MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132502

Total Repeats: 13117

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_012858	CCGGCA	2	12	255299	255310	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241666726
5502	NC_012858	CAC	2	6	255319	255324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241666726
5503	NC_012858	GATC	2	8	255412	255419	25 %	25 %	25 %	25 %	241666726
5504	NC_012858	CCA	2	6	255522	255527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241666726
5505	NC_012858	TCG	2	6	255650	255655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666726
5506	NC_012858	TGA	2	6	255717	255722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666726
5507	NC_012858	GCC	2	6	255741	255746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666726
5508	NC_012858	CG	3	6	255795	255800	0 %	0 %	50 %	50 %	241666726
5509	NC_012858	GCTCG	2	10	255853	255862	0 %	20 %	40 %	40 %	241666726
5510	NC_012858	GAT	2	6	255891	255896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666726
5511	NC_012858	CT	3	6	255918	255923	0 %	50 %	0 %	50 %	241666726
5512	NC_012858	CAGCTG	2	12	255970	255981	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241666726
5513	NC_012858	GGC	2	6	255986	255991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666726
5514	NC_012858	AGC	2	6	256028	256033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666726
5515	NC_012858	CTCAC	2	10	256058	256067	20 %	20 %	0 %	60 %	241666726
5516	NC_012858	CGT	2	6	256069	256074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666726
5517	NC_012858	CAT	2	6	256075	256080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666726
5518	NC_012858	CAG	2	6	256143	256148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666726
5519	NC_012858	CGG	2	6	256281	256286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666726
5520	NC_012858	AGA	2	6	256324	256329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241666726
5521	NC_012858	CCTGT	2	10	256364	256373	0 %	40 %	20 %	40 %	241666726
5522	NC_012858	TCGT	2	8	256403	256410	0 %	50 %	25 %	25 %	241666726
5523	NC_012858	GGC	2	6	256432	256437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666726
5524	NC_012858	GAT	2	6	256488	256493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666726
5525	NC_012858	GACA	2	8	256838	256845	50 %	0 %	25 %	25 %	241666727
5526	NC_012858	GC	3	6	256872	256877	0 %	0 %	50 %	50 %	241666727
5527	NC_012858	CGC	2	6	256888	256893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666727
5528	NC_012858	TGC	2	6	256916	256921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666727
5529	NC_012858	CGG	2	6	256953	256958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666727
5530	NC_012858	CGA	2	6	257025	257030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666727
5531	NC_012858	CTG	2	6	257032	257037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666727
5532	NC_012858	TGA	2	6	257092	257097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666727
5533	NC_012858	ATG	2	6	257133	257138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666728
5534	NC_012858	GGC	2	6	257144	257149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666728
5535	NC_012858	TCG	2	6	257170	257175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666728
5536	NC_012858	CGGC	2	8	257224	257231	0 %	0 %	50 %	50 %	241666728
5537	NC_012858	TTGT	2	8	257235	257242	0 %	75 %	25 %	0 %	241666728
5538	NC_012858	ACT	2	6	257269	257274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666728
5539	NC_012858	CGG	2	6	257291	257296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666728
5540	NC_012858	GGT	2	6	257333	257338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241666728
5541	NC_012858	CGT	2	6	257351	257356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666728
5542	NC_012858	GCT	2	6	257357	257362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666728
5543	NC_012858	TTG	2	6	257370	257375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241666728
5544	NC_012858	GC	3	6	257430	257435	0 %	0 %	50 %	50 %	241666728
5545	NC_012858	GCCG	2	8	257439	257446	0 %	0 %	50 %	50 %	241666728
5546	NC_012858	AG	3	6	257448	257453	50 %	0 %	50 %	0 %	241666728
5547	NC_012858	CGA	2	6	257508	257513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666728
5548	NC_012858	TAT	2	6	257522	257527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	241666728
5549	NC_012858	TCG	2	6	257541	257546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666728
5550	NC_012858	GC	3	6	257622	257627	0 %	0 %	50 %	50 %	241666728
5551	NC_012858	ATTG	2	8	257696	257703	25 %	50 %	25 %	0 %	241666729
5552	NC_012858	CTG	2	6	257710	257715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666729
5553	NC_012858	TCA	2	6	257726	257731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666729
5554	NC_012858	GAC	2	6	257772	257777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666729
5555	NC_012858	CCA	2	6	257796	257801	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241666729
5556	NC_012858	CG	3	6	257865	257870	0 %	0 %	50 %	50 %	241666729
5557	NC_012858	CGA	2	6	257897	257902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666729
5558	NC_012858	CGC	2	6	257921	257926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666729
5559	NC_012858	CGG	2	6	257948	257953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666729
5560	NC_012858	GGC	2	6	258102	258107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666729
5561	NC_012858	CGGCGC	2	12	258224	258235	0 %	0 %	50 %	50 %	241666729
5562	NC_012858	AGG	2	6	258256	258261	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241666729
5563	NC_012858	TCCG	2	8	258267	258274	0 %	25 %	25 %	50 %	241666729
5564	NC_012858	CTC	2	6	258288	258293	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241666729
5565	NC_012858	CCA	2	6	258466	258471	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241666729
5566	NC_012858	TTC	2	6	258484	258489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241666729
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5569	NC_012858	GTG	2	6	258669	258674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241666729
5570	NC_012858	GAA	2	6	258707	258712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241666729
5571	NC_012858	GAA	2	6	258720	258725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241666729
5572	NC_012858	CGC	2	6	258777	258782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666729
5573	NC_012858	ACCC	2	8	258809	258816	25 %	0 %	0 %	75 %	241666729
5574	NC_012858	CG	3	6	258819	258824	0 %	0 %	50 %	50 %	241666729
5575	NC_012858	CAG	2	6	258897	258902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666729
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5579	NC_012858	GCA	2	6	259008	259013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666730
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5581	NC_012858	GC	3	6	259068	259073	0 %	0 %	50 %	50 %	241666730
5582	NC_012858	GTC	2	6	259091	259096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666730
5583	NC_012858	GCCA	2	8	259150	259157	25 %	0 %	25 %	50 %	241666730
