MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ralstonia pickettii 12D plasmid pRp12D01

Total Repeats: 6216

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_012855	CA	3	6	224519	224524	50 %	0 %	0 %	50 %	241589790
3502	NC_012855	GGC	2	6	224591	224596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241589790
3503	NC_012855	CTC	2	6	224604	224609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	241589790
3504	NC_012855	AGCG	2	8	224645	224652	25 %	0 %	50 %	25 %	241589790
3505	NC_012855	TGA	2	6	224678	224683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241589790
3506	NC_012855	CAAC	2	8	224710	224717	50 %	0 %	0 %	50 %	241589790
3507	NC_012855	TGC	2	6	224729	224734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589790
3508	NC_012855	AGC	2	6	224762	224767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589790
3509	NC_012855	CT	3	6	224768	224773	0 %	50 %	0 %	50 %	241589790
3510	NC_012855	ACG	2	6	224988	224993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589791
3511	NC_012855	CGTG	2	8	225010	225017	0 %	25 %	50 %	25 %	241589791
3512	NC_012855	GCG	2	6	225027	225032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241589791
3513	NC_012855	GTTG	2	8	225043	225050	0 %	50 %	50 %	0 %	241589791
3514	NC_012855	CG	3	6	225057	225062	0 %	0 %	50 %	50 %	241589791
3515	NC_012855	GTGC	2	8	225094	225101	0 %	25 %	50 %	25 %	241589791
3516	NC_012855	GCC	2	6	225110	225115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241589791
3517	NC_012855	CGGT	2	8	225148	225155	0 %	25 %	50 %	25 %	241589791
3518	NC_012855	GCT	2	6	225241	225246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589791
3519	NC_012855	GC	3	6	225257	225262	0 %	0 %	50 %	50 %	241589791
3520	NC_012855	GCG	2	6	225345	225350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241589792
3521	NC_012855	CCG	2	6	225458	225463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241589792
3522	NC_012855	GATCG	2	10	225495	225504	20 %	20 %	40 %	20 %	241589792
3523	NC_012855	CGG	2	6	225518	225523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241589792
3524	NC_012855	TGGA	2	8	225581	225588	25 %	25 %	50 %	0 %	241589792
3525	NC_012855	TCA	2	6	225639	225644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241589793
3526	NC_012855	GC	3	6	225753	225758	0 %	0 %	50 %	50 %	241589793
3527	NC_012855	A	6	6	225790	225795	100 %	0 %	0 %	0 %	241589793
3528	NC_012855	TGG	2	6	225878	225883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241589793
3529	NC_012855	GGT	2	6	225888	225893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241589793
3530	NC_012855	CA	3	6	225988	225993	50 %	0 %	0 %	50 %	241589793
3531	NC_012855	CAGA	2	8	225996	226003	50 %	0 %	25 %	25 %	241589793
3532	NC_012855	GCG	2	6	226037	226042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241589793
3533	NC_012855	GA	3	6	226058	226063	50 %	0 %	50 %	0 %	241589793
3534	NC_012855	AGA	2	6	226111	226116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241589793
3535	NC_012855	GAA	2	6	226189	226194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241589794
3536	NC_012855	ACT	2	6	226210	226215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241589794
3537	NC_012855	AC	3	6	226272	226277	50 %	0 %	0 %	50 %	241589794
3538	NC_012855	GC	3	6	226292	226297	0 %	0 %	50 %	50 %	241589794
3539	NC_012855	GCA	3	9	226311	226319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589794
3540	NC_012855	GTG	2	6	226346	226351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241589794
3541	NC_012855	G	6	6	226351	226356	0 %	0 %	100 %	0 %	241589794
3542	NC_012855	CTGGC	2	10	226366	226375	0 %	20 %	40 %	40 %	241589794
3543	NC_012855	GAT	2	6	226469	226474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241589794
3544	NC_012855	GCA	2	6	226481	226486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589794
3545	NC_012855	GGC	2	6	226520	226525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241589794
3546	NC_012855	AGC	2	6	226566	226571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589794
3547	NC_012855	TGA	2	6	226660	226665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241589794
3548	NC_012855	GGC	2	6	226697	226702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241589794
3549	NC_012855	GGC	2	6	226751	226756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241589794
3550	NC_012855	AGGC	2	8	226798	226805	25 %	0 %	50 %	25 %	241589794
3551	NC_012855	CGG	2	6	226827	226832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241589794
3552	NC_012855	CCAAA	2	10	227871	227880	60 %	0 %	0 %	40 %	241589795
3553	NC_012855	GC	3	6	227907	227912	0 %	0 %	50 %	50 %	241589795
3554	NC_012855	CAG	2	6	227976	227981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589795
3555	NC_012855	CACT	2	8	228002	228009	25 %	25 %	0 %	50 %	241589795
3556	NC_012855	GCTG	2	8	228034	228041	0 %	25 %	50 %	25 %	241589795
3557	NC_012855	GGA	2	6	228104	228109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241589795
3558	NC_012855	GGC	2	6	228122	228127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241589795
3559	NC_012855	GTT	2	6	228128	228133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241589795
3560	NC_012855	CGG	2	6	228139	228144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241589795
3561	NC_012855	TAC	2	6	228171	228176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241589795
3562	NC_012855	AGCGC	2	10	228259	228268	20 %	0 %	40 %	40 %	241589795
3563	NC_012855	CTT	2	6	228275	228280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241589795
