	8	37516	37523	0 %	25 %	75 %	0 %	260060617
624	NC_013222	CTT	2	6	37626	37631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260060617
625	NC_013222	T	6	6	37643	37648	0 %	100 %	0 %	0 %	260060617
626	NC_013222	CGGA	2	8	37670	37677	25 %	0 %	50 %	25 %	260060617
627	NC_013222	CGGATT	2	12	37695	37706	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	260060617
628	NC_013222	CTTC	2	8	37797	37804	0 %	50 %	0 %	50 %	260060618
629	NC_013222	AACC	2	8	37809	37816	50 %	0 %	0 %	50 %	260060618
630	NC_013222	CCGGG	2	10	37892	37901	0 %	0 %	60 %	40 %	260060618
631	NC_013222	CGA	2	6	38017	38022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260060618
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640	NC_013222	TTC	2	6	38725	38730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260060619
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741	NC_013222	TCC	2	6	43242	43247	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260060622
742	NC_013222	GCAG	2	8	43390	43397	25 %	0 %	50 %	25 %	260060622
743	NC_013222	GGC	2	6	43456	43461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260060622
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745	NC_013222	C	6	6	43644	43649	0 %	0 %	0 %	100 %	260060622
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749	NC_013222	CGC	2	6	44360	44365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260060625
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751	NC_013222	CCG	2	6	44436	44441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260060625
752	NC_013222	AGT	2	6	44473	44478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260060625
753	NC_013222	AAC	2	6	44526	44531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260060625
754	NC_013222	CGG	2	6	44589	44594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260060625
755	NC_013222	GCA	2	6	44689	44694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260060625
756	NC_013222	CGGCC	2	10	44794	44803	0 %	0 %	40 %	60 %	260060625
757	NC_013222	CCGTT	2	10	44819	44828	0 %	40 %	20 %	40 %	260060625
758	NC_013222	CCG	2	6	44932	44937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260060625
759	NC_013222	TAC	2	6	44945	44950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260060625
760	NC_013222	GCT	2	6	44975	44980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060625
761	NC_013222	CGC	2	6	45034	45039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260060625
762	NC_013222	GGT	2	6	45049	45054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260060625
763	NC_013222	CGT	2	6	45100	45105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060625
764	NC_013222	CTG	2	6	45200	45205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060625
765	NC_013222	C	6	6	45228	45233	0 %	0 %	0 %	100 %	260060625
766	NC_013222	ATGG	2	8	45249	45256	25 %	25 %	50 %	0 %	260060625
767	NC_013222	GTA	2	6	45266	45271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260060625
768	NC_013222	GCA	2	6	45333	45338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260060625
769	NC_013222	CAGG	2	8	45341	45348	25 %	0 %	50 %	25 %	260060625
770	NC_013222	AGG	2	6	45363	45368	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260060625
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773	NC_013222	ATC	2	6	45509	45514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260060626
774	NC_013222	CAA	2	6	45529	45534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260060626
775	NC_013222	CGA	2	6	45604	45609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260060626
776	NC_013222	TCG	2	6	45684	45689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060626
777	NC_013222	TGA	2	6	45852	45857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260060626
778	NC_013222	CAA	2	6	45868	45873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260060626
779	NC_013222	C	6	6	45927	45932	0 %	0 %	0 %	100 %	260060626
780	NC_013222	AGG	2	6	45966	45971	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260060626
781	NC_013222	GGA	2	6	46024	46029	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260060626
782	NC_013222	GCC	2	6	46070	46075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260060626
783	NC_013222	GGA	2	6	46076	46081	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260060626
784	NC_013222	GGA	2	6	46189	46194	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260060626
785	NC_013222	AGCC	2	8	46203	46210	25 %	0 %	25 %	50 %	260060626
786	NC_013222	ATG	2	6	46355	46360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260060626
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788	NC_013222	GTAAA	2	10	46658	46667	60 %	20 %	20 %	0 %	260060627
789	NC_013222	GCA	2	6	46860	46865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260060628
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793	NC_013222	TGA	2	6	47111	47116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260060628
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812	NC_013222	GAC	2	6	48049	48054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260060628
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853	NC_013222	TCGCG	2	10	50554	50563	0 %	20 %	40 %	40 %	260060630
854	NC_013222	ACA	2	6	51066	51071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260060631
855	NC_013222	CCT	2	6	51072	51077	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260060631
856	NC_013222	CAA	2	6	51091	51096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260060631
857	NC_013222	GGGCCT	2	12	51395	51406	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	260060632
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863	NC_013222	AAAG	2	8	51789	51796	75 %	0 %	25 %	0 %	260060632
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865	NC_013222	AAG	2	6	52026	52031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260060632
866	NC_013222	CTG	2	6	52056	52061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060632
867	NC_013222	GGC	2	6	52071	52076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260060632
868	NC_013222	CAG	2	6	52092	52097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260060632
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870	NC_013222	GTC	2	6	52245	52250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060632
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872	NC_013222	CATT	2	8	52286	52293	25 %	50 %	0 %	25 %	260060632
873	NC_013222	GTG	2	6	52369	52374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260060632
874	NC_013222	GATC	2	8	52406	52413	25 %	25 %	25 %	25 %	260060632
875	NC_013222	CAG	2	6	52454	52459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260060632
876	NC_013222	CTG	2	6	52521	52526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260060632
877	NC_013222	GTT	2	6	52536	52541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260060632
878	NC_013222	CTC	2	6	52563	52568	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260060632
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880	NC_013222	T	6	6	52676	52681	0 %	100 %	0 %	0 %	260060632
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1000	NC_013222	CCGG	2	8	59124	59131	0 %	0 %	50 %	50 %	260060638

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