MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132502

Total Repeats: 13117

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_012858	ATC	2	6	118515	118520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666603
2502	NC_012858	GCC	2	6	118557	118562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666603
2503	NC_012858	GCT	2	6	118575	118580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666604
2504	NC_012858	GAG	2	6	118615	118620	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241666604
2505	NC_012858	CGA	2	6	118638	118643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666604
2506	NC_012858	GCC	2	6	118730	118735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666604
2507	NC_012858	GCC	2	6	118743	118748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666604
2508	NC_012858	AG	3	6	118764	118769	50 %	0 %	50 %	0 %	241666604
2509	NC_012858	TGC	2	6	118886	118891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666604
2510	NC_012858	TGC	2	6	118916	118921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666604
2511	NC_012858	TGC	2	6	118944	118949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666604
2512	NC_012858	CCG	2	6	118964	118969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666604
2513	NC_012858	TCG	2	6	118982	118987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666604
2514	NC_012858	CGG	2	6	119031	119036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666604
2515	NC_012858	TCG	2	6	119087	119092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666604
2516	NC_012858	CGA	2	6	119105	119110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666604
2517	NC_012858	CGT	3	9	119121	119129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666604
2518	NC_012858	TCA	2	6	119192	119197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666604
2519	NC_012858	CAT	2	6	119241	119246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666604
2520	NC_012858	TGG	2	6	119261	119266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241666604
2521	NC_012858	GAA	2	6	119316	119321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241666604
2522	NC_012858	CCT	2	6	119330	119335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241666604
2523	NC_012858	GGA	2	6	119350	119355	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241666604
2524	NC_012858	GACG	2	8	119366	119373	25 %	0 %	50 %	25 %	241666604
2525	NC_012858	GCG	2	6	119433	119438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666605
2526	NC_012858	CG	3	6	119437	119442	0 %	0 %	50 %	50 %	241666605
2527	NC_012858	GCCG	2	8	119463	119470	0 %	0 %	50 %	50 %	241666605
2528	NC_012858	ACC	2	6	119508	119513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241666605
2529	NC_012858	GGCC	2	8	119571	119578	0 %	0 %	50 %	50 %	241666605
2530	NC_012858	GGC	2	6	119585	119590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666605
2531	NC_012858	CCG	2	6	119596	119601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666605
2532	NC_012858	CCG	2	6	119615	119620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666605
2533	NC_012858	GAT	2	6	119630	119635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666605
2534	NC_012858	CAT	2	6	119682	119687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666605
2535	NC_012858	CGC	2	6	119741	119746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666605
2536	NC_012858	CTG	2	6	119757	119762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666605
2537	NC_012858	TCG	2	6	119788	119793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666605
2538	NC_012858	CGG	2	6	119819	119824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666605
2539	NC_012858	CCAGCG	2	12	119825	119836	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241666605
2540	NC_012858	CG	4	8	119846	119853	0 %	0 %	50 %	50 %	241666605
2541	NC_012858	TCG	2	6	119878	119883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666605
2542	NC_012858	CGA	2	6	119885	119890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666605
2543	NC_012858	GTCC	2	8	119912	119919	0 %	25 %	25 %	50 %	241666605
2544	NC_012858	GCTT	2	8	119971	119978	0 %	50 %	25 %	25 %	241666605
2545	NC_012858	CTG	2	6	120108	120113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666605
2546	NC_012858	CGA	2	6	120146	120151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666605
2547	NC_012858	GGA	2	6	120182	120187	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241666605
2548	NC_012858	CGC	2	6	120192	120197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666605
2549	NC_012858	GAC	2	6	120216	120221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666605
2550	NC_012858	TCG	2	6	120223	120228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666605
2551	NC_012858	TGC	2	6	120336	120341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666606