3564	NC_012855	GA	3	6	228332	228337	50 %	0 %	50 %	0 %	241589795
3565	NC_012855	GAG	2	6	228353	228358	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	241589795
3566	NC_012855	TCG	2	6	228416	228421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589795
3567	NC_012855	CAT	3	9	228496	228504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241589795
3568	NC_012855	GAAG	2	8	228524	228531	50 %	0 %	50 %	0 %	241589795
3569	NC_012855	AC	4	8	228591	228598	50 %	0 %	0 %	50 %	241589795
3570	NC_012855	GT	3	6	228657	228662	0 %	50 %	50 %	0 %	241589795
3571	NC_012855	GA	3	6	228674	228679	50 %	0 %	50 %	0 %	241589795
3572	NC_012855	CAG	2	6	228731	228736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589795
3573	NC_012855	GCT	2	6	228781	228786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589795
3574	NC_012855	TGG	2	6	228804	228809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241589795
3575	NC_012855	CA	3	6	228814	228819	50 %	0 %	0 %	50 %	241589795
3576	NC_012855	TGC	2	6	228873	228878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589795
3577	NC_012855	G	6	6	228943	228948	0 %	0 %	100 %	0 %	241589795
3578	NC_012855	TCCA	2	8	228992	228999	25 %	25 %	0 %	50 %	241589795
3579	NC_012855	GGTT	2	8	229051	229058	0 %	50 %	50 %	0 %	241589795
3580	NC_012855	TGGC	2	8	229059	229066	0 %	25 %	50 %	25 %	241589795
3581	NC_012855	GGC	2	6	229108	229113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241589795
3582	NC_012855	CG	3	6	229145	229150	0 %	0 %	50 %	50 %	241589795
3583	NC_012855	AC	3	6	229503	229508	50 %	0 %	0 %	50 %	241589796
3584	NC_012855	GAA	2	6	229556	229561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241589796
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3587	NC_012855	GCT	2	6	229724	229729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589796
3588	NC_012855	CGCA	2	8	229738	229745	25 %	0 %	25 %	50 %	241589796
3589	NC_012855	AAG	2	6	229830	229835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241589796
3590	NC_012855	GAC	2	6	230027	230032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589796
3591	NC_012855	GTG	2	6	230194	230199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241589796
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3593	NC_012855	GCTG	2	8	230298	230305	0 %	25 %	50 %	25 %	241589796
3594	NC_012855	GAA	2	6	230327	230332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241589796
3595	NC_012855	CGG	2	6	230333	230338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241589796
3596	NC_012855	TCGC	2	8	230602	230609	0 %	25 %	25 %	50 %	241589797
3597	NC_012855	GAA	2	6	230613	230618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	241589797
3598	NC_012855	GGC	2	6	230691	230696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241589797
3599	NC_012855	GCG	2	6	230705	230710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241589797
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3602	NC_012855	GACCGT	2	12	230978	230989	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	241589798
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3604	NC_012855	CGAG	2	8	231109	231116	25 %	0 %	50 %	25 %	241589798
3605	NC_012855	TGA	2	6	231241	231246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241589799
3606	NC_012855	GCG	2	6	231285	231290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241589799
3607	NC_012855	CGT	3	9	231296	231304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589799
3608	NC_012855	CAT	2	6	231392	231397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	241589799
3609	NC_012855	AGT	2	6	231466	231471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241589799
3610	NC_012855	AG	3	6	231664	231669	50 %	0 %	50 %	0 %	241589800
3611	NC_012855	GTT	2	6	231748	231753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	241589800
3612	NC_012855	GACT	2	8	231881	231888	25 %	25 %	25 %	25 %	241589800
3613	NC_012855	ACG	2	6	231911	231916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589800
3614	NC_012855	GAC	2	6	231973	231978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	241589800
3615	NC_012855	TC	3	6	232566	232571	0 %	50 %	0 %	50 %	241589801
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3622	NC_012855	GCT	2	6	232849	232854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589801
3623	NC_012855	CGT	2	6	232864	232869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589801
3624	NC_012855	TGA	2	6	232879	232884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	241589801
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3989	NC_012855	GC	3	6	254697	254702	0 %	0 %	50 %	50 %	241589826
3990	NC_012855	TGG	2	6	254741	254746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	241589826
3991	NC_012855	CG	3	6	254764	254769	0 %	0 %	50 %	50 %	241589826
3992	NC_012855	CTTC	2	8	254777	254784	0 %	50 %	0 %	50 %	241589826
3993	NC_012855	TGC	2	6	254827	254832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589826
3994	NC_012855	GCG	2	6	254883	254888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	241589826
3995	NC_012855	CCG	2	6	254900	254905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	241589826
3996	NC_012855	GTC	2	6	254919	254924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	241589826
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3999	NC_012855	CTTCC	2	10	255027	255036	0 %	40 %	0 %	60 %	241589826
4000	NC_012855	TCT	2	6	255080	255085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	241589826

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