MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Ralstonia pickettii 12D plasmid pRp12D01

Total Repeats: 873

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012855	AGTC	2	8	265	272	25 %	25 %	25 %	25 %	241589534
2	NC_012855	CGGT	2	8	664	671	0 %	25 %	50 %	25 %	241589535
3	NC_012855	GACG	2	8	976	983	25 %	0 %	50 %	25 %	241589535
4	NC_012855	CTGG	2	8	2304	2311	0 %	25 %	50 %	25 %	241589536
5	NC_012855	AGTC	2	8	2601	2608	25 %	25 %	25 %	25 %	241589537
6	NC_012855	GCAA	2	8	2684	2691	50 %	0 %	25 %	25 %	241589537
7	NC_012855	CCAA	2	8	3605	3612	50 %	0 %	0 %	50 %	241589538
8	NC_012855	ACGG	2	8	3682	3689	25 %	0 %	50 %	25 %	241589538
9	NC_012855	CGGG	2	8	3942	3949	0 %	0 %	75 %	25 %	241589538
10	NC_012855	ACGA	2	8	4112	4119	50 %	0 %	25 %	25 %	241589539
11	NC_012855	GTGG	2	8	4141	4148	0 %	25 %	75 %	0 %	241589539
12	NC_012855	GACA	2	8	4589	4596	50 %	0 %	25 %	25 %	241589540
13	NC_012855	TTGC	2	8	4672	4679	0 %	50 %	25 %	25 %	241589540
14	NC_012855	AGCG	2	8	5563	5570	25 %	0 %	50 %	25 %	241589541
15	NC_012855	GAAG	2	8	5750	5757	50 %	0 %	50 %	0 %	241589541
16	NC_012855	TCGC	2	8	5923	5930	0 %	25 %	25 %	50 %	241589541
17	NC_012855	GAAA	2	8	6320	6327	75 %	0 %	25 %	0 %	241589541
18	NC_012855	GCCG	2	8	6779	6786	0 %	0 %	50 %	50 %	241589541
19	NC_012855	GATC	2	8	7778	7785	25 %	25 %	25 %	25 %	241589541
20	NC_012855	GACG	2	8	8253	8260	25 %	0 %	50 %	25 %	241589542
21	NC_012855	CAAC	2	8	8262	8269	50 %	0 %	0 %	50 %	241589542
22	NC_012855	GCTG	2	8	8451	8458	0 %	25 %	50 %	25 %	241589542
23	NC_012855	ACGC	2	8	8551	8558	25 %	0 %	25 %	50 %	241589542
24	NC_012855	CTGA	2	8	8674	8681	25 %	25 %	25 %	25 %	241589542
25	NC_012855	GAAA	2	8	10013	10020	75 %	0 %	25 %	0 %	241589544
26	NC_012855	CTCG	2	8	10126	10133	0 %	25 %	25 %	50 %	241589544
27	NC_012855	TGTT	2	8	10380	10387	0 %	75 %	25 %	0 %	241589544
28	NC_012855	AAGG	2	8	11310	11317	50 %	0 %	50 %	0 %	241589545
29	NC_012855	CAAG	2	8	11454	11461	50 %	0 %	25 %	25 %	241589545
30	NC_012855	GGAC	2	8	11520	11527	25 %	0 %	50 %	25 %	241589545
31	NC_012855	CCTT	2	8	11764	11771	0 %	50 %	0 %	50 %	241589546
32	NC_012855	TTTG	2	8	11875	11882	0 %	75 %	25 %	0 %	241589546
33	NC_012855	GGCA	2	8	12037	12044	25 %	0 %	50 %	25 %	241589546
34	NC_012855	GGGC	2	8	13213	13220	0 %	0 %	75 %	25 %	241589548
35	NC_012855	CGAG	2	8	13774	13781	25 %	0 %	50 %	25 %	241589548
36	NC_012855	GCGT	2	8	14591	14598	0 %	25 %	50 %	25 %	241589549
37	NC_012855	GATC	2	8	14849	14856	25 %	25 %	25 %	25 %	241589549
38	NC_012855	GGCA	2	8	15143	15150	25 %	0 %	50 %	25 %	241589549
39	NC_012855	CAGC	2	8	16061	16068	25 %	0 %	25 %	50 %	241589551
40	NC_012855	ATCG	2	8	16735	16742	25 %	25 %	25 %	25 %	241589552
41	NC_012855	AGCG	2	8	18279	18286	25 %	0 %	50 %	25 %	241589554
42	NC_012855	CAGG	2	8	18981	18988	25 %	0 %	50 %	25 %	241589555
43	NC_012855	GCCA	2	8	19138	19145	25 %	0 %	25 %	50 %	241589555
44	NC_012855	TTGC	2	8	19728	19735	0 %	50 %	25 %	25 %	241589555
45	NC_012855	GGGT	2	8	20036	20043	0 %	25 %	75 %	0 %	241589556
