MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132502

Total Repeats: 13117

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_012858	GCG	2	6	23765	23770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666516
502	NC_012858	GCG	2	6	23870	23875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666516
503	NC_012858	CGA	2	6	23931	23936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666516
504	NC_012858	TTC	2	6	23941	23946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241666516
505	NC_012858	GC	3	6	23961	23966	0 %	0 %	50 %	50 %	241666516
506	NC_012858	GCT	2	6	24045	24050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666516
507	NC_012858	CG	3	6	24059	24064	0 %	0 %	50 %	50 %	241666516
508	NC_012858	GCCG	2	8	24084	24091	0 %	0 %	50 %	50 %	241666516
509	NC_012858	GAT	2	6	24204	24209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666516
510	NC_012858	GTG	2	6	24213	24218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241666516
511	NC_012858	GC	3	6	24262	24267	0 %	0 %	50 %	50 %	241666516
512	NC_012858	GCC	2	6	24301	24306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666516
513	NC_012858	CAGCG	2	10	24344	24353	20 %	0 %	40 %	40 %	241666516
514	NC_012858	TCGA	2	8	24481	24488	25 %	25 %	25 %	25 %	241666517
515	NC_012858	TCT	2	6	24497	24502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241666517
516	NC_012858	GCCG	2	8	24662	24669	0 %	0 %	50 %	50 %	241666517
517	NC_012858	AGC	2	6	24715	24720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666517
518	NC_012858	CAT	2	6	24727	24732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666517
519	NC_012858	TAC	2	6	24877	24882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666518
520	NC_012858	ACG	2	6	25003	25008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666518
521	NC_012858	AAG	2	6	25071	25076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241666518
522	NC_012858	ATC	2	6	25092	25097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666518
523	NC_012858	CGA	2	6	25154	25159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666518
524	NC_012858	CGA	2	6	25184	25189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666518
525	NC_012858	GGC	2	6	25258	25263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666518
526	NC_012858	TTCG	2	8	25265	25272	0 %	50 %	25 %	25 %	241666518
527	NC_012858	CAT	2	6	25289	25294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666518
528	NC_012858	CGA	3	9	25412	25420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666518
529	NC_012858	GCG	2	6	25460	25465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666518
530	NC_012858	GGC	2	6	25472	25477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666518
531	NC_012858	GTC	2	6	25491	25496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666518
532	NC_012858	CAT	2	6	25537	25542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666518
533	NC_012858	GGC	2	6	25584	25589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666519
534	NC_012858	GTC	2	6	25607	25612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666519
535	NC_012858	TGA	2	6	25623	25628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666519
536	NC_012858	GAA	2	6	25838	25843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241666519
537	NC_012858	GGCCA	2	10	25877	25886	20 %	0 %	40 %	40 %	241666519
538	NC_012858	CGA	2	6	25903	25908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666519
539	NC_012858	TCG	2	6	26049	26054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666519
540	NC_012858	CGC	2	6	26085	26090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666519
541	NC_012858	CGAT	2	8	26145	26152	25 %	25 %	25 %	25 %	241666519
542	NC_012858	GGCG	2	8	26165	26172	0 %	0 %	75 %	25 %	241666519
543	NC_012858	CGC	2	6	26205	26210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666519
544	NC_012858	CG	3	6	26228	26233	0 %	0 %	50 %	50 %	241666519
545	NC_012858	CGA	2	6	26245	26250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666519
546	NC_012858	GCC	2	6	26285	26290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666519
547	NC_012858	TCAA	2	8	26351	26358	50 %	25 %	0 %	25 %	241666519
548	NC_012858	GACC	2	8	26359	26366	25 %	0 %	25 %	50 %	241666519
549	NC_012858	TCA	2	6	26448	26453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666519
550	NC_012858	GATC	2	8	26455	26462	25 %	25 %	25 %	25 %	241666519
551	NC_012858	TCA	2	6	26484	26489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666519
552	NC_012858	GCC	2	6	26513	26518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666519
553	NC_012858	GC	3	6	26584	26589	0 %	0 %	50 %	50 %	241666519
554	NC_012858	TGA	2	6	26592	26597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666519
555	NC_012858	CGG	2	6	26623	26628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666519
556	NC_012858	CAT	2	6	26638	26643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666519
557	NC_012858	CGA	2	6	26680	26685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666519
558	NC_012858	CCG	2	6	26700	26705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666519
559	NC_012858	GGA	2	6	26710	26715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241666519
560	NC_012858	TTC	2	6	26732	26737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241666519
561	NC_012858	ACG	2	6	26748	26753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666519
562	NC_012858	CGG	2	6	26806	26811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666519
563	NC_012858	CAA	2	6	26824	26829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241666519
564	NC_012858	CCG	2	6	26864	26869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666519
565	NC_012858	GC	3	6	27179	27184	0 %	0 %	50 %	50 %	241666520
566	NC_012858	GC	3	6	27191	27196	0 %	0 %	50 %	50 %	241666520
567	NC_012858	CGG	2	6	27197	27202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666520
568	NC_012858	GTC	2	6	27215	27220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666520
569	NC_012858	AG	3	6	27253	27258	50 %	0 %	50 %	0 %	241666520
570	NC_012858	CGCC	2	8	27289	27296	0 %	0 %	25 %	75 %	241666520
571	NC_012858	GTCA	2	8	27304	27311	25 %	25 %	25 %	25 %	241666520
572	NC_012858	ACC	2	6	27356	27361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241666520
573	NC_012858	ACC	2	6	27369	27374	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241666520
574	NC_012858	CGA	2	6	27379	27384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666520
575	NC_012858	ATC	2	6	27386	27391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666520
576	NC_012858	CCTTCA	2	12	27408	27419	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	241666520
577	NC_012858	GAT	2	6	27422	27427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666520
578	NC_012858	TCG	2	6	27444	27449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666520
579	NC_012858	CGG	2	6	27457	27462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666520
