MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132502

Total Repeats: 13117

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_012858	GTC	2	6	656685	656690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241667113
13002	NC_012858	CGG	2	6	656701	656706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241667113
13003	NC_012858	CGC	2	6	656713	656718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241667113
13004	NC_012858	GC	3	6	656717	656722	0 %	0 %	50 %	50 %	241667113
13005	NC_012858	CGT	2	6	656860	656865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241667113
13006	NC_012858	CGA	2	6	656875	656880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667113
13007	NC_012858	GACC	2	8	656903	656910	25 %	0 %	25 %	50 %	241667113
13008	NC_012858	GCC	2	6	656931	656936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241667113
13009	NC_012858	CCG	3	9	656962	656970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241667113
13010	NC_012858	GCG	2	6	657006	657011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241667113
13011	NC_012858	AGCCG	2	10	657050	657059	20 %	0 %	40 %	40 %	241667113
13012	NC_012858	CTG	2	6	657077	657082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241667113
13013	NC_012858	GGCA	2	8	657139	657146	25 %	0 %	50 %	25 %	241667113
13014	NC_012858	ATGA	2	8	657149	657156	50 %	25 %	25 %	0 %	241667113
13015	NC_012858	GCC	2	6	657167	657172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241667113
13016	NC_012858	CGG	2	6	657201	657206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241667113
13017	NC_012858	CGC	2	6	657232	657237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241667113
13018	NC_012858	GCC	2	6	657248	657253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241667113
13019	NC_012858	CG	3	6	657320	657325	0 %	0 %	50 %	50 %	241667113
13020	NC_012858	CGA	2	6	657331	657336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667113
13021	NC_012858	CGC	2	6	657338	657343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241667113
13022	NC_012858	CGG	2	6	657355	657360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241667113
13023	NC_012858	TGG	2	6	657397	657402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241667113
13024	NC_012858	CAT	2	6	657470	657475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241667113
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13026	NC_012858	CTC	2	6	657515	657520	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241667113
13027	NC_012858	GGCG	2	8	657544	657551	0 %	0 %	75 %	25 %	241667113
13028	NC_012858	GTC	2	6	657638	657643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241667113
13029	NC_012858	GGC	2	6	657673	657678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241667113
13030	NC_012858	AGC	2	6	657708	657713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667113
13031	NC_012858	CCG	2	6	657730	657735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241667113
13032	NC_012858	GCC	2	6	657773	657778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241667113
13033	NC_012858	TCG	2	6	657792	657797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241667113
13034	NC_012858	CG	3	6	657808	657813	0 %	0 %	50 %	50 %	241667113
13035	NC_012858	CGGC	2	8	657822	657829	0 %	0 %	50 %	50 %	241667113
13036	NC_012858	CAG	2	6	657872	657877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667113
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13039	NC_012858	GTA	2	6	658010	658015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241667113
13040	NC_012858	CAG	2	6	658040	658045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667113
13041	NC_012858	ATC	2	6	658125	658130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241667113
13042	NC_012858	GC	3	6	658134	658139	0 %	0 %	50 %	50 %	241667113
13043	NC_012858	CGC	2	6	658159	658164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241667113
13044	NC_012858	CGT	2	6	658169	658174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241667113
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13050	NC_012858	CGT	2	6	658337	658342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241667113
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13052	NC_012858	GGA	2	6	658364	658369	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241667113
13053	NC_012858	CGA	2	6	658461	658466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667114
13054	NC_012858	CAGC	2	8	658468	658475	25 %	0 %	25 %	50 %	241667114
13055	NC_012858	GGC	2	6	658476	658481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241667114
13056	NC_012858	GTG	2	6	658492	658497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241667114
13057	NC_012858	GCC	2	6	658556	658561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241667114
13058	NC_012858	CGC	2	6	658599	658604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241667114
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13060	NC_012858	TCGG	2	8	658623	658630	0 %	25 %	50 %	25 %	241667114
13061	NC_012858	TGGGC	2	10	658688	658697	0 %	20 %	60 %	20 %	241667115
13062	NC_012858	TCG	2	6	658711	658716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241667115
13063	NC_012858	CG	3	6	658729	658734	0 %	0 %	50 %	50 %	241667115
13064	NC_012858	GCGG	2	8	658755	658762	0 %	0 %	75 %	25 %	241667115
13065	NC_012858	GCG	2	6	658769	658774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241667115
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13067	NC_012858	GAT	2	6	658884	658889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241667115
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13069	NC_012858	CCG	2	6	659047	659052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241667115
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13074	NC_012858	CGA	2	6	659201	659206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667115
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13085	NC_012858	GAT	2	6	659691	659696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241667115
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13089	NC_012858	CGA	2	6	659816	659821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667115
13090	NC_012858	TGA	2	6	659822	659827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241667115
13091	NC_012858	CGT	2	6	659828	659833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241667115
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13099	NC_012858	CGG	2	6	660340	660345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241667116
13100	NC_012858	GCC	3	9	660371	660379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241667116
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13103	NC_012858	CGC	2	6	660456	660461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241667116
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13105	NC_012858	GCG	3	9	660501	660509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241667116
13106	NC_012858	ATG	2	6	660527	660532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241667116
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13108	NC_012858	GC	3	6	660628	660633	0 %	0 %	50 %	50 %	241667116
13109	NC_012858	CAT	2	6	660659	660664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241667116
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13114	NC_012858	GCA	2	6	660829	660834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241667116
13115	NC_012858	CTG	2	6	660845	660850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241667116
13116	NC_012858	CG	4	8	660951	660958	0 %	0 %	50 %	50 %	241667116
13117	NC_012858	GCG	2	6	660961	660966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241667116

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.