46	NC_012855	CGAT	2	8	20295	20302	25 %	25 %	25 %	25 %	241589556
47	NC_012855	GCGT	2	8	23221	23228	0 %	25 %	50 %	25 %	241589558
48	NC_012855	AGCC	2	8	23621	23628	25 %	0 %	25 %	50 %	241589558
49	NC_012855	CATG	2	8	23794	23801	25 %	25 %	25 %	25 %	241589558
50	NC_012855	GCGG	2	8	23878	23885	0 %	0 %	75 %	25 %	241589558
51	NC_012855	GGCG	2	8	24203	24210	0 %	0 %	75 %	25 %	241589559
52	NC_012855	GCCC	2	8	24246	24253	0 %	0 %	25 %	75 %	241589559
53	NC_012855	TCGT	2	8	24603	24610	0 %	50 %	25 %	25 %	241589559
54	NC_012855	AAGC	2	8	25577	25584	50 %	0 %	25 %	25 %	241589560
55	NC_012855	GCAC	2	8	26483	26490	25 %	0 %	25 %	50 %	241589562
56	NC_012855	CACC	2	8	26589	26596	25 %	0 %	0 %	75 %	241589562
57	NC_012855	TCGA	2	8	26612	26619	25 %	25 %	25 %	25 %	241589562
58	NC_012855	GGGC	2	8	27174	27181	0 %	0 %	75 %	25 %	241589562
59	NC_012855	TCAC	2	8	27191	27198	25 %	25 %	0 %	50 %	241589562
60	NC_012855	GGTT	2	8	27827	27834	0 %	50 %	50 %	0 %	241589563
61	NC_012855	TCAA	2	8	29416	29423	50 %	25 %	0 %	25 %	241589565
62	NC_012855	GCGG	2	8	29811	29818	0 %	0 %	75 %	25 %	241589565
63	NC_012855	CAAA	2	8	30096	30103	75 %	0 %	0 %	25 %	241589565
64	NC_012855	TCGC	2	8	30147	30154	0 %	25 %	25 %	50 %	241589565
65	NC_012855	CAGA	2	8	30159	30166	50 %	0 %	25 %	25 %	241589565
66	NC_012855	CTGG	2	8	30270	30277	0 %	25 %	50 %	25 %	241589565
67	NC_012855	GCTC	2	8	30439	30446	0 %	25 %	25 %	50 %	241589565
68	NC_012855	CTGC	2	8	30696	30703	0 %	25 %	25 %	50 %	241589565
69	NC_012855	CGTG	2	8	30854	30861	0 %	25 %	50 %	25 %	241589565
70	NC_012855	TTGA	2	8	33530	33537	25 %	50 %	25 %	0 %	241589566
71	NC_012855	TGCT	2	8	34199	34206	0 %	50 %	25 %	25 %	241589568
72	NC_012855	CATG	2	8	34289	34296	25 %	25 %	25 %	25 %	241589568
73	NC_012855	GCGT	2	8	34368	34375	0 %	25 %	50 %	25 %	241589568
74	NC_012855	GCAT	2	8	34449	34456	25 %	25 %	25 %	25 %	241589568
75	NC_012855	GGTC	2	8	35044	35051	0 %	25 %	50 %	25 %	241589568
76	NC_012855	CGGC	2	8	35079	35086	0 %	0 %	50 %	50 %	241589568
77	NC_012855	GAGC	2	8	35087	35094	25 %	0 %	50 %	25 %	241589568
78	NC_012855	GCGA	2	8	35520	35527	25 %	0 %	50 %	25 %	241589568
79	NC_012855	CGGC	2	8	35824	35831	0 %	0 %	50 %	50 %	241589569
80	NC_012855	GCGA	2	8	35880	35887	25 %	0 %	50 %	25 %	241589569
81	NC_012855	GAAG	2	8	36791	36798	50 %	0 %	50 %	0 %	241589569
82	NC_012855	CGAA	2	8	36871	36878	50 %	0 %	25 %	25 %	241589569
83	NC_012855	ATTC	2	8	36987	36994	25 %	50 %	0 %	25 %	241589569
84	NC_012855	GCCA	2	8	37095	37102	25 %	0 %	25 %	50 %	241589569
85	NC_012855	CGGC	2	8	37167	37174	0 %	0 %	50 %	50 %	241589569
86	NC_012855	CGAC	2	8	37400	37407	25 %	0 %	25 %	50 %	241589569
87	NC_012855	GTCC	2	8	37443	37450	0 %	25 %	25 %	50 %	241589569
88	NC_012855	AGGC	2	8	37783	37790	25 %	0 %	50 %	25 %	241589569
89	NC_012855	CGCT	2	8	39308	39315	0 %	25 %	25 %	50 %	241589570
90	NC_012855	GAAT	2	8	39749	39756	50 %	25 %	25 %	0 %	241589571
91	NC_012855	CTTG	2	8	39915	39922	0 %	50 %	25 %	25 %	241589571
92	NC_012855	CGGC	2	8	40557	40564	0 %	0 %	50 %	50 %	241589571