580	NC_012858	CCCG	2	8	27487	27494	0 %	0 %	25 %	75 %	241666520
581	NC_012858	CGATG	2	10	27520	27529	20 %	20 %	40 %	20 %	241666520
582	NC_012858	CGG	2	6	27579	27584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666520
583	NC_012858	ATC	2	6	27590	27595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666520
584	NC_012858	TCG	2	6	27729	27734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666520
585	NC_012858	GAC	2	6	27773	27778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666520
586	NC_012858	GCT	2	6	27787	27792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666520
587	NC_012858	TCGA	2	8	27801	27808	25 %	25 %	25 %	25 %	241666520
588	NC_012858	ACG	2	6	27816	27821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666520
589	NC_012858	GCCA	2	8	27851	27858	25 %	0 %	25 %	50 %	241666520
590	NC_012858	ATC	2	6	27909	27914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666520
591	NC_012858	GCC	2	6	27954	27959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666520
592	NC_012858	TGG	2	6	27968	27973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241666520
593	NC_012858	ACG	2	6	27999	28004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666520
594	NC_012858	GCC	2	6	28051	28056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666520
595	NC_012858	GAC	2	6	28364	28369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666521
596	NC_012858	CG	4	8	28402	28409	0 %	0 %	50 %	50 %	241666521
597	NC_012858	CGTG	2	8	29093	29100	0 %	25 %	50 %	25 %	241666522
598	NC_012858	TGG	2	6	29134	29139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241666522
599	NC_012858	GCG	2	6	29155	29160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666522
600	NC_012858	CGG	2	6	29201	29206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666522
601	NC_012858	GCTGAC	2	12	29228	29239	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241666522
602	NC_012858	CCTT	2	8	29266	29273	0 %	50 %	0 %	50 %	241666522
603	NC_012858	CGG	2	6	29303	29308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666522
604	NC_012858	GCCG	2	8	29310	29317	0 %	0 %	50 %	50 %	241666522
605	NC_012858	CAT	2	6	29318	29323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666522
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607	NC_012858	CATC	2	8	29552	29559	25 %	25 %	0 %	50 %	241666522
608	NC_012858	ACTC	2	8	29582	29589	25 %	25 %	0 %	50 %	241666522
609	NC_012858	CCG	2	6	29651	29656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666522
610	NC_012858	AGCAG	2	10	29687	29696	40 %	0 %	40 %	20 %	241666522
611	NC_012858	GCA	2	6	29723	29728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666522
612	NC_012858	CGC	2	6	29770	29775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666522
613	NC_012858	CGT	2	6	29893	29898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666523
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615	NC_012858	GGCCA	2	10	29960	29969	20 %	0 %	40 %	40 %	241666523
616	NC_012858	TCG	2	6	30003	30008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666523
617	NC_012858	CTC	2	6	30019	30024	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241666523
618	NC_012858	GAAG	2	8	30049	30056	50 %	0 %	50 %	0 %	241666523
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620	NC_012858	CGG	2	6	30142	30147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666523
621	NC_012858	CAA	2	6	30163	30168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241666523
622	NC_012858	CAT	2	6	30175	30180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666523
623	NC_012858	CCG	2	6	30181	30186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666523
624	NC_012858	CTT	2	6	30253	30258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241666523
625	NC_012858	GCAG	2	8	30265	30272	25 %	0 %	50 %	25 %	241666523
626	NC_012858	GCC	2	6	30276	30281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666523
627	NC_012858	ATC	2	6	30308	30313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666523
628	NC_012858	GCT	2	6	30325	30330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666523
629	NC_012858	GGC	2	6	30341	30346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666523
630	NC_012858	GCT	2	6	30400	30405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666523
631	NC_012858	CGTCAA	2	12	30430	30441	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	241666523
632	NC_012858	CAA	2	6	30469	30474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241666523
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636	NC_012858	CGG	2	6	30562	30567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666523
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645	NC_012858	GC	3	6	31060	31065	0 %	0 %	50 %	50 %	241666524
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649	NC_012858	GCC	2	6	31214	31219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666524
650	NC_012858	GCG	2	6	31234	31239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666524
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657	NC_012858	GCG	2	6	31466	31471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666524
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660	NC_012858	GCGCC	2	10	31534	31543	0 %	0 %	40 %	60 %	241666524
661	NC_012858	CG	3	6	31570	31575	0 %	0 %	50 %	50 %	241666524
662	NC_012858	GGCTTC	2	12	31644	31655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666525
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664	NC_012858	GCG	2	6	31733	31738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666525
665	NC_012858	CGA	2	6	31771	31776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666525
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737	NC_012858	ACATC	2	10	36961	36970	40 %	20 %	0 %	40 %	241666527
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742	NC_012858	AGC	2	6	37325	37330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666527
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744	NC_012858	GCC	2	6	37667	37672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666528
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746	NC_012858	GC	3	6	37770	37775	0 %	0 %	50 %	50 %	241666528
747	NC_012858	GAAG	2	8	37801	37808	50 %	0 %	50 %	0 %	241666528
748	NC_012858	AGCA	2	8	38069	38076	50 %	0 %	25 %	25 %	241666529
749	NC_012858	CGA	2	6	38092	38097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666529
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752	NC_012858	GTC	2	6	38198	38203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666529
753	NC_012858	CGTTGG	2	12	38465	38476	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	241666530
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755	NC_012858	CGA	2	6	38650	38655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666530
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875	NC_012858	GAG	2	6	44952	44957	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241666534
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