MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132502

Total Repeats: 13117

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_012858	GCCG	2	8	185987	185994	0 %	0 %	50 %	50 %	241666667
4002	NC_012858	TGA	2	6	186089	186094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666667
4003	NC_012858	AGA	2	6	186128	186133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241666667
4004	NC_012858	GAC	2	6	186334	186339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666668
4005	NC_012858	CG	3	6	186401	186406	0 %	0 %	50 %	50 %	241666668
4006	NC_012858	GTC	2	6	186502	186507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666668
4007	NC_012858	CGT	2	6	186513	186518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666668
4008	NC_012858	ATC	2	6	186568	186573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666668
4009	NC_012858	CCG	2	6	186639	186644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666668
4010	NC_012858	CGA	2	6	186663	186668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666668
4011	NC_012858	GCC	2	6	186695	186700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666668
4012	NC_012858	ACG	2	6	186757	186762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666668
4013	NC_012858	ACG	2	6	186791	186796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666668
4014	NC_012858	ATC	2	6	186847	186852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666668
4015	NC_012858	CGA	2	6	186861	186866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666668
4016	NC_012858	ATC	2	6	186874	186879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666668
4017	NC_012858	GAT	2	6	186892	186897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666668
4018	NC_012858	CCG	2	6	186941	186946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666668
4019	NC_012858	ATT	2	6	186962	186967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	241666668
4020	NC_012858	TGCGC	2	10	187002	187011	0 %	20 %	40 %	40 %	241666668
4021	NC_012858	CGA	2	6	187029	187034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666668
4022	NC_012858	GCG	2	6	187081	187086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666668
4023	NC_012858	ACC	2	6	187112	187117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241666668
4024	NC_012858	CGC	2	6	187146	187151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666668
4025	NC_012858	TGCG	2	8	187169	187176	0 %	25 %	50 %	25 %	241666668
4026	NC_012858	GCC	2	6	187183	187188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666668
4027	NC_012858	CGC	2	6	187245	187250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666668
4028	NC_012858	AGC	2	6	187268	187273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666668
4029	NC_012858	GGCGA	2	10	187279	187288	20 %	0 %	60 %	20 %	241666668
4030	NC_012858	TCG	2	6	187322	187327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666668
4031	NC_012858	GCCAC	2	10	187328	187337	20 %	0 %	20 %	60 %	241666668
4032	NC_012858	CAA	2	6	187341	187346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241666668
4033	NC_012858	GAA	2	6	187374	187379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241666668
4034	NC_012858	TGG	2	6	187396	187401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241666668
4035	NC_012858	CGA	2	6	187416	187421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666668
4036	NC_012858	CAC	2	6	187482	187487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241666668
4037	NC_012858	CG	4	8	187488	187495	0 %	0 %	50 %	50 %	241666668
4038	NC_012858	GCG	2	6	187504	187509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666668
4039	NC_012858	CGC	2	6	187517	187522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666668
4040	NC_012858	CTG	2	6	187543	187548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666668
4041	NC_012858	CGT	2	6	187584	187589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666668
4042	NC_012858	TCC	2	6	187658	187663	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241666668
4043	NC_012858	CGGC	2	8	187672	187679	0 %	0 %	50 %	50 %	241666668
4044	NC_012858	GC	3	6	187700	187705	0 %	0 %	50 %	50 %	241666668
4045	NC_012858	CTT	3	9	187716	187724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241666668
4046	NC_012858	GCC	2	6	187728	187733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666668
4047	NC_012858	CTT	4	12	187779	187790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241666668
4048	NC_012858	CAT	2	6	187800	187805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666668
4049	NC_012858	GCC	4	12	187840	187851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666668
4050	NC_012858	GC	3	6	187861	187866	0 %	0 %	50 %	50 %	241666668
4051	NC_012858	TCT	2	6	187886	187891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241666668
4052	NC_012858	CCGGCA	2	12	187904	187915	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241666668
4053	NC_012858	CGT	2	6	187974	187979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666668
4054	NC_012858	GCT	3	9	187980	187988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666668
4055	NC_012858	GCA	2	6	188000	188005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666668
4056	NC_012858	TGA	2	6	188031	188036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666668
4057	NC_012858	GCC	3	9	188059	188067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666668
4058	NC_012858	CGC	2	6	188091	188096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666668
4059	NC_012858	CCG	2	6	188162	188167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666668
4060	NC_012858	CCG	2	6	188193	188198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666668
4061	NC_012858	GCT	2	6	188208	188213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666668
4062	NC_012858	GCT	2	6	188232	188237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666668
4063	NC_012858	GGC	2	6	188256	188261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666668
4064	NC_012858	TCG	2	6	188285	188290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666668
4065	NC_012858	GCC	2	6	188383	188388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666668
4066	NC_012858	GCC	2	6	188398	188403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666668
