MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Ralstonia pickettii 12D plasmid pRp12D01

Total Repeats: 4338

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012855	CGA	2	6	496	501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589534
2	NC_012855	TTC	3	9	550	558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241589535
3	NC_012855	CGA	2	6	684	689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589535
4	NC_012855	CTG	2	6	703	708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589535
5	NC_012855	GGC	2	6	735	740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241589535
6	NC_012855	CTG	2	6	859	864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589535
7	NC_012855	AGA	2	6	882	887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241589535
8	NC_012855	AGC	2	6	1001	1006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589535
9	NC_012855	GAA	2	6	1087	1092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241589535
10	NC_012855	AGT	2	6	1132	1137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241589535
11	NC_012855	CGC	2	6	1273	1278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241589536
12	NC_012855	ATG	2	6	1336	1341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241589536
13	NC_012855	GAT	2	6	1382	1387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241589536
14	NC_012855	TGG	2	6	1484	1489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241589536
15	NC_012855	GCA	2	6	1541	1546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589536
16	NC_012855	GGC	2	6	1679	1684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241589536
17	NC_012855	TCC	2	6	1756	1761	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241589536
18	NC_012855	GTT	2	6	1803	1808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241589536
19	NC_012855	GCC	2	6	1873	1878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241589536
20	NC_012855	CCG	2	6	1935	1940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241589536
21	NC_012855	ACC	2	6	1994	1999	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241589536
22	NC_012855	CGT	2	6	2112	2117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589536
23	NC_012855	GTC	2	6	2121	2126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589536
24	NC_012855	CGT	2	6	2153	2158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589536
25	NC_012855	CGA	2	6	2210	2215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589536
26	NC_012855	GCT	2	6	2500	2505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589537
27	NC_012855	CAC	2	6	2651	2656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	241589537
28	NC_012855	GTA	2	6	2754	2759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241589537
29	NC_012855	TGT	2	6	2808	2813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241589537
30	NC_012855	TGA	2	6	2924	2929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241589537
31	NC_012855	CCG	2	6	2962	2967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241589538
32	NC_012855	TGG	2	6	3054	3059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241589538
33	NC_012855	TGC	2	6	3078	3083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589538
34	NC_012855	TTG	2	6	3098	3103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241589538
35	NC_012855	AGC	2	6	3121	3126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589538
36	NC_012855	ATG	2	6	3144	3149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241589538
37	NC_012855	GCT	2	6	3209	3214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589538
38	NC_012855	GAG	2	6	3229	3234	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241589538
39	NC_012855	TGT	2	6	3312	3317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241589538
40	NC_012855	GGC	2	6	3329	3334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241589538
41	NC_012855	AGG	2	6	3341	3346	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241589538
42	NC_012855	GGA	2	6	3406	3411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241589538
43	NC_012855	TCG	2	6	3513	3518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589538
44	NC_012855	GAA	2	6	3550	3555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241589538
45	NC_012855	GGT	2	6	3613	3618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241589538
46	NC_012855	AAG	2	6	3620	3625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241589538
47	NC_012855	GCA	2	6	3690	3695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589538
48	NC_012855	TGA	2	6	3871	3876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241589538
49	NC_012855	GAA	2	6	3961	3966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241589538
50	NC_012855	CAG	2	6	4214	4219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589539
51	NC_012855	CGA	2	6	4222	4227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589539
52	NC_012855	GAA	2	6	4267	4272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241589539
53	NC_012855	CAG	2	6	4355	4360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589539
54	NC_012855	GAG	2	6	4362	4367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241589539
55	NC_012855	AGG	2	6	4428	4433	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241589539
56	NC_012855	TGT	2	6	4441	4446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241589539
57	NC_012855	GTC	2	6	4450	4455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589539
58	NC_012855	GAC	2	6	4457	4462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589539
59	NC_012855	TGG	2	6	4468	4473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241589539
60	NC_012855	TCA	2	6	4639	4644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241589540
61	NC_012855	AGC	2	6	4694	4699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589540
62	NC_012855	TGG	2	6	4744	4749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241589540
63	NC_012855	TGC	2	6	4813	4818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589540
64	NC_012855	GTC	2	6	5434	5439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589541
65	NC_012855	AGC	2	6	5448	5453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589541
66	NC_012855	GGC	2	6	5625	5630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241589541
67	NC_012855	ACA	2	6	5740	5745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241589541