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5587	NC_012858	GAA	2	6	259728	259733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241666731
5588	NC_012858	TCGA	2	8	259756	259763	25 %	25 %	25 %	25 %	241666731
5589	NC_012858	CAG	2	6	259825	259830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666731
5590	NC_012858	CGC	2	6	259992	259997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666732
5591	NC_012858	CTC	3	9	259998	260006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241666732
5592	NC_012858	GC	3	6	260044	260049	0 %	0 %	50 %	50 %	241666732
5593	NC_012858	TGC	2	6	260058	260063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666732
5594	NC_012858	GC	3	6	260077	260082	0 %	0 %	50 %	50 %	241666732
5595	NC_012858	CAGC	2	8	260103	260110	25 %	0 %	25 %	50 %	241666732
5596	NC_012858	GCGT	2	8	260121	260128	0 %	25 %	50 %	25 %	241666732
5597	NC_012858	CTC	2	6	260205	260210	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241666732
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5600	NC_012858	ATA	2	6	260376	260381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	241666732
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5602	NC_012858	GC	3	6	260408	260413	0 %	0 %	50 %	50 %	241666732
5603	NC_012858	A	6	6	260424	260429	100 %	0 %	0 %	0 %	241666732
5604	NC_012858	CGGC	2	8	260431	260438	0 %	0 %	50 %	50 %	241666732
5605	NC_012858	TCA	2	6	260479	260484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666732
5606	NC_012858	GGAAT	2	10	260540	260549	40 %	20 %	40 %	0 %	241666732
5607	NC_012858	GTC	2	6	260578	260583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666732
5608	NC_012858	ACGA	2	8	260593	260600	50 %	0 %	25 %	25 %	241666732
5609	NC_012858	GCC	2	6	260646	260651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666732
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5611	NC_012858	CAG	3	9	260721	260729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666732
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5618	NC_012858	GCG	2	6	261367	261372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666733
5619	NC_012858	CGG	2	6	261377	261382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666733
5620	NC_012858	CCG	2	6	261511	261516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666733
5621	NC_012858	GCG	2	6	261537	261542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666733
5622	NC_012858	TGA	2	6	261550	261555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666733
5623	NC_012858	GAC	2	6	261579	261584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666733
5624	NC_012858	TGTCGA	2	12	261629	261640	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	241666733
5625	NC_012858	GTT	2	6	261657	261662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241666733
5626	NC_012858	GGC	2	6	261672	261677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666733
5627	NC_012858	GTC	2	6	261687	261692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666733
5628	NC_012858	GCG	2	6	261711	261716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666733
5629	NC_012858	TCG	2	6	261736	261741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666733
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5632	NC_012858	TTC	2	6	261841	261846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241666733
5633	NC_012858	ACC	2	6	261869	261874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241666733
5634	NC_012858	TCG	2	6	261949	261954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666733
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5640	NC_012858	GTC	2	6	262724	262729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666734
5641	NC_012858	GC	3	6	262786	262791	0 %	0 %	50 %	50 %	241666734
5642	NC_012858	CGG	2	6	263350	263355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666735
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5649	NC_012858	TCA	2	6	263878	263883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666736
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5653	NC_012858	GGA	2	6	264074	264079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241666736
5654	NC_012858	TGG	2	6	264082	264087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241666736
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5742	NC_012858	ATC	2	6	268392	268397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666740
5743	NC_012858	GCG	3	9	268443	268451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666740
5744	NC_012858	CGCGG	2	10	268463	268472	0 %	0 %	60 %	40 %	241666740
5745	NC_012858	CGG	2	6	268513	268518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666740
5746	NC_012858	TCG	2	6	268548	268553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666740
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5750	NC_012858	GCT	2	6	268729	268734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666740
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5752	NC_012858	CGA	2	6	269712	269717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666741
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5755	NC_012858	CCG	2	6	269855	269860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666741
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5759	NC_012858	GCC	2	6	270017	270022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666741
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5761	NC_012858	TCG	2	6	270188	270193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666741
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5764	NC_012858	GCG	2	6	270323	270328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666741
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5808	NC_012858	CGCC	2	8	272791	272798	0 %	0 %	25 %	75 %	241666745
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5852	NC_012858	CA	3	6	275549	275554	50 %	0 %	0 %	50 %	241666747
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5854	NC_012858	TGC	2	6	275602	275607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666747
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5859	NC_012858	CTG	2	6	275934	275939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666747
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5863	NC_012858	TCCGA	2	10	276085	276094	20 %	20 %	20 %	40 %	241666747
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5986	NC_012858	GCT	2	6	283523	283528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666753
5987	NC_012858	CAGC	2	8	283649	283656	25 %	0 %	25 %	50 %	241666754
5988	NC_012858	ATG	2	6	283680	283685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666754
5989	NC_012858	CCG	2	6	283702	283707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666754
5990	NC_012858	ACC	2	6	283721	283726	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241666754
5991	NC_012858	GTC	2	6	283729	283734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666754
5992	NC_012858	CGA	2	6	283790	283795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666754
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