MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ralstonia pickettii 12D chromosome 2

Total Repeats: 29572

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_012857	TGG	2	6	144634	144639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241665165
3002	NC_012857	CG	3	6	144655	144660	0 %	0 %	50 %	50 %	241665165
3003	NC_012857	GCG	2	6	144730	144735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241665165
3004	NC_012857	ACT	2	6	144817	144822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241665165
3005	NC_012857	GCA	2	6	144835	144840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241665165
3006	NC_012857	TGGA	2	8	144885	144892	25 %	25 %	50 %	0 %	241665165
3007	NC_012857	AAC	2	6	144895	144900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241665165
3008	NC_012857	CAA	2	6	145051	145056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241665166
3009	NC_012857	GGC	2	6	145118	145123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241665166
3010	NC_012857	ACGCC	2	10	145129	145138	20 %	0 %	20 %	60 %	241665166
3011	NC_012857	CGA	2	6	145219	145224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241665166
3012	NC_012857	CTA	2	6	145225	145230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241665166
3013	NC_012857	CG	3	6	145252	145257	0 %	0 %	50 %	50 %	241665166
3014	NC_012857	CGC	2	6	145269	145274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241665166
3015	NC_012857	CGC	2	6	145284	145289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241665166
3016	NC_012857	CG	3	6	145294	145299	0 %	0 %	50 %	50 %	241665166
3017	NC_012857	GAC	2	6	145361	145366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241665166
3018	NC_012857	GCG	2	6	145371	145376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241665166
3019	NC_012857	ATG	2	6	145454	145459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241665166
3020	NC_012857	GAG	2	6	145538	145543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241665166
3021	NC_012857	AAG	2	6	145613	145618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241665166
3022	NC_012857	ACCG	2	8	145690	145697	25 %	0 %	25 %	50 %	241665166
3023	NC_012857	ACG	2	6	145749	145754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241665166
3024	NC_012857	GCC	3	9	145769	145777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241665166
3025	NC_012857	CGC	2	6	145995	146000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241665166
3026	NC_012857	GAT	2	6	146050	146055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241665166
3027	NC_012857	CTG	2	6	146102	146107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241665166
3028	NC_012857	TGT	2	6	146128	146133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241665166
3029	NC_012857	GC	3	6	146136	146141	0 %	0 %	50 %	50 %	241665166
3030	NC_012857	GC	3	6	146161	146166	0 %	0 %	50 %	50 %	241665166
3031	NC_012857	GC	3	6	146173	146178	0 %	0 %	50 %	50 %	241665166
3032	NC_012857	GGA	2	6	146245	146250	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241665166
3033	NC_012857	GCT	2	6	146373	146378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241665166
3034	NC_012857	GCG	2	6	146382	146387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241665166
3035	NC_012857	TTC	2	6	146402	146407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241665166
3036	NC_012857	AAG	2	6	146414	146419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241665166
3037	NC_012857	AAG	2	6	146456	146461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241665166
3038	NC_012857	ACC	2	6	146510	146515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241665167
3039	NC_012857	CTG	2	6	146551	146556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241665167
3040	NC_012857	TGCCC	2	10	146559	146568	0 %	20 %	20 %	60 %	241665167
3041	NC_012857	CGCC	2	8	146594	146601	0 %	0 %	25 %	75 %	241665167
3042	NC_012857	CG	4	8	146605	146612	0 %	0 %	50 %	50 %	241665167
3043	NC_012857	GCT	2	6	146622	146627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241665167
3044	NC_012857	TCA	2	6	146651	146656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241665167
3045	NC_012857	CGCA	2	8	146699	146706	25 %	0 %	25 %	50 %	241665167
3046	NC_012857	GGCCA	2	10	146749	146758	20 %	0 %	40 %	40 %	241665167
3047	NC_012857	CGA	2	6	146772	146777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241665167
3048	NC_012857	GGC	2	6	146919	146924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241665167
3049	NC_012857	GCAGCC	2	12	147000	147011	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	241665167
3050	NC_012857	GCC	2	6	147021	147026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241665167
3051	NC_012857	GCT	2	6	147087	147092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241665167
3052	NC_012857	AGC	2	6	147113	147118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241665167
3053	NC_012857	CGC	3	9	147155	147163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241665167
3054	NC_012857	CTG	2	6	147249	147254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241665168