4067	NC_012858	GGA	3	9	188436	188444	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241666668
4068	NC_012858	CTG	2	6	188455	188460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666668
4069	NC_012858	CGT	2	6	188466	188471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666668
4070	NC_012858	CGA	2	6	188472	188477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666668
4071	NC_012858	TCG	2	6	188579	188584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666668
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4076	NC_012858	GGC	2	6	188932	188937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666668
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4078	NC_012858	TCG	3	9	189058	189066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666669
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4080	NC_012858	GCT	2	6	189089	189094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666669
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4082	NC_012858	GTCG	2	8	189161	189168	0 %	25 %	50 %	25 %	241666669
4083	NC_012858	CGA	2	6	189170	189175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666669
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4085	NC_012858	CGA	2	6	189248	189253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666669
4086	NC_012858	GTC	2	6	189270	189275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666669
4087	NC_012858	CGA	2	6	189293	189298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666669
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4089	NC_012858	CGA	2	6	189332	189337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666669
4090	NC_012858	GCA	2	6	189407	189412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666669
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4092	NC_012858	TCGA	2	8	189450	189457	25 %	25 %	25 %	25 %	241666669
4093	NC_012858	AC	3	6	189561	189566	50 %	0 %	0 %	50 %	241666669
4094	NC_012858	TCT	2	6	189572	189577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241666669
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4098	NC_012858	CAT	2	6	189841	189846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666670
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4100	NC_012858	CGA	2	6	189882	189887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666670
4101	NC_012858	GC	4	8	189892	189899	0 %	0 %	50 %	50 %	241666670
4102	NC_012858	GCC	2	6	189920	189925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666670
4103	NC_012858	GCTCG	2	10	189982	189991	0 %	20 %	40 %	40 %	241666670
4104	NC_012858	CG	3	6	190050	190055	0 %	0 %	50 %	50 %	241666670
4105	NC_012858	TCC	2	6	190062	190067	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241666670
4106	NC_012858	CGA	2	6	190099	190104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666670
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4109	NC_012858	CGA	2	6	190240	190245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666670
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4111	NC_012858	CGA	2	6	190492	190497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666671
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4113	NC_012858	GACC	2	8	190601	190608	25 %	0 %	25 %	50 %	241666671
4114	NC_012858	CTG	2	6	190636	190641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666671
4115	NC_012858	GTA	3	9	190664	190672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666671
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4117	NC_012858	GTT	2	6	190838	190843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241666671
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4119	NC_012858	CTT	2	6	190873	190878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241666671
4120	NC_012858	TCG	2	6	190884	190889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666671
4121	NC_012858	GCCG	2	8	190898	190905	0 %	0 %	50 %	50 %	241666671
4122	NC_012858	GTC	2	6	190947	190952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666671
4123	NC_012858	CGC	2	6	190978	190983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666671
4124	NC_012858	GTC	2	6	190988	190993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666671
4125	NC_012858	CCA	2	6	190997	191002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241666671
4126	NC_012858	TCG	2	6	191079	191084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666671
4127	NC_012858	TGA	2	6	191101	191106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666671
4128	NC_012858	CGTAC	2	10	191117	191126	20 %	20 %	20 %	40 %	241666671
4129	NC_012858	TGACC	2	10	191152	191161	20 %	20 %	20 %	40 %	241666671
4130	NC_012858	CTG	2	6	191198	191203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666671
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4132	NC_012858	CCG	2	6	191326	191331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666671
4133	NC_012858	GGC	2	6	191375	191380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666671
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4135	NC_012858	CTT	2	6	191870	191875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241666672
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4142	NC_012858	GCG	2	6	192252	192257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666672
4143	NC_012858	CG	3	6	192256	192261	0 %	0 %	50 %	50 %	241666672
4144	NC_012858	GCATGG	2	12	192278	192289	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	241666672
4145	NC_012858	GGC	2	6	192305	192310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666672
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4150	NC_012858	CGT	2	6	192532	192537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666672
4151	NC_012858	AAG	2	6	192554	192559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241666672
4152	NC_012858	AGA	2	6	192615	192620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241666672
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4223	NC_012858	TGA	2	6	195576	195581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666675
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4231	NC_012858	TGA	2	6	196125	196130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666676
