MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132502

Total Repeats: 13117

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_012858	AGGA	2	8	50682	50689	50 %	0 %	50 %	0 %	241666539
1002	NC_012858	GAT	2	6	50726	50731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666539
1003	NC_012858	CG	3	6	50929	50934	0 %	0 %	50 %	50 %	241666540
1004	NC_012858	GGCCT	2	10	50940	50949	0 %	20 %	40 %	40 %	241666540
1005	NC_012858	CAGG	2	8	50969	50976	25 %	0 %	50 %	25 %	241666540
1006	NC_012858	AAGG	2	8	51012	51019	50 %	0 %	50 %	0 %	241666540
1007	NC_012858	CGA	2	6	51047	51052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666540
1008	NC_012858	GCG	2	6	51072	51077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666540
1009	NC_012858	GCC	2	6	51106	51111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666540
1010	NC_012858	GCCT	2	8	51216	51223	0 %	25 %	25 %	50 %	241666540
1011	NC_012858	GAC	2	6	51282	51287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666540
1012	NC_012858	CG	3	6	51321	51326	0 %	0 %	50 %	50 %	241666540
1013	NC_012858	CCGC	2	8	51365	51372	0 %	0 %	25 %	75 %	241666540
1014	NC_012858	CGT	2	6	51384	51389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666540
1015	NC_012858	CG	3	6	51405	51410	0 %	0 %	50 %	50 %	241666540
1016	NC_012858	GCA	2	6	51412	51417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666540
1017	NC_012858	TTG	2	6	51424	51429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241666540
1018	NC_012858	AC	3	6	51441	51446	50 %	0 %	0 %	50 %	241666540
1019	NC_012858	CGG	2	6	51455	51460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666540
1020	NC_012858	CGA	2	6	51515	51520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666540
1021	NC_012858	ACG	2	6	51589	51594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666540
1022	NC_012858	GCG	2	6	51616	51621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666540
1023	NC_012858	CGC	2	6	51624	51629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666540
1024	NC_012858	GTC	2	6	51724	51729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666541
1025	NC_012858	GCT	3	9	51750	51758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666541
1026	NC_012858	ATCG	2	8	51823	51830	25 %	25 %	25 %	25 %	241666541
1027	NC_012858	GATA	2	8	51864	51871	50 %	25 %	25 %	0 %	241666541
1028	NC_012858	ACG	2	6	51899	51904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666541
1029	NC_012858	CGG	2	6	51909	51914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666541
1030	NC_012858	GC	3	6	51986	51991	0 %	0 %	50 %	50 %	241666541
1031	NC_012858	CAT	2	6	52060	52065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666541
1032	NC_012858	TCG	2	6	52133	52138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666541
1033	NC_012858	ATC	2	6	52142	52147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666541
1034	NC_012858	GCC	2	6	52156	52161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666541
1035	NC_012858	CGG	2	6	52206	52211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666541
1036	NC_012858	TGA	2	6	52272	52277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666541
1037	NC_012858	GCC	2	6	52395	52400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666541
1038	NC_012858	GGC	2	6	52421	52426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666541
1039	NC_012858	GAT	2	6	52453	52458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666541
1040	NC_012858	GAT	2	6	52492	52497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666541
1041	NC_012858	GGAG	2	8	52516	52523	25 %	0 %	75 %	0 %	241666541
1042	NC_012858	AG	3	6	52522	52527	50 %	0 %	50 %	0 %	241666541
1043	NC_012858	ATCC	2	8	52590	52597	25 %	25 %	0 %	50 %	241666542
1044	NC_012858	CTT	2	6	52600	52605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241666542
1045	NC_012858	CAT	2	6	52642	52647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666542
1046	NC_012858	CGA	2	6	52648	52653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666542
1047	NC_012858	CA	3	6	52657	52662	50 %	0 %	0 %	50 %	241666542
1048	NC_012858	CGG	2	6	52672	52677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666542
1049	NC_012858	CG	3	6	52725	52730	0 %	0 %	50 %	50 %	241666542
1050	NC_012858	ATC	2	6	52732	52737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666542
1051	NC_012858	ACG	2	6	52757	52762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666542
1052	NC_012858	ATG	2	6	52832	52837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666542
1053	NC_012858	GAT	2	6	52846	52851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666542
1054	NC_012858	GCC	2	6	52933	52938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666542
1055	NC_012858	CG	3	6	53159	53164	0 %	0 %	50 %	50 %	241666543
1056	NC_012858	GCC	2	6	53182	53187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666543
1057	NC_012858	TGG	2	6	53198	53203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241666543
1058	NC_012858	GGA	2	6	53217	53222	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241666543
1059	NC_012858	AGGC	2	8	53317	53324	25 %	0 %	50 %	25 %	241666543
1060	NC_012858	AGA	2	6	53352	53357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241666543
1061	NC_012858	CG	3	6	53358	53363	0 %	0 %	50 %	50 %	241666543
1062	NC_012858	ACG	3	9	53380	53388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666543
1063	NC_012858	CGG	2	6	53442	53447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666543
1064	NC_012858	CGA	2	6	53460	53465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666543
1065	NC_012858	GCA	2	6	53617	53622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666544
1066	NC_012858	TCG	2	6	53664	53669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666544
1067	NC_012858	CT	3	6	53682	53687	0 %	50 %	0 %	50 %	241666544
1068	NC_012858	GCA	2	6	53878	53883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666544
1069	NC_012858	GTC	2	6	53899	53904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666544
1070	NC_012858	TGG	2	6	53924	53929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241666544
1071	NC_012858	CCG	2	6	53930	53935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666544
1072	NC_012858	TCT	2	6	53958	53963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241666544
1073	NC_012858	TCG	2	6	53981	53986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666544
1074	NC_012858	CGC	2	6	54048	54053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666544
1075	NC_012858	TCG	2	6	54098	54103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666544
1076	NC_012858	GAT	2	6	54186	54191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666544