3055	NC_012857	CTG	2	6	147261	147266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241665168
3056	NC_012857	TGC	2	6	147313	147318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241665168
3057	NC_012857	CTG	2	6	147345	147350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241665168
3058	NC_012857	TTC	2	6	147375	147380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241665168
3059	NC_012857	TGG	2	6	147454	147459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241665168
3060	NC_012857	GCT	2	6	147503	147508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241665168
3061	NC_012857	CTG	2	6	147510	147515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241665168
3062	NC_012857	CTG	2	6	147576	147581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241665168
3063	NC_012857	GCT	2	6	147587	147592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241665168
3064	NC_012857	GCT	3	9	147599	147607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241665168
3065	NC_012857	CCG	2	6	147631	147636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241665168
3066	NC_012857	TGC	2	6	147661	147666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241665168
3067	NC_012857	TGA	2	6	147667	147672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241665168
3068	NC_012857	TGC	2	6	147950	147955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241665169
3069	NC_012857	GCT	2	6	147957	147962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241665169
3070	NC_012857	GC	3	6	147963	147968	0 %	0 %	50 %	50 %	241665169
3071	NC_012857	CCA	2	6	148002	148007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241665169
3072	NC_012857	CCG	2	6	148024	148029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241665169
3073	NC_012857	CGTG	2	8	148047	148054	0 %	25 %	50 %	25 %	241665169
3074	NC_012857	CCG	2	6	148055	148060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241665169
3075	NC_012857	TGG	2	6	148076	148081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241665169
3076	NC_012857	CTG	2	6	148147	148152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241665169
3077	NC_012857	GCC	2	6	148245	148250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241665169
3078	NC_012857	CGA	3	9	148260	148268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241665169
3079	NC_012857	CCGC	2	8	148311	148318	0 %	0 %	25 %	75 %	241665169
3080	NC_012857	ACTCGA	2	12	148368	148379	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	241665169
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3082	NC_012857	GAT	2	6	148564	148569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241665170
3083	NC_012857	CGG	2	6	148570	148575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241665170
3084	NC_012857	GC	3	6	148645	148650	0 %	0 %	50 %	50 %	241665170
3085	NC_012857	GC	3	6	148679	148684	0 %	0 %	50 %	50 %	241665170
3086	NC_012857	CGCT	2	8	148734	148741	0 %	25 %	25 %	50 %	241665170
3087	NC_012857	CCG	2	6	148782	148787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241665170
3088	NC_012857	CCG	2	6	148798	148803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241665170
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3090	NC_012857	GCC	2	6	148873	148878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241665170
3091	NC_012857	GC	3	6	148881	148886	0 %	0 %	50 %	50 %	241665170
3092	NC_012857	CACC	2	8	148900	148907	25 %	0 %	0 %	75 %	241665170
3093	NC_012857	GAGCA	2	10	148952	148961	40 %	0 %	40 %	20 %	241665170
3094	NC_012857	GAC	2	6	148972	148977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241665170
3095	NC_012857	GCT	2	6	148978	148983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241665170
3096	NC_012857	ATCT	2	8	149039	149046	25 %	50 %	0 %	25 %	241665170
3097	NC_012857	ATC	2	6	149060	149065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241665170
3098	NC_012857	CTG	2	6	149159	149164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241665170
3099	NC_012857	GC	3	6	149165	149170	0 %	0 %	50 %	50 %	241665170
3100	NC_012857	GAG	2	6	149189	149194	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241665170
3101	NC_012857	CCTCG	2	10	149215	149224	0 %	20 %	20 %	60 %	241665170
3102	NC_012857	CG	3	6	149223	149228	0 %	0 %	50 %	50 %	241665170
3103	NC_012857	AGA	2	6	149235	149240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241665170
3104	NC_012857	CAG	2	6	149243	149248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241665170
3105	NC_012857	GTC	2	6	149308	149313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241665170
3106	NC_012857	TGC	2	6	149368	149373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241665170
3107	NC_012857	GCA	2	6	149379	149384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241665170
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3109	NC_012857	GGA	2	6	149452	149457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241665170
3110	NC_012857	ATGC	2	8	149467	149474	25 %	25 %	25 %	25 %	241665170
3111	NC_012857	GGCCA	2	10	149495	149504	20 %	0 %	40 %	40 %	241665170
3112	NC_012857	GCA	2	6	149506	149511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241665170