68	NC_012855	GCG	2	6	5784	5789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241589541
69	NC_012855	GGC	2	6	5825	5830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241589541
70	NC_012855	ATG	2	6	5863	5868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241589541
71	NC_012855	CGA	2	6	5966	5971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589541
72	NC_012855	GAC	2	6	6278	6283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589541
73	NC_012855	GAC	2	6	6291	6296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589541
74	NC_012855	TGT	2	6	6334	6339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241589541
75	NC_012855	TGG	2	6	6350	6355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241589541
76	NC_012855	GGT	2	6	6446	6451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241589541
77	NC_012855	GGC	2	6	6480	6485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241589541
78	NC_012855	GAG	2	6	6537	6542	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241589541
79	NC_012855	GAT	2	6	6570	6575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241589541
80	NC_012855	CGT	2	6	6579	6584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589541
81	NC_012855	GTT	2	6	6659	6664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241589541
82	NC_012855	GAG	2	6	6714	6719	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241589541
83	NC_012855	CTC	2	6	6871	6876	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241589541
84	NC_012855	AGC	2	6	6877	6882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589541
85	NC_012855	GTG	2	6	6891	6896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241589541
86	NC_012855	TTG	2	6	6979	6984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241589541
87	NC_012855	ATG	2	6	7152	7157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241589541
88	NC_012855	GGC	2	6	7205	7210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241589541
89	NC_012855	CTA	2	6	7247	7252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241589541
90	NC_012855	TCT	2	6	7266	7271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241589541
91	NC_012855	CTG	2	6	7356	7361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589541
92	NC_012855	TTC	2	6	7400	7405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241589541
93	NC_012855	GGC	2	6	7441	7446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241589541
94	NC_012855	GAA	2	6	7610	7615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241589541
95	NC_012855	TGT	2	6	7639	7644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241589541
96	NC_012855	ACG	2	6	7660	7665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589541
97	NC_012855	AGA	2	6	7675	7680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241589541
98	NC_012855	CTG	2	6	7693	7698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589541
99	NC_012855	AAG	2	6	7827	7832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241589541
100	NC_012855	CTA	2	6	7880	7885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241589541
101	NC_012855	GCC	2	6	7899	7904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241589541
102	NC_012855	TCG	2	6	7959	7964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589541
103	NC_012855	GCA	2	6	7976	7981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589541
104	NC_012855	AAC	2	6	7982	7987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241589541
105	NC_012855	TCT	2	6	8164	8169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241589542
106	NC_012855	ATC	2	6	8239	8244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241589542
107	NC_012855	AAG	2	6	8339	8344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241589542
108	NC_012855	ATC	2	6	8410	8415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241589542
109	NC_012855	CAA	2	6	8460	8465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241589542
110	NC_012855	CTG	2	6	8518	8523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589542
111	NC_012855	GAG	2	6	8536	8541	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241589542
112	NC_012855	CGT	2	6	8684	8689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589542
113	NC_012855	GCT	2	6	8721	8726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589542
114	NC_012855	TTC	2	6	8767	8772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241589542
115	NC_012855	TGC	2	6	8826	8831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589542
116	NC_012855	CGA	2	6	8856	8861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589542
117	NC_012855	AGA	2	6	8997	9002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241589542
118	NC_012855	CCG	2	6	9072	9077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241589542
119	NC_012855	GAA	2	6	9724	9729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241589543
120	NC_012855	GAT	2	6	9860	9865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241589543
121	NC_012855	GAC	2	6	10001	10006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589544
122	NC_012855	GCG	2	6	10036	10041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241589544
123	NC_012855	GTT	2	6	10226	10231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241589544
124	NC_012855	ATT	2	6	10256	10261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	241589544
125	NC_012855	TGG	2	6	10324	10329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241589544
126	NC_012855	ATC	2	6	10350	10355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241589544
127	NC_012855	CTG	3	9	10371	10379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589544
128	NC_012855	AAG	2	6	10451	10456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241589544
129	NC_012855	AAG	2	6	11407	11412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241589545
130	NC_012855	GCA	2	6	11535	11540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589545
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254	NC_012855	CCG	2	6	23706	23711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241589558
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499	NC_012855	CAA	2	6	42654	42659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	241589572
500	NC_012855	TCA	2	6	42697	42702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241589572

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