1077	NC_012858	CG	3	6	54209	54214	0 %	0 %	50 %	50 %	241666544
1078	NC_012858	TCG	2	6	54230	54235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666544
1079	NC_012858	GAT	2	6	54259	54264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666544
1080	NC_012858	GCT	2	6	54333	54338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666544
1081	NC_012858	ATA	2	6	54350	54355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	241666544
1082	NC_012858	GCG	2	6	54370	54375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666544
1083	NC_012858	CGA	2	6	54438	54443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666544
1084	NC_012858	GAAG	2	8	54444	54451	50 %	0 %	50 %	0 %	241666544
1085	NC_012858	CG	3	6	54460	54465	0 %	0 %	50 %	50 %	241666544
1086	NC_012858	GGC	2	6	54520	54525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666544
1087	NC_012858	TGC	2	6	54582	54587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666544
1088	NC_012858	GCG	2	6	54631	54636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666544
1089	NC_012858	CCGGCA	2	12	54683	54694	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241666544
1090	NC_012858	GTC	2	6	54718	54723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666544
1091	NC_012858	GAA	2	6	54732	54737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241666544
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1093	NC_012858	ATC	2	6	54811	54816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666544
1094	NC_012858	CG	3	6	54827	54832	0 %	0 %	50 %	50 %	241666544
1095	NC_012858	T	6	6	54854	54859	0 %	100 %	0 %	0 %	241666544
1096	NC_012858	AGA	2	6	54887	54892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241666544
1097	NC_012858	CCA	2	6	54908	54913	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241666544
1098	NC_012858	CTT	2	6	54918	54923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241666544
1099	NC_012858	CGG	2	6	54944	54949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666544
1100	NC_012858	CCG	2	6	54965	54970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666544
1101	NC_012858	AAT	2	6	54985	54990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	241666544
1102	NC_012858	ACG	2	6	54997	55002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666544
1103	NC_012858	TCG	2	6	55037	55042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666544
1104	NC_012858	GCC	2	6	55069	55074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666544
1105	NC_012858	ACA	2	6	55085	55090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241666545
1106	NC_012858	CGT	2	6	55098	55103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666545
1107	NC_012858	AGGC	2	8	55109	55116	25 %	0 %	50 %	25 %	241666545
1108	NC_012858	TC	3	6	55131	55136	0 %	50 %	0 %	50 %	241666545
1109	NC_012858	CGC	2	6	55139	55144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666545
1110	NC_012858	CGA	2	6	55155	55160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666545
1111	NC_012858	GGCT	2	8	55166	55173	0 %	25 %	50 %	25 %	241666545
1112	NC_012858	CCGC	2	8	55224	55231	0 %	0 %	25 %	75 %	241666545
1113	NC_012858	GCC	2	6	55276	55281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666545
1114	NC_012858	TCA	2	6	55355	55360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666545
1115	NC_012858	GTC	2	6	55432	55437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666545
1116	NC_012858	AGTGA	2	10	55444	55453	40 %	20 %	40 %	0 %	241666545
1117	NC_012858	GGC	2	6	55467	55472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666545
1118	NC_012858	CGG	3	9	55521	55529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666545
1119	NC_012858	GCG	2	6	55535	55540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666545
1120	NC_012858	GGC	2	6	55557	55562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666545
1121	NC_012858	CTCG	2	8	55563	55570	0 %	25 %	25 %	50 %	241666545
1122	NC_012858	CGG	2	6	55605	55610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666545
1123	NC_012858	GCC	3	9	55639	55647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666545
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1125	NC_012858	TGG	2	6	55955	55960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241666545
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1236	NC_012858	CCAT	2	8	61498	61505	25 %	25 %	0 %	50 %	241666549
1237	NC_012858	GCA	2	6	61553	61558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666549
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1240	NC_012858	GCC	2	6	61750	61755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666549
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1243	NC_012858	GCTG	2	8	61910	61917	0 %	25 %	50 %	25 %	241666549
1244	NC_012858	CGA	2	6	61946	61951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666549
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1246	NC_012858	GAT	2	6	62001	62006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666549
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1248	NC_012858	GC	3	6	62049	62054	0 %	0 %	50 %	50 %	241666550
1249	NC_012858	GGC	2	6	62068	62073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666550
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1369	NC_012858	GTT	2	6	67515	67520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241666554
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1373	NC_012858	ATTC	2	8	67659	67666	25 %	50 %	0 %	25 %	241666554
1374	NC_012858	GA	3	6	67709	67714	50 %	0 %	50 %	0 %	241666554
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1377	NC_012858	ATG	2	6	67770	67775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666554
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1380	NC_012858	GCC	2	6	67908	67913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666555
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1492	NC_012858	ATG	2	6	72602	72607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666559
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1494	NC_012858	TCCC	2	8	72720	72727	0 %	25 %	0 %	75 %	241666559
1495	NC_012858	CAC	2	6	72763	72768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241666559
1496	NC_012858	GAC	2	6	72769	72774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666559
1497	NC_012858	CTG	2	6	72794	72799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666559
1498	NC_012858	CGGCT	2	10	72842	72851	0 %	20 %	40 %	40 %	241666559
1499	NC_012858	GAA	2	6	72889	72894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241666559
1500	NC_012858	TCG	2	6	72942	72947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666559

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