3113	NC_012857	CGT	2	6	149515	149520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241665170
3114	NC_012857	GGT	2	6	149521	149526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241665170
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3117	NC_012857	CCG	2	6	149562	149567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241665170
3118	NC_012857	CTGCC	2	10	149579	149588	0 %	20 %	20 %	60 %	241665170
3119	NC_012857	CAT	2	6	149623	149628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241665170
3120	NC_012857	GCA	2	6	149632	149637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241665170
3121	NC_012857	GCC	2	6	149686	149691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241665170
3122	NC_012857	CTG	2	6	149705	149710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241665170
3123	NC_012857	GCA	2	6	149722	149727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241665170
3124	NC_012857	AGGCCA	2	12	149760	149771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241665170
3125	NC_012857	GGT	2	6	149782	149787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241665170
3126	NC_012857	GAA	2	6	149789	149794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241665170
3127	NC_012857	TCG	2	6	149802	149807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241665170
3128	NC_012857	CGC	2	6	149875	149880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241665170
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3130	NC_012857	CTGCG	2	10	149927	149936	0 %	20 %	40 %	40 %	241665170
3131	NC_012857	AG	3	6	149944	149949	50 %	0 %	50 %	0 %	241665170
3132	NC_012857	CTG	3	9	149969	149977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241665170
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3134	NC_012857	CGG	2	6	150015	150020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241665170
3135	NC_012857	GCA	2	6	150046	150051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241665170
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3141	NC_012857	CAT	2	6	150298	150303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241665170
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3143	NC_012857	CTG	2	6	150323	150328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241665170
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3147	NC_012857	CAT	2	6	150436	150441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241665171
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3152	NC_012857	CTG	2	6	150596	150601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241665171
3153	NC_012857	CGT	2	6	150673	150678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241665171
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3162	NC_012857	CAA	2	6	150955	150960	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241665171
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3181	NC_012857	GCG	2	6	151865	151870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241665172
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3185	NC_012857	CG	3	6	152098	152103	0 %	0 %	50 %	50 %	241665172
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3187	NC_012857	CTG	2	6	152231	152236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241665172
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3198	NC_012857	GCA	2	6	152746	152751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241665173
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3200	NC_012857	CG	3	6	152815	152820	0 %	0 %	50 %	50 %	241665173
3201	NC_012857	GC	3	6	152848	152853	0 %	0 %	50 %	50 %	241665173
3202	NC_012857	CCAG	2	8	152872	152879	25 %	0 %	25 %	50 %	241665173
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3212	NC_012857	CGA	2	6	153400	153405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241665173
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3228	NC_012857	CGCGG	2	10	154249	154258	0 %	0 %	60 %	40 %	241665174
3229	NC_012857	GCC	2	6	154324	154329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241665174
3230	NC_012857	CGA	2	6	154375	154380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241665174
3231	NC_012857	GGCG	2	8	154450	154457	0 %	0 %	75 %	25 %	241665174
3232	NC_012857	CA	3	6	154523	154528	50 %	0 %	0 %	50 %	241665174
3233	NC_012857	TGC	2	6	154557	154562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241665174
3234	NC_012857	CTGC	2	8	154564	154571	0 %	25 %	25 %	50 %	241665174
3235	NC_012857	GAA	2	6	154633	154638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241665174
3236	NC_012857	ATC	2	6	154646	154651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241665174
3237	NC_012857	GC	3	6	154678	154683	0 %	0 %	50 %	50 %	241665174
3238	NC_012857	TCA	2	6	154704	154709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241665174
3239	NC_012857	CTT	2	6	154741	154746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241665174
3240	NC_012857	CG	3	6	154814	154819	0 %	0 %	50 %	50 %	241665175
3241	NC_012857	CTG	2	6	154829	154834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241665175
3242	NC_012857	CCA	2	6	154966	154971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241665175