2552	NC_012858	AGC	2	6	120399	120404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666606
2553	NC_012858	TGA	2	6	120444	120449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666606
2554	NC_012858	GGA	2	6	120469	120474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241666606
2555	NC_012858	GGATC	2	10	120496	120505	20 %	20 %	40 %	20 %	241666606
2556	NC_012858	CGG	2	6	120535	120540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666606
2557	NC_012858	GC	3	6	120562	120567	0 %	0 %	50 %	50 %	241666606
2558	NC_012858	TCG	2	6	120603	120608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666606
2559	NC_012858	GCCG	2	8	120619	120626	0 %	0 %	50 %	50 %	241666606
2560	NC_012858	CGA	2	6	120676	120681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666606
2561	NC_012858	CATC	2	8	120694	120701	25 %	25 %	0 %	50 %	241666606
2562	NC_012858	GGCGA	2	10	120713	120722	20 %	0 %	60 %	20 %	241666606
2563	NC_012858	CGC	2	6	120832	120837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666606
2564	NC_012858	CGG	2	6	120856	120861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666606
2565	NC_012858	GTC	2	6	120877	120882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666606
2566	NC_012858	CG	3	6	120948	120953	0 %	0 %	50 %	50 %	241666606
2567	NC_012858	CGG	2	6	120967	120972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666606
2568	NC_012858	CGCC	2	8	120973	120980	0 %	0 %	25 %	75 %	241666606
2569	NC_012858	CTGG	2	8	120988	120995	0 %	25 %	50 %	25 %	241666606
2570	NC_012858	GCGG	2	8	121037	121044	0 %	0 %	75 %	25 %	241666607
2571	NC_012858	GCG	2	6	121055	121060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666607
2572	NC_012858	CAG	2	6	121121	121126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666607
2573	NC_012858	TCGCCG	2	12	121140	121151	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	241666607
2574	NC_012858	TGC	2	6	121200	121205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666607
2575	NC_012858	CGG	2	6	121222	121227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666607
2576	NC_012858	GTC	2	6	121319	121324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666607
2577	NC_012858	TTC	2	6	121386	121391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241666607
2578	NC_012858	ATC	2	6	121397	121402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666607
2579	NC_012858	TGG	2	6	121471	121476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241666607
2580	NC_012858	ATC	2	6	121512	121517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666607
2581	NC_012858	GAT	2	6	121523	121528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666607
2582	NC_012858	ACCG	2	8	121574	121581	25 %	0 %	25 %	50 %	241666607
2583	NC_012858	GC	3	6	121586	121591	0 %	0 %	50 %	50 %	241666607
2584	NC_012858	TGC	2	6	121662	121667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666607
2585	NC_012858	CCT	2	6	121693	121698	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241666607
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2587	NC_012858	GGT	2	6	121762	121767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241666607
2588	NC_012858	AAT	2	6	121934	121939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	241666608
2589	NC_012858	CGC	2	6	121958	121963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666608
2590	NC_012858	TGAT	2	8	121998	122005	25 %	50 %	25 %	0 %	241666608
2591	NC_012858	GAG	2	6	122066	122071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241666608
2592	NC_012858	ACG	2	6	122088	122093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666608
2593	NC_012858	ATGTC	2	10	122232	122241	20 %	40 %	20 %	20 %	241666609
2594	NC_012858	CCA	2	6	122255	122260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241666609
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2597	NC_012858	CCA	2	6	122354	122359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241666609
2598	NC_012858	TG	3	6	122365	122370	0 %	50 %	50 %	0 %	241666609
2599	NC_012858	GA	3	6	122371	122376	50 %	0 %	50 %	0 %	241666609
2600	NC_012858	GAC	2	6	122436	122441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666609
2601	NC_012858	CGGC	2	8	122473	122480	0 %	0 %	50 %	50 %	241666609
2602	NC_012858	GCT	2	6	122582	122587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666609
2603	NC_012858	TCG	2	6	122593	122598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666609
2604	NC_012858	GCA	2	6	122654	122659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666609
2605	NC_012858	ACC	3	9	122701	122709	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241666609
2606	NC_012858	CGT	2	6	122717	122722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666609
2607	NC_012858	CGA	2	6	122753	122758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666609
