MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325 plasmid pR132502

Total Repeats: 13117

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_012858	ATC	2	6	231534	231539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666707
5002	NC_012858	GAA	2	6	231545	231550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241666707
5003	NC_012858	GGC	2	6	231557	231562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666707
5004	NC_012858	GCA	2	6	231598	231603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666707
5005	NC_012858	AGC	2	6	231642	231647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666707
5006	NC_012858	ATC	2	6	231657	231662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666707
5007	NC_012858	ACG	2	6	231663	231668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666707
5008	NC_012858	TCGC	2	8	231687	231694	0 %	25 %	25 %	50 %	241666707
5009	NC_012858	C	6	6	231697	231702	0 %	0 %	0 %	100 %	241666707
5010	NC_012858	AGA	2	6	231703	231708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241666707
5011	NC_012858	GCC	2	6	231710	231715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666707
5012	NC_012858	TCA	2	6	231841	231846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666707
5013	NC_012858	CGA	2	6	231859	231864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666707
5014	NC_012858	TCGG	2	8	232093	232100	0 %	25 %	50 %	25 %	241666708
5015	NC_012858	CGA	2	6	232115	232120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666708
5016	NC_012858	GCA	2	6	232136	232141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666708
5017	NC_012858	AGC	2	6	232213	232218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666708
5018	NC_012858	GGCT	2	8	232219	232226	0 %	25 %	50 %	25 %	241666708
5019	NC_012858	CCG	2	6	232236	232241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666708
5020	NC_012858	TGG	2	6	232340	232345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241666708
5021	NC_012858	CGG	2	6	232389	232394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666708
5022	NC_012858	GCA	2	6	232422	232427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666708
5023	NC_012858	CG	3	6	232465	232470	0 %	0 %	50 %	50 %	241666708
5024	NC_012858	GAATGC	2	12	232504	232515	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	241666708
5025	NC_012858	GGC	2	6	232525	232530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666708
5026	NC_012858	T	6	6	232585	232590	0 %	100 %	0 %	0 %	241666708
5027	NC_012858	CCA	2	6	232597	232602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241666708
5028	NC_012858	AGC	2	6	232630	232635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666708
5029	NC_012858	GCC	2	6	232680	232685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666708
5030	NC_012858	GGT	2	6	232713	232718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241666708
5031	NC_012858	GTC	2	6	232734	232739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666708
5032	NC_012858	CGAA	2	8	232822	232829	50 %	0 %	25 %	25 %	241666708
5033	NC_012858	CGC	2	6	232875	232880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666708
5034	NC_012858	GGC	2	6	232891	232896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666708
5035	NC_012858	CG	3	6	232913	232918	0 %	0 %	50 %	50 %	241666708
5036	NC_012858	CACCGT	2	12	232922	232933	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	241666708
5037	NC_012858	A	6	6	232998	233003	100 %	0 %	0 %	0 %	241666708
5038	NC_012858	GCCA	2	8	233026	233033	25 %	0 %	25 %	50 %	241666708
5039	NC_012858	GCTG	2	8	233037	233044	0 %	25 %	50 %	25 %	241666708
5040	NC_012858	TCA	2	6	233048	233053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666708
5041	NC_012858	GAAA	2	8	233063	233070	75 %	0 %	25 %	0 %	241666708
5042	NC_012858	GAAT	2	8	233210	233217	50 %	25 %	25 %	0 %	241666708
5043	NC_012858	CTC	2	6	233256	233261	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241666708
5044	NC_012858	AGT	2	6	233264	233269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666708
5045	NC_012858	GGT	2	6	233292	233297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241666708
5046	NC_012858	CAG	2	6	233313	233318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666708
5047	NC_012858	A	6	6	233387	233392	100 %	0 %	0 %	0 %	241666708
5048	NC_012858	CGC	2	6	233398	233403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666708
5049	NC_012858	GCAGG	2	10	233412	233421	20 %	0 %	60 %	20 %	241666708
5050	NC_012858	CGA	2	6	233426	233431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666708
5051	NC_012858	GAT	2	6	233547	233552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666708
5052	NC_012858	CGC	2	6	233592	233597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666709
5053	NC_012858	CACCG	2	10	233606	233615	20 %	0 %	20 %	60 %	241666709
5054	NC_012858	AGC	2	6	233646	233651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666709
5055	NC_012858	TCA	2	6	233695	233700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666709
5056	NC_012858	GTG	2	6	233715	233720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241666709
5057	NC_012858	GAA	2	6	233729	233734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241666709
5058	NC_012858	TCA	2	6	233776	233781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666709