3243	NC_012857	CAC	2	6	155044	155049	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241665175
3244	NC_012857	GCGG	2	8	155054	155061	0 %	0 %	75 %	25 %	241665175
3245	NC_012857	CG	3	6	155102	155107	0 %	0 %	50 %	50 %	241665175
3246	NC_012857	GCA	2	6	155110	155115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241665175
3247	NC_012857	CGC	2	6	155126	155131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241665175
3248	NC_012857	TTC	2	6	155247	155252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241665175
3249	NC_012857	CTT	2	6	155303	155308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241665175
3250	NC_012857	GC	3	6	155309	155314	0 %	0 %	50 %	50 %	241665175
3251	NC_012857	CAG	2	6	155333	155338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241665175
3252	NC_012857	GAC	2	6	155423	155428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241665175
3253	NC_012857	GCT	2	6	155434	155439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241665175
3254	NC_012857	GCT	2	6	155470	155475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241665175
3255	NC_012857	GTC	2	6	155495	155500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241665175
3256	NC_012857	GGC	2	6	155518	155523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241665175
3257	NC_012857	GCTGCG	2	12	155534	155545	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	241665175
3258	NC_012857	TGCA	2	8	155598	155605	25 %	25 %	25 %	25 %	241665175
3259	NC_012857	CAG	2	6	155678	155683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241665175
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3261	NC_012857	CGG	2	6	155764	155769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241665175
3262	NC_012857	ACG	2	6	155771	155776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241665175
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3264	NC_012857	GTC	2	6	155801	155806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241665175
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3272	NC_012857	GGTC	2	8	156127	156134	0 %	25 %	50 %	25 %	241665175
3273	NC_012857	CCG	2	6	156139	156144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241665175
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3280	NC_012857	TCG	2	6	156925	156930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241665176
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3286	NC_012857	CGTG	2	8	157217	157224	0 %	25 %	50 %	25 %	241665176
3287	NC_012857	GCG	2	6	157270	157275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241665176
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3356	NC_012857	GTCGCG	2	12	160102	160113	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	241665178
3357	NC_012857	CAC	3	9	160126	160134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241665178
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3359	NC_012857	CAC	2	6	160288	160293	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241665178
3360	NC_012857	GCG	2	6	160303	160308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241665178
3361	NC_012857	GCC	2	6	160339	160344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241665178
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3363	NC_012857	CTG	2	6	160432	160437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241665178
3364	NC_012857	GTC	2	6	160531	160536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241665178
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3483	NC_012857	GGC	2	6	165087	165092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241665180
3484	NC_012857	CG	4	8	165152	165159	0 %	0 %	50 %	50 %	241665180
3485	NC_012857	ACA	2	6	165199	165204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241665180
3486	NC_012857	GCA	2	6	165339	165344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241665181
3487	NC_012857	GGA	2	6	165374	165379	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241665181
3488	NC_012857	AG	3	6	165380	165385	50 %	0 %	50 %	0 %	241665181
3489	NC_012857	CG	4	8	165393	165400	0 %	0 %	50 %	50 %	241665181
3490	NC_012857	GGC	3	9	165431	165439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241665181
3491	NC_012857	CGCTG	2	10	165478	165487	0 %	20 %	40 %	40 %	241665181
3492	NC_012857	GCG	2	6	165492	165497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241665181
3493	NC_012857	GCC	2	6	165563	165568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241665181
3494	NC_012857	CAT	2	6	165642	165647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241665181
3495	NC_012857	ATG	2	6	165650	165655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241665181
3496	NC_012857	GTGG	2	8	165703	165710	0 %	25 %	75 %	0 %	241665181
3497	NC_012857	AAC	2	6	165731	165736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241665181
3498	NC_012857	CACGC	2	10	165784	165793	20 %	0 %	20 %	60 %	241665181
3499	NC_012857	GCG	2	6	165927	165932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241665182
3500	NC_012857	GCAG	2	8	165971	165978	25 %	0 %	50 %	25 %	241665182

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