93	NC_012855	CCGA	2	8	42541	42548	25 %	0 %	25 %	50 %	241589572
94	NC_012855	GCAA	2	8	44848	44855	50 %	0 %	25 %	25 %	241589575
95	NC_012855	GTCC	2	8	45014	45021	0 %	25 %	25 %	50 %	241589575
96	NC_012855	CTTA	2	8	46877	46884	25 %	50 %	0 %	25 %	241589576
97	NC_012855	AGGC	2	8	46886	46893	25 %	0 %	50 %	25 %	241589576
98	NC_012855	TAGC	2	8	46953	46960	25 %	25 %	25 %	25 %	241589576
99	NC_012855	TGGC	2	8	48383	48390	0 %	25 %	50 %	25 %	241589577
100	NC_012855	GAGC	2	8	48516	48523	25 %	0 %	50 %	25 %	241589577
101	NC_012855	GGCC	2	8	48780	48787	0 %	0 %	50 %	50 %	241589577
102	NC_012855	TGCC	2	8	49245	49252	0 %	25 %	25 %	50 %	241589577
103	NC_012855	GATT	2	8	49312	49319	25 %	50 %	25 %	0 %	241589577
104	NC_012855	TCCG	2	8	49587	49594	0 %	25 %	25 %	50 %	241589577
105	NC_012855	GATG	2	8	49889	49896	25 %	25 %	50 %	0 %	241589577
106	NC_012855	GCCG	2	8	50226	50233	0 %	0 %	50 %	50 %	241589578
107	NC_012855	CGTC	2	8	50492	50499	0 %	25 %	25 %	50 %	241589578
108	NC_012855	TTGT	2	8	50868	50875	0 %	75 %	25 %	0 %	241589579
109	NC_012855	ATTG	2	8	51033	51040	25 %	50 %	25 %	0 %	241589579
110	NC_012855	CCGA	2	8	51149	51156	25 %	0 %	25 %	50 %	241589579
111	NC_012855	TAGC	2	8	51158	51165	25 %	25 %	25 %	25 %	241589579
112	NC_012855	GTTG	2	8	51487	51494	0 %	50 %	50 %	0 %	241589579
113	NC_012855	ATTG	2	8	51772	51779	25 %	50 %	25 %	0 %	241589579
114	NC_012855	AGCG	2	8	51891	51898	25 %	0 %	50 %	25 %	241589579
115	NC_012855	ACCC	2	8	54282	54289	25 %	0 %	0 %	75 %	241589581
116	NC_012855	GCAG	2	8	54994	55001	25 %	0 %	50 %	25 %	241589581
117	NC_012855	CTGC	2	8	55066	55073	0 %	25 %	25 %	50 %	241589581
118	NC_012855	ATTC	2	8	55142	55149	25 %	50 %	0 %	25 %	241589581
119	NC_012855	GCAA	2	8	55471	55478	50 %	0 %	25 %	25 %	241589581
120	NC_012855	CCCA	2	8	56355	56362	25 %	0 %	0 %	75 %	241589582
121	NC_012855	TTGA	2	8	56410	56417	25 %	50 %	25 %	0 %	241589582
122	NC_012855	TGCC	2	8	58761	58768	0 %	25 %	25 %	50 %	241589583
123	NC_012855	GGGT	2	8	58873	58880	0 %	25 %	75 %	0 %	241589583
124	NC_012855	TCGG	2	8	58986	58993	0 %	25 %	50 %	25 %	241589583
125	NC_012855	GTCG	2	8	59313	59320	0 %	25 %	50 %	25 %	241589584
126	NC_012855	TCGT	2	8	60708	60715	0 %	50 %	25 %	25 %	241589585
127	NC_012855	TCCA	2	8	61106	61113	25 %	25 %	0 %	50 %	241589585
128	NC_012855	ACGC	2	8	61122	61129	25 %	0 %	25 %	50 %	241589585
129	NC_012855	TACT	2	8	62059	62066	25 %	50 %	0 %	25 %	241589586
130	NC_012855	CGAA	2	8	62100	62107	50 %	0 %	25 %	25 %	241589586
131	NC_012855	CGAC	2	8	62302	62309	25 %	0 %	25 %	50 %	241589586
132	NC_012855	CGAT	2	8	62321	62328	25 %	25 %	25 %	25 %	241589586
133	NC_012855	GCAC	2	8	62851	62858	25 %	0 %	25 %	50 %	241589586
134	NC_012855	TGCC	2	8	63770	63777	0 %	25 %	25 %	50 %	241589587
135	NC_012855	CGCT	2	8	63857	63864	0 %	25 %	25 %	50 %	241589587
136	NC_012855	TCTG	2	8	64372	64379	0 %	50 %	25 %	25 %	241589587
137	NC_012855	TGAT	2	8	64743	64750	25 %	50 %	25 %	0 %	241589588
138	NC_012855	GGTC	2	8	65289	65296	0 %	25 %	50 %	25 %	241589588
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