5059	NC_012858	CAC	2	6	233840	233845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241666709
5060	NC_012858	GAT	2	6	233879	233884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666709
5061	NC_012858	TCG	2	6	233919	233924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666709
5062	NC_012858	AGAT	2	8	233961	233968	50 %	25 %	25 %	0 %	241666709
5063	NC_012858	TTG	2	6	234018	234023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241666709
5064	NC_012858	GCG	2	6	234055	234060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666709
5065	NC_012858	GGCCGC	2	12	234115	234126	0 %	0 %	50 %	50 %	241666709
5066	NC_012858	GAC	2	6	234203	234208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666709
5067	NC_012858	AGG	2	6	234249	234254	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241666709
5068	NC_012858	GTA	2	6	234257	234262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666709
5069	NC_012858	GGAA	2	8	234325	234332	50 %	0 %	50 %	0 %	241666709
5070	NC_012858	ACC	2	6	234339	234344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241666709
5071	NC_012858	CAG	3	9	234368	234376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666709
5072	NC_012858	GAC	2	6	234455	234460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666710
5073	NC_012858	GA	3	6	234479	234484	50 %	0 %	50 %	0 %	241666710
5074	NC_012858	CAT	2	6	234514	234519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666710
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5077	NC_012858	TTG	2	6	234656	234661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241666710
5078	NC_012858	TCG	2	6	234672	234677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666710
5079	NC_012858	CAG	2	6	234679	234684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666710
5080	NC_012858	CGA	2	6	234687	234692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666710
5081	NC_012858	GAT	2	6	234721	234726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666710
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5085	NC_012858	CGA	2	6	234987	234992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666710
5086	NC_012858	CGG	2	6	234994	234999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666710
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5088	NC_012858	GAC	2	6	235111	235116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666710
5089	NC_012858	CAG	2	6	235129	235134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666710
5090	NC_012858	CAT	2	6	235167	235172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666710
5091	NC_012858	CGG	2	6	235182	235187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666710
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5093	NC_012858	GCCGG	2	10	235274	235283	0 %	0 %	60 %	40 %	241666710
5094	NC_012858	A	6	6	235285	235290	100 %	0 %	0 %	0 %	241666710
5095	NC_012858	GC	3	6	235370	235375	0 %	0 %	50 %	50 %	241666710
5096	NC_012858	GC	3	6	235383	235388	0 %	0 %	50 %	50 %	241666710
5097	NC_012858	CAT	2	6	235411	235416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666710
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5099	NC_012858	TGA	3	9	235454	235462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666711
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5101	NC_012858	TGA	2	6	235520	235525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666711
5102	NC_012858	CGGC	2	8	235613	235620	0 %	0 %	50 %	50 %	241666711
5103	NC_012858	AGC	2	6	235639	235644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666711
5104	NC_012858	CCT	2	6	235718	235723	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241666711
5105	NC_012858	CAG	2	6	235812	235817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666711
5106	NC_012858	CGG	2	6	235838	235843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666711
5107	NC_012858	GCG	2	6	235856	235861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666711
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5109	NC_012858	CCG	2	6	235897	235902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666711
5110	NC_012858	TGA	2	6	235934	235939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241666711
5111	NC_012858	CGC	3	9	235989	235997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666711
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5115	NC_012858	CAC	2	6	236153	236158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241666711
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5120	NC_012858	TCG	2	6	236332	236337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666711
5121	NC_012858	GAG	2	6	236382	236387	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241666711
5122	NC_012858	CG	3	6	236398	236403	0 %	0 %	50 %	50 %	241666711
5123	NC_012858	GCT	2	6	236429	236434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666711
5124	NC_012858	CGG	2	6	236453	236458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666711
5125	NC_012858	CG	3	6	236465	236470	0 %	0 %	50 %	50 %	241666711
5126	NC_012858	CGC	2	6	236489	236494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666711
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5152	NC_012858	TGC	2	6	237985	237990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666713