2608	NC_012858	ACC	2	6	122851	122856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241666609
2609	NC_012858	GC	3	6	122883	122888	0 %	0 %	50 %	50 %	241666609
2610	NC_012858	ACCG	2	8	122904	122911	25 %	0 %	25 %	50 %	241666609
2611	NC_012858	GGC	2	6	122916	122921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666609
2612	NC_012858	CTCC	2	8	122939	122946	0 %	25 %	0 %	75 %	241666609
2613	NC_012858	CGC	2	6	122960	122965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666609
2614	NC_012858	GGC	2	6	122972	122977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666609
2615	NC_012858	GCA	2	6	122978	122983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666609
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2617	NC_012858	CAG	2	6	123029	123034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666609
2618	NC_012858	GCC	2	6	123055	123060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666609
2619	NC_012858	CATC	2	8	123105	123112	25 %	25 %	0 %	50 %	241666609
2620	NC_012858	CGG	2	6	123124	123129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666609
2621	NC_012858	CTTT	2	8	123329	123336	0 %	75 %	0 %	25 %	241666610
2622	NC_012858	T	6	6	123354	123359	0 %	100 %	0 %	0 %	241666610
2623	NC_012858	CGC	2	6	123365	123370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666610
2624	NC_012858	CCT	2	6	123449	123454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241666610
2625	NC_012858	GCCGA	2	10	123471	123480	20 %	0 %	40 %	40 %	241666610
2626	NC_012858	GCG	2	6	123499	123504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666610
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2629	NC_012858	TCG	2	6	123587	123592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666610
2630	NC_012858	GAG	2	6	123616	123621	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241666610
2631	NC_012858	GAC	2	6	123627	123632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666610
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2633	NC_012858	ACCA	2	8	123748	123755	50 %	0 %	0 %	50 %	241666610
2634	NC_012858	GAC	2	6	123766	123771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666610
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2641	NC_012858	ATC	2	6	124132	124137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666610
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2651	NC_012858	GC	3	6	124642	124647	0 %	0 %	50 %	50 %	241666610
2652	NC_012858	GGT	2	6	124653	124658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241666610
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2656	NC_012858	GCA	2	6	124983	124988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666611
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2659	NC_012858	TGGCA	2	10	125127	125136	20 %	20 %	40 %	20 %	241666611
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2669	NC_012858	CGA	2	6	125499	125504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666611
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2863	NC_012858	CGT	2	6	134785	134790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666623
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2982	NC_012858	CGA	2	6	139905	139910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666627
2983	NC_012858	TC	3	6	139911	139916	0 %	50 %	0 %	50 %	241666627
2984	NC_012858	TCG	2	6	139976	139981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666627
2985	NC_012858	ACC	2	6	139987	139992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241666627
2986	NC_012858	CGC	2	6	140004	140009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666627
2987	NC_012858	GTC	2	6	140017	140022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666627
2988	NC_012858	CGAT	2	8	140132	140139	25 %	25 %	25 %	25 %	241666627
2989	NC_012858	GCC	2	6	140260	140265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666627
2990	NC_012858	TCT	2	6	140318	140323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241666627
2991	NC_012858	TGA	2	6	140397	140402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666628
2992	NC_012858	CAA	2	6	140414	140419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241666628
2993	NC_012858	CGAA	2	8	140613	140620	50 %	0 %	25 %	25 %	241666628
2994	NC_012858	TCG	2	6	140631	140636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666628
2995	NC_012858	CCAT	2	8	140694	140701	25 %	25 %	0 %	50 %	241666628
2996	NC_012858	CGA	2	6	140719	140724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666628
2997	NC_012858	CGCGC	2	10	140758	140767	0 %	0 %	40 %	60 %	241666628
2998	NC_012858	GCT	2	6	140818	140823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666628
2999	NC_012858	CGA	2	6	140850	140855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666628
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