4232	NC_012858	CG	3	6	196131	196136	0 %	0 %	50 %	50 %	241666676
4233	NC_012858	TTC	2	6	196229	196234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241666676
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4236	NC_012858	CGC	4	12	196338	196349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666676
4237	NC_012858	CCT	2	6	196353	196358	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241666676
4238	NC_012858	TGC	2	6	196395	196400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666676
4239	NC_012858	CGC	2	6	196401	196406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666676
4240	NC_012858	CGG	2	6	196428	196433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666676
4241	NC_012858	CGAGCC	2	12	196540	196551	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241666676
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4244	NC_012858	GC	3	6	196696	196701	0 %	0 %	50 %	50 %	241666677
4245	NC_012858	GGC	2	6	196757	196762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666677
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4359	NC_012858	CGA	2	6	202299	202304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666682
4360	NC_012858	CTT	2	6	202348	202353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241666682
4361	NC_012858	CCAT	2	8	202365	202372	25 %	25 %	0 %	50 %	241666682
4362	NC_012858	TCG	2	6	202404	202409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666682
4363	NC_012858	CGT	3	9	202416	202424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666682
4364	NC_012858	GGC	2	6	202453	202458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666682
4365	NC_012858	ATC	2	6	202463	202468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666682
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4370	NC_012858	CGG	2	6	202570	202575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666682
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4383	NC_012858	T	6	6	203032	203037	0 %	100 %	0 %	0 %	241666682
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4387	NC_012858	CTG	2	6	203208	203213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666683
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4453	NC_012858	GGC	2	6	206270	206275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666686
4454	NC_012858	GTC	4	12	206342	206353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666686
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4458	NC_012858	TCG	2	6	206448	206453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666686
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4461	NC_012858	GC	3	6	206548	206553	0 %	0 %	50 %	50 %	241666686
4462	NC_012858	CGT	2	6	206626	206631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666686
4463	NC_012858	ACT	2	6	206721	206726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666686
4464	NC_012858	ATCA	2	8	206915	206922	50 %	25 %	0 %	25 %	241666686
4465	NC_012858	GGCG	2	8	206926	206933	0 %	0 %	75 %	25 %	241666686
4466	NC_012858	CTT	2	6	206936	206941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241666686
4467	NC_012858	ACA	2	6	206946	206951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241666686
4468	NC_012858	AAC	2	6	206954	206959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241666686
4469	NC_012858	GGC	2	6	207037	207042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666686
4470	NC_012858	CCGG	2	8	207091	207098	0 %	0 %	50 %	50 %	241666686
4471	NC_012858	CGC	2	6	207238	207243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666686
4472	NC_012858	GGT	2	6	207263	207268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241666686
4473	NC_012858	CG	3	6	207322	207327	0 %	0 %	50 %	50 %	241666686
4474	NC_012858	GGCC	2	8	207363	207370	0 %	0 %	50 %	50 %	241666686
4475	NC_012858	GT	3	6	207417	207422	0 %	50 %	50 %	0 %	241666686
4476	NC_012858	TCGATC	2	12	207426	207437	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	241666686
4477	NC_012858	GCT	2	6	207442	207447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666686
4478	NC_012858	GGC	2	6	207451	207456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666686
4479	NC_012858	CT	3	6	207462	207467	0 %	50 %	0 %	50 %	241666686
4480	NC_012858	CCT	2	6	207576	207581	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241666687
4481	NC_012858	GTT	2	6	207675	207680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241666687
4482	NC_012858	ATC	2	6	207692	207697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666687
4483	NC_012858	GCG	2	6	207754	207759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666687
4484	NC_012858	GCCG	2	8	207766	207773	0 %	0 %	50 %	50 %	241666687
4485	NC_012858	GCGTC	2	10	207774	207783	0 %	20 %	40 %	40 %	241666687
4486	NC_012858	GAT	2	6	207853	207858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666687
4487	NC_012858	CCT	2	6	207882	207887	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241666687
4488	NC_012858	GCC	3	9	207994	208002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666687
4489	NC_012858	TGC	2	6	208024	208029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666687
4490	NC_012858	TCG	2	6	208085	208090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666687
4491	NC_012858	GCA	2	6	208103	208108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666687
4492	NC_012858	GAC	3	9	208135	208143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666687
4493	NC_012858	GCG	2	6	208169	208174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666687
4494	NC_012858	CGA	2	6	208176	208181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666687
4495	NC_012858	CAT	2	6	208197	208202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666687
4496	NC_012858	ATC	2	6	208255	208260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666687
4497	NC_012858	CGC	2	6	208285	208290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666687
4498	NC_012858	CGC	2	6	208299	208304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666687
4499	NC_012858	GC	3	6	208303	208308	0 %	0 %	50 %	50 %	241666687
4500	NC_012858	ATG	2	6	208325	208330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666687

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