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5236	NC_012858	TCT	2	6	241475	241480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241666717
5237	NC_012858	GGCC	2	8	241490	241497	0 %	0 %	50 %	50 %	241666717
5238	NC_012858	GCCTCG	2	12	241503	241514	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	241666717
5239	NC_012858	CGC	2	6	241560	241565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666717
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5241	NC_012858	TGC	2	6	241630	241635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666717
5242	NC_012858	AGCGAG	2	12	241647	241658	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	241666717
5243	NC_012858	GC	4	8	241659	241666	0 %	0 %	50 %	50 %	241666717
5244	NC_012858	GGA	2	6	241721	241726	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241666717
5245	NC_012858	TCA	2	6	241729	241734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666717
5246	NC_012858	CCG	2	6	241742	241747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666717
5247	NC_012858	CAT	2	6	241769	241774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666717
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5249	NC_012858	GCC	2	6	241869	241874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666717
5250	NC_012858	CGG	2	6	241882	241887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666717
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5252	NC_012858	GCT	2	6	241946	241951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666717
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5352	NC_012858	CTG	2	6	248170	248175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666722
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5356	NC_012858	ATCT	2	8	248239	248246	25 %	50 %	0 %	25 %	241666722
5357	NC_012858	GCC	2	6	248250	248255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666722
5358	NC_012858	GCC	2	6	248262	248267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666722
5359	NC_012858	ACG	2	6	248290	248295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666722
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5361	NC_012858	T	6	6	248350	248355	0 %	100 %	0 %	0 %	241666722
5362	NC_012858	CAT	2	6	248382	248387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666722
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5364	NC_012858	TCG	2	6	248405	248410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666722
5365	NC_012858	CGG	2	6	248421	248426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666722
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5370	NC_012858	TCG	2	6	248669	248674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666722
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5445	NC_012858	ACG	2	6	252036	252041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666725
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5464	NC_012858	CG	3	6	253276	253281	0 %	0 %	50 %	50 %	241666726
5465	NC_012858	GC	3	6	253349	253354	0 %	0 %	50 %	50 %	241666726
5466	NC_012858	CG	3	6	253366	253371	0 %	0 %	50 %	50 %	241666726
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5473	NC_012858	CG	3	6	253826	253831	0 %	0 %	50 %	50 %	241666726
5474	NC_012858	GCG	2	6	253845	253850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241666726
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5480	NC_012858	CCG	2	6	254073	254078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666726
5481	NC_012858	CCT	2	6	254097	254102	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241666726
5482	NC_012858	TCC	2	6	254150	254155	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241666726
5483	NC_012858	CGT	2	6	254194	254199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666726
5484	NC_012858	TCG	3	9	254328	254336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666726
5485	NC_012858	TCG	2	6	254385	254390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666726
5486	NC_012858	CGC	2	6	254577	254582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666726
5487	NC_012858	GC	3	6	254581	254586	0 %	0 %	50 %	50 %	241666726
5488	NC_012858	CTGGT	2	10	254606	254615	0 %	40 %	40 %	20 %	241666726
5489	NC_012858	CAC	2	6	254628	254633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241666726
5490	NC_012858	ATC	2	6	254635	254640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241666726
5491	NC_012858	CTT	2	6	254654	254659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241666726
5492	NC_012858	CGT	2	6	254715	254720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666726
5493	NC_012858	CGT	2	6	254805	254810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666726
5494	NC_012858	GCA	2	6	254852	254857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666726
5495	NC_012858	TCGA	2	8	254888	254895	25 %	25 %	25 %	25 %	241666726
5496	NC_012858	GC	3	6	254979	254984	0 %	0 %	50 %	50 %	241666726
5497	NC_012858	TCG	2	6	255053	255058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666726
5498	NC_012858	GAC	2	6	255075	255080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241666726
5499	NC_012858	GCC	2	6	255091	255096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241666726
5500	NC_012858	TCG	2	6	255098	255